Phage RBP Database

UniProt accession

A0A873WAT5 [UniProt]

Protein name

Structural protein

RBP type

TF

Evidence RBPdetect2

Probability 0,56

Protein sequence

MSVTKKSISTLIESQLPEFISSEYELFSKFVTKYYEQQELQGQPLDVLSNLQTYADIDYYEKNILKQNTTLSVDISDSVTTINVVDASSFPEKNGYIQIGNEICFYKERTDTQFLEVSRGVSGNTKLGDLYTTSNFVSTQASFHPGGSSVNNVSNLFLYALVKSFESQYLGAFPQRYLKGEVDKRTLIKNIRKFYKAKGTDASVRFIFNTLVAGGEENTPSLYNPKDFTYKSSESDWVKGYALKVKVLSGDPNDLIGKVITQPATSTIPFASATVDNVRFDSNVDGEAIYNIFLAEETVNGEFFITSKTELTKQISSNDVAGNFINVFSTLGWKNTGALLIGNETFTFDEKNITQFRIKTRQNTSSYPIGTEVYEPIRLEGSGVELLSFGLVYNLEVLDGQPNSFTGDNVEIGLPGFTTDNAKIINPSTNSVRWKFNNGTQISTPGYSTIQQNLANLSTDVSALFEDEQYYYIASSGYPSYPILDGATDISTNAADQKLLKLIRKEAIRSTEIYETPSTDVGILVNGTRVYGHKDTDSVDFGELKRIDVLQQGSRYTIPPYVLIDGVAGKAVARLSGEFVESVEILEKSLYPRVPNVEILSGRNAVVRAVVTLGRVTSLVIDNPGEYYSAPPEIVIRDRVGRGRFAEYRSKIEGGKIVDFEVVNEGEFYSQDNIEVLVFPVGSGARGQAVLKNWRKNRYKVLESKLDSENGYLFDNYNPELEKGYGHVANPKALRIALGDNLNSTLQEPATKTHSPILGFAYDGNPIYGPFAYENPLDSQSSIVRMTSSYIQKTSRVEGPSISTYPLGTFIDDYEYRHRSGSLDNNNGRFCVTPDFPEGTYAYFLTIDSSQNPIYPYIIGQNFYSLPVDSNYNSNLSQKDLPLNARRFYLAGTPGNGGNVIANIKDIKSGSIDEFEVVSSTDTFSVGSELFIDDSETNGFGAAGSVSLVKGKSVNFLESQQTKATRLEIVRPAYLFAGDTLSQPITGAFGEVVGDVLNDNTVVLRNVQGTFDTTNTFSASIKVLSLLLNKPSSYASGSILKLTDGFVAEVAYGEVLETTVESNIVTVKVLTSVDFNGDGTLETPTGTAPFYFETEDNLADHYLQSNSLSDTSGTGIISITSLSDGLEPFDVNQNVALVETSENHGVGLDDIVNISINPDDSSTTTTYYVRKRIYQNLKLATPTIKTAVNYNGVGRLLTVNVGWDYTAGSYTNIPLTGGSGTGATANIVVNADGYVTDVQITDGGSGYKREDILSVDDTSLVRSVASQSTQRVKLLVDHVGVSTEATKIVLDDATRFVENDLVKIDDEIVKVISISSNTITVERAQNGTKAVDHYNDAPASLYKGRYNFNSNFTINGSETVTYDPNDQMLYVVYPSSTNISTLQPITDLFSFFDNSTPQRFVDIVNVTSPVNKFEFRKDGTSEYLTNPILEIQEYYKYRFDTSDSSLSGTYLDFSPSKNFNVIPVEKVESVPLPGSPNAFIDLKFGFGVRNSTNTYSDKKLTEFSNYYYFDRNGVCDSEGSYLNIITDPLSGRQVVNYVTPNRFCYALAKIPQWDGSGSITYTTNSLFAVGEISSVAITNIGDNYQKPPIISGVYPSVDNLAEATVLFDDYTKSITGVTVEKTGSNYSKPTVVITDGDGSGAEFTVIEQGGKVLDIRIKSRGKGYKTAPKIAIIEGDAFIFAKGKDIGVPKNVTIIRNGGSFHKDQTIYSDYTSSYTFTLKGYPEKAFKQGEVIVQKVNGIEVARGYVAIGGWREGSNLLKVTRIQGKFRENFNVQSVKTGNAGEITSIFVTTFSPTITSTYNNQGYYTSDRGRIGNSNQRITDSFFYQDYSYVIKSRTPITVWRDLIKSTTHPSGMKLFGEVIVDAEADIKMPVESPKASHFTVIELGIENSIKSENTRRIVTQTVQKIEDYRCKKGTGSVSVQEYNFNDLIASRVVLDSPFDGEFNSSGQLVGTRTFLLRDADTNAPVRPYNEQALIITLDGVLQEPGVSFTVSGDTITFAAPPLGEQIVEGQTVLQQKFLGKVFSFRSNTENQNVLKKIKNIYQRNGRWLDAANQIKLNEDFIVLETIGWFETQYSSVISNNTIPWNILEQRFKDDIRLILNAIEHDIRFGGNIKSVDYARGYSNTYNGYETYVIAAFEYAIRLARLAIRNWDWIAINASFTTGSDIVTVDSTDNVAIGAYVSAGSALPLANNIKVTEIISDTEVRISSPALATSGVPPAGSASPGNTYLSGTQSNNVSLPTGTGVVSPGNTYSVGPGTTLTAPPVFTGLNQVTFTFAGTNNGTFYDASNLINKNRDYIVDYAVNWAQATYPLINWTLKETKCRRDIGFLLDSVIEHLRYGGNYKIVEFAELYFIGSRLAYIDDQLTETLATYEKVLNELCVDAMRQSLAGTTPYTNIQPVIDPEVIADGNVPTCAGVESALNTYYEIISTIFNSGPTVVDSTSFNQNKTGAYTNQTPITNLNIIPDNQLISSECADVISSVDSLKENIAFEINGTAQSRSLPEYIDGETAIFDLYYEDGTAVNLPGPEDNLFVALNGVLQRPQFELDNPAFDAYFIDRSKNPNQIVFDSPPIWDQDFSALTIGEATSVEKFFAYDVGSYKRYTTDKSIIADEGTSSLGPFLILSVEDNKVVNIDDEKFLVVLVNGVIQEYDYAYTVSGPTITFKYPLRKEDVVDMRLLYGKEFEKIVTFYDHEPGSYLIEKTLVISDPSRSAYNGFGVWWNSPKPVVSDYSNVFVYQERPDGSVNPIGKLVNYWYSSGSFYVKMRSNNHVLESLDLSFRVLNDNTGPVFNVSASSNPFTLTTENIDPEGRVRLTRESQTYYKGDKGRTTDVLKRKGFFKLAPGDKVKIDGEKDFRFIKKVPDFVYAKEYRTNEDVTSDHYGSYTVTPYNGITRGEGLSVVAVVSNGEVVDLTWNQKIVDFSDPNNPKVSQPTAYQYYTPPILEFVPRDGNGGGARAEVIVKNGQVISVDLLHRGSGYTTDPKVVVTRSYKVCRENDIETNVVKVGVNKVIQQGITALSIIDTISLPPPEFALLSSVVLSSPTFVQDNIEHHIWPDVRESDMPVGSDQPGLQIRTRATDRIVPTPAGQSEVVDNQITTIIPTAAPNVLSTSTVTTSRNITTTLTREIDNTILESKAFNDPGAFLQIDLNIGDRVVYIPDTSRFSSNGKLLVGDEVIYYPRKYDDRFIFCDRGVENTTEQFWPAGTFLRQVPDYVSVVSGGINVVNSISSIETTHLPDGRGAENQRTHQLSGEIVTLTSSSRELISQVQVQTDIQSVSSLIYERTPTIESGVVGVDPVVITHNQTVIEQLDQINVVFDYSVRRDSVGVLIFTPPSGLIDYYQEEVLFTNPVSTRLNGFVTLIDKSVEQRSGNIIVVINQNEGLVQYQGEYSVGNLGSNIGNWSRVGYDDGFANVSNWTLQQFNRYFAEITINDFVKRGNSNFTLTGAKWNLANPSHQNSVAISSSSGTIGGPIIVQDTTYFPDSGYLLTSGGSVIQYTSKTATSFEDCTLYSGPNLISASDELVPFVIS

