Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAB4204275.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTSPTF
- Protein sequence
-
MQRAIIIVLLFLSFGLKAQVYQAMPQAGYGPVKRFLTDSVLTIPTGINSLRNISGGRDAGQIRWNTTDSGFYVYSGYQWIKINIDSVSLSNRINGKLNISDTASMLSAYLRKGDTLSLSNRINLRVKYSDTASMLLPYLRKLDTASLSDRINKKMDSLILTTIGTGGLATLLGTTLNIPNYGGALTGYVPYSGATNNVTLGSYNLTGTLLNADYALQVKNGGGSFGNATLNYTAITSQNGSFNFFTNWMSGATTFSKGAAFVYPTSGTTFQYLLPIRNGTLALVEDTVSLSNRINAKIGASDTVSLSNRINLKVNISDTASMLLPYLRKADTSSLSNRINLKLNAADTVSLSNRINLKLNISDTASMLSSYQSAINARVKYSDTAAMLDSYLTAAVKSVGLSMPVAFSVANSPITSTGTLAVSAIGTAAQYIRGDGQLATLPTGSGGGSSVNYYLNGGTSQGTIGGSTYYEMSRTAVIGTNVDFSRTNAQGNGLISQFITDANDPNRTEIPAGAWNFELFFNASSSGGSPSYYVELLKYDGTTFTSIASGSANPELITSGTTIDLYLTSLAVPYTTLAITDRLVVRVYVVTSGKTITLHTQNGHLCLITTTFSGGVTSLNGLTANTQYLAVGTAGTDFAINSLTDTHTFNLPTASATNRGALSSADWTTFNGKMNYTDTVSLSNRINTKLNSSDTVSLSNRINTKANALSGTTNTVPKFTSSTIIGNSNIKDDGNIVTINATAGSFGALQVGNYNGNILLNTNNTSAGLIFQNTSASNKKWDFSSFNNDLSFNESNVNPVMTLQAGGNVGINVTNPSNKLEVNGTFKSVGIATFGSTLSNGTYGYTLPSATGTLALTSQLTSGTVTSIATGLGLSGGTITTSGTLLVDTSSTSILSRQRAANTYATTSSLSGYLPLIGGTLTGALGGTSALFSSSVTASGLVAKGTGSFNVNNNIRFQRGTGVEMGYIGWSDESLNNSTWLFKSSNGNPIAFSADGISQQMFIGLTGNVLIGTTTDAGYKLDVNGTGRFSGSVGINTNPGINKFAIQVNNSSSNQSGIDITNGVNASFNVSLRTDITEINAGGTGNMCFSNGLERMRITSSGNVGIGTTSPSDVLEVNGAGNLGVTISAPTDISPRLLFKTVSVDRAKIVGSTDGLLLSTLSTTPIIFNTNSVERMRITSGGNVLIGIAADNGRKLQVNGTIYANNNIIADAASFQLNIPSGGNYQMYVPGSNNFTFYNSNVGNISNINYTTGAYTATSDINKKKDFELSNIGLNEVLGLKPTLYRMKSEDKTSDKHLGFIAQEVKEFIPQAYSESGEGEDKFIGLTEMPIVAALTKAVQELSAQIKELQTKIQTLENK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1359 AA molecular weight: 142904,13450 Da isoelectric point: 9,00786 aromaticity: 0,07726 hydropathy: -0,05482
Domains
Domains [InterPro]
DC_0598
STR
1–826
STR
1–826
DC_1367
RBD
1121–1359
RBD
1121–1359
IPR030392
CHP
1259–1312
CHP
1259–1312
1
1359
Architecture
STR 1-826 | STR 1036-1142 | RBD 1143-1359
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
1359
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 138 | 138 | 0,4984 |
| Central domain | 139 | 422 | 285 | 0,8640 |
| C-terminal | 423 | 1359 | 936 | 0,3613 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
Sequence started with non-N-terminal domain
Sequence started with non-N-terminal domain
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-138
1-138
Central
139-422
139-422
C-terminal
