Protein
View in Explore- Genbank accession
- XXQ04518.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MSEEYPNKINSFVPKTNATYDGDPNGDYVMAEDINELQDGIISIEQALGVMPQGNHATVKDRMDSLDGYGMLQSPSVFFYLGTYANLNNLSDANKIAYLQKFKHIVLPTDIPDAIISNLTASSNLYGYIDASTTSSSLTIGEIRQRIRTFREKGINGIYVDNMGYDHEVSRRRQRDILDAIHELGMRAIVYATYMEDVMEATYHASMNEDALTTGMKLGDILHLRGFGVNTLSSFLLPEFLDKMDKVLSYRKTYHIQVMGTSLIDSSKTTDASTKLFQYAHQLAVLYGINMFGTTVENNGVSVNEHKWYPYSLVMGTWKSEAPIVLRNNDVLSREMEIGKLSINTTSQTWQYEGSKIPVSHIDIPPSSISGNIIQNNSIDDIKIKSYNGQRLLQAINADPSSEKLDIKKLATLNYTDLEGVVSVDALSANVIHAINAYIGTAVIDQAFIGDLHAEKITAGTIDADRITASVIKAINIAADHAEIGNAYIHGAVIDQLNATSIKAGDIDADRIKANIIEAINFEAQAANIKNLNADNITTGNLSAERIQAAVVNAINLYAESAVIDKAVIKDAAIGNLNATKITAGDINAERMKANVVEAMNIYAENMNADSAKINTAVIGELDAKHIQANVIEAIHIATGVISADLGKIDGAVIKEGTIDSVQIADASITDAKIVSLTANKIKAGQIDTGLVTVQGPDGLLKIKSNRLQVFDRSQVPVERVSIGDVNGDGTQYGFRVRGADGQTVLYDEKGVYNEGITDGAITNPKIGDGEVDGRIIAAESVLAKHIVAETITGDKIKAQEINANHIQVGTITAGSAIIAEGAISNAQIGNLDATKITSGIIDAARIRVGKTTTFEDGYNPNLINLGLRDDLNLAGPLPTAITMGDFGFKAESAKGNVVISGDGMKITNGFLEIVGGLTEAQLAQAVKDKWNKTVTDIADMSKDNILTPSERKEIKDSLTFLLGAAPSGNTLPAITAIDSGTVGEIYHVRLQARQAKLGDSNADYKAVETKYVALKGYLETLSPRPWDNANANNLTIVKTDWDLKWRELYDSMDKLLSTTAKTINDNADNSIKPAQDYNGVKIDTANGVVITSSKNKTTLNATKGIEILRTSDSAVVFGVDSSTGNLTITGNINMQGGSISWDKVTGNGPDYSKITGTKPPTDATNTYKELTGNDDIKGMFIKNGNKLEIRADSITTGTMDAAKVKIINLDAGTINAGNLNVSAQQLLHETAYDFGTPKYWTASAPGLGGTWTVDVTKKFFTTNSIKVSVTGQAADIWWGVFSEFTPVSPGEQFTLSANSFVEDRTLLDQGANLEIEWYNATTRIGTSTKSFVPPTNNTWSYVTVTGTAPANAVKARARFYVVRNGTIWGSRPMLQRGSVATQWQLHTDEDISVGAITADKIAAGSISAEHMTVAAREVGLTGHYYRGKNFENYAGQKIDPVISFDWGTGGPGIIAPTVDNFSIRWQGYLFAKQTGNYTIIAQADDGVKVTLNNTVIIDSPVYQTADRTATVTLEANTWNAISIEYIEGTGGARMNMQWRPPWETSNKNIPADVFRPGVTVFDGTTITTGKIKADLIQIGPDNIFNEGYDPSASFKNLQDPFFERSIMLYSSISEDESPPSLAGQAGFQQISGAGANGGSALELNGNKIVFSKNAIPVDTNKTYRMTFRVKQKVTNGNNINKVFAGVATLDGKYKNLTGGQGAHRYFAADGPTLKVTDGWQTFTGLITGIGDTHKTFRAGTVYVRPMFIVNYGGDTAGVAQVDMLTFEDVTTEVNSKNYVVETANRLSTKGLMSTVENVGGVEKFFFHGYDDLGNPDKTKDGYLIVNGARMGVTKGYLTTGGATGYIMYDGSNSKWYVASMDASKVWKKFNVGETGHNTTFTPNGNLYFVGYLN
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1894 AA molecular weight: 204435,21970 Da isoelectric point: 5,25865 aromaticity: 0,07709 hydropathy: -0,21732
Domains
Domains [InterPro]
DC_0904
STR
5–597
STR
5–597
DC_2138
STR
550–755
STR
550–755
G3DSA:2.60.120.260
STR
1221–1371
STR
1221–1371
SSF56988
STR
1420–1559
STR
1420–1559
IPR011658
RBD
1420–1548
RBD
1420–1548
1
1894
Architecture
STR 5-1386 | STR 1408-1573 | STR 1620-1779 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Bacillus phage Edson [NCBI] |
3442624 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Bacillus cereus [NCBI] |
1396 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XXQ04518.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV796108
[NCBI]
CDS location
range 60013 -> 65697
strand -
strand -
CDS
ATGTCAGAAGAGTATCCAAATAAAATAAATTCATTTGTACCTAAAACCAACGCAACATATGATGGAGACCCGAACGGTGATTACGTAATGGCTGAAGACATCAATGAGTTGCAAGATGGGATTATATCCATTGAACAAGCTCTTGGTGTCATGCCACAAGGAAATCATGCAACAGTAAAAGATAGAATGGACTCATTAGATGGATATGGTATGTTGCAATCACCATCCGTGTTCTTCTATCTTGGAACATATGCAAATCTGAATAACTTATCGGATGCGAATAAGATTGCATACCTCCAGAAGTTCAAGCACATTGTATTGCCGACGGATATACCTGATGCGATTATTTCTAATCTGACTGCATCTTCGAATCTATATGGATACATTGATGCCAGCACAACTTCATCTAGTTTAACGATTGGTGAGATTCGCCAACGTATTCGTACCTTTAGAGAAAAAGGTATTAACGGCATCTACGTAGACAACATGGGATATGACCATGAAGTTTCAAGACGAAGACAACGAGATATATTAGATGCAATTCATGAACTTGGAATGAGAGCCATTGTTTATGCTACTTACATGGAAGATGTTATGGAAGCTACTTACCATGCTTCGATGAATGAAGATGCATTAACAACAGGAATGAAGCTAGGCGACATTCTTCATCTGAGAGGGTTCGGTGTAAATACACTATCCTCTTTCCTTCTTCCAGAATTCCTAGATAAGATGGATAAGGTACTATCTTACCGCAAGACTTATCACATCCAAGTAATGGGAACCTCTTTAATTGACTCCTCTAAAACTACTGATGCTTCTACAAAACTATTCCAGTATGCACATCAATTAGCAGTCTTATATGGAATCAACATGTTTGGTACGACTGTCGAAAACAACGGTGTTAGTGTTAACGAACATAAATGGTATCCATATAGTTTGGTTATGGGTACATGGAAAAGTGAAGCACCTATTGTTCTTCGAAACAACGATGTACTTAGCAGAGAAATGGAAATCGGAAAGCTCTCTATTAATACGACAAGTCAAACTTGGCAGTATGAAGGTTCTAAGATTCCTGTCTCCCACATAGATATTCCTCCATCCTCTATTTCTGGAAACATCATTCAAAACAATTCCATTGATGATATCAAAATAAAATCCTATAACGGACAGCGATTACTACAAGCTATTAATGCTGACCCAAGTAGCGAGAAGTTAGATATTAAAAAACTAGCTACTCTTAACTATACTGATCTTGAAGGAGTAGTATCTGTTGATGCTTTAAGTGCAAACGTAATCCATGCCATTAATGCCTATATCGGCACAGCTGTTATTGACCAGGCTTTCATTGGTGATTTACATGCAGAGAAGATTACGGCAGGTACAATTGATGCTGACCGTATTACTGCAAGTGTTATCAAGGCTATTAATATAGCAGCAGACCACGCTGAAATTGGAAATGCATATATTCATGGTGCAGTCATTGACCAGTTAAATGCGACAAGTATTAAAGCTGGAGATATTGATGCAGACCGTATCAAGGCTAACATCATTGAAGCAATCAACTTTGAAGCGCAAGCAGCGAACATCAAAAACTTAAATGCCGATAACATTACGACAGGTAACTTGTCAGCAGAACGTATTCAAGCGGCAGTAGTTAACGCAATTAACTTATACGCTGAGAGTGCAGTTATTGATAAGGCTGTAATCAAAGATGCGGCTATCGGAAATTTAAATGCTACGAAAATTACTGCTGGTGATATTAATGCCGAACGTATGAAGGCAAATGTTGTTGAAGCAATGAACATCTATGCTGAAAACATGAATGCAGATTCCGCTAAAATCAATACAGCTGTTATTGGTGAATTGGATGCAAAACATATTCAAGCTAATGTTATTGAAGCTATCCACATTGCTACTGGTGTTATCTCTGCTGACTTAGGTAAAATTGATGGCGCTGTTATTAAAGAAGGTACTATCGACTCTGTACAGATTGCTGATGCTAGTATCACGGATGCGAAGATTGTTAGCTTAACTGCAAATAAAATTAAAGCTGGTCAGATTGATACAGGTTTAGTTACTGTTCAAGGTCCAGATGGGTTACTAAAGATTAAGTCTAATAGATTGCAAGTATTCGATAGAAGCCAAGTTCCTGTTGAACGTGTATCTATTGGTGATGTAAATGGTGATGGTACGCAATACGGTTTCCGTGTTCGTGGTGCAGATGGACAAACCGTTCTCTATGATGAAAAGGGTGTATACAACGAAGGTATCACTGATGGAGCTATTACGAATCCTAAGATTGGTGATGGTGAAGTAGACGGACGTATTATCGCTGCTGAATCTGTACTAGCTAAACATATCGTCGCTGAAACAATTACTGGTGATAAGATTAAAGCACAGGAGATTAATGCAAACCATATCCAAGTAGGTACAATTACTGCTGGTAGTGCAATCATTGCAGAAGGTGCTATCTCTAATGCTCAAATTGGAAACCTAGATGCAACTAAGATTACATCGGGTATTATTGATGCAGCTCGTATCCGTGTTGGTAAAACAACAACTTTTGAAGATGGATATAATCCTAACTTAATTAACTTAGGTTTACGAGATGACTTGAATCTGGCTGGCCCACTTCCTACTGCTATTACAATGGGTGACTTTGGTTTCAAAGCTGAGTCAGCTAAAGGTAATGTAGTAATTAGTGGCGACGGTATGAAAATCACAAATGGTTTCTTAGAAATCGTAGGCGGATTAACAGAAGCTCAACTTGCTCAAGCAGTAAAAGACAAGTGGAACAAAACTGTTACTGACATAGCTGATATGTCTAAAGACAACATCCTAACTCCTTCAGAAAGAAAAGAGATTAAAGACTCATTAACATTCCTTCTAGGTGCAGCTCCTTCTGGAAATACTCTTCCTGCAATCACTGCTATTGATTCTGGTACTGTCGGTGAAATATACCACGTTCGTTTACAAGCAAGGCAAGCGAAGCTAGGAGATAGCAATGCAGACTACAAAGCAGTAGAGACAAAGTATGTAGCTTTAAAAGGATACCTTGAAACTCTTTCTCCTCGTCCTTGGGATAATGCAAATGCAAACAACCTCACAATTGTTAAAACAGATTGGGATTTAAAATGGAGAGAACTATACGACAGTATGGATAAACTCCTTTCTACAACTGCTAAAACAATTAATGACAATGCTGATAATAGTATTAAGCCAGCACAAGATTATAATGGTGTGAAGATTGATACTGCGAATGGTGTTGTAATCACAAGCTCGAAAAACAAAACAACACTGAATGCTACAAAAGGTATCGAGATTCTAAGAACATCTGATAGTGCTGTTGTCTTTGGTGTAGATAGCTCAACAGGTAACTTAACTATCACTGGTAATATTAACATGCAAGGTGGTAGCATCTCATGGGATAAGGTTACTGGTAACGGTCCTGACTATTCTAAGATCACTGGGACAAAGCCTCCAACTGATGCAACTAATACCTATAAAGAATTAACAGGTAATGACGACATTAAAGGTATGTTCATTAAGAATGGTAACAAGCTTGAGATTCGAGCTGACTCTATTACTACTGGAACAATGGATGCGGCTAAAGTAAAAATCATTAACTTAGATGCTGGTACGATTAATGCAGGTAACTTAAATGTTTCTGCTCAACAGTTATTACATGAAACAGCGTATGATTTCGGTACTCCTAAATACTGGACTGCTTCTGCACCTGGTCTTGGTGGAACTTGGACTGTTGATGTAACGAAGAAGTTCTTTACTACAAACAGTATCAAGGTAAGCGTAACAGGGCAAGCAGCAGATATTTGGTGGGGAGTGTTCTCTGAATTTACTCCAGTTAGTCCAGGAGAGCAATTCACTTTATCTGCTAACTCATTCGTAGAAGATAGAACATTACTAGACCAAGGTGCAAACCTAGAAATTGAATGGTACAATGCAACAACTCGTATCGGAACTTCAACAAAGTCATTCGTACCTCCTACGAATAATACTTGGAGTTACGTCACTGTTACAGGTACTGCACCTGCTAATGCTGTGAAAGCTAGAGCAAGATTCTATGTTGTACGTAATGGTACAATCTGGGGTTCTCGTCCTATGCTTCAACGAGGTAGTGTAGCGACTCAGTGGCAACTTCATACTGATGAGGACATTTCAGTTGGTGCAATTACAGCTGATAAGATTGCGGCTGGAAGTATCTCTGCTGAACATATGACTGTAGCAGCTCGTGAAGTTGGTTTAACTGGTCATTACTACAGAGGTAAAAACTTCGAAAACTATGCTGGTCAAAAGATTGACCCTGTAATCTCATTTGATTGGGGAACAGGTGGACCAGGAATCATTGCTCCTACTGTAGATAATTTCTCTATTCGTTGGCAAGGATATCTATTCGCTAAACAAACAGGTAACTACACAATCATTGCTCAAGCTGATGATGGTGTAAAAGTCACTTTGAATAACACAGTAATTATAGATAGCCCAGTGTATCAAACAGCTGATAGAACAGCTACTGTTACGTTAGAAGCAAATACATGGAATGCAATCTCTATTGAGTATATCGAAGGTACTGGCGGAGCAAGAATGAATATGCAATGGCGTCCACCTTGGGAAACTTCTAATAAGAATATCCCAGCTGATGTATTCCGACCTGGCGTAACGGTCTTTGATGGAACTACGATTACTACTGGTAAAATCAAAGCGGACTTAATCCAGATTGGTCCCGACAATATCTTCAACGAAGGATATGACCCTAGTGCATCATTCAAGAATTTGCAAGACCCATTCTTCGAACGATCAATCATGTTGTACTCTTCCATTTCAGAAGATGAGAGTCCACCATCACTAGCAGGGCAAGCTGGTTTCCAACAGATTAGTGGAGCAGGTGCGAACGGCGGTAGTGCATTAGAACTCAATGGCAACAAGATTGTATTTTCAAAGAATGCTATCCCCGTCGATACGAATAAAACATATCGTATGAC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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
72fb0400903bd364f18876869d1d182442d2e6b5f6ffe7cb89a05833a9dd6dd1
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Characterization of a new Bacillus phage | Lone,A., Kropinski,A.M. and Anany,H. | 2020-07-22 | — | GenBank |