Protein
View in Explore- Genbank accession
- QAY00486.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MYSIKTDLDITGGATVAKDLLVKGDAVFNKNLTVNGTVTFADAVFTAIEAETVDISSTLDVAGKASLNGGIEVHGNSVIGNLPVGSDTATINSNAQFQSPVSMAGNLTQTAGTAVLKDTQVASMDVLGTSSFKGNITAETGTTAAFDKITATDATFTNTATTDITSTGTANFKDVNISGTLGGTFSLSDVNATTLTVSGLTSLQGGVTLGSNITGVNSSANFRDIKIGSNAANTNYRLSFNYSAPSLRPTVILQNEIQSELMSPATLSVLKTASFGDSSLSTFGITGNGLNKLDYLTVSGNSVQDPTTPLLQVTSGKTKVHDFEVTGTATIPNIESTGTANFNNINVSGTLGGTFSLDDIEANTLTVSGLTSLVGGVTLGADISGANSTANFKAVSLGQNAADANVKYGFAYSAPGARPTVILQNEIQSELVSPAVLNVQKTATFGDASLATYGITGNGLNKLDYLSITGNGTQSPATPQLQVAGKSVLNDVEFTGTVTGLTVDVSGQDLTPKSVDAAEAIKGQTLESVGQTTVGTNLQVGGTANVVGALTGTAATFTGDVSAAKGTFSGDVSVTGQTVTVRDLVVTGTTTGVTAQADVDGLDIAPNKVDVTTTLSVAGDTTLAGLTASSVTSTGDVTGASVSGNTVTAAGALSGGSLAVTGAGSMASLTVPSITGDTTFANNVTITGTLTPSSIDLSTTDVSAASLTTTGNVTVGGSLAVTGAIDLSAADVVTKSVSATNPSTFGVINASSVAATGDVSGGTLTTTGAAKVGTLTSTGVVSGSRLSSGTATITTSVTVPTLQAEAAGAGTLNLASNVVAAKDLTVTGVFKPEGGLDLTTVDITANSLTTTADVNVGGNLVVDGTFDLSAADVSVKSLASAETITSAGVITVTDSTNTSSLPKITSTDATLFTVNAGTINATGNSVLQSVSATQVTANSAEFSGGGLGLQVDNDANVGGALSVGGIATVGSLTTTAASLNIAKNTAITGDLAVSGTLTAGSIDLSNTDVTVKSLDSLGNAHIAGNLTVDGAFDLSATNLVAASLASTGSTTVGTDLVLTTGVVTGSPAISGNTTIGGTLGVTGAVNLTDIVNIGKKVTVSTGGIQVVDGGINTNTINVSGASTLAGTSITGTLGVTGASTLAGVSATSLTVSGDSTVQKLTVQGELIPQGGLDLSGADITANSLTTATTINATGLSTLSGGVSTSTVTASGLATVGSLTSTANASVGGNLGVTGTLGVTGATTVSSLTATGAVKTGTTLTVGTPVGEQPETVQIIPDTYIAGKLRVIGGINAEIDVSGQTLEPYAIEAAATLSAVGNITSGATIVSKAATIGDVGSQNNNLTVNGNVVTNGDFTVTGVLNAQLNQADSDVAVKSLTATNNVAAGTSITAGTSITASGLLKGNSLEVTTTGSFGGAVTMSSGANITGTVGITAGDLTVGGNISATGTAGFGATTVSTITTSGLATLASASVTGALTVGGTLTANGNTVIGDAAADTLTVNATSTFKENATFDKNLTVTGSINTTTANFTTNNMVTKKYSVIPASVTASTAAVGGTWTPDGTTNVYRLTLDQSVTMDSIAGLIGSGQACSVYIYVTPSVADTTFTFGGAYSVVSGTVSAVVGQTSIIQVIYDGFSTVFDTFVAQRV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1644 AA molecular weight: 160730,74100 Da isoelectric point: 4,14449 aromaticity: 0,03467 hydropathy: 0,28844
Domains
Domains [InterPro]
DC_0092
STR
1–334
STR
1–334
DC_0092
STR
304–612
STR
304–612
1
1644
Architecture
STR 1-1291 | RBD 1292-1644
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage Ecwhy_1 [NCBI] |
2419744 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Escherichia coli [NCBI] |
562 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QAY00486.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH791411.1
[NCBI]
CDS location
range 151958 -> 156892
strand +
strand +
CDS
