Protein

Genbank accession
AXF40808.1 [GenBank]
Protein name
long distal tail fiber subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,65
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MALDPNINRIKFLRSSTAGAKPTTAAIQPGEIAINLADRTLYSTDGNAIIDIGFGLGGSVNGPINATGQISTNDFLYSKYGFSVNSETADGRGISLYGNGYTASNGLPSYGLAMAATSKYGTFGAVSGSHATYLTTNSGTDRGWIFNYNGTTNVASISGTGIATFARVDAPLNGNANTATKLQSARNINGVLFDGTSDINTPAITDVVSFDNRTVKPSDVRNKAMGVYFTSKAGLNGAADTNYGDFLSLSTYQDGTGGKVNGLYFNKLSREILHYQTDLNSNSWGTPKTIAYTDSSITGNAASATRLQTARTINGTAFDGTANINVNATYSEFIPDGANLNDYKTPGLYYCPTDAGAATQLNLPFSNAYSLFVERHAGIKQTITQYATNKTFIRKFYNGYWDNWRQLAFLDPSDQKFTENITLEKASSDVAINIKTTTDNTSELVLSNRNKTASVSLVSDGTFLLWDSNRQTSFMSFTPNGVQSTLNSKLLINTPASLNVTGGETFAVTGGESSPIRFKINRGGAITTNSPVTGVSSIPHAISFNWYNTEWQIGNVRDGSTGTVGFGITKFNDTLVWRHDGNTMTNYGNISNTGSISTQGDISSNGNLRTAGSISTQGDISSNGNLTTAGSISGDSLITRTGRIGAPTSTYHYLDIGRDGTDITTVGQYGGAFRVVDTAIGKNTFSVDQNTAIFAGRIVTKPGAFYQNITDLGNSTAAITVPVVTAPQNTTGYVPFIHGSVQTNGHGYRTNVSIGAFRGSNTWSASGAYIAIGGNDNHTTEDFRFMSGGYIGTSSGTLNILGTLVAPTVNSNTFNVDAINSTSVNVASNIYFSTAFGINGIYNGNGDGATLATANLDIRAHYGLGILDNLGNRNIVFNSRTGEIGTRGVQIYLGNTTSAETRLLTNDSHLQFLKSGGQAKGIATGGVLTSDSYADFNKVPTNGIYSKGDIKTAVWMYASKFTGPTGSGDGMFDGNANTATRLQTARSFQITGGITTNAVSFDGQQNVTLTASNVDGSKVTGKVPAAAQADNATNATKANTLDIAGQKEAKLVATWTGGVYVGYSQTAKYYSPTQIQIELSSGTVVQDRISQIKVGSLLHGVFAGSTGWSNGLSTGRIVQVTTNRVSGVIDAIVEIPHSISRGNVTSFNVLAVTYNSSNCSFIGNIAAYAKQDLGANSGWSWLLRTSTAINNPSVSISTSGDTANIDARLDLGWFLSGKNPTAGSATMINSNTCNFIVSDNNNDTASSCGYISIQIWDVV
Physico‐chemical
properties
protein length:1259 AA
molecular weight: 132476,32830 Da
isoelectric point:6,90153
aromaticity:0,09055
hydropathy:-0,20794

Domains

Domains [InterPro]
cd19958
334–408
cd19958 IPR005601
AXF40808.1
1 1259
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage vB_ApiM_fHyAci03
[NCBI] 		2269366 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXF40808.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH460829 [NCBI]
CDS location
range 156202 -> 159981
strand +
CDS
