Protein

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Genbank accession
YP_007004202.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,58
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,85
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDINAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTVVIKDIGGRVGYNEIKVQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFTETLITKPFSYNMIIFANRLWHFWESGNEERGIRVEPNTAQFQAQAGDNILRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDIIKTADIDGLGSKFHLIVETFDASSALGKPGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYVWDGDLKTRLRVIRDDVELLANESIIVFGPNNTTPQTINITLPTGVAQGDVVKIALNYLRKAQTVNIKAAVGYKIASSVQLLQFPKRSEYPPDTEWVLNDVLTFNGDISYTPVIELSYIEDTTTGGKYWVVAQNVPTIERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQDTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQVETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYTSTVGTTPATARDTVGTNVYNKNVGNLVISPKALDQYKATQVQQGTVYLSNQSEVNAGQTASGFANSAVSPETLHARVALDTRTGLIEIATQTETDTGTDYTRAVTPKTLNDRKATERLTGIARIATQVEFDAGVLDNVISTPLKIKTRFNDTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREANETQRGTARLATQTEVNVGTDDKTIVTPLKLHSKKSTESSEGIIRVATNTETTAGTSKVLAVSPSGLKYVVQTETTWEATALRRGFVKLTEGALTYSGNKVTGSGVKFNSGTGLYENDDTVLNAANYPKTGYAVSSYEMNKTLQNFLPINATAVNSEKLDGLDSLQFIRRDVDQTVNGSLTLTKQLNLAAPLVSSSTANITGNTILGSLEVTGNSTFKNDVSVSSGKSIKFVGPQSGAGTWNSQGDTLAPIFAEINSTPDAKFHPIVKQRLGQGTFSLGTVNDGTRDFKIHYLPSPGSLESFYWTFNTTGDFAVNSGSISISKNANITGTTTSNGVSTTTLNASALSSLQNVTTSGTIVSTGQVSANNGLVAQKYVRSVGVKPTLASQAPTAETVGFWSVDINDSATFNLFPGYWTMKTKRQVNIDTVQTKPAGVSDEIWNASGWLTETGAFSSPAIRYRNEDGSFGDEVLSTTGQKLRGTWFDYSVRDKEVKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKNAWTTFSMVYTADNPPSAEEVGALPADNATMGNITILDWLRIGNVRIIPDPVTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1349 AA
molecular weight: 146414,44090 Da
isoelectric point:5,73530
aromaticity:0,08302
hydropathy:-0,32987

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–126
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1143–1176
IPR048391 IPR048391
YP_007004202.1
1 1349
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-126 | STR 349-1142 | ATT 1143-1176 | STR 1177-1234 | ATT 1235-1297 | STR 1298-1331 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage Bp7
[NCBI] 		1052121 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Dhakavirus
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_007004202.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_019500 [NCBI]
CDS location
range 83103 -> 87152
strand -
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCTGCCTTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCAGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTATTAGACGACGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCCGTAATCCATGACCAACGTATCTGGGTTGCTCAACGTGATATCAATGCTCCAGCAGGAACCTTTGTACCTGGTTATTGGACTGCTACCCGTACTGACCCTAAATGGATTACCGTAGCATCTCCTACACGCCAACTGGCTTCTGGTGAATATATTGCAGTGGATTCTGCTGCTAGCTTTACTACATTTACCCTGCCTCCTAACCCTACAGATGGCGATACCGTTGTAATTAAAGATATCGGTGGACGTGTTGGTTATAATGAAATCAAGGTTCAGTCTAGTTCTGCTCCGGGCGGTGGTAACCAGAAAATTGTCCGTTTCGGTAACCAGTTCACTGAGACCTTAATTACGAAGCCTTTTTCCTATAATATGATTATCTTTGCCAACCGTTTATGGCATTTCTGGGAATCAGGTAACGAAGAACGTGGTATCCGTGTAGAACCTAACACCGCCCAGTTCCAAGCTCAAGCTGGTGATAACATCCTCCGTCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAGTTTACTCTTCCTAAGTATGCGAACCAAGGCGATATTATTAAAACCGCTGATATCGATGGTTTAGGAAGTAAATTCCATTTAATCGTTGAAACGTTTGATGCTTCGTCTGCATTAGGTAAACCCGGACAGCATAGCATGGAATTCCGTACCTCCGGTGATGGATTCTTTGTTTATAACTCTACCGAAAAATTATGGTATGTTTGGGACGGTGACCTTAAAACCCGTTTACGTGTAATTCGCGATGATGTTGAACTCTTGGCTAACGAAAGTATTATTGTTTTTGGTCCTAATAATACAACGCCGCAGACGATTAATATCACATTACCTACAGGCGTAGCCCAGGGTGATGTCGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGTAAAGCTCAGACGGTAAATATTAAGGCTGCTGTAGGATATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTCCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCGCCGGATACTGAATGGGTGTTGAATGATGTACTGACCTTTAATGGCGATATAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTGAGTTATATCGAAGACACCACTACAGGTGGCAAATATTGGGTTGTTGCTCAGAACGTTCCTACTATAGAACGTGTAGATTCTAAAGATGATTTAACTCGTGCTCGTTTAGGTGTTATTGCCCTTGCGTCGCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCTGAGAAAGAACTTGCAATTACTCCACAGACTTTAGCTAATCGTGTAGCGACTGAATCTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACTACTGCTCAGGTGAACCAGGACACAACCTTCGCATTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCAACCGAAACTCGCCGTGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAAACTAACACGGGTACAGATGATACTACAATCATCACTCCTAAGAAGCTACAAGCACGCCAGGGTTCGGAAAGTCTTTCAGGTATTGTAACATATACCTCTACTGTAGGAACCACTCCTGCGACTGCTAGAGACACTGTAGGTACTAACGTTTATAATAAGAACGTAGGCAATTTGGTTATTTCTCCTAAAGCTCTCGACCAGTATAAAGCTACCCAAGTTCAACAGGGTACAGTATATCTTTCTAACCAATCTGAAGTTAACGCAGGTCAAACTGCAAGTGGATTTGCCAACAGTGCTGTTTCTCCTGAAACATTACATGCTCGTGTGGCTCTTGATACTCGTACAGGGTTAATTGAAATTGCTACGCAAACAGAGACTGATACTGGAACAGATTATACTCGTGCGGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAAGATTGACTGGTATTGCTAGAATTGCAACACAGGTAGAATTTGATGCAGGTGTATTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTAATGATACCGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGTGGTTTGGTTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATTAGAGAAGCAAATGAGACTCAACGTGGTACTGCTCGCCTGGCGACCCAGACCGAAGTCAACGTTGGTACTGATGATAAAACTATCGTCACTCCTTTGAAATTACATTCTAAAAAATCTACTGAAAGTTCTGAAGGTATTATTCGTGTTGCAACGAATACCGAAACAACCGCAGGAACTTCTAAAGTTCTGGCTGTAAGCCCTTCTGGTTTAAAATATGTAGTACAGACCGAAACCACTTGGGAAGCTACTGCACTTCGTCGTGGATTTGTTAAATTAACCGAAGGTGCTTTAACCTATTCAGGAAATAAAGTTACCGGTTCTGGTGTTAAATTTAACTCAGGTACAGGCCTTTATGAGAACGACGATACTGTTCTGAACGCAGCTAACTACCCTAAAACAGGTTATGCTGTTTCATCTTACGAGATGAATAAAACTTTACAGAACTTTTTACCTATAAATGCTACGGCTGTGAACTCCGAGAAATTGGATGGCCTAGATTCACTCCAGTTCATTCGTAGAGACGTTGACCAAACGGTTAATGGTTCTTTAACGTTGACAAAACAATTGAACCTGGCCGCTCCTCTGGTGTCTTCTAGTACGGCTAATATTACCGGCAACACTATTTTAGGTTCTCTAGAAGTAACTGGAAATTCTACTTTTAAAAATGATGTATCTGTTAGCTCAGGTAAATCTATTAAATTTGTAGGACCCCAATCTGGTGCAGGTACTTGGAACTCTCAAGGTGATACTTTAGCTCCGATTTTTGCCGAGATAAATTCGACCCCGGATGCCAAGTTCCATCCTATTGTTAAACAACGTTTAGGGCAAGGTACATTCTCTTTAGGCACTGTAAACGACGGAACTCGTGATTTTAAAATACATTATCTTCCATCGCCGGGTTCTTTAGAATCTTTCTACTGGACCTTTAATACGACCGGTGATTTTGCTGTTAATAGTGGTTCTATTAGTATTTCCAAGAACGCTAATATCACCGGTACAACTACTTCTAACGGTGTTTCTACAACTACATTAAATGCTTCTGCTCTGTCTTCATTACAAAACGTAACTACTTCAGGTACTATCGTTTCTACCGGGCAGGTATCGGCAAATAATGGTTTGGTTGCTCAAAAATACGTCCGTTCTGTTGGTGTTAAACCTACATTAGCATCCCAGGCCCCTACTGCAGAAACCGTTGGCTTCTGGTCTGTCGATATCAATGATTCGGCTACATTTAACCTGTTCCCTGGTTATTGGACGATGAAAACTAAACGTCAGGTTAATATCGATACGGTCCAAACTAAACCTGCCGGTGTTTCTGATGAGATATGGAATGCTTCTGGTTGGTTGACAGAAACGGGTGCATTTAGTTCTCCGGCTATTCGTTATCGTAACGAAGACGGTAGTTTTGGTGACGAAGTTCTCAGTACGACGGGTCAGAAATTACGTGGTACTTGGTTTGATTATTCTGTTCGTGATAAGGAAGTTAAATATCCTGGTACGTTAACTCAGTTTGGTAATACATTGGATTCATGTTATCAAGATTGGGTGTGCTATCCTACAGGACTGAATGGTGGTACTATTCGTTATACACGTACCTGGCAGAAAAATAAAAACGCATGGACTACGTTCTCTATGGTCTATACGGCAGATAACCCTCCTTCTGCGGAAGAGGTTGGTGCATTGCCTGCTGATAACGCTACAATGGGTAACATTACAATCCTTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATTATTCCTGACCCGGTCACTAAATCCGTTAAGTTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
fe4c1204b54a29b3f03889a615d212e6604cb6055838b92493ad3747814a0a05
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5371
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Morphological observation on lytic cycle of bacteriophag Bp7 Liu,X., Ren,H., Liu,W., Wen,J., Zou,L. and Liu,C. 2010 — GenBank
Complete genome sequence and analysis of polyvalent Phage Bp7 of E. coli Wu,D. and Ren,H. 2013-06-12 — GenBank