Protein

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Genbank accession
QMV33885.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,73
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVRPAPTVLAEGELAINLKDRLLFTKDDTGAIIDLGFAKGGNIDGNVIHKGNYNQTGAYTIAGDISQTSGHFTTTGNITANGDITAKARLMTDNGEVLVRGTGTTHVRFQDLADARERGIIYSQNRTGDTKQILNVRVQDYTNSTSNIFAFNGDGLFYAPSISGGTSVKSPVIYTNTVDTGNKSALDYDISSLANNNPASSSATAINYLRISRHAVDGIRYRELNNVNGISWHSISTAGTAKYLWSFNADGDVKTSNSLSVGLPGDSSGYSTLGPSAIALGDNNTGLKWRQDGQFHIVNNGAYTLLTTPTEVTSLKQLVAGYSTNGSDLILPTTQNYPLVIVNTTNDKNGFGDGQTLLGYHQSGKYHHYFRGKGVTNVNTDGGLLVTPGNVEVRGGSVNIDGLSNASTVLFKGNTTGSSSVDNIELKVWGDTFNTVDGSRKNVMETSDATGWMHYIQRTTAGKVESYLNGTMNVIEGLTVNQDTSLKRNLYVSNEIKVRAASGLRIWNDKYGVIFRNSEDQLHIIPTNVNAGESGGLGPLRPLSITLDTGQVKIPNLAADQVSFIANSVLEFPAGNGASYANQNTTKAPLYQTLGAATQAFYPITKQKNTVSNVTITQGMDRATSEYRIVAQGDLLGNGDVTGLKYWRFTKEGNFIAQNRLYAGTAYMNTDGNIAGSIWKKYSGATNLDSAVNTRVGKGGDTMTGRLTLNANSDAIVINSAATESGYMKGQKAGIDNWYVGNGGADNAVSIYSFQTNSGVNINAGGDIALNPQGSATFNFNRDRLFINGSVWAAHQAGDWGTQWKQEAPVFVDFGNVGNDSYYPIIKGKSGITNEGYVSGVDFGMRRITNTWAQGIIRVGNQENGSDPQAIYEFHHNGVMYVPNMVKTGARLSAGGGDPVWTGPCLVIGDNDTGLVHGGDGRINMVANGMHIASWSSAYHIHEGLWDTNGALWTEQGRAIMSYGHLVQANDSYSTYVRDVYVRSDIRVKKDLVKFENASQKLSKINGYTYMQKRGLDEEGNQKWEPNAGLIAQEVQSILPELVEGDPDGEALLRLNYNGVIGLNTAAINEHTAEIAELKSEIEELKALIKSLLK
Physico‐chemical
properties
protein length:1109 AA
molecular weight: 119323,14400 Da
isoelectric point:6,23589
aromaticity:0,08296
hydropathy:-0,35636

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–709
DC_0538 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
DC_0339
STR
575–1051
DC_0339 Coil
IPR030392
CHP
999–1058
IPR030392
DC_0227
RBD
1036–1109
DC_0227
QMV33885.1
1 1109
Architecture
STR
RBD
STR 1-1051 | RBD 1052-1109
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QMV33885.1
1 1109
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 57 57 0,5710
Central domain 58 256 200 0,2325
C-terminal 257 1109 852 0,8022
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-57
Central
58-256
C-terminal
257-1109

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage DK-13
[NCBI] 		2746075 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QMV33885.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT611523 [NCBI]
CDS location
range 74681 -> 78010
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGTAAGGTTGCCGGCGTTCGTCCGGCGCCAACAGTTCTTGCTGAAGGTGAACTGGCTATCAACCTGAAAGACCGCTTACTTTTTACTAAAGATGACACCGGCGCCATCATCGACCTTGGCTTTGCTAAAGGTGGTAATATTGACGGTAACGTTATTCATAAAGGAAATTACAATCAAACCGGCGCCTATACTATAGCCGGAGATATTTCACAAACGTCTGGACATTTTACTACTACTGGTAATATAACAGCAAATGGTGATATTACTGCAAAAGCCCGTTTAATGACAGATAACGGTGAAGTTCTTGTACGAGGTACAGGAACCACTCATGTTCGATTCCAGGATTTGGCTGATGCTCGCGAAAGAGGTATAATTTATTCTCAAAACCGTACTGGGGATACCAAGCAAATCTTGAACGTTCGTGTCCAGGATTACACTAATTCAACATCTAATATTTTTGCATTCAACGGCGACGGTTTATTTTATGCTCCATCTATTTCCGGTGGAACATCGGTAAAATCTCCGGTAATTTATACTAATACCGTTGATACCGGTAATAAATCAGCTCTTGATTATGATATATCTTCATTAGCAAATAATAATCCTGCAAGTTCAAGCGCAACAGCTATTAACTATCTTAGAATAAGTAGACACGCTGTCGATGGAATTAGGTATCGTGAACTTAATAATGTAAATGGTATTTCATGGCATTCTATTTCTACAGCCGGAACAGCTAAGTATCTTTGGTCATTTAATGCAGATGGAGATGTCAAAACATCAAATTCTCTTTCCGTTGGCCTACCTGGGGATAGCTCAGGATACTCAACATTAGGTCCGTCTGCTATCGCACTTGGCGACAATAACACAGGTTTGAAATGGAGACAAGACGGCCAGTTCCATATAGTTAATAATGGAGCTTATACTTTACTTACAACTCCGACTGAAGTTACAAGCCTTAAACAGTTAGTTGCGGGTTATTCAACCAACGGTTCTGATTTAATTCTCCCTACAACCCAAAACTATCCATTAGTTATTGTTAATACTACTAATGATAAAAACGGCTTCGGTGACGGTCAAACTCTTTTAGGATATCACCAAAGCGGCAAATATCACCATTATTTTCGTGGCAAAGGTGTAACAAACGTTAACACCGATGGTGGGTTGTTGGTTACTCCTGGTAACGTTGAAGTCCGTGGTGGTTCGGTTAATATTGATGGTCTCAGTAATGCTTCGACAGTGCTTTTTAAAGGAAATACTACAGGTTCTAGTTCAGTTGATAATATAGAGCTCAAAGTTTGGGGTGACACTTTTAATACGGTAGATGGTTCTCGTAAAAACGTAATGGAAACATCTGATGCTACCGGCTGGATGCATTATATTCAACGAACTACAGCAGGTAAAGTCGAATCCTATTTAAATGGTACCATGAATGTAATTGAAGGATTGACTGTCAATCAAGATACATCCTTAAAACGCAATCTGTATGTTTCTAATGAAATTAAAGTTCGCGCTGCTAGTGGTCTTCGTATTTGGAACGATAAGTACGGTGTTATTTTTCGAAATTCGGAAGACCAGCTGCATATTATCCCGACCAATGTTAATGCCGGCGAAAGTGGCGGATTAGGCCCATTACGCCCATTAAGTATTACGTTAGACACTGGTCAAGTTAAAATCCCTAATTTAGCGGCTGACCAAGTTTCTTTTATTGCTAACAGCGTATTAGAATTCCCTGCTGGTAATGGTGCATCTTATGCCAACCAGAATACGACTAAAGCTCCGTTGTATCAAACACTTGGTGCAGCAACCCAAGCATTCTATCCAATTACCAAGCAGAAAAATACAGTTTCTAATGTAACTATTACTCAAGGTATGGACCGCGCTACGAGCGAATACCGAATTGTTGCTCAAGGTGATTTGCTTGGTAATGGTGATGTTACAGGATTAAAATACTGGCGCTTTACCAAAGAAGGTAACTTCATAGCTCAGAACCGCTTATATGCCGGTACAGCTTATATGAATACCGATGGTAATATTGCAGGTTCTATTTGGAAAAAGTATAGCGGTGCTACTAACCTTGATTCTGCGGTGAATACTCGTGTAGGTAAAGGCGGCGATACAATGACAGGCCGTTTAACTCTTAATGCAAACTCGGATGCTATTGTTATTAACAGTGCTGCAACCGAATCTGGTTATATGAAAGGACAAAAAGCTGGTATTGATAACTGGTATGTAGGTAACGGCGGTGCCGATAATGCTGTATCAATTTATAGTTTTCAAACTAATTCAGGTGTTAATATTAATGCAGGTGGTGATATTGCTTTAAACCCACAAGGTTCAGCCACTTTTAATTTTAATAGGGACAGACTTTTTATTAATGGCTCTGTCTGGGCGGCTCACCAAGCTGGCGATTGGGGAACCCAATGGAAGCAAGAAGCTCCGGTATTTGTAGATTTTGGTAATGTTGGTAATGATAGTTATTATCCGATTATCAAAGGAAAATCTGGTATTACTAATGAAGGATATGTATCGGGTGTTGATTTCGGTATGCGTCGTATTACTAATACATGGGCCCAAGGTATTATTCGTGTAGGTAACCAGGAAAACGGTTCCGACCCACAAGCTATATATGAATTCCACCACAATGGAGTTATGTATGTTCCTAACATGGTTAAAACTGGAGCAAGATTATCAGCTGGTGGTGGTGACCCTGTATGGACCGGCCCGTGTCTTGTTATTGGTGATAATGATACAGGATTAGTTCATGGTGGTGACGGCCGAATCAATATGGTTGCCAATGGTATGCATATTGCATCTTGGTCTAGCGCTTATCATATCCATGAAGGTCTTTGGGATACCAATGGTGCTTTGTGGACTGAGCAAGGAAGAGCTATTATGTCTTATGGTCATCTTGTTCAGGCAAACGACAGCTATTCTACATATGTTCGAGATGTTTATGTCCGTTCTGATATTCGTGTTAAAAAAGACCTTGTTAAATTTGAAAATGCTTCTCAGAAGCTTTCTAAAATCAACGGTTACACTTATATGCAGAAACGTGGCCTGGATGAAGAAGGTAATCAGAAATGGGAACCTAACGCTGGTTTAATTGCTCAAGAAGTTCAATCTATTTTACCTGAATTGGTTGAAGGCGACCCTGATGGTGAAGCTTTACTTCGTTTAAACTATAACGGTGTAATTGGTTTAAATACAGCTGCAATCAATGAGCATACTGCAGAAATTGCAGAACTTAAGTCAGAGATTGAAGAACTTAAAGCATTAATTAAATCATTGTTAAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
afbfc5125c161dfa6b9088b425397caebda27ee40ade71d8eb3436f80b3d4c1e
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5401
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50