ATGTACTCGATTAAAACAGATCTCGATATAACTGGTGGTGCAACGGTTGCTAAAGATCTTCTTGTGAAAGGCGATGCAGTATTCAATAAAAATCTAACAGTTAATGGAACTGTAACTTTTGCTGACGCTGTATTCACTGCAATTGAAGCAGAAACTGTAGACATTTCATCTACACTAGATGTTGCTGGTAAAGCATCATTGAATGGTGGAATTGAAGTTCATGGTAATTCCGTAATTGGTAATTTGCCTGTTGGTTCTGATACTGCAACGATTAATTCTAATGCACAATTCCAAAGCCCAGTATCAATGGCAGGTAATCTAACACAAACCGCTGGCACTGCTGTACTAAAAGATACCCAAGTGGCATCAATGGATGTTCTTGGGACTTCTTCATTTAAAGGTAATATTACTGCTGAAACTGGCACTACCGCAGCATTTGACAAAATAACTGCAACTGATGCAACATTCACAAACACTGCAACTACTGATATCACATCAACTGGAACTGCAAACTTTAAAGATGTGAATATTTCCGGTACACTAGGTGGAACATTTAGTCTATCTGATGTTAATGCAACAACTCTAACTGTTTCTGGTTTAACCAGTCTACAAGGTGGTGTTACATTAGGTTCCAACATTACTGGTGTGAATAGTAGTGCAAACTTCCGTGATATTAAAATTGGTTCCAATGCTGCAAACACTAACTACCGTTTGAGCTTTAACTATTCTGCTCCAAGTCTTCGTCCAACTGTAATTCTACAGAACGAAATCCAATCAGAATTGATGTCTCCAGCTACCCTAAGTGTATTGAAAACTGCATCTTTTGGTGATTCGTCACTATCCACTTTTGGTATTACTGGTAATGGTCTAAACAAACTAGATTACCTAACAGTATCTGGTAACTCTGTTCAAGATCCAACAACTCCACTATTACAAGTAACTTCAGGTAAAACTAAAGTTCATGATTTCGAAGTAACAGGAACTGCAACTATTCCTAACATTGAAAGTACTGGTACTGCTAATTTTAATAACATCAACGTATCTGGTACACTCGGTGGTACTTTCAGTCTTGATGATATTGAAGCAAACACACTAACTGTATCCGGTTTAACTAGCCTTGTTGGTGGTGTAACTTTAGGTGCTGATATTTCCGGTGCTAATAGTACTGCTAATTTTAAAGCAGTAAGTTTAGGACAAAACGCCGCCGATGCTAACGTTAAGTATGGTTTTGCTTATTCTGCCCCTGGTGCTCGCCCAACTGTAATTCTACAAAATGAAATTCAGTCTGAGCTAGTATCTCCAGCAGTACTTAATGTACAAAAAACTGCAACCTTTGGTGATGCATCTCTTGCAACCTATGGTATCACAGGTAACGGTCTAAACAAACTAGATTATCTATCTATTACTGGTAATGGTACACAAAGTCCAGCTACCCCACAACTACAAGTTGCTGGTAAATCAGTACTAAATGATGTTGAATTCACTGGTACTGTAACTGGTCTAACTGTTGATGTGAGTGGACAAGATCTAACTCCTAAATCAGTAGATGCTGCTGAAGCAATCAAAGGTCAAACCCTTGAATCAGTTGGTCAAACCACAGTAGGAACTAACCTACAAGTTGGTGGAACTGCTAATGTTGTTGGTGCACTAACTGGTACTGCTGCTACCTTCACTGGTGATGTAAGTGCTGCTAAAGGTACTTTCAGTGGTGATGTTAGCGTTACTGGTCAAACTGTAACTGTACGTGATTTAGTAGTAACTGGTACAACTACTGGTGTAACTGCCCAAGCTGATGTTGATGGTCTTGATATCGCCCCAAATAAAGTTGATGTTACAACAACACTATCTGTTGCTGGGGACACTACTTTAGCTGGCCTAACTGCTAGTTCAGTAACCAGTACTGGTGATGTTACTGGTGCGTCTGTATCTGGTAATACAGTAACTGCGGCTGGGGCACTATCTGGTGGTTCTCTTGCAGTAACTGGTGCTGGTTCTATGGCTTCACTAACTGTTCCAAGTATTACTGGTGACACTACTTTTGCTAATAACGTAACTATTACTGGAACACTAACTCCGAGTAGTATAGATTTAAGCACTACTGATGTAAGTGCTGCTTCTTTAACAACTACTGGTAACGTAACTGTTGGTGGTTCTCTTGCAGTAACTGGTGCTATTGATTTGTCTGCTGCTGATGTAGTAACAAAATCAGTTAGTGCAACTAACCCAAGTACATTTGGTGTAATTAATGCATCTTCTGTTGCCGCAACTGGTGACGTTTCAGGTGGCACACTAACTACTACTGGTGCAGCGAAAGTAGGAACACTAACTAGTACTGGTGTAGTATCTGGTTCGCGTTTGTCTTCTGGTACTGCAACAATCACAACTTCTGTAACAGTTCCAACTTTACAAGCTGAAGCTGCTGGTGCTGGTACACTAAATCTAGCAAGTAATGTTGTCGCGGCAAAAGATCTAACTGTCACTGGTGTATTCAAACCTGAAGGTGGTCTTGATCTAACAACTGTTGATATTACTGCAAACTCACTAACTACTACTGCTGATGTTAATGTTGGTGGAAACTTAGTAGTTGATGGTACTTTTGACCTAAGTGCTGCTGATGTGTCTGTGAAATCTCTTGCAAGTGCAGAGACAATTACAAGTGCTGGTGTTATTACCGTTACCGATTCAACCAATACTAGTTCGTTACCTAAAATTACTTCAACTGATGCAACACTCTTTACAGTAAATGCAGGTACTATTAATGCAACTGGTAACAGTGTACTACAAAGTGTATCAGCTACTCAAGTAACTGCTAATAGTGCTGAATTTTCTGGTGGTGGCCTTGGTCTTCAAGTTGATAATGATGCAAACGTTGGTGGTGCATTATCTGTTGGTGGCATTGCAACTGTTGGTTCTTTAACAACAACTGCTGCTTCTCTTAATATTGCAAAAAATACTGCAATCACTGGTGATTTAGCTGTATCTGGCACACTAACTGCTGGTTCAATCGACCTAAGCAATACTGATGTAACCGTTAAATCTCTTGATTCACTAGGTAACGCACACATTGCTGGTAACCTAACTGTAGATGGTGCATTCGACTTAAGTGCAACTAACCTTGTAGCTGCAAGTCTAGCAAGTACTGGTTCTACTACTGTTGGAACTGATCTAGTACTAACAACTGGTGTTGTGACTGGTAGCCCAGCTATCTCTGGTAATACAACAATCGGTGGAACTCTTGGTGTAACTGGTGCTGTTAACCTAACTGATATTGTTAATATCGGTAAGAAAGTAACAGTGAGTACTGGTGGTATTCAGGTAGTTGATGGTGGTATCAATACTAACACAATTAACGTTTCTGGTGCTTCTACTCTAGCAGGAACTTCCATTACTGGAACTTTAGGTGTAACTGGTGCTTCTACTCTAGCAGGTGTATCTGCGACATCACTAACAGTTTCTGGTGACAGTACTGTTCAGAAACTAACTGTCCAAGGTGAATTGATCCCACAAGGTGGTCTTGACCTAAGCGGTGCAGACATTACTGCTAATAGTCTAACTACTGCGACAACTATCAATGCAACTGGCCTAAGTACTCTAAGTGGTGGTGTTAGTACTTCTACTGTGACTGCATCTGGTCTAGCAACTGTTGGAAGTTTAACTTCTACTGCAAACGCATCAGTTGGTGGTAATTTGGGTGTAACTGGAACTCTAGGTGTTACTGGTGCAACTACTGTATCTTCACTAACAGCTACTGGTGCAGTGAAAACTGGTACAACCCTAACTGTTGGTACTCCAGTTGGTGAACAACCTGAAACTGTACAGATCATTCCAGATACTTATATTGCTGGTAAATTGCGTGTAATCGGTGGTATTAACGCTGAAATCGACGTAAGTGGTCAAACACTAGAACCATATGCAATTGAAGCTGCTGCAACACTATCTGCTGTTGGTAACATTACTTCTGGTGCAACCATCGTTTCTAAAGCTGCAACAATTGGTGATGTTGGTTCACAAAACAACAACCTAACTGTTAATGGTAACGTAGTAACTAATGGTGACTTCACCGTTACTGGTGTACTAAATGCACAATTGAACCAAGCAGATTCCGATGTAGCTGTTAAGTCTTTGACTGCAACTAATAACGTTGCGGCTGGTACTTCAATCACTGCTGGAACATCCATCACTGCATCAGGCTTACTAAAAGGTAATTCGTTAGAAGTCACCACTACTGGTTCATTTGGTGGTGCAGTAACTATGTCAAGTGGTGCAAACATCACTGGTACTGTTGGTATCACTGCTGGTGACCTAACAGTAGGTGGTAATATCTCTGCAACTGGTACTGCTGGATTCGGTGCAACAACCGTTTCTACCATTACAACATCAGGTTTAGCTACCCTTGCAAGTGCATCTGTAACTGGTGCTCTAACTGTAGGTGGTACATTAACTGCAAATGGTAACACTGTGATTGGTGATGCTGCTGCTGATACTTTAACTGTAAATGCAACATCTACATTTAAAGAGAACGCAACATTTGATAAGAACCTAACAGTGACTGGTTCTATTAACACCACCACTGCAAACTTCACTACAAACAACATGGTAACTAAGAAATATTCTGTTATCCCTGCTAGTGTTACTGCTTCTACTGCTGCTGTAGGTGGCACTTGGACACCAGATGGTACTACTAACGTATATCGCTTAACTCTTGACCAAAGTGTTACAATGGATTCCATCGCGGGTCTAATTGGTAGTGGTCAAGCATGTTCAGTGTATATCTATGTAACTCCATCTGTTGCTGATACTACTTTCACCTTCGGTGGTGCATACTCTGTAGTTTCTGGTACAGTAAGTGCTGTAGTTGGTCAAACAAGTATTATCCAAGTAATCTATGATGGTTTCAGTACTGTGTTTGATACCTTCGTTGCACAACGTGTATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
6f1d09b2d7b20778cd2964616fdc1a2a05bf1b0dad37e9c402ba719b0baa4827
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Ecwhy_1, Complete genome sequences of 3 novel enterobacteria, Pakpunavirus like phages | Yuan,S., Ma,Y. and Liu,Q. | 2020-07-27 | — | GenBank |