Protein

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Genbank accession
YP_004323242.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANSNPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDADGNFSAGTITSTVIGNSSTASRLASSRQIQLSNEVTASGVFDGSQNLNLSAELALVSTLPHYDGTSSPSATYNKVTVDAKGRVTNAQDFTASNNGTLADYGLDGTNEGTSAQPYDLDLVALAGLTTTGMISRTASNTVATRAITGTATRISVSEGAGISGNPTIDMITTAVTAGNYNTESLTSVSGAGGNGEPFGTATVNATKFTVDAYGRLTSATNVPIATAAEGSKYASYNAGTTYVRYDIIANASKVYQAITGIAAGAGAPTHSSGDSGGWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIATAGVDNTQLQNNKLIFTDGNAVENFELDNELTTSTANTGFNKLNFIKINNTSGGLLFGANNTGDSGAGEIDVNVRSYFSDPDITLDGSVAQTLNKTGDGNLTFTTTQNSSSARSLTVSASNSGSGTSTVTITAEDVVDIDASDSNGKVHVEDSRFQDNYIATSNATMHLDPGDDRATSGLVRVHGDLQVDGTTTTINSTVTTIDDPIITLGGDTAPGSDDNKDRGVEFRYYDNQARIGFFGYDDSYTDLGGHVGGFTFLHNATNTSEVFSGTASGITAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGVGIGDDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNIVFQGASKTLSLNNGSGTTKIQLHTTTGNVEIGGILTNTGAIDANSTLNVASTVRFEDTDEPTVAQNGGTGIYEIQSNDYGAFRFDGGGYVEGDTVFNSDVFINGVLNQRDSATESFGNRNYLNIRYKLRSGSSAAYTPSYASDNTSNLRIFGGAGIQTDLHIGDDLYIGKLNSGDSVSFQVLGESGNTTTQGTLTVEGQTNINDSLIVNASNENFKIQNGSAADKFTVDTDNGNTLIEGTLNVNGVTDIDADFAVRNGTTDKFFVASASGNTQIKGNLTADGHTELNSTLNVDSNTTLGAQLTVTGNSEFNGTVDVDANFAVRSGTTDKMTVASSTGNIATDGTLVVAGQTTINDSLIVQSDNEVVNINNGSGTTKFSIDTDNGNTNIIGTLTVADATQINNTLGVSNVVTLTRNTQQTLTGSYSADGAFKLTGGAGIGKNLAVGEGLRVYGGTELTGALDLNNSADISGALVTHDDVTITADNKMFKVQNASAANKFTVDTDNGNTDIQGTLDVAGDVTASSDLTVTGNLTVNGTTTTVNSTVTTIDDPVITVGGDTAPASNDGKDRGIEFRYYDGSAKIGFFGFDRSSSQFQFLTSATNTSEVLSGTDGALRAGSLNLTGAGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPTTDKINNLNADLLDGATTATAATASTVVLRDSSGDFAANQITAASAAGSGAGFLGNASTADAWKTARTLTISGVVSGFVVIDGSENETLTTTYVDADITALAAMSGTGYVVRTAANTYAQRTLQVTASSGITLTNADGVSGNTTINVASASSNSANNLVLRDGSGNFAAGTITAALTGNVTGNVTGNVTGQVSDISNHDTGDLTEGSNLYYTNERVDDRVNALITAGTGITKVYDDAANTYTLTVTQSDINTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGITHSSGTLSVTQSDINTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGITHSSGTLSVTQSDINTDNITEGSTNLFITNERVDDRVNALTVAGTGVSKTYDDAAGTLTLAVDFSEFNTGNITEGSNLYFTNTRADARADLKVAAATGSNLDLSSKSTSDLSEGTNQYYTEARVQAKLDNAYEQLRAMLTNLATSTTLNLNLSGDPTPGAVVTTGVSVGGGGGFTAGTAVATSGSATGSGLTVDTTVDSDGNITAAAVNAGGSGYLITDTVTVTNPNAGKILTLNLATLSGGTGYSSATGVAVTGGDGSSATVDITASAGAITNVTVNNGGTGFAAGNTITIANANATGVKTLGSISAAGSGYSTGTAIATSASASGSGATLNITSVNASGGITGVAINDDGSGYAASEVLTITNANASGIATVGNIGAADASRTAGTYNLGTSDYGTEASGANATFTVVVDSNGAASITVTDDGSGFIANETITVADAQLGGGGGAALTFDVTAIHGSTATVPVSAIHGNGATVNVATVATNATLTLTDITTMEVGATVTGATSGTTGVITALGTNQITVNTVDGFFKKGEVVSANDVTTLTISSFS
Physico‐chemical
properties
protein length:2236 AA
molecular weight: 226908,34840 Da
isoelectric point:4,21929
aromaticity:0,05590
hydropathy:-0,15309

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–247
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352 DC_1617 DC_0029
YP_004323242.1
1 2236
Architecture
ATT
STR
STR
STR
RBD
RBD
ATT 4-43 | STR 44-247 | STR 342-1065 | STR 1111-1539 | RBD 1721-1995 | RBD 2086-2236
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-RSM4
[NCBI] 		444862 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Thaumasvirus > Thaumasvirus stim4
Host Prochlorococcus marinus str. MIT 9303
[NCBI] 		59922 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_004323242.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_015283 [NCBI]
CDS location
range 95142 -> 101852
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCACAGGAATGGGCGAACTCTAACCCGACTCTTGCACAAGGTGAATTGGGTATCGAACTTGACACGGGTCGTTTTAAGATCGGTGATGGTGTATCTGCATGGAACACCTTAAGGTACGAACGTCCTGTAGAGTCTACATCTAATACTGCAAATACTTTAGTCCAAAGGGATGCTGATGGTAACTTCTCTGCAGGTACCATTACTTCTACTGTTATTGGTAACTCGTCTACTGCGTCTAGACTTGCTTCATCTAGACAAATCCAACTCTCTAATGAGGTTACTGCTTCTGGTGTATTTGATGGTTCTCAAAACTTAAATCTATCTGCTGAATTAGCACTTGTTTCTACTTTACCACATTACGATGGTACATCATCTCCCTCAGCAACTTACAATAAGGTAACTGTTGATGCTAAAGGTAGAGTAACAAACGCACAAGATTTTACTGCTTCTAACAACGGTACTCTTGCTGATTATGGTCTTGATGGAACCAATGAAGGAACATCTGCACAACCATATGATTTAGACTTAGTTGCTTTAGCAGGTTTGACCACTACTGGTATGATCTCTAGAACTGCTTCTAATACTGTAGCAACTAGAGCAATTACTGGAACTGCCACAAGAATCTCTGTAAGTGAGGGTGCAGGTATTTCTGGTAACCCAACTATTGATATGATTACCACTGCTGTTACAGCAGGTAACTATAATACGGAATCCCTGACATCTGTATCTGGTGCAGGTGGAAATGGCGAACCCTTTGGTACCGCTACAGTTAACGCTACTAAGTTTACTGTTGATGCCTATGGTAGATTGACAAGTGCAACAAATGTGCCTATCGCTACTGCTGCAGAAGGTAGTAAGTATGCTAGCTATAATGCAGGTACTACTTACGTTAGATATGACATCATTGCTAACGCATCAAAAGTTTACCAAGCCATCACTGGCATTGCTGCAGGTGCAGGTGCACCTACTCATAGTAGCGGTGACTCTGGCGGGTGGAGATATCTCGCTGCCGAAGCAACAGAGCAGAAGGGATTGGCTAGTTTTGCACAAGAAGATTTCGACGTTGACGCGAACGGGCACGTCACGATCGCCACCGCAGGAGTAGATAATACACAACTACAAAATAATAAACTTATTTTCACAGATGGAAATGCTGTTGAAAATTTTGAATTAGATAACGAACTTACAACTTCTACCGCCAACACTGGTTTTAATAAATTAAACTTTATTAAAATCAATAATACTTCTGGCGGTTTATTATTTGGTGCTAATAATACTGGTGATAGTGGTGCAGGTGAGATCGATGTAAACGTACGTTCTTACTTTAGCGATCCTGATATTACTTTAGATGGTTCAGTTGCACAAACTCTAAACAAAACTGGTGATGGTAATCTTACTTTCACAACTACTCAAAACTCATCATCTGCAAGATCTTTAACAGTTTCAGCATCAAACTCTGGTTCTGGAACTAGCACAGTTACAATTACTGCAGAAGATGTAGTTGATATTGATGCCTCAGATTCAAACGGAAAAGTTCATGTCGAAGATTCTAGATTCCAAGATAACTACATTGCTACGTCTAATGCCACTATGCACCTTGATCCTGGTGATGATCGTGCTACTAGTGGGTTAGTTCGTGTTCATGGAGATTTACAGGTAGATGGTACGACTACGACAATTAATTCAACAGTTACAACAATTGATGATCCCATTATTACTCTTGGTGGCGATACTGCTCCAGGTAGTGATGACAATAAAGATCGTGGAGTTGAATTCAGATACTACGACAATCAAGCAAGAATTGGATTCTTTGGTTACGATGATTCTTACACCGACCTCGGAGGACACGTCGGAGGATTTACATTTTTACACAACGCCACAAATACTTCAGAGGTCTTTAGTGGAACTGCGTCAGGTATAACTGCAGGTAATTTAAAACTTACAACAAATACTAACTCAACATCTAATACTACAGGAGACTTAGTAGTTGCAGGTGGTGTTGGTATTGGAGATGATGTTAATATTGGTGGATTGCTAGATGTCGATGGCACATTCCGTGCTAATAGCACATCTAGATTTGATGATAACATTGTATTCCAAGGTGCTTCTAAGACATTATCATTGAATAATGGTAGTGGCACAACTAAAATACAACTTCACACTACTACAGGTAATGTAGAAATTGGTGGTATCTTAACAAATACTGGTGCTATTGATGCAAACAGCACTTTAAATGTTGCATCCACAGTACGTTTTGAAGACACAGATGAACCAACTGTTGCACAGAATGGTGGAACTGGTATTTATGAAATTCAATCAAATGATTATGGTGCATTTAGATTTGATGGTGGTGGATATGTTGAAGGTGATACAGTATTCAATAGTGATGTTTTTATTAACGGTGTTCTAAACCAAAGAGACAGTGCTACAGAATCATTCGGTAATAGAAACTATCTAAACATCAGATATAAATTACGTTCTGGTTCAAGTGCAGCGTATACTCCTTCATATGCATCTGATAATACTTCTAACTTAAGAATCTTTGGTGGTGCAGGTATTCAAACTGACCTCCATATTGGTGATGATCTTTATATTGGTAAATTAAACTCTGGTGACAGTGTTTCATTCCAAGTATTAGGAGAGTCAGGTAATACAACTACTCAAGGAACATTAACAGTAGAAGGTCAAACAAATATTAATGACTCTCTAATTGTTAATGCTTCTAACGAAAACTTTAAGATTCAAAATGGATCTGCTGCAGATAAATTTACAGTTGATACTGATAATGGTAATACATTAATTGAAGGAACACTTAATGTAAACGGTGTAACTGATATTGACGCAGACTTCGCAGTTAGAAACGGAACGACTGATAAGTTCTTTGTCGCATCTGCCTCAGGTAATACTCAAATTAAAGGCAATCTGACTGCTGATGGTCATACTGAATTAAATTCAACACTTAATGTTGATAGTAATACAACACTTGGTGCACAACTTACAGTAACTGGTAACTCAGAGTTCAACGGAACTGTAGATGTTGATGCAAACTTTGCAGTCAGATCAGGAACTACTGATAAGATGACTGTTGCATCTTCTACAGGTAACATAGCAACTGATGGAACTCTAGTTGTTGCAGGTCAAACAACTATTAATGATTCTCTAATTGTTCAAAGTGATAACGAAGTAGTTAATATAAACAATGGTTCTGGCACAACTAAGTTCAGCATTGATACTGATAACGGTAATACAAATATTATCGGAACATTAACAGTTGCTGATGCTACTCAAATTAATAATACTCTTGGTGTTTCTAACGTTGTAACCTTAACAAGAAACACTCAGCAAACTCTGACTGGATCTTATTCTGCTGATGGTGCATTCAAACTAACTGGTGGTGCAGGTATCGGTAAAAACCTTGCTGTTGGTGAAGGTCTAAGAGTATATGGAGGCACTGAACTTACTGGTGCTCTTGATCTTAATAATAGTGCTGATATATCTGGTGCTTTAGTAACTCATGATGATGTTACTATCACTGCAGATAATAAGATGTTCAAGGTGCAGAATGCTTCTGCAGCGAACAAGTTTACAGTCGATACCGATAATGGTAACACTGATATTCAAGGAACATTGGATGTTGCAGGTGATGTAACTGCATCATCTGACCTTACAGTCACAGGAAATCTTACAGTCAATGGAACAACAACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACAATCGATGACCCTGTTATTACTGTTGGTGGTGATACAGCACCCGCGTCTAATGATGGAAAGGATCGTGGTATTGAATTTCGTTATTATGATGGTTCTGCTAAAATCGGTTTCTTCGGTTTTGATAGATCATCCTCCCAATTCCAATTCTTAACAAGTGCAACAAATACTTCTGAAGTTCTCTCAGGAACAGATGGTGCTCTAAGAGCAGGTAGTTTAAATCTTACTGGTGCGGGCACATCTCTTGATGTTGATGCTAATGCAAACATTGATGGCACACTGACTGTAGATGGTCAGATTATTTCACAAGTATCTTCAGGTCCTGCTCTTGTTATCCCAACAACAGATAAGATTAATAATCTTAACGCAGACTTACTAGATGGTGCTACAACCGCAACTGCTGCAACTGCATCCACAGTTGTTCTTCGTGATTCATCTGGTGATTTTGCTGCCAATCAAATCACTGCTGCTAGTGCTGCAGGATCTGGTGCAGGTTTCTTAGGAAACGCATCCACTGCTGACGCATGGAAGACTGCTAGAACACTCACCATTAGCGGTGTTGTATCTGGTTTTGTAGTCATCGATGGAAGTGAAAATGAAACACTTACAACAACTTATGTTGATGCAGACATCACTGCTCTAGCAGCGATGAGTGGAACTGGTTATGTCGTACGAACTGCTGCTAACACTTATGCCCAAAGAACTCTCCAAGTCACCGCATCGTCTGGAATCACTCTTACTAACGCTGATGGCGTTTCTGGTAATACTACAATTAACGTTGCTAGTGCATCTTCTAATTCTGCAAACAACCTCGTCCTAAGAGACGGATCTGGTAACTTTGCTGCAGGAACTATTACTGCTGCCTTAACTGGTAATGTCACAGGTAATGTAACTGGTAATGTAACTGGTCAGGTATCTGATATCTCAAACCATGATACTGGTGATCTTACTGAGGGATCTAACCTCTACTACACTAATGAAAGAGTTGACGATAGAGTCAATGCTCTTATTACTGCAGGAACTGGTATTACTAAGGTTTACGATGACGCTGCAAATACATATACACTGACTGTAACTCAGTCAGATATCAATACTGATAATGTAACAGAGGGATCAACAAATCTATTCACAACTGCTGCTAGAACTAGAACTCATTTCACATATGGAACTGGTATCACACATAGTTCTGGAACTTTATCAGTTACTCAGTCTGATATTAATACTGACAACGTAACTGAAGG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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f5968b7e8b0d3d735100b970ae87af9c54d62c5eae12955118af188025a3b6be
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4860
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage 9303-10a Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Erlich,R., Young,S.K., Koehrsen,M., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Borenstein,D., Chen,Z., Engels,R., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heiman,D., Hepburn,T., Howarth,C., Jen,D., Larson,L., Lewis,B., Mehta,T., Park,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., Walk,T., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C., Galagan,J. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank