Protein

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Genbank accession
UIS66071.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,63
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,68
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYSVLSDGVNVDFFIEENTVQQYDATRGYKKNFAVINDNRIWVAQRDIAAPAGAFTPQYWLATRTDPKWETVASPTRQLNSGEFIAVDSAASFTTFTLPPNPVDGDTIVIKDIGGNVGYNEIKIQSSNVPGAGNQKIVRFGNQYPEILITKPFSYNMLIFSNRLWQFWEAGNEERGIRVEPSTGRFHAQAGDFIMRRYTTGAPITFILPKYANQGDIVKSVDIDGMGPTFHLMVETFDTSSSLGKAGQHQMEFRTTGDGFFVYNAAEKLWYVWDGDNKTRLRVIRDSVKLLPNESIIVFGEDNSTPATINIDLPTNVLQGDIVKIALNYLRKSQTVNIRAAVGDKIASDIKLLQFPKRSEYPPDTTWVLVDSLTFNGNISYTPVIELSYAEDTVAGTSYWVVAQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALANQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVAKENQRGIARIATTAQVNQNSDFAFVDDVIISPKKLNERTATETRRGLAELATQQETDAGVDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYVSTTGTTPAASRELNGTNVYNKNTVNLVVSPKALDQYKATYTQQGAVILAVESEVIAGTSQSGWANAVVTPEMLHRKTALDSRIGLIEIATQVETDAGTDYTRAVTPKTLNDRKASETLTGIAEIATQSEFDTGTDDTRISTPLKIKNRFNNTARTSVNALSGLVETGTLWDHYSLNILEANETQRGTARLATQGEVNTGTDDKTIVTPLKLMSKKATENAEGIVRIATNAEATAGTSKVLAISPSALKYIAQTETTWEASETLRGFVRLSSGAATSAATTTTGAGFTYANGVYTPDPSKLVSYAKSGYAVSPYELNRVLQNFLPINAMAVNAEKLDNLDSTQFIRRDIAQTVEGALTLTKQTNISAPVVSTSTAVFTDVTAGTSTFGTVNVVNGTNKWKITAPSAGTTMTIGDTTNVLTLNTASGNVAVLNNLSAGNDVQAKNNYVLNGRTIATTTGEASGATLALGDNSQNLVLKTLDAGNIIANGGGAFKVLTEKNAVEIVDRNFVNQAGDTMSGVLRVNAPVRVFGTKPSLIAQAPTADTVGFWSVDINDEPTYSQFPGYWTMKLKRQVNIDTVQTKPAGVTDEVWNASGWLTENGTFASPAIRYRNDDGSLGDEVLSSSGQKLRGTWFDYSVRDKQIKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKSAWTTFAMVYTADNPPSAEDVGALPADNTTMGNLTILDWLRIGNVRIIPDPTTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1318 AA
molecular weight: 142977,17430 Da
isoelectric point:5,25882
aromaticity:0,07891
hydropathy:-0,28263

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
12–126
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1112–1145
IPR048391 IPR048391
UIS66071.1
1 1318
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 12-126 | STR 349-1111 | ATT 1112-1145 | STR 1146-1204 | ATT 1205-1266 | STR 1267-1300 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage PSD2001
[NCBI] 		2880889 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UIS66071.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OK254198.1 [NCBI]
CDS location
range 103697 -> 107653
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCAGCATTCAGAGCAACATCCGGTCTCGATGCTGCTGGTGAGAAAGTCATTAATGTCGCAAAAGCTGATTACTCAGTTTTATCAGACGGCGTTAACGTAGATTTCTTTATAGAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATGCAACACGCGGATACAAAAAGAACTTTGCAGTTATTAATGATAACCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATCGCGGCTCCTGCGGGAGCATTTACCCCTCAGTATTGGTTAGCAACTCGTACTGACCCGAAATGGGAAACTGTTGCATCTCCAACTCGTCAGCTTAACTCGGGTGAATTTATCGCCGTCGACTCGGCTGCAAGCTTTACCACATTTACATTGCCTCCAAACCCGGTTGACGGTGATACCATCGTTATTAAAGATATCGGTGGGAACGTTGGTTACAATGAAATTAAAATCCAGTCAAGCAACGTACCAGGGGCAGGTAACCAAAAGATTGTTCGCTTTGGTAATCAGTATCCGGAAATTTTAATTACCAAACCATTCTCTTATAACATGCTTATCTTTTCAAACCGCTTATGGCAATTTTGGGAAGCTGGCAACGAAGAACGTGGCATCAGAGTAGAACCATCAACGGGTCGTTTCCATGCACAAGCTGGCGACTTTATTATGCGTCGTTATACAACTGGTGCACCGATTACTTTCATTCTTCCTAAGTATGCAAACCAGGGTGATATTGTCAAATCTGTTGATATCGATGGCATGGGACCAACGTTCCACCTGATGGTTGAAACTTTTGACACCAGTTCCAGTCTTGGAAAAGCTGGCCAGCATCAAATGGAATTCCGTACCACAGGTGATGGTTTCTTCGTTTATAATGCTGCCGAAAAACTCTGGTATGTTTGGGACGGTGATAATAAAACTCGTCTGCGCGTTATTCGTGACAGTGTTAAACTTTTACCAAACGAAAGCATCATTGTATTTGGCGAAGATAACTCAACTCCGGCAACGATTAATATCGATTTACCAACTAATGTTTTACAAGGTGACATTGTTAAAATTGCGCTGAACTATCTCCGCAAATCACAGACCGTTAATATAAGAGCTGCTGTTGGTGATAAGATTGCATCTGACATTAAATTGCTACAATTCCCTAAACGTTCCGAGTATCCACCGGATACAACTTGGGTGCTGGTTGATTCATTAACCTTTAATGGCAACATCAGTTATACTCCGGTTATTGAATTGTCATATGCAGAAGATACAGTGGCTGGAACAAGTTATTGGGTTGTCGCTCAGAACGTCCCGACTGTCGAACGAGTTGACTCATTAAATGATTCCACGCGCGCACGTCTTGGTGTTATTGCTCTGGCAAACCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAATCCAGAGAAAGAACTTGCAATTACCCCTCAGACTTTAGCCAACCGTGTTGCTAAAGAGAACCAACGAGGCATTGCCAGAATCGCAACGACTGCTCAAGTAAATCAGAACAGTGATTTTGCATTTGTTGATGATGTