Genbank accession
QAY00486.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MYSIKTDLDITGGATVAKDLLVKGDAVFNKNLTVNGTVTFADAVFTAIEAETVDISSTLDVAGKASLNGGIEVHGNSVIGNLPVGSDTATINSNAQFQSPVSMAGNLTQTAGTAVLKDTQVASMDVLGTSSFKGNITAETGTTAAFDKITATDATFTNTATTDITSTGTANFKDVNISGTLGGTFSLSDVNATTLTVSGLTSLQGGVTLGSNITGVNSSANFRDIKIGSNAANTNYRLSFNYSAPSLRPTVILQNEIQSELMSPATLSVLKTASFGDSSLSTFGITGNGLNKLDYLTVSGNSVQDPTTPLLQVTSGKTKVHDFEVTGTATIPNIESTGTANFNNINVSGTLGGTFSLDDIEANTLTVSGLTSLVGGVTLGADISGANSTANFKAVSLGQNAADANVKYGFAYSAPGARPTVILQNEIQSELVSPAVLNVQKTATFGDASLATYGITGNGLNKLDYLSITGNGTQSPATPQLQVAGKSVLNDVEFTGTVTGLTVDVSGQDLTPKSVDAAEAIKGQTLESVGQTTVGTNLQVGGTANVVGALTGTAATFTGDVSAAKGTFSGDVSVTGQTVTVRDLVVTGTTTGVTAQADVDGLDIAPNKVDVTTTLSVAGDTTLAGLTASSVTSTGDVTGASVSGNTVTAAGALSGGSLAVTGAGSMASLTVPSITGDTTFANNVTITGTLTPSSIDLSTTDVSAASLTTTGNVTVGGSLAVTGAIDLSAADVVTKSVSATNPSTFGVINASSVAATGDVSGGTLTTTGAAKVGTLTSTGVVSGSRLSSGTATITTSVTVPTLQAEAAGAGTLNLASNVVAAKDLTVTGVFKPEGGLDLTTVDITANSLTTTADVNVGGNLVVDGTFDLSAADVSVKSLASAETITSAGVITVTDSTNTSSLPKITSTDATLFTVNAGTINATGNSVLQSVSATQVTANSAEFSGGGLGLQVDNDANVGGALSVGGIATVGSLTTTAASLNIAKNTAITGDLAVSGTLTAGSIDLSNTDVTVKSLDSLGNAHIAGNLTVDGAFDLSATNLVAASLASTGSTTVGTDLVLTTGVVTGSPAISGNTTIGGTLGVTGAVNLTDIVNIGKKVTVSTGGIQVVDGGINTNTINVSGASTLAGTSITGTLGVTGASTLAGVSATSLTVSGDSTVQKLTVQGELIPQGGLDLSGADITANSLTTATTINATGLSTLSGGVSTSTVTASGLATVGSLTSTANASVGGNLGVTGTLGVTGATTVSSLTATGAVKTGTTLTVGTPVGEQPETVQIIPDTYIAGKLRVIGGINAEIDVSGQTLEPYAIEAAATLSAVGNITSGATIVSKAATIGDVGSQNNNLTVNGNVVTNGDFTVTGVLNAQLNQADSDVAVKSLTATNNVAAGTSITAGTSITASGLLKGNSLEVTTTGSFGGAVTMSSGANITGTVGITAGDLTVGGNISATGTAGFGATTVSTITTSGLATLASASVTGALTVGGTLTANGNTVIGDAAADTLTVNATSTFKENATFDKNLTVTGSINTTTANFTTNNMVTKKYSVIPASVTASTAAVGGTWTPDGTTNVYRLTLDQSVTMDSIAGLIGSGQACSVYIYVTPSVADTTFTFGGAYSVVSGTVSAVVGQTSIIQVIYDGFSTVFDTFVAQRV
Physico‐chemical
properties
protein length:1644 AA
molecular weight: 160730,74100 Da
isoelectric point:4,14449
aromaticity:0,03467
hydropathy:0,28844

Domains

Domains [InterPro]
QAY00486.1
1 1644
Architecture
STR
RBD
STR 1-1291 | RBD 1292-1644
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage Ecwhy_1
[NCBI]
2419744 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI]
562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QAY00486.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH791411.1 [NCBI]
CDS location
range 151958 -> 156892
strand +
CDS