ATGGCATTAGATCCAAATATTAACAGAATTAAATTTTTACGATCTTCTACTGCTGGAGCTAAACCTACTACTGCAGCGATTCAACCAGGCGAAATTGCTATCAATTTGGCAGATAGAACTCTTTACTCAACCGATGGTAATGCTATTATTGATATCGGTTTTGGTTTGGGTGGAAGTGTCAATGGGCCAATAAATGCAACAGGACAAATCAGTACCAATGACTTTTTATATTCAAAGTACGGATTTTCTGTAAATTCAGAAACTGCAGATGGCCGCGGTATTTCTCTTTACGGAAATGGATATACCGCATCAAACGGTCTGCCGTCATACGGTCTTGCGATGGCTGCTACAAGTAAATATGGTACATTTGGTGCTGTGTCAGGTTCGCACGCAACTTACCTTACTACAAACTCAGGTACTGACCGTGGTTGGATTTTTAACTATAACGGAACTACCAATGTAGCTTCAATTTCGGGAACTGGCATTGCGACATTTGCTCGTGTAGATGCTCCGTTAAACGGTAATGCTAATACAGCAACTAAACTTCAATCAGCTAGAAACATTAATGGCGTGTTGTTTGACGGCACATCGGATATTAATACACCAGCTATAACTGACGTCGTTTCATTTGATAATAGAACTGTTAAACCTTCTGATGTTAGAAATAAAGCCATGGGTGTTTATTTTACTTCAAAAGCAGGTTTAAATGGCGCGGCTGATACCAATTATGGTGATTTTTTATCTCTAAGCACTTATCAAGATGGCACTGGAGGAAAGGTAAACGGTTTATATTTCAATAAATTATCTCGAGAAATATTACATTACCAGACAGATTTAAATTCAAATTCGTGGGGAACTCCGAAAACGATTGCGTATACAGATAGTTCTATTACCGGCAATGCTGCATCAGCAACACGCTTACAGACAGCAAGAACTATCAATGGTACTGCATTTGATGGTACTGCGAATATCAATGTCAATGCTACATATTCGGAATTTATTCCTGATGGTGCGAATTTAAATGATTATAAAACTCCAGGGCTATATTATTGTCCTACTGATGCTGGTGCAGCGACTCAATTAAATTTACCGTTTAGTAATGCGTATTCGTTGTTTGTTGAGAGACATGCTGGAATTAAACAGACTATTACCCAATATGCGACAAATAAAACTTTTATTCGTAAATTTTATAATGGTTATTGGGATAATTGGCGTCAATTAGCTTTCTTAGACCCAAGTGATCAGAAATTTACAGAAAATATCACTTTGGAAAAAGCTTCTTCTGACGTAGCAATCAACATTAAAACTACTACTGATAATACTTCTGAACTTGTTTTAAGCAATAGAAATAAAACAGCGTCTGTAAGTCTTGTATCAGACGGTACTTTTTTATTATGGGATTCAAATAGACAAACATCATTCATGTCATTTACACCAAATGGTGTACAATCGACATTAAATTCTAAGTTGTTGATTAATACTCCAGCATCGCTAAATGTTACAGGCGGAGAAACATTTGCTGTTACGGGTGGAGAAAGTTCTCCAATCAGATTTAAAATTAACCGCGGTGGGGCAATCACTACTAACTCGCCTGTTACTGGTGTTTCTTCTATTCCCCATGCTATATCATTTAACTGGTATAATACAGAATGGCAAATAGGTAACGTTCGTGATGGTTCTACCGGTACCGTTGGTTTTGGTATTACTAAATTCAACGATACGTTAGTATGGCGCCATGATGGTAATACTATGACCAACTACGGTAATATTAGTAATACGGGTTCGATCAGTACACAAGGAGATATTTCATCTAATGGTAACTTGCGTACTGCAGGTTCGATCAGTACACAAGGAGATATTTCATCTAATGGTAACTTAACTACCGCAGGTTCAATCAGCGGAGATAGTTTAATCACTAGAACTGGTCGTATCGGTGCGCCAACATCTACGTATCACTATCTCGATATCGGTAGAGATGGTACAGATATTACTACGGTCGGTCAATATGGGGGTGCATTTAGAGTTGTTGATACAGCTATCGGCAAAAATACATTCAGCGTTGACCAAAATACAGCTATTTTCGCTGGAAGAATTGTCACAAAGCCTGGTGCATTTTATCAAAATATAACAGACTTGGGTAATTCTACTGCAGCTATTACAGTTCCAGTTGTGACGGCTCCACAAAATACTACAGGATATGTTCCGTTCATTCATGGATCAGTTCAAACGAATGGCCATGGTTATAGAACTAACGTATCTATTGGTGCTTTTAGAGGTTCTAATACTTGGTCAGCTTCAGGTGCTTATATTGCTATCGGAGGAAACGATAACCATACGACAGAAGATTTTAGATTTATGTCTGGTGGTTATATTGGAACAAGTAGCGGCACATTGAATATTTTAGGCACTTTGGTTGCACCTACAGTAAATAGTAATACTTTTAATGTTGATGCCATCAACAGCACATCTGTAAATGTGGCTTCCAATATTTATTTTTCTACTGCTTTTGGCATAAACGGAATCTACAATGGTAATGGCGATGGAGCTACTTTAGCTACTGCTAACTTAGATATCAGAGCGCATTACGGTTTGGGTATTCTTGATAACTTGGGTAATCGCAATATTGTCTTTAATTCAAGAACTGGTGAAATTGGAACAAGAGGCGTACAGATTTACTTAGGTAACACTACAAGTGCGGAAACTAGATTATTAACAAATGATAGTCATTTGCAGTTTCTTAAATCAGGCGGCCAAGCTAAAGGTATTGCTACTGGTGGCGTGTTAACTTCAGATTCGTACGCTGATTTTAATAAGGTTCCGACAAATGGCATCTACTCAAAAGGTGATATTAAAACTGCCGTATGGATGTATGCATCTAAATTCACCGGTCCTACTGGATCAGGTGATGGTATGTTTGACGGTAATGCCAATACAGCAACTCGTTTGCAAACTGCAAGATCTTTCCAAATTACTGGTGGCATCACAACAAATGCAGTATCATTTGACGGGCAACAAAACGTTACATTGACTGCATCTAACGTCGATGGTTCAAAAGTTACAGGCAAAGTTCCTGCAGCCGCACAAGCAGATAATGCAACAAATGCTACTAAGGCAAACACATTAGATATTGCAGGGCAAAAGGAGGCCAAATTAGTTGCGACTTGGACTGGTGGAGTTTATGTTGGATATTCACAGACAGCAAAATATTATTCACCTACTCAAATTCAGATTGAACTTAGCTCGGGTACAGTAGTACAAGATCGAATTTCCCAAATTAAAGTAGGATCTTTATTACACGGTGTGTTTGCTGGTTCTACCGGGTGGTCTAATGGATTGTCTACCGGAAGAATAGTACAAGTAACAACTAATCGAGTATCCGGTGTTATTGATGCTATTGTTGAAATTCCTCATTCTATTTCCCGGGGTAATGTGACTTCGTTTAATGTTTTAGCTGTGACATATAACTCATCTAATTGTAGTTTTATTGGTAATATTGCAGCATACGCCAAACAAGACCTAGGAGCAAATTCAGGTTGGTCTTGGTTATTACGTACATCTACTGCTATAAACAATCCATCTGTATCAATAAGTACCTCTGGTGATACTGCAAATATAGATGCTCGCCTTGATTTAGGTTGGTTCTTATCAGGTAAAAATCCAACAGCTGGTTCTGCAACTATGATTAACTCGAACACATGTAATTTTATTGTGTCAGATAATAATAATGATACGGCATCAAGTTGTGGTTATATATCAATACAAATTTGGGATGTTGTATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
cd36cacae72236e74ed63551fc500d9a29813b198c7848539efaa9a86704eee1
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4697
Evidence 0,4697
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization of vB_ApiM_fHyAci03, a novel lytic bacteriophage that infects clinical Acinetobacter strains Pulkkinen,E., Wicklund,A., Oduor,J.M.O., Skurnik,M. and Kiljunen,S. 2019 — GenBank