Protein

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Genbank accession

WPK40329.1 [GenBank]

Protein name

hypothetical protein

RBP type

Evidence RBPdetect2

Probability 0,92

Protein sequence

MSIQSGPSVLNQFVPDFLIDSTPTNGQFLVYDDTVQAFVNSTNPRIVLDSSNILDGSITIDKLAISGNKVPGYVLTITSAGGMAFLPVPGNGGQLPSLDELLDTNIVSPTVTQYLKWDGSAWVNSNITLNDVSDVSVISPTADDVLAWESGSWTNKKIDYTSLTNKPDLSDVVRSSELSSVAFSGDYNDLVNIPSATSNTIVGLTDVNDTALPNGFLRWNASGDEVEFITSISATVITGLAPVATSGNYNDLLGKPNLSVYPLRTEFSTVATTGNYSDLNNVPLTFAPSAHTHPAAQITGLASVATSNDYNDLVNKPTAMAPTAHTHAISDIIGLQNSLDSKLTVNLTTRLPKDVIYFNGTSWINKQLSYTDISGTPNLDNYVTDSELSTVATTGRYSDLINKPELVENLNDLLDVDVSSKQTGNVLTWNGTAWVASAITQASIDWANISNKPSVFSPAAHTHDVVDVLGLQSLLDSKLDANIAFDGDYNSLTNKPGLIDLQDTFSPAVPNGFLRWNNLGTLVAYQDYIYPQDISGLSDVAISGQYSDLLGTPSLSTVAITGSYSDLIDAPPAFDGDYDSLTNKPFIPTNFDFKFIGLNDVSPTVQPGGYLKWNLDGSFVVSSANIPATDVAGLSVVSTTGQYSDLLGKPLLATVSSSGSYTDLINIPTEFNPAEHTHSIADVSGLQASLDNKLNTSDAFSGDYNDLTNAPTNSSYSLVGLSDTNSVPVANGFLRWNASGSSVEYIQTIPVNAITGLAPVASSGQYADLQGTPDLSDYVLSVSLADIATTGEYSDLINAPDLSVYANKTDLSDVATTGQYSDLLGIPTQFTPTVHVHNVSQISGLSAVATSGSYNDLSNKPSFANVATTGSYDDLNNKPSIPTNGSFSLLGLNDTNNTPVADGILRWNSSANQVIYANTIDAQSVSGLATVATIGKLSSLSDVDLIGLNQNEILQWNGSAWVPVPYNPNQIQAYIESGNTKVSTNDILDSIVLTAGPTTGNIIFELGNTNSSIILNPVTNNVDALISSTSRIKLDSSTGISLGNISYPMTDGTVGQAIVTNGAGQLSFETVVKPSQLATVATSGNYNDLTNKPTLVTELNGLADVRMRDTNGNYLAQPEDVLTYSNGIWQARPNTSSSFIGLSDTQNITLPEDRANAYLRWDTTGNLIIYEDSISASVIAGLAEVATTGDLHDLINVNVNLPDMNNPATQAVWGLIWDRQNQRWINYNLRNIAGSGGSTVVALNDLTDVTLTFPVVDGNVLRATVQPDNSIVWQNKQLSYSDLTGTISMSLLQLTDTSSSAVPNGFLRWDSSGNTVQYITTISTNDISGLAPVATSGNYNDLSNTPAIPASINDLADVNTVSPVPTNGYVLTWDSSSNNWIAKEPATSPSGSTALADLTDVSLSDLTASDVLKYNGTTWVNEPVTYSELTDLPTFALVAFSGDYNDLTNKPSGSTTSILDLTDTADTALPNGFLRWNASGDEVLYQLSINVSDIIGLSSVAISGDFNDLSNKPENNSYYFRKLADAGNPQPNTFIKYPAFTIPPGSDIDDVNPILEYVSSINALTDIDNLAPVATNGILGSLVDVNLNSVEDGQVLTYDAVTNSWINKNSSGSPVVTSWTKINGNYTVTGSEYLLVDTTSASVTITLPVAPTENMVIRIADWKGTFRTNSCVVNTNGMPLMGASMDNTLTIQNQNASIELTFVDTTYGWKITDGIGEISKQNIPVTNWRTVDSSSTPAMLIAQPGEAIYVNTNNGAVTVKLPTGASVNAVVRIADLLGTYDKASCFVDGNGNPIMGKNEILEIANENASIEFTYVDSVVGWKVTDGIGELGRKTDIASDSDIIVYVATDGNDTTGSGTEESPFATLNAAFLSLDGKFVNSSAEIIVRVAEGVYEPTNPVAFSHIQGMNVKLIGELPQASSSFTVTNITNDAGLAKVTMQLSSVSDYEVGDIIKITSAATMLECVEIITAINTGSNTLEIVIPNSVLADVSDYTGYTGTISKFTTVFKNTNMYVAGGYSLGFIDNIALVDDTGLGTALTVGRTYTTGIYDGPAYVGLGANFAVYGYETAIQSIPGSSVVLAGNLCRQAGAAIRADGSILSFNAGQSVYIANQAQDGIVLKHGSKLIHNDDASQSFVFVIFNNIKSGTILSLDTSISTANFEVKNSEGIMIAATRHSTVDARSAIVSGTITGDLEVNATGMSVISINEPADSTDIPLAVVCNPAYGSNIELQKGYIGL

