Protein

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Genbank accession
QQO92438.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,84
Protein sequence
MEDKDKNLLQISEEMNSIKSKINSLVQDQDSIKNLSEDNKNKINVLNENLDNIDKENDNLIEKLRNLDGSHDIDLDLSNYVTLDTLKTELRKYQKLSIDYIDRLAEGGWDSDIKGNLENLNGRVSANEESISSTMSKVNKYESSIQYLSTKVEQTAESIKSIATDYTLNEINQSITKLESFREQTARVLQDTVTRADIDTMNNKVTEFESQVSQFADLIEQTVSKSEIDGITIGGKNLLENSLAIKGNWLLYPESLSSTKENALTFGQDNNGKSYFTINTDGIEGEVGAISYNSFPLKYNETYTISFDFRSDTFNRLDHCYFIDPSGNYTTPISEKYLDIDEEWHRYSFVYKQTLTGRNSTKLLIGVDTNLNQLNGTFDISSVKVERGSVSSDWTPAPEDFDNMLENYNKDINSKIDNIEENAIGLGDTVTEAFKDGIISNAEKIAIEKQKNIIDKDKKEIDQIFNSLYANKMMTNSVKTELKNNYDLFNEKYNILLQDITNTISDGIATKEEVAQFNTNFLRYNEAQSNIKSSIQKAVDNISNGYAVDEASKITVGGMNLVSYENILAIGSATLNKNTYKENGEMNVALTANGQGIKFKLDKVRNRREHVLGFNLEKKTGTLTNVDINIPNASVTSCSVNGNKIGSDSRSITFNDTTSLTFIEVVFIPNDSFTASNLIEMVINRNGAFPLSVDVEGLKVEEGNKATAWQPSINDSNARITNMESRISQTESKIDLSVTKETYNADKSKMEKMGSALSILANGISMSSSSNDKLSTFDIDPNSIALKSNMVNINDGDVIIQNGRATIKEASITNLMSKNIVIQTMMDAMGQVKGGMTIKRPDGGYIIYNGMPQFATAYVRSEPGVQDLMSNGTPRFKNVGNAFMFSDKTTGSYFRRAMTLYGQHETRWLHIGIWYATPQCGIDIKVDSFNEQNGVIFDKTISIAKDTSTSVTKTKFKEIRVDMGTPHQSIASIAIRARVKPGQKGNAWFLNSYIYGRN
Physico‐chemical
properties
protein length:998 AA
molecular weight: 111477,21740 Da
isoelectric point:4,99560
aromaticity:0,07615
hydropathy:-0,52315

