Protein

Genbank accession
AEZ65686.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein and packaging
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,87
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPLTRIDSAFLDLDAIGGIDFDVQSGVPTFSVDAVNHRVGIGTDSPTTKLEVIGDITVSKQNAFIELKDPDTADANYRLRNQGGSFSIYDVTNNQVKIAATAGYVTIYPNLNANNGLDVMGTITGDGNLDIADGIRHYGDTNTSISFPAADTITAETGGTERLRITSGGNIGINNTTPDTVLDVNSDGTAGIIQLTGARPSDSNNAFFSGRSSRGTIASPTTLVTNDIIATFQGKAHDGSNYLQAGRVRFGVDSISTGNLSSNLQFMLSNNGEFEALRITSDGDVGIGVADPDVYSLGGNNRYAAIKASAGYTVLNLVDSNNSGSYLQFGNSSVRRGSLQFLSNSDFVITSNASNSGTTLTERLRIKSAGRIGIETDDPTERLTVHGTNNDTTPILGLRSGNSQTTINNGAQIAFGFNGTNHYQHFIHTRHNASNNNNAIDFYVCDGTQQNTVTSGSIHTLSMVSGKVGIGVTNPQGTVHISSGTSGDATLILEADTDNSNDADNPYIVFRQDGGVNASAIGHGVNSGVDGNVLTIANSISNGSITFATGATNGYANATERLRINSDGKINVGGSAGAVGTKFNILNGSDNQNILGITGADESSEYAAIGVSGGNAVFTGGGAGTTSTGIIFRTAASGAETERVRITSDGSVGIGTVSAEHQLTVFNNGYTGVTIKSSRTNATSNIGGLDFKTQNTTVARIQSFVDGSIRFRNTSSLLDRLRITPTGNVGIGVIDPECKLQVGGDLQVGDSNNPGTFINVVGAGVGQNFGIRFGGGSNNPESKFSILGNTNDGHMRFRFGGTEKFRIRSDGKFGFGTGGNIDERGHIETASGNCRLKLQTGNTAVAGFVLQTSAKRFDIQAQNNFFQLYDSTVGTDRIRIDSDGDVGVGIADPQERLHVARIVMITGNTPQIRLNANDSDASDGDRTMLGQATGNGNFVTTAVDNDTILRGTSTGNLLFGVGTSEKFRITSSGNVGIGTNNPASKLSNSATAVSDGTQSVGSNGLNWKTSNSNAYIAGFENQSTGNGALFRVGDDNSARKILHAMNGSGSTVFLARGDGNVGLGTNSPGGKLHVESAATTAGWQIRTDSVGLSNESGFYRDASDHYEVVIRNGLGGLSYVKNDGGASTANLRFNVQGGERLTILSSGNVGIGTNNPVYPLHVQESAYFRRGIQVAVLSSNELQSRSPINSGFYNVDNTTTANGWPFTGWAHLLANTHSNTTNYYSQQFASSFYNQELYFRNTNNGSTTTTQSWGQVMHTNSALKPVFAESSGVTDAYSRYWYPGGEYYVSVHGITAPGDANNMIEQGYYHIANNTSNNPTSAYGYLNVHRHAGSQYSLQHFIVSSDTGRQWMRASYPDGSQSSGRNWYQWYSYGALERENTFTNRQHIIGPSSTSTFTGLHPNTSNNRAQFVLHSNYSDLVISSSQNNNNHGSTLSFVTQNPSNTADYNKFVINKGNYGTRNQFLEFGFIDNEYTNPHDYVNSTNTAVTIDGNNKRLGIGPGARTPGYPLDVRFAGDSGIHASSSNSHCSLFLNASTGNGSYIRMSAGGNQKFWIATDGSGHLNFRPNAGGTTIRMQNGGKLDAFAGIYVSGASLTLANTELDFTTANHKYIDFYTNNGNTVNFRMPNNSNVFHTGIQMVKAGAVNLYHNNTVKFYTTSTGTFTNGIQGSSDARLKTNVITVPNALDKVRAMRGVKFNWIEDGRADYGVIAQEAETVVPELVGDHETKKLTQAGSLKKRPDDSDYITTTEKGFSYMSMVGILIEAIKEQQATIDSLTARIDALENP
Physico‐chemical
properties
protein length:1786 AA
molecular weight: 189574,88520 Da
isoelectric point:5,87592
aromaticity:0,08175
hydropathy:-0,39211

Domains

Domains [InterPro]
cd19958
1293–1370
cd19958 IPR030392
IPR030392
1671–1780
IPR030392
AEZ65686.1
1 1786
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-TIM5
[NCBI] 		1137745 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 8102
[NCBI] 		84588 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AEZ65686.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JQ245707 [NCBI]
CDS location
range 76754 -> 82114
strand +
CDS
ATGCCCTTAACCCGTATTGATTCTGCGTTCCTTGACCTAGATGCAATAGGTGGGATAGATTTTGATGTGCAGTCAGGAGTCCCGACGTTTAGTGTTGATGCTGTAAACCACCGAGTTGGTATTGGTACTGATAGTCCGACAACAAAATTAGAAGTCATTGGAGATATAACGGTATCAAAGCAAAATGCATTTATAGAATTAAAAGACCCAGACACGGCTGATGCAAACTACCGACTAAGAAACCAGGGCGGATCATTTAGTATTTACGACGTTACTAACAATCAAGTAAAAATCGCTGCTACAGCTGGGTATGTAACAATCTATCCCAATCTAAATGCCAATAACGGCCTAGATGTGATGGGAACAATTACCGGAGATGGCAATTTAGACATTGCTGATGGCATAAGACATTACGGAGATACTAATACTTCTATTAGTTTTCCTGCCGCTGATACAATTACGGCAGAAACAGGTGGTACTGAAAGACTTCGTATAACTTCTGGTGGTAATATTGGTATTAATAATACTACTCCAGATACAGTTTTAGACGTCAATAGCGACGGAACTGCTGGAATTATTCAACTCACTGGAGCAAGACCCTCTGATAGTAACAATGCTTTTTTCTCAGGTAGATCATCAAGAGGAACTATTGCTTCACCTACAACCCTTGTAACAAATGATATTATTGCAACTTTTCAGGGTAAGGCACATGATGGATCAAATTACTTACAAGCAGGAAGAGTAAGGTTTGGTGTTGATAGTATTTCTACTGGAAATTTAAGTTCAAACCTACAGTTCATGCTCTCCAATAATGGAGAATTTGAAGCACTTCGTATAACTTCTGATGGTGATGTAGGAATCGGAGTTGCTGACCCAGATGTGTATAGTCTTGGTGGCAATAATAGATATGCTGCTATAAAAGCATCTGCTGGATATACAGTATTGAATTTGGTTGATTCAAATAATTCTGGATCATACTTACAATTTGGAAACTCTTCAGTTAGAAGAGGATCTTTACAATTTTTGAGTAATTCTGACTTTGTTATTACCTCCAATGCAAGTAATAGTGGAACAACTCTCACAGAAAGACTTCGTATAAAATCTGCTGGTAGAATTGGTATCGAGACTGATGATCCAACTGAAAGACTAACTGTTCATGGAACTAACAATGACACCACTCCTATTTTAGGATTAAGATCAGGTAATAGTCAAACTACCATTAATAATGGAGCACAAATTGCCTTTGGATTTAATGGAACAAATCACTATCAGCATTTTATTCATACTAGACATAACGCATCAAATAATAATAATGCAATAGATTTTTATGTTTGTGACGGAACACAGCAAAATACTGTAACTTCTGGTTCTATCCATACATTAAGTATGGTATCTGGAAAAGTTGGTATCGGAGTCACAAATCCACAAGGAACTGTACACATTTCATCAGGAACTTCTGGAGATGCAACGTTAATTCTTGAAGCAGACACTGACAATAGTAACGATGCGGATAATCCATATATTGTGTTTAGGCAAGATGGTGGTGTTAATGCCTCTGCAATAGGACATGGTGTGAATTCTGGAGTTGATGGTAATGTGCTTACCATAGCAAATTCAATTAGTAATGGTTCTATAACTTTTGCAACAGGAGCTACTAATGGTTATGCAAACGCGACAGAAAGACTTCGTATAAATTCTGATGGTAAGATAAATGTAGGTGGATCAGCTGGGGCGGTTGGAACTAAATTTAACATTCTCAATGGAAGTGATAATCAAAATATACTTGGAATTACTGGTGCAGATGAATCTAGTGAATATGCAGCAATTGGAGTTAGTGGAGGTAATGCTGTATTTACTGGTGGAGGAGCTGGCACAACAAGTACAGGTATAATTTTTAGAACTGCTGCAAGTGGCGCAGAAACTGAAAGAGTTCGTATAACTTCTGATGGTTCAGTTGGTATCGGAACTGTAAGTGCCGAACATCAACTTACTGTTTTTAATAATGGATATACTGGAGTTACTATTAAATCAAGTAGAACAAATGCCACAAGTAACATTGGTGGACTTGATTTTAAAACTCAAAACACAACTGTTGCCCGTATTCAATCTTTTGTTGATGGATCAATTAGATTTAGAAATACCTCATCCTTACTAGACAGACTTCGTATAACTCCTACTGGTAATGTTGGCATTGGAGTTATTGATCCAGAATGTAAACTTCAAGTTGGGGGTGATTTACAAGTAGGAGATTCTAATAATCCAGGCACATTTATTAACGTGGTTGGTGCTGGTGTAGGTCAGAATTTTGGGATTAGATTTGGTGGTGGTTCTAATAACCCAGAATCAAAGTTTTCAATCTTGGGTAATACCAATGATGGTCATATGCGATTTAGATTTGGTGGAACAGAAAAGTTCCGTATCAGATCTGATGGTAAGTTTGGATTTGGAACTGGTGGGAATATAGATGAAAGGGGACACATAGAAACTGCTAGTGGAAATTGTAGATTAAAATTACAAACTGGAAATACTGCCGTTGCTGGTTTTGTTCTTCAAACTTCTGCTAAAAGATTTGATATCCAGGCACAAAATAATTTCTTCCAACTTTATGATAGTACTGTAGGTACAGATAGGATTCGTATAGATTCCGATGGTGATGTGGGTGTCGGAATTGCTGATCCACAAGAAAGGTTACATGTGGCAAGAATTGTCATGATAACCGGCAATACGCCACAAATCAGACTAAATGCTAATGATTCTGATGCATCTGATGGTGATAGAACGATGCTCGGGCAGGCAACAGGTAATGGTAATTTTGTAACCACTGCTGTTGATAATGATACCATTCTACGAGGAACTTCAACTGGTAATTTATTATTTGGTGTTGGTACATCAGAAAAATTCCGTATAACCTCTTCTGGTAATGTTGGCATTGGGACTAACAATCCTGCTTCAAAGCTTTCAAACTCCGCAACAGCAGTTAGTGATGGAACCCAGAGTGTAGGTTCAAATGGATTAAACTGGAAAACTTCGAACTCAAATGCGTATATCGCTGGCTTCGAAAACCAGTCTACTGGTAACGGGGCTCTGTTCCGGGTTGGTGATGATAATTCCGCCCGAAAGATCCTACATGCAATGAACGGATCTGGGTCTACTGTATTTCTAGCTAGAGGTGACGGCAACGTTGGCCTTGGTACAAACAGCCCAGGAGGAAAACTGCATGTCGAATCAGCGGCAACTACGGCCGGTTGGCAAATAAGAACAGATAGCGTTGGCTTAAGCAATGAAAGTGGATTCTATCGCGATGCCTCTGATCACTACGAGGTGGTAATCAGAAACGGCCTTGGTGGTCTTTCGTATGTTAAAAACGACGGCGGGGCTTCTACTGCAAATCTTAGATTCAACGTACAGGGAGGCGAGCGTCTTACCATACTTTCCAGTGGTAACGTTGGCATTGGTACTAACAACCCCGTCTATCCTCTTCATGTTCAAGAATCGGCTTATTTCCGCAGAGGTATACAAGTAGCAGTACTCTCTTCAAATGAACTTCAGAGTAGGTCTCCGATCAACTCTGGTTTTTATAACGTAGACAATACTACAACTGCAAACGGGTGGCCATTTACCGGTTGGGCACATCTCCTTGCAAACACACATAGCAACACCACCAACTACTACTCCCAGCAATTTGCCAGCAGCTTCTATAACCAAGAGCTATACTTCCGTAACACTAACAACGGTAGCACAACAACCACCCAGTCCTGGGGTCAGGTGATGCATACCAACTCCGCCCTAAAGCCTGTGTTTGCCGAATCTAGTGGTGTTACAGACGCATATAGCAGATATTGGTACCCTGGTGGTGAGTATTATGTTTCTGTTCATGGCATCACCGCCCCTGGCGATGCAAACAATATGATTGAGCAAGGCTACTATCACATTGCAAATAACACTTCCAACAACCCGACCTCCGCCTACGGATATTTAAATGTCCATCGGCATGCCGGATCTCAATACTCTCTCCAGCATTTTATTGTGAGCTCAGACACTGGTAGGCAGTGGATGAGAGCTTCGTATCCTGACGGCAGCCAATCAAGCGGAAGAAACTGGTACCAATGGTATAGCTACGGAGCCCTTGAAAGGGAAAACACATTCACAAACCGCCAGCACATCATCGGCCCCTCTTCTACATCTACATTTACAGGACTTCATCCCAATACAAGTAATAATAGGGCTCAGTTTGTTCTGCATAGCAACTACTCTGATTTGGTTATCTCGTCTTCACAAAACAATAATAACCACGGAAGTACCTTATCGTTTGTAACACAAAATCCTTCTAATACTGCAGATTATAATAAGTTTGTTATTAACAAAGGAAATTATGGCACAAGAAATCAATTCTTAGAATTTGGATTTATTGACAACGAGTACACCAACCCTCATGACTACGTTAATAGTACTAACACTGCGGTAACTATCGACGGTAATAACAAACGGTTGGGTATTGGGCCCGGTGCACGAACTCCGGGATATCCATTAGACGTTCGTTTTGCTGGAGACTCTGGAATCCACGCCTCTAGTAGCAACTCTCACTGTTCTTTATTTTTAAATGCTTCAACAGGAAACGGTAGCTACATTAGAATGTCGGCCGGTGGAAATCAAAAATTCTGGATTGCCACAGACGGCAGCGGCCATTTAAACTTCAGACCAAATGCCGGAGGTACAACTATAAGAATGCAAAACGGCGGAAAACTTGATGCATTCGCAGGGATTTATGTGTCCGGCGCGTCGCTAACGCTTGCAAATACTGAGCTAGACTTTACTACCGCAAACCATAAGTACATTGACTTCTACACCAATAACGGCAACACGGTGAACTTTAGAATGCCGAATAATTCTAACGTTTTCCACACTGGTATACAAATGGTTAAAGCCGGAGCAGTAAATCTTTACCATAATAACACCGTTAAATTCTACACCACTAGCACCGGAACTTTCACTAACGGCAT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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
726107dedd48422797ae6e691c40b2efee0a254e48bd09dced5a566b4a691fa2
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5217
Evidence 0,5217
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Literature

No literature entries available.