Protein

Genbank accession
AIM50828.1 [GenBank]
Protein name
distal half fiber
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHIGNYNQTGDYTLNGVFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELITKSSGTSHVRFHDSADRERGIIFSPANDGLTTQVINIRVQDYAAGSESTYAFSGSGQFISPEVSAWKSMSTPQILTDKVITDGKKAGDYDIYSLANNNSNTDKNNLRVVRTDPAAAMLHEICENNGISWYSGSTPTDYMLSFAYSGGFQAGHSIAVGMESGPMTYSTLGKSSIVLGDNDTGFKWHQDGYYFSVNNGTKTFLFNPSETTSLRKFVAGYSTNGTDLTTPPTENYALATVVTYHDNNAFGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNSSTLMFRGNTTGYSSVDNMDIKVWGNTFVDPSGGIRKNVMEISDATSWMSYIQRLTTGEVEMNVNGSFESSRVTAGDRGVYTTGEISSGAVNALRIWNADYGAIFRRSEDSLHIIPTTYGEGKHGGIGPLRPFSLALDTGKVTIPDLQSKYNTITANGYIKFVGHGAGAGGYDIQYAQAAPIFQEIDDDAVNKYYPIVKQKFLNGKAVWSLGTEINSGTFVIHHLKEDGTQGHTSRFNQDGTVNFPDNVLVGGGEAAIARNGNIFSDIWKTFTSAGDVTNIRDAIATRVAKEGDTMTGTLWINKDAAGIVLNPPLASDSSFIRSDTAGANNWYIGKGGADNGLGFYSYITQGGVYITTNGEISLSPQGQGTFNFNRDRLHINGTQWTAHQGGDWANQWRQEAPIFVDFGNVGNDSYYPIIKGKSGITNEGYVSGVDFGMRRITNTWAQGIIRVGNQENGSDPQAIYEFHHNGVFYAPSLLKSSRVSAGGGDPAWAGPCIVLGDNDTGLLWENDGIFNAYANGQGVFSFRPGLAQTFGDVNFHCNAGMYVRDNIDVNDVYIRSDIRCKSEIKLIENAQEKSKLLGGYTYLLKNSVTDEVKPSAGLIAQEVQEVLPELVSEDKETGLLRLNYNGIIGLNTAAINEHTDEIKELKSEIAELKALIKSLIK
Physico‐chemical
properties
protein length:1079 AA
molecular weight: 116675,99410 Da
isoelectric point:5,38967
aromaticity:0,09824
hydropathy:-0,33753

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
720–774
G3DSA:6.20.80.10 IPR030392 Coil
IPR030392
974–1067
IPR030392
AIM50828.1
1 1079
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage Shf125875
[NCBI] 		1541825 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Shigella flexneri
[NCBI] 		623 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Shigella