Physico‐chemical properties

protein length:	3530 AA
molecular weight:	389166,00670 Da
isoelectric point:	4,79320
aromaticity:	0,10425
hydropathy:	-0,25720

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_1555	ATT	DC_1555	4	331	Novel HMM	DC_1555	N-terminal	Low	Positional only	41 proteins / 41 hits
DC_0146	STR	DC_0146	501	981	Novel HMM	DC_0146	Central	Low	Positional only	81 proteins / 81 hits
IPR025924	STR	DC_0819	725	849	InterPro cluster	YHYH domain	Central	Low	Positional only	112 proteins / 112 hits
DC_0891	STR	DC_0891	1249	1793	Novel HMM	DC_0891	Central	Low	Positional only	66 proteins / 66 hits
DC_0085	STR	DC_0085	2070	2509	Novel HMM	DC_0085	Central	Low	Positional only	39 proteins / 39 hits
DC_0832	ATT	DC_0832	2524	3052	Novel HMM	DC_0832	N-terminal	Low	Positional only	64 proteins / 64 hits
DC_1555	ATT	DC_1555	3061	3330	Novel HMM	DC_1555	N-terminal	Low	Positional only	41 proteins / 41 hits

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Synechococcus phage S-H9-1 [NCBI]	2783674	Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Scyllavirus > Scyllavirus aitchnine
Host	Synechococcus sp. MW02 [NCBI]	1620844	Cyanobacteriota > Cyanophyceae > Synechococcales > Synechococcaceae > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

QPB08260.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

MW117966 [NCBI]

CDS location

range 173280 -> 183872
strand -

CDS

ATGTCCGTAACGAAGAAGTCAATTTCAACTCTGATTGAGTCTCAGCTCCCAGAGTTTATCTCTTCTGAGTATGAACTTTTTAGTAAGTTCGTAACAAAATACTATGAGCAACAAGAGTTGCAGGGACAACCACTAGATGTCCTCAGCAATTTGCAGACTTATGCTGACATCGATTATTACGAGAAAAATATTCTCAAGCAGAATACAACCCTTTCTGTTGATATCTCGGATTCTGTTACCACCATCAATGTAGTTGATGCTTCTTCTTTTCCAGAGAAGAATGGATATATTCAAATTGGAAATGAAATCTGTTTTTATAAGGAAAGAACAGATACTCAGTTTCTAGAGGTTTCCCGTGGTGTTAGTGGAAACACAAAACTTGGTGATTTATATACTACATCCAACTTTGTTTCAACTCAGGCATCTTTTCATCCTGGTGGTTCTTCAGTAAACAATGTTAGTAATCTTTTTCTATATGCTTTAGTAAAAAGTTTTGAGTCTCAGTATCTTGGAGCATTTCCACAAAGGTATTTAAAAGGAGAGGTTGATAAGAGAACCCTAATTAAAAATATTCGTAAGTTTTACAAGGCAAAAGGCACAGATGCCTCTGTAAGATTTATTTTTAATACACTAGTTGCTGGTGGAGAAGAGAATACACCATCACTATACAATCCAAAAGACTTTACATATAAGTCTTCCGAGTCCGATTGGGTAAAAGGTTACGCACTTAAAGTAAAAGTTCTCAGTGGAGATCCAAACGATCTTATTGGAAAAGTTATTACTCAACCAGCAACGTCAACTATTCCTTTTGCTTCTGCTACGGTAGATAATGTAAGATTTGATAGTAATGTTGATGGAGAAGCAATTTACAATATTTTCTTGGCAGAAGAAACTGTCAATGGAGAATTCTTCATCACTTCAAAAACAGAACTAACAAAACAGATTAGTTCTAATGATGTTGCTGGTAATTTTATTAATGTATTTTCAACATTAGGATGGAAAAACACAGGGGCTTTATTGATTGGTAATGAAACATTTACGTTTGATGAAAAAAACATTACCCAATTTAGAATCAAAACAAGACAAAATACTTCATCATATCCCATCGGAACAGAAGTATATGAACCAATCAGGCTAGAAGGTTCTGGTGTAGAACTTCTTTCTTTTGGACTAGTATATAATTTGGAAGTCCTAGATGGACAACCAAATTCTTTCACTGGAGACAATGTTGAAATTGGACTTCCAGGATTTACGACTGATAATGCAAAAATTATTAATCCATCTACAAATTCTGTAAGATGGAAGTTTAACAACGGAACTCAGATTTCAACGCCAGGATATAGCACGATTCAACAAAATTTAGCAAATCTGTCAACGGATGTTTCTGCACTCTTTGAAGATGAACAATATTATTACATTGCGTCATCTGGGTATCCATCATACCCAATTCTTGATGGGGCAACAGATATTTCAACAAATGCAGCAGATCAAAAACTGCTAAAGTTAATCAGAAAGGAAGCAATTAGAAGTACCGAGATTTATGAGACTCCATCTACAGATGTAGGTATTCTTGTAAATGGAACTCGTGTGTATGGACACAAAGATACAGACTCTGTTGATTTTGGAGAACTAAAAAGAATTGATGTATTGCAACAAGGATCTAGATATACAATTCCTCCATATGTTTTGATTGATGGAGTTGCTGGAAAAGCTGTTGCTAGACTATCGGGAGAATTTGTCGAGTCTGTAGAAATTCTAGAGAAGTCTTTATACCCAAGAGTTCCTAATGTTGAAATTTTATCTGGAAGAAATGCCGTCGTTAGGGCTGTTGTTACTTTGGGTAGAGTAACCAGTTTGGTAATTGATAATCCTGGTGAATATTATTCAGCTCCACCAGAAATTGTTATCAGAGATAGAGTTGGTAGAGGAAGATTTGCTGAATATAGATCTAAAATTGAAGGTGGTAAAATTGTTGATTTTGAAGTAGTTAACGAAGGAGAATTCTATTCTCAAGATAATATTGAAGTATTAGTATTTCCAGTTGGTTCTGGAGCTAGAGGACAAGCTGTTTTAAAAAATTGGAGAAAGAACAGATATAAAGTTCTAGAATCAAAATTGGATTCTGAAAATGGATATCTGTTTGATAATTATAATCCCGAACTCGAAAAGGGTTATGGTCATGTAGCAAACCCCAAAGCACTTCGCATTGCTCTTGGTGATAACTTAAATTCCACTCTACAAGAACCAGCAACGAAAACACATTCTCCAATTTTGGGATTTGCATATGATGGAAACCCAATTTATGGTCCATTCGCATATGAGAATCCTTTAGATTCTCAGTCATCCATTGTTAGGATGACATCTAGTTATATTCAAAAAACTTCTAGAGTAGAAGGTCCATCTATATCAACATATCCTCTCGGAACATTCATCGATGACTATGAATACCGCCATCGTAGCGGATCTCTTGATAATAACAACGGAAGATTTTGCGTTACTCCAGATTTTCCAGAAGGAACTTATGCATATTTCTTAACTATTGATTCTTCACAAAATCCAATTTATCCATATATTATTGGACAAAACTTCTATTCATTACCAGTAGATTCAAATTATAATTCAAATCTTTCTCAGAAAGATTTACCATTGAATGCAAGACGTTTTTATCTTGCTGGAACTCCAGGTAATGGCGGAAATGTTATTGCTAATATTAAAGATATCAAGTCTGGAAGTATAGATGAGTTTGAAGTTGTATCATCTACAGATACTTTTAGTGTTGGTTCTGAGTTGTTTATTGACGATTCTGAGACAAATGGATTTGGTGCTGCAGGCAGTGTATCTCTTGTAAAAGGAAAATCAGTAAATTTCTTAGAGTCTCAACAAACAAAAGCAACTAGATTAGAAATTGTACGCCCAGCATATTTGTTTGCTGGTGATACTCTTTCCCAACCAATTACTGGTGCTTTTGGTGAAGTGGTTGGTGATGTATTAAACGATAATACAGTTGTACTCAGAAATGTCCAGGGAACTTTTGATACTACAAATACATTCTCTGCTTCTATTAAAGTATTAAGTCTTCTTCTTAACAAACCATCATCCTATGCTTCTGGATCTATTTTAAAGCTGACGGATGGATTTGTTGCAGAAGTTGCTTATGGTGAAGTCTTAGAGACTACAGTAGAATCAAATATCGTAACTGTCAAGGTTCTTACTAGCGTTGATTTTAATGGGGATGGTACATTAGAAACCCCAACAGGCACTGCTCCTTTCTATTTTGAAACAGAGGACAATTTAGCAGATCATTATTTGCAAAGTAACTCTTTATCAGATACTTCTGGAACGGGAATTATCAGCATCACATCCCTAAGTGATGGTCTAGAACCATTTGATGTTAACCAGAACGTTGCGTTAGTAGAAACTTCCGAAAATCATGGTGTTGGTTTAGATGACATTGTAAACATCTCTATCAATCCAGATGATTCCAGTACAACTACAACATACTATGTGAGAAAGAGAATCTATCAAAATCTAAAGTTAGCAACCCCCACTATTAAAACTGCTGTAAATTACAATGGTGTTGGAAGGCTTTTAACGGTAAATGTTGGATGGGATTACACTGCTGGTAGTTACACAAACATTCCTCTTACTGGAGGATCGGGAACTGGTGCAACTGCAAACATTGTAGTGAATGCTGATGGATATGTAACTGATGTTCAAATCACCGATGGTGGTAGTGGATACAAGAGAGAAGATATTTTATCAGTAGATGATACTTCATTAGTAAGATCCGTTGCTTCTCAGAGCACACAAAGAGTAAAATTACTGGTTGATCACGTAGGAGTTTCAACAGAAGCAACTAAGATTGTTCTAGACGATGCAACAAGATTTGTTGAGAACGATTTAGTTAAGATTGATGATGAGATCGTAAAAGTAATTTCAATTTCTAGTAATACGATTACTGTAGAAAGAGCACAGAATGGAACAAAAGCAGTAGACCACTATAATGATGCTCCTGCTTCTTTGTACAAAGGAAGATATAATTTTAATTCTAATTTTACAATCAATGGATCGGAAACTGTAACTTATGATCCTAATGATCAGATGTTGTATGTGGTATATCCATCTTCAACAAATATTTCTACATTACAACCAATCACAGATCTATTCTCATTCTTTGATAATAGCACCCCACAGAGATTTGTTGATATTGTAAATGTTACATCTCCTGTCAATAAATTTGAATTCAGAAAAGATGGAACATCTGAATACCTCACAAATCCAATTTTAGAAATTCAGGAATATTATAAGTACAGATTTGATACTTCAGATTCTTCATTGTCTGGAACATATCTTGATTTCAGCCCAAGCAAAAACTTTAATGTAATACCTGTAGAAAAAGTTGAATCTGTACCTTTACCTGGAAGTCCCAATGCCTTTATTGATTTAAAGTTCGGTTTTGGAGTAAGGAATTCTACAAATACATATTCAGATAAAAAACTAACAGAATTTAGTAACTACTACTATTTTGATAGAAATGGTGTTTGTGATTCTGAAGGATCATATTTAAATATTATAACTGATCCACTATCTGGAAGACAAGTTGTAAATTATGTAACACCAAATAGATTTTGCTATGCATTGGCAAAAATTCCACAATGGGATGGCAGTGGTTCTATTACATATACGACAAATTCTCTTTTTGCTGTTGGTGAAATATCTTCTGTTGCAATTACAAATATTGGTGATAATTACCAAAAACCTCCTATTATTTCTGGAGTTTATCCATCTGTAGATAATCTAGCAGAAGCAACAGTTCTTTTTGATGATTACACAAAATCAATAACTGGAGTTACTGTAGAAAAAACTGGATCTAATTACTCGAAACCAACAGTTGTCATAACTGATGGTGATGGATCTGGAGCAGAATTTACTGTTATTGAACAAGGTGGAAAGGTTTTAGACATTCGAATCAAGAGCAGAGGAAAAGGTTATAAAACTGC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CACCATCTGGATTAATTGATTACTACCAAGAAGAAGTATTATTTACAAATCCTGTTAGCACCAGACTAAATGGATTTGTCACACTCATAGATAAGTCGGTGGAACAAAGATCTGGAAATATTATTGTTGTAATTAACCAAAATGAAGGTCTTGTTCAATATCAAGGTGAATATAGTGTTGGTAACCTAGGATCTAATATTGGTAACTGGAGTAGAGTTGGTTATGATGATGGATTTGCAAATGTGTCGAATTGGACACTGCAACAGTTTAATAGATATTTTGCTGAGATAACAATTAATGATTTTGTCAAGAGGGGAAATTCTAATTTCACTCTGACTGGAGCAAAATGGAATCTTGCGAATCCATCACATCAAAATTCAGTAGCAATTAGTTCTTCTTCTGGAACTATTGGTGGACCAATTATAGTTCAGGATACAACATACTTCCCAGATTCTGGATACTTACTCACATCTGGTGGGTCTGTAATCCAATACACAAGTAAGACAGCGACTTCTTTTGAGGATTGCACGCTGTATAGTGGTCCAAATTTGATCAGTGCTTCTGACGAATTAGTACCCTTTGTAATTTCCTAA

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Predicted Aligned Error (PAE)

Model Confidence