423-1359
423-1359
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
uncultured Caudovirales phage [NCBI] |
2100421 | Uroviricota > Caudoviricetes > Peduoviridae > Maltschvirus maltsch > |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4204275.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR797341.1
[NCBI]
CDS location
range 21218 -> 25297
strand -
strand -
CDS
ATGCAACGTGCCATTATTATAGTTTTATTATTTTTATCTTTTGGATTAAAAGCACAGGTTTACCAAGCTATGCCGCAGGCTGGTTATGGTCCTGTTAAAAGGTTTTTAACCGATAGTGTTTTGACTATTCCAACAGGTATAAATTCTTTAAGAAATATAAGCGGTGGAAGGGATGCAGGGCAAATAAGATGGAATACAACCGATAGCGGTTTTTATGTTTATAGTGGTTATCAATGGATTAAAATTAATATTGATAGTGTTTCTTTAAGCAATCGAATTAATGGCAAATTAAATATAAGCGATACTGCATCAATGTTATCTGCTTACTTAAGAAAAGGCGATACTTTAAGTCTTTCAAATAGAATTAATTTGAGGGTTAAGTATTCAGATACTGCATCGATGCTTTTACCATATTTAAGGAAGTTAGATACTGCAAGTTTATCTGATAGGATTAATAAAAAAATGGATAGTTTAATATTAACTACCATTGGTACAGGTGGATTGGCGACCTTATTAGGAACTACTTTAAACATACCTAATTATGGGGGCGCATTGACTGGCTATGTACCTTATAGTGGTGCAACAAATAACGTTACATTAGGAAGTTATAATTTAACAGGAACGTTATTAAATGCAGATTATGCTTTACAGGTAAAAAATGGTGGTGGTAGTTTTGGCAATGCAACTTTAAATTATACTGCAATAACTTCACAAAATGGAAGTTTTAATTTTTTTACAAATTGGATGTCGGGAGCAACTACATTTTCAAAGGGTGCGGCTTTTGTATATCCTACAAGCGGTACAACTTTTCAGTATTTACTACCTATCAGAAATGGCACATTAGCATTGGTAGAAGATACCGTTAGTTTATCAAATAGAATCAATGCAAAAATAGGGGCAAGCGATACGGTTTCTTTGAGTAACAGAATAAATTTAAAAGTAAATATTTCAGATACTGCAAGTATGCTTTTGCCTTATTTAAGAAAAGCAGATACAAGTTCTTTGAGCAATAGAATTAATTTAAAATTAAATGCTGCCGATACTGTAAGTCTTTCCAATAGGATAAATTTAAAATTAAATATTAGTGATACTGCTAGTATGTTATCTAGTTATCAAAGCGCTATAAACGCACGTGTTAAATATAGCGATACTGCGGCTATGTTAGACTCTTATTTAACTGCTGCGGTAAAGAGCGTTGGATTATCTATGCCCGTAGCTTTTAGCGTCGCCAATAGCCCTATAACAAGCACAGGAACGCTTGCAGTTAGTGCCATTGGTACGGCTGCACAATATATTCGTGGCGATGGTCAATTGGCTACCTTACCAACTGGTAGTGGCGGTGGTTCATCCGTTAATTATTATTTAAATGGTGGCACAAGTCAGGGTACTATTGGTGGAAGTACTTATTACGAAATGAGCAGAACTGCGGTAATAGGAACAAATGTAGATTTTAGCAGAACAAACGCGCAAGGAAACGGTTTAATATCTCAATTTATTACTGATGCTAATGATCCTAATAGAACCGAAATACCAGCGGGTGCTTGGAATTTTGAATTATTTTTTAATGCTTCAAGTTCTGGCGGTTCACCTTCTTATTATGTAGAGTTATTAAAATACGATGGAACTACTTTTACTTCGATTGCTTCAGGTTCGGCAAATCCAGAATTAATAACAAGCGGCACAACTATTGATTTGTATTTAACTTCTTTAGCAGTACCCTATACAACATTGGCAATTACTGATAGATTAGTAGTAAGGGTTTACGTTGTTACGAGTGGTAAAACAATTACTTTACATACGCAGAACGGGCATCTTTGTTTAATTACAACTACCTTTTCGGGTGGTGTAACTTCTTTAAATGGCTTAACTGCAAATACTCAATATTTAGCAGTTGGAACTGCTGGAACTGATTTTGCAATTAATAGTTTAACCGATACACATACATTTAATTTACCGACTGCAAGCGCAACAAATAGGGGTGCTTTGTCAAGTGCTGACTGGACTACCTTTAATGGTAAAATGAATTACACAGATACAGTTAGTTTAAGCAATAGAATCAATACAAAATTAAATAGCAGCGATACTGTAAGCCTATCTAATCGAATCAATACAAAAGCAAACGCATTAAGTGGAACTACAAACACAGTTCCCAAATTTACTTCATCAACTATCATCGGAAATAGTAACATTAAAGATGATGGAAATATAGTTACGATAAATGCAACTGCTGGAAGTTTTGGTGCTTTACAAGTTGGGAATTATAATGGTAATATTTTATTAAATACTAATAACACAAGTGCTGGTTTAATATTTCAAAATACTTCAGCATCTAATAAAAAATGGGATTTTTCTTCTTTCAATAATGATCTATCTTTTAATGAATCGAATGTAAATCCTGTAATGACTTTACAAGCAGGAGGTAATGTGGGAATAAATGTTACTAACCCATCAAATAAATTAGAAGTTAACGGAACTTTTAAGTCGGTTGGCATTGCGACATTTGGCAGCACATTATCAAATGGAACGTATGGTTATACCTTACCAAGCGCAACAGGAACGCTTGCATTGACTTCGCAACTTACAAGTGGCACGGTTACTTCAATAGCCACAGGATTAGGATTAAGCGGTGGTACAATTACAACAAGCGGTACGTTATTAGTAGACACTTCAAGTACTTCTATATTAAGCAGACAAAGGGCAGCGAATACCTATGCAACTACTTCATCATTGAGTGGATATTTACCATTAATAGGTGGTACACTTACAGGTGCTTTGGGTGGTACGAGTGCTTTATTTAGTAGTAGTGTAACGGCAAGTGGTTTAGTAGCAAAAGGAACTGGAAGTTTCAATGTTAATAATAATATTAGATTTCAAAGAGGTACGGGAGTTGAAATGGGTTATATTGGATGGAGTGATGAATCCTTAAATAATTCTACTTGGTTATTCAAATCTAGTAATGGTAATCCAATCGCTTTTAGTGCTGATGGTATTTCTCAACAAATGTTTATTGGATTAACTGGCAATGTATTAATAGGAACTACTACAGATGCAGGATATAAATTAGATGTTAATGGTACAGGGAGATTTAGTGGAAGTGTAGGAATAAATACAAATCCGGGAATTAATAAATTTGCAATACAAGTAAATAATTCATCCTCAAATCAAAGTGGGATTGATATTACAAACGGAGTAAATGCAAGTTTTAATGTCAGTTTAAGGACAGATATAACAGAAATAAATGCAGGTGGAACGGGAAATATGTGTTTTAGTAATGGTTTAGAAAGAATGCGTATAACAAGTAGTGGTAATGTAGGTATAGGTACTACAAGTCCAAGTGATGTACTTGAAGTAAATGGTGCAGGAAATTTAGGTGTTACAATTTCTGCTCCTACTGATATTAGTCCACGTTTGTTATTTAAAACAGTTAGTGTTGATAGGGCAAAAATAGTTGGTAGTACTGATGGATTATTATTAAGTACTCTTTCCACTACTCCAATTATTTTTAATACTAATTCAGTAGAAAGAATGCGTATAACAAGTGGTGGTAATGTATTAATAGGTATTGCAGCAGATAATGGAAGAAAGTTGCAAGTTAATGGTACAATATATGCTAATAACAATATTATAGCGGATGCGGCTTCATTTCAGTTGAATATTCCGAGTGGTGGTAATTATCAAATGTATGTTCCCGGAAGCAATAATTTTACTTTTTATAATAGTAATGTAGGAAATATATCTAATATAAATTATACTACGGGAGCATATACAGCTACTTCTGATATAAATAAAAAGAAAGATTTTGAATTATCAAACATAGGTTTAAATGAGGTTTTAGGGTTAAAGCCTACATTATATAGAATGAAATCAGAAGATAAAACTTCAGATAAACATTTAGGATTTATTGCGCAAGAAGTTAAAGAATTTATACCACAAGCATATTCAGAAAGTGGAGAAGGAGAAGATAAATTTATTGGATTAACAGAAATGCCCATAGTGGCAGCATTAACTAAAGCAGTACAAGAACTTTCCGCACAAATAAAAGAATTACAAACAAAAATTCAAACATTAGAAAACAAATGA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
7b49d2c414325abf0c78bcbe0d535722f714848394bf8c42c45c6e1f687eabaa
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50