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIM50828.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KM407600 [NCBI]
CDS location
range 156293 -> 159532
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGTGTACTTTTTACTAAAGATGACCAAGGAAATATTATTGATCTGGGTTTTGCTAAGGGTGGTAGTATTGACGGGAATGTTATTCATATAGGAAACTATAATCAAACTGGTGATTATACTTTAAATGGCGTCTTCACTCAGACTGGTAATTTTAATTTAACTGGTATTGCTCGAGTAACTCGCGATATTATTGCCGCTGGGCAGATTATGACTGAAGGCGGAGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGTACATCACATGTTCGTTTTCATGATTCAGCTGACCGTGAACGTGGAATCATTTTTTCTCCTGCTAATGATGGATTAACTACACAAGTAATTAATATTAGAGTTCAAGACTACGCAGCTGGTAGCGAAAGCACCTATGCATTTTCAGGCAGTGGACAATTTATTTCACCTGAAGTATCGGCATGGAAATCTATGTCAACTCCTCAGATTTTGACTGACAAAGTCATTACAGACGGGAAGAAGGCAGGTGATTATGACATCTATTCATTAGCAAATAATAATTCTAATACAGATAAAAATAATTTACGTGTTGTACGTACCGACCCAGCGGCCGCAATGCTCCATGAAATTTGTGAAAACAACGGCATCAGTTGGTATTCTGGTTCAACCCCTACTGATTATATGTTATCTTTTGCTTATTCCGGCGGTTTTCAAGCAGGCCATTCGATTGCAGTAGGTATGGAATCAGGGCCTATGACATATTCAACCTTAGGTAAAAGTTCTATTGTTCTTGGGGATAATGATACTGGATTTAAATGGCATCAAGACGGATATTATTTCAGCGTTAATAATGGAACAAAAACGTTTTTATTTAATCCTAGCGAAACAACTAGCCTAAGAAAATTTGTAGCTGGATATTCTACTAATGGAACCGATTTAACTACTCCTCCAACTGAAAACTATGCTCTTGCTACTGTTGTGACATATCACGATAATAACGCGTTTGGAGATGGTCAGACTCTTTTGGGATATTATCAAGGCGGTAACTATCATCACTATTTCCGTGGTAAGGGTACCACAAACATTAATACTCATGGCGGTTTGTTGGTTACTCCTGGTAATATTGATGTTATTGGCGGTTCTGTTAATATAGATGGTAGAAATAATTCTTCTACACTAATGTTTAGAGGCAACACAACAGGATACAGCTCGGTTGATAATATGGATATTAAAGTTTGGGGTAATACGTTTGTTGATCCAAGCGGAGGTATCCGTAAAAACGTCATGGAAATTTCTGATGCAACTAGTTGGATGAGCTATATTCAAAGACTTACAACAGGTGAAGTAGAAATGAACGTTAACGGTTCATTTGAATCATCTCGTGTTACTGCTGGAGATAGGGGAGTTTACACAACAGGCGAAATTTCATCTGGGGCTGTGAATGCGCTTCGTATTTGGAACGCAGATTATGGAGCTATTTTTAGACGTTCAGAAGATAGTCTTCATATTATTCCAACTACTTACGGTGAAGGTAAACACGGCGGTATCGGTCCACTTCGCCCGTTTAGTTTGGCTTTAGATACCGGTAAAGTTACTATTCCAGATTTACAGTCAAAATACAATACGATCACTGCGAACGGCTATATTAAATTTGTTGGTCATGGAGCGGGTGCCGGCGGTTATGACATTCAATATGCTCAAGCAGCTCCTATTTTCCAGGAAATTGATGATGATGCTGTAAACAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAGTTTTTAAATGGTAAAGCCGTCTGGTCTTTAGGTACTGAAATTAATTCGGGTACATTCGTTATTCATCATTTAAAAGAAGACGGAACTCAAGGACATACATCTCGTTTTAATCAAGACGGTACTGTTAACTTCCCAGATAACGTTCTGGTCGGTGGTGGTGAAGCTGCTATTGCTCGTAATGGTAATATTTTCTCGGATATTTGGAAAACGTTTACTTCTGCAGGCGACGTAACTAATATTCGCGACGCAATAGCTACTCGTGTTGCCAAAGAAGGTGATACGATGACCGGCACTCTTTGGATTAATAAAGATGCTGCTGGAATAGTTCTTAATCCTCCTTTGGCCAGTGATTCATCATTTATTCGTTCTGATACGGCCGGGGCCAATAATTGGTATATTGGTAAAGGCGGTGCCGACAATGGTCTAGGTTTTTACAGTTACATTACACAAGGCGGTGTATACATAACAACTAACGGTGAAATATCGCTTTCTCCTCAAGGCCAAGGAACATTTAATTTTAATAGAGACCGCCTCCATATAAACGGTACACAATGGACCGCACACCAGGGCGGTGACTGGGCTAACCAATGGCGCCAAGAAGCTCCTATATTTGTAGATTTTGGTAATGTCGGTAATGATAGTTATTATCCTATTATTAAAGGAAAATCCGGTATTACTAACGAAGGATACGTATCCGGCGTAGATTTTGGTATGCGACGCATTACTAATACCTGGGCACAAGGTATTATTCGTGTAGGTAACCAGGAAAACGGTTCTGACCCCCAAGCCATCTATGAATTCCATCATAATGGTGTTTTTTATGCCCCTAGCTTACTTAAGAGCAGCAGAGTATCAGCAGGCGGCGGTGACCCTGCATGGGCCGGGCCGTGTATTGTACTGGGAGATAACGATACCGGTTTGCTTTGGGAAAACGATGGTATTTTCAACGCATATGCAAACGGCCAAGGTGTGTTTAGTTTTAGACCTGGTTTAGCTCAGACATTCGGTGATGTTAACTTCCACTGTAATGCAGGTATGTATGTTCGTGATAACATCGATGTTAACGACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTGTAAGTCAGAAATTAAGCTTATAGAGAATGCCCAAGAGAAATCTAAACTATTGGGCGGTTATACTTATCTGCTTAAAAACTCTGTTACAGACGAAGTTAAACCGTCCGCAGGTTTAATTGCTCAGGAAGTTCAAGAAGTATTACCTGAACTTGTTTCTGAAGATAAAGAGACCGGACTGCTTCGTTTGAACTATAACGGTATTATTGGTTTAAATACAGCTGCAATAAACGAGCATACAGATGAAATCAAGGAATTGAAATCTGAAATTGCCGAATTGAAAGCATTAATTAAATCATTGATAAAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
fde143e2abca5986fa347f6a53abb0a60d94db6dfab0cee6d0581ea25d222f5f
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5378
Evidence 0,5378
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and development of bioluminescent reporter phages for bacterial dysentery Schofield,D.A., Wray,D.J. and Molineux,I.J. — — GenBank