Physico‐chemical properties

protein length:	2236 AA
molecular weight:	236458,99390 Da
isoelectric point:	4,08527
aromaticity:	0,07424
hydropathy:	-0,02464

Domains

Domains [InterPro]

DC_0165
STR
1–264

DC_0165 DC_0755 PF12789 DC_0165 DC_1797 DC_0165 G3DSA:3.30.1910.20 DC_0829

PF12789
STR
324–347

PF12789 DC_0165 DC_0755 DC_0165

DC_0165
STR
694–785

DC_0165

WPK40329.1

1 2236

Architecture

STR

ATT

STR

ATT

STR

RBD

STR 1-264 | ATT 321-592 | STR 593-862 | STR 880-1118 | ATT 1119-1396 | STR 1397-1841 | RBD 1842-2236

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_0165	STR	DC_0165	1	264	Novel HMM	DC_0165	Central	Low	Positional only	31 proteins / 31 hits
DC_0755	ATT	DC_0755	321	592	Novel HMM	DC_0755	N-terminal	Low	Positional only	28 proteins / 28 hits
PF12789	STR	DC_0212	324	347	InterPro cluster	PF12789	C-terminal	Low	Positional only	31 proteins / 33 hits
DC_0165	STR	DC_0165	553	700	Novel HMM	DC_0165	Central	Low	Positional only	31 proteins / 31 hits
PF12789	STR	DC_0212	675	695	InterPro cluster	PF12789	C-terminal	Low	Positional only	31 proteins / 33 hits
DC_0165	STR	DC_0165	694	785	Novel HMM	DC_0165	Central	Low	Positional only	31 proteins / 31 hits
DC_0165	STR	DC_0165	774	862	Novel HMM	DC_0165	Central	Low	Positional only	31 proteins / 31 hits
DC_1797	STR	DC_1797	880	1122	Novel HMM	DC_1797	Central	Low	Positional only	26 proteins / 26 hits
DC_0755	ATT	DC_0755	1119	1396	Novel HMM	DC_0755	N-terminal	Low	Positional only	28 proteins / 28 hits
DC_0165	STR	DC_0165	1384	1723	Novel HMM	DC_0165	Central	Low	Positional only	31 proteins / 31 hits
DC_0165	STR	DC_0165	1718	1841	Novel HMM	DC_0165	Central	Low	Positional only	31 proteins / 31 hits
G3DSA:3.30.1910.20	RBD	G3DSA:3.30.1910.20	1842	1908	Merged direct domain	G3DSA:3.30.1910.20	C-terminal	Low	Positional only	16 proteins / 16 hits
DC_0829	RBD	DC_0829	1909	2236	Novel HMM	DC_0829	C-terminal	Low	Positional only	10 proteins / 10 hits

Taxonomy

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Pseudomonas phage Paride [NCBI]	3092178	Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host	Pseudomonas aeruginosa PAO1 [NCBI]	208964	Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales > Pseudomonadaceae > Pseudomonas

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

WPK40329.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

OR805295 [NCBI]

CDS location

range 67696 -> 74406
strand +

CDS

ATGAGTATACAATCGGGTCCTTCTGTATTAAATCAATTTGTTCCAGATTTTCTGATAGATAGTACACCAACTAATGGTCAATTTTTAGTTTATGACGATACTGTCCAGGCATTTGTAAATAGCACAAATCCCAGAATCGTATTAGATTCGTCTAATATATTAGACGGTTCTATAACAATTGATAAACTTGCAATATCTGGTAATAAAGTACCTGGATACGTACTAACTATAACTTCCGCAGGCGGAATGGCATTTTTACCAGTGCCCGGCAACGGCGGTCAGCTACCTAGTCTAGATGAATTACTAGACACAAATATAGTATCTCCTACTGTAACCCAATATCTTAAATGGGACGGTTCTGCATGGGTTAATAGTAATATAACATTAAATGATGTATCAGATGTCTCTGTTATCTCCCCTACAGCCGATGATGTATTAGCATGGGAATCAGGTTCTTGGACAAATAAGAAAATAGATTATACATCACTAACAAACAAACCAGATTTGAGTGATGTAGTTAGATCTAGCGAATTGTCATCAGTTGCATTCAGTGGTGATTATAATGATTTAGTAAATATTCCCAGTGCAACTTCTAATACTATAGTTGGATTAACAGATGTTAACGATACTGCACTACCTAACGGATTCTTGCGCTGGAACGCAAGCGGTGATGAGGTAGAATTTATTACTTCAATTTCTGCTACTGTAATAACCGGGTTAGCTCCAGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTATTAGGAAAACCTAATTTGTCAGTGTATCCGCTTAGAACTGAATTTTCTACTGTTGCAACCACCGGTAATTATTCTGATTTGAACAATGTGCCTTTGACATTTGCACCAAGTGCGCATACTCACCCGGCTGCACAAATCACAGGATTAGCATCTGTAGCTACTAGCAACGATTATAACGATTTAGTTAATAAACCGACTGCGATGGCGCCAACAGCACATACGCATGCTATATCTGATATTATAGGATTGCAAAATTCGCTAGATAGTAAGTTGACTGTTAATTTAACTACTAGACTTCCAAAAGATGTTATTTATTTTAACGGCACTTCATGGATAAACAAGCAATTATCTTATACTGATATTTCCGGTACTCCTAACTTAGATAACTATGTTACTGATTCAGAATTATCTACTGTTGCTACAACTGGCAGATATTCTGATTTAATAAATAAACCCGAGTTAGTAGAAAATTTAAACGACTTATTAGATGTAGATGTTTCTTCTAAACAAACAGGGAACGTATTAACCTGGAACGGAACAGCATGGGTTGCTAGTGCAATAACACAAGCAAGCATAGATTGGGCTAATATAAGCAATAAACCAAGCGTTTTTAGCCCCGCTGCGCATACACACGACGTAGTAGACGTACTAGGCCTGCAAAGTTTACTAGACAGCAAACTTGACGCAAATATTGCATTCGACGGCGATTATAATAGTTTAACAAATAAACCGGGGTTAATAGATCTTCAAGATACATTTAGTCCTGCTGTACCTAATGGATTCTTGCGGTGGAATAATTTAGGTACCTTAGTTGCATATCAAGATTACATATATCCGCAAGATATTTCAGGATTGTCAGATGTTGCTATATCGGGTCAGTATTCAGATTTATTGGGTACCCCTTCCTTATCGACTGTTGCTATAACCGGGAGTTATAGCGACTTAATTGATGCTCCGCCTGCGTTTGACGGTGATTATGATAGTTTAACAAATAAACCGTTTATTCCTACTAATTTTGATTTTAAATTTATAGGTTTAAATGATGTAAGTCCCACTGTTCAGCCCGGCGGCTATTTAAAATGGAACTTAGACGGTTCATTTGTTGTATCGTCAGCAAACATTCCTGCAACAGATGTAGCAGGATTGTCTGTTGTGTCTACAACCGGACAATATTCAGATTTATTAGGCAAACCGTTATTAGCTACAGTTTCTTCGTCAGGTAGTTATACTGATTTAATAAATATTCCTACTGAATTTAATCCAGCTGAACATACCCACAGTATAGCAGACGTATCTGGATTACAGGCATCCCTGGACAATAAATTAAATACCTCTGATGCATTTAGTGGTGATTATAATGATTTAACTAACGCACCTACTAATAGTTCATATTCATTGGTGGGATTATCAGATACTAATTCTGTACCTGTTGCAAACGGATTCTTACGCTGGAATGCATCCGGAAGTAGTGTTGAATATATTCAAACAATTCCTGTAAATGCAATAACCGGATTGGCTCCTGTCGCATCATCTGGCCAGTATGCAGATTTGCAAGGAACACCGGATTTATCTGACTATGTTTTATCTGTATCATTAGCTGACATAGCTACAACTGGAGAATATTCAGATTTAATAAATGCACCCGATTTAAGTGTGTATGCTAATAAAACTGATCTGTCAGATGTGGCTACAACAGGACAATATTCGGATTTATTGGGTATTCCTACGCAATTTACACCGACAGTTCATGTCCATAACGTTTCTCAAATAAGTGGATTATCTGCAGTTGCTACTAGCGGAAGTTATAATGATTTATCTAATAAACCGTCGTTTGCTAATGTTGCAACAACAGGCAGCTATGATGATCTAAACAATAAACCATCCATACCTACTAATGGCAGTTTTAGTTTACTTGGGTTAAATGATACAAATAATACGCCAGTTGCAGATGGTATATTGCGTTGGAATTCCAGTGCAAATCAGGTAATATATGCAAATACAATCGATGCACAATCTGTTTCTGGATTAGCTACTGTTGCGACTATAGGTAAACTATCTTCACTAAGTGATGTAGATTTAATAGGTTTGAACCAGAATGAAATATTGCAATGGAACGGTTCTGCATGGGTACCTGTACCTTATAATCCTAATCAAATACAAGCTTACATAGAGAGCGGAAATACAAAAGTTTCTACTAACGATATTTTAGATAGCATTGTTCTAACAGCAGGACCTACTACTGGAAATATAATATTCGAGTTAGGAAACACAAATAGCTCAATTATTCTAAATCCAGTTACTAATAACGTAGATGCTCTTATTTCTTCTACTTCTAGAATAAAATTAGATTCATCCACTGGCATATCATTAGGTAATATAAGTTATCCAATGACCGACGGTACAGTTGGGCAAGCAATAGTTACAAATGGAGCTGGCCAACTATCGTTTGAAACAGTAGTTAAACCCTCTCAATTGGCCACAGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTAACTAATAAACCTACATTAGTAACCGAACTAAACGGACTTGCTGACGTTCGTATGCGTGATACTAATGGAAATTATTTAGCACAACCGGAGGATGTGTTAACATATTCTAACGGAATATGGCAAGCACGACCGAACACTAGTTCTTCTTTTATAGGTTTAAGCGATACCCAAAATATAACATTGCCAGAAGATAGGGCTAATGCATACTTACGTTGGGATACTACTGGAAATCTAATTATATACGAAGATAGTATTTCTGCAAGCGTAATTGCCGGATTAGCAGAAGTAGCAACCACAGGAGATTTGCACGATTTAATAAATGTAAATGTAAATTTACCTGATATGAACAATCCAGCTACACAAGCTGTTTGGGGTTTAATATGGGATCGTCAGAATCAACGTTGGATAAATTACAATTTACGTAATATAGCAGGTTCGGGTGGATCTACAGTAGTAGCATTGAATGACTTAACTGATGTTACTCTTACTTTCCCTGTAGTTGATGGTAATGTTCTTAGAGCAACTGTGCAACCAGACAATAGTATTGTTTGGCAGAACAAACAACTATCTTATAGTGACTTAACTGGAACTATAAGTATGAGTCTATTGCAATTAACTGATACTAGTTCATCTGCTGTACCTAATGGATTCTTACGGTGGGATTCGTCGGGTAACACAGTTCAGTATATTACTACAATAAGTACAAATGATATATCTGGGTTAGCTCCGGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTATCTAATACACCTGCTATACCAGCATCAATTAACGATTTAGCAGACGTTAATACAGTTAGTCCTGTTCCTACAAACGGATATGTATTAACATGGGATAGTAGTTCGAATAATTGGATTGCAAAAGAACCTGCAACTAGCCCATCTGGTAGCACAGCCCTCGCCGATCTAACAGATGTATCTCTATCTGATCTAACTGCTAGTGATGTTTTAAAATACAACGGCACTACATGGGTAAACGAACCAGTTACGTATTCTGAATTAACAGATTTACCTACATTTGCGTTAGTTGCATTTAGTGGTGATTATAATGATTTAACTAATAAGCCATCGGGATCTACTACATCTATACTAGATCTAACTGACACTGCAGATACTGCACTACCTAACGGATTCTTGCGCTGGAACGCAAGCGGTGATGAGGTTTTATATCAATTATCTATTAATGTTTCTGATATAATAGGATTATCTAGTGTAGCTATAAGTGGTGATTTTAACGATTTATCCAATAAACCGGAAAATAATTCGTATTATTTTAGAAAGTTAGCTGACGCAGGAAATCCGCAGCCTAATACATTTATAAAATATCCTGCGTTTACTATTCCGCCCGGTAGTGATATAGACGATGTTAATCCTATACTCGAATATGTAAGTAGCATAAATGCACTAACTGACATAGATAACCTAGCTCCGGTTGCCACTAACGGAATACTAGGAAGTTTAGTAGACGTAAATCTAAATTCAGTAGAAGATGGACAAGTTCTTACTTATGATGCTGTAACAAATAGCTGGATAAACAAAAATAGTTCAGGATCGCCGGTAGTAACTTCGTGGACAAAGATAAATGGCAACTATACTGTAACTGGCTCAGAATATTTATTGGTAGATACAACTTCTGCTAGTGTAACAATTACTCTGCCTGTTGCCCCTACCGAAAATATGGTAATTCGTATTGCTGATTGGAAAGGTACATTTAGAACAAATAGTTGCGTAGTGAATACTAATGGCATGCCTTTAATGGGTGCTAGCATGGATAACACACTAACTATTCAGAACCAAAATGCAAGTATAGAGTTAACATTTGTAGACACAACGTACGGTTGGAAAATAACAGATGGTATAGGTGAGATATCTAAACAAAACATTCCAGTTACGAACTGGCGTACTGTGGATTCATCTAGCACTCCTGCTATGCTAATAGCTCAACCCGGCGAAGCAATTTATGTTAATACCAACAATGGTGCAGTAACTGTTAAATTACCGACAGGAGCAAGTGTTAATGCTGTTGTTAGAATAGCTGACTTGTTAGGTACTTACGATAAAGCAAGTTGCTTTGTAGATGGCAACGGCAACCCAATAATGGGTAAAAACGAAATATTAGAAATTGCAAACGAAAATGCTTCTATAGAATTTACATACGTCGATTCGGTAGTAGGGTGGAAAGTAACAGACGGCATAGGTGAGTTAGGTAGAAAAACTGATATTGCATCTGATTCGGATATAATAGTTTATGTAGCTACAGACGGTAACGACACTACAGGAAGTGGAACCGAAGAATCTCCATTTGCTACATTAAATGCTGCTTTCCTTAGTCTAGATGGCAAATTTGTAAATAGTTCTGCAGAAATTATAGTTCGTGTTGCAGAAGGTGTCTACGAACCTACCAATCCTGTTGCGTTTAGTCACATTCAGGGAATGAATGTAAAACTTATAGGCGAATTGCCCCAAGCAAGTAGTTCATTCACTGTTACTAATATAACCAATGATGCAGGATTGGCAAAAGTAACAATGCAACTTTCTTCTGTCAGTGACTACGAAGTAGGGGACATTATAAAGATTACGTCGGCAGCAACTATGTTAGAATGTGTTGAAATTATAACAGCAATAAACACAGGATCTAATACTTTAGAGATAGTAATTCCTAATAGTGTATTAGCCGATGTATCTGACTATACTGGGTACACCGGAACTATATCTAAATTCACTACAGTATTTAAAAATACAAACATGTATGTAGCTGGCGGATATTCGTTAGGTTTCATAGATAACATAGCGTTAGTAGACGATACTGGATTAGGAACTGCACTTACTGTAGGAAGAACATATACCACAGGTATATATGATGGACCTGCGTATGTTGGTTTAGGTGCAAACTTTGCAGTATATGGATACGAAACTGCAATACAATCTATACCGGGTTCCAGTGTAGTATTGGCAGGAAATCTATGCAGGCAAGCAGGCGCTGCAATCCGTGCAGACGGTTCTATATTGTCATTTAATGCCGGACAATCTGTTTATATTGCAAACCAAGCACAAGATGGTATTGTGTTAAAACACGGAAGTAAACTAATACACAACGACGATGCTAGTCAATCGTTTGTATTTGTGATATTCAATAATATCAAATCCGGCACAATCCTATCGTTAGATACAAGTATATCTACTGCCAATTTTGAAGTTAAAAACTCAGAAGGCATAATGATAGCTGCAACCAGACATAGTACAGTTGATGCTAGATCAGCTATTGTATCTGGAACAATAACGGGCGATTTAGAAGTAAATGCAACAGGCATGTCTGTAATCAGCATAAACGAACCTGCAGACAGTACAGATATACCATTAGCAGTTGTTTGTAATCCTGCTTATGGATCTAATATAGAATTACAAAAAGGTTACATAGGATTATAA

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID

e467e10bc6a9be3d136e23d0e5b8b061a2814d01f226081fb8e252621057507b

ColabFold

Source ColabFold

Method ColabFold

Resolution 0,3744

Oligomeric State monomer

Download PDB

Model Confidence

Very high
pLDDT > 90

High
90 > pLDDT > 70

Low
70 > pLDDT > 50

Very low
pLDDT < 50

Literature

Title	Authors	Date	PMID	Source
Phage Paride can kill dormant, antibiotic-tolerant cells	Maffei,E., Harms,A. and Humolli,D.	—	—	GenBank

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Predicted Aligned Error (PAE)

Model Confidence

Literature