Domains

Domains [InterPro]
DC_2057
STR
1–424
DC_2057 Coil
Coil
Unmapped
36–70
Coil G3DSA:2.60.120.260
IPR008979
STR
270–387
IPR008979
DC_1272
STR
323–750
DC_1272
QQO92438.1
1 998
Architecture
STR
STR 1-750 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage Machias
[NCBI] 		2797423 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Staphylococcus aureus
[NCBI] 		1280 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QQO92438.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW349128 [NCBI]
CDS location
range 24718 -> 27714
strand -
CDS
ATGGAAGATAAAGATAAAAATCTCTTACAAATAAGTGAAGAGATGAATTCTATTAAGTCTAAGATAAATTCTTTAGTTCAAGATCAAGATAGTATTAAGAATTTATCAGAAGATAATAAGAATAAGATTAATGTACTTAATGAAAATCTGGATAATATTGATAAAGAAAATGATAACTTAATAGAAAAATTAAGAAATTTAGATGGTAGTCATGATATTGATTTAGATCTTTCTAATTATGTTACACTTGATACACTTAAAACAGAATTAAGAAAATATCAAAAATTAAGTATTGACTATATTGATAGATTAGCTGAAGGTGGTTGGGATTCTGATATTAAAGGTAATTTAGAAAACCTTAATGGCAGAGTCTCAGCTAATGAAGAATCAATTTCTTCAACTATGTCTAAAGTTAATAAATATGAATCATCTATACAATATTTAAGTACTAAAGTTGAACAAACAGCTGAGTCTATTAAGAGTATTGCTACTGATTACACACTTAATGAAATTAATCAAAGTATTACTAAATTAGAATCATTTAGAGAACAAACAGCTAGAGTTTTACAAGATACAGTTACTAGAGCTGATATAGATACTATGAATAATAAAGTAACTGAATTTGAAAGTCAAGTATCTCAGTTTGCAGATTTAATAGAACAGACTGTTTCTAAATCAGAAATTGACGGAATTACTATTGGTGGTAAAAACTTACTAGAAAATTCATTAGCTATTAAAGGTAATTGGTTATTATACCCTGAAAGTTTATCTTCAACTAAAGAGAATGCTTTAACATTCGGTCAAGATAATAACGGTAAGAGTTATTTTACTATTAATACCGATGGAATAGAAGGAGAAGTTGGAGCTATAAGCTATAATTCTTTCCCTTTAAAATATAATGAGACTTATACTATTTCATTTGATTTTAGATCAGATACATTTAATAGACTTGATCATTGTTACTTTATTGATCCTTCAGGTAATTATACTACACCTATTTCTGAAAAATATTTAGATATTGATGAAGAATGGCATAGATATTCATTTGTATATAAACAAACTTTAACTGGAAGAAATAGTACAAAATTATTAATTGGTGTGGATACTAATTTAAATCAATTAAATGGTACATTTGATATATCTAGTGTTAAAGTTGAAAGAGGTAGTGTATCATCTGACTGGACTCCTGCTCCAGAAGACTTTGATAATATGTTAGAGAATTATAACAAAGATATCAATAGTAAAATAGATAATATTGAAGAGAATGCCATTGGATTAGGAGATACTGTTACTGAAGCTTTTAAAGATGGTATTATATCTAATGCAGAAAAAATAGCTATTGAAAAGCAAAAGAATATCATTGATAAAGATAAAAAAGAAATAGATCAAATATTTAATTCATTATATGCAAATAAAATGATGACAAATAGTGTTAAAACTGAATTGAAAAATAATTATGATTTATTCAATGAAAAATATAATATATTACTACAAGATATAACTAATACAATTTCAGATGGAATAGCTACTAAAGAAGAAGTAGCTCAATTTAATACAAATTTCTTAAGATATAATGAAGCACAGTCAAATATTAAATCATCTATTCAAAAGGCAGTAGATAATATTTCTAATGGATATGCAGTTGATGAAGCTAGCAAAATCACTGTAGGTGGAATGAACTTAGTAAGTTATGAAAATATTTTAGCTATAGGATCTGCAACTCTAAATAAGAATACTTATAAAGAGAACGGTGAAATGAATGTAGCTTTAACTGCTAACGGACAAGGTATTAAATTTAAATTAGATAAAGTGAGAAATAGACGTGAACATGTATTAGGTTTTAATTTAGAAAAGAAAACTGGGACACTTACAAATGTTGATATTAATATTCCTAATGCTTCTGTAACTTCTTGTTCTGTTAATGGTAATAAAATTGGAAGTGATTCTAGAAGTATTACATTTAACGATACAACATCATTAACATTTATTGAAGTTGTATTTATACCTAATGACAGTTTCACAGCTAGTAATCTTATAGAAATGGTTATTAATCGTAATGGTGCATTCCCATTATCTGTAGATGTAGAAGGATTAAAAGTAGAAGAAGGTAATAAAGCTACTGCTTGGCAACCTTCAATAAATGATAGTAATGCTAGAATAACTAATATGGAAAGTAGAATCAGTCAAACTGAATCTAAAATAGACTTATCTGTAACAAAAGAAACATATAATGCAGATAAATCTAAAATGGAAAAAATGGGTTCTGCATTATCTATATTAGCAAACGGTATTTCTATGTCATCTAGTTCAAATGATAAGCTATCTACTTTTGATATTGATCCTAATAGTATTGCTCTTAAATCTAATATGGTTAATATTAATGATGGAGACGTTATTATTCAAAATGGTAGAGCTACTATTAAAGAAGCTTCTATTACTAATTTGATGTCTAAAAATATAGTTATCCAAACTATGATGGATGCAATGGGACAAGTTAAAGGTGGTATGACGATAAAACGTCCAGATGGAGGTTATATTATATACAATGGTATGCCTCAGTTTGCTACAGCTTATGTACGTTCAGAACCAGGGGTACAAGATTTAATGTCTAATGGTACACCTAGATTTAAAAATGTTGGTAATGCATTTATGTTTAGTGATAAAACTACAGGTAGTTATTTCAGACGTGCAATGACTCTATACGGTCAACATGAAACTAGATGGTTGCATATAGGTATTTGGTATGCTACTCCACAATGTGGAATAGATATTAAAGTAGATTCATTTAATGAACAAAATGGTGTTATCTTTGATAAAACTATTTCTATAGCTAAAGATACTTCAACTAGTGTAACTAAGACTAAATTTAAAGAGATAAGAGTAGATATGGGAACTCCTCACCAATCTATAGCATCCATTGCTATTAGAGCTAGAGTTAAACCGGGTCAAAAAGGTAATGCTTGGTTCTTAAACTCTTATATTTATGGTAGAAATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
ba152196a0b564a3c129d45e56c41bbb1ec65d610ba69b1c88823d91179cfb06
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3231
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Staphylococcus phage Machias Korn,A., Hillhouse,A. and Gill,J. 2019-07-18 — GenBank