ATGTACTCGATTAAAACAGATCTCGATATAACTGGTGGTGCAACGGTTGCTAAAGATCTTCTTGTGAAAGGCGATGCAGTATTCAATAAAAATCTAACAGTTAATGGAACTGTAACTTTTGCTGACGCTGTATTCACTGCAATTGAAGCAGAAACTGTAGACATTTCATCTACACTAGATGTTGCTGGTAAAGCATCATTGAATGGTGGAATTGAAGTTCATGGTAATTCCGTAATTGGTAATTTGCCTGTTGGTTCTGATACTGCAACGATTAATTCTAATGCACAATTCCAAAGCCCAGTATCAATGGCAGGTAATCTAACACAAACCGCTGGCACTGCTGTACTAAAAGATACCCAAGTGGCATCAATGGATGTTCTTGGGACTTCTTCATTTAAAGGTAATATTACTGCTGAAACTGGCACTACCGCAGCATTTGACAAAATAACTGCAACTGATGCAACATTCACAAACACTGCAACTACTGATATCACATCAACTGGAACTGCAAACTTTAAAGATGTGAATATTTCCGGTACACTAGGTGGAACATTTAGTCTATCTGATGTTAATGCAACAACTCTAACTGTTTCTGGTTTAACCAGTCTACAAGGTGGTGTTACATTAGGTTCCAACATTACTGGTGTGAATAGTAGTGCAAACTTCCGTGATATTAAAATTGGTTCCAATGCTGCAAACACTAACTACCGTTTGAGCTTTAACTATTCTGCTCCAAGTCTTCGTCCAACTGTAATTCTACAGAACGAAATCCAATCAGAATTGATGTCTCCAGCTACCCTAAGTGTATTGAAAACTGCATCTTTTGGTGATTCGTCACTATCCACTTTTGGTATTACTGGTAATGGTCTAAACAAACTAGATTACCTAACAGTATCTGGTAACTCTGTTCAAGATCCAACAACTCCACTATTACAAGTAACTTCAGGTAAAACTAAAGTTCATGATTTCGAAGTAACAGGAACTGCAACTATTCCTAACATTGAAAGTACTGGTACTGCTAATTTTAATAACATCAACGTATCTGGTACACTCGGTGGTACTTTCAGTCTTGATGATATTGAAGCAAACACACTAACTGTATCCGGTTTAACTAGCCTTGTTGGTGGTGTAACTTTAGGTGCTGATATTTCCGGTGCTAATAGTACTGCTAATTTTAAAGCAGTAAGTTTAGGACAAAACGCCGCCGATGCTAACGTTAAGTATGGTTTTGCTTATTCTGCCCCTGGTGCTCGCCCAACTGTAATTCTACAAAATGAAATTCAGTCTGAGCTAGTATCTCCAGCAGTACTTAATGTACAAAAAACTGCAACCTTTGGTGATGCATCTCTTGCAACCTATGGTATCACAGGTAACGGTCTAAACAAACTAGATTATCTATCTATTACTGGTAATGGTACACAAAGTCCAGCTACCCCACAACTACAAGTTGCTGGTAAATCAGTACTAAATGATGTTGAATTCACTGGTACTGTAACTGGTCTAACTGTTGATGTGAGTGGACAAGATCTAACTCCTAAATCAGTAGATGCTGCTGAAGCAATCAAAGGTCAAACCCTTGAATCAGTTGGTCAAACCACAGTAGGAACTAACCTACAAGTTGGTGGAACTGCTAATGTTGTTGGTGCACTAACTGGTACTGCTGCTACCTTCACTGGTGATGTAAGTGCTGCTAAAGGTACTTTCAGTGGTGATGTTAGCGTTACTGGTCAAACTGTAACTGTACGTGATTTAGTAGTAACTGGTACAACTACTGGTGTAACTGCCCAAGCTGATGTTGATGGTCTTGATATCGCCCCAAATAAAGTTGATGTTACAACAACACTATCTGTTGCTGGGGACACTACTTTAGCTGGCCTAACTGCTAGTTCAGTAACCAGTACTGGTGATGTTACTGGTGCGTCTGTATCTGGTAATACAGTAACTGCGGCTGGGGCACTATCTGGTGGTTCTCTTGCAGTAACTGGTGCTGGTTCTATGGCTTCACTAACTGTTCCAAGTATTACTGGTGACACTACTTTTGCTAATAACGTAACTATTACTGGAACACTAACTCCGAGTAGTATAGATTTAAGCACTACTGATGTAAGTGCTGCTTCTTTAACAACTACTGGTAACGTAACTGTTGGTGGTTCTCTTGCAGTAACTGGTGCTATTGATTTGTCTGCTGCTGATGTAGTAACAAAATCAGTTAGTGCAACTAACCCAAGTACATTTGGTGTAATTAATGCATCTTCTGTTGCCGCAACTGGTGACGTTTCAGGTGGCACACTAACTACTACTGGTGCAGCGAAAGTAGGAACACTAACTAGTACTGGTGTAGTATCTGGTTCGCGTTTGTCTTCTGGTACTGCAACAATCACAACTTCTGTAACAGTTCCAACTTTACAAGCTGAAGCTGCTGGTGCTGGTACACTAAATCTAGCAAGTAATGTTGTCGCGGCAAAAGATCTAACTGTCACTGGTGTATTCAAACCTGAAGGTGGTCTTGATCTAACAACTGTTGATATTACTGCAAACTCACTAACTACTACTGCTGATGTTAATGTTGGTGGAAACTTAGTAGTTGATGGTACTTTTGACCTAAGTGCTGCTGATGTGTCTGTGAAATCTCTTGCAAGTGCAGAGACAATTACAAGTGCTGGTGTTATTACCGTTACCGATTCAACCAATACTAGTTCGTTACCTAAAATTACTTCAACTGATGCAACACTCTTTACAGTAAATGCAGGTACTATTAATGCAACTGGTAACAGTGTACTACAAAGTGTATCAGCTACTCAAGTAACTGCTAATAGTGCTGAATTTTCTGGTGGTGGCCTTGGTCTTCAAGTTGATAATGATGCAAACGTTGGTGGTGCATTATCTGTTGGTGGCATTGCAACTGTTGGTTCTTTAACAACAACTGCTGCTTCTCTTAATATTGCAAAAAATACTGCAATCACTGGTGATTTAGCTGTATCTGGCACACTAACTGCTGGTTCAATCGACCTAAGCAATACTGATGTAACCGTTAAATCTCTTGATTCACTAGGTAACGCACACATTGCTGGTAACCTAACTGTAGATGGTGCATTCGACTTAAGTGCAACTAACCTTGTAGCTGCAAGTCTAGCAAGTACTGGTTCTACTACTGTTGGAACTGATCTAGTACTAACAACTGGTGTTGTGACTGGTAGCCCAGCTATCTCTGGTAATACAACAATCGGTGGAACTCTTGGTGTAACTGGTGCTGTTAACCTAACTGATATTGTTAATATCGGTAAGAAAGTAACAGTGAGTACTGGTGGTATTCAGGTAGTTGATGGTGGTATCAATACTAACACAATTAACGTTTCTGGTGCTTCTACTCTAGCAGGAACTTCCATTACTGGAACTTTAGGTGTAACTGGTGCTTCTACTCTAGCAGGTGTATCTGCGACATCACTAACAGTTTCTGGTGACAGTACTGTTCAGAAACTAACTGTCCAAGGTGAATTGATCCCACAAGGTGGTCTTGACCTAAGCGGTGCAGACATTACTGCTAATAGTCTAACTACTGCGACAACTATCAATGCAACTGGCCTAAGTACTCTAAGTGGTGGTGTTAGTACTTCTACTGTGACTGCATCTGGTCTAGCAACTGTTGGAAGTTTAACTTCTACTGCAAACGCATCAGTTGGTGGTAATTTGGGTGTAACTGGAACTCTAGGTGTTACTGGTGCAACTACTGTATCTTCACTAACAGCTACTGGTGCAGTGAAAACTGGTACAACCCTAACTGTTGGTACTCCAGTTGGTGAACAACCTGAAACTGTACAGATCATTCCAGATACTTATATTGCTGGTAAATTGCGTGTAATCGGTGGTATTAACGCTGAAATCGACGTAAGTGGTCAAACACTAGAACCATATGCAATTGAAGCTGCTGCAACACTATCTGCTGTTGGTAACATTACTTCTGGTGCAACCATCGTTTCTAAAGCTGCAACAATTGGTGATGTTGGTTCACAAAACAACAACCTAACTGTTAATGGTAACGTAGTAACTAATGGTGACTTCACCGTTACTGGTGTACTAAATGCACAATTGAACCAAGCAGATTCCGATGTAGCTGTTAAGTCTTTGACTGCAACTAATAACGTTGCGGCTGGTACTTCAATCACTGCTGGAACATCCATCACTGCATCAGGCTTACTAAAAGGTAATTCGTTAGAAGTCACCACTACTGGTTCATTTGGTGGTGCAGTAACTATGTCAAGTGGTGCAAACATCACTGGTACTGTTGGTATCACTGCTGGTGACCTAACAGTAGGTGGTAATATCTCTGCAACTGGTACTGCTGGATTCGGTGCAACAACCGTTTCTACCATTACAACATCAGGTTTAGCTACCCTTGCAAGTGCATCTGTAACTGGTGCTCTAACTGTAGGTGGTACATTAACTGCAAATGGTAACACTGTGATTGGTGATGCTGCTGCTGATACTTTAACTGTAAATGCAACATCTACATTTAAAGAGAACGCAACATTTGATAAGAACCTAACAGTGACTGGTTCTATTAACACCACCACTGCAAACTTCACTACAAACAACATGGTAACTAAGAAATATTCTGTTATCCCTGCTAGTGTTACTGCTTCTACTGCTGCTGTAGGTGGCACTTGGACACCAGATGGTACTACTAACGTATATCGCTTAACTCTTGACCAAAGTGTTACAATGGATTCCATCGCGGGTCTAATTGGTAGTGGTCAAGCATGTTCAGTGTATATCTATGTAACTCCATCTGTTGCTGATACTACTTTCACCTTCGGTGGTGCATACTCTGTAGTTTCTGGTACAGTAAGTGCTGTAGTTGGTCAAACAAGTATTATCCAAGTAATCTATGATGGTTTCAGTACTGTGTTTGATACCTTCGTTGCACAACGTGTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6f1d09b2d7b20778cd2964616fdc1a2a05bf1b0dad37e9c402ba719b0baa4827
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5683
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecwhy_1, Complete genome sequences of 3 novel enterobacteria, Pakpunavirus like phages Yuan,S., Ma,Y. and Liu,Q. 2020-07-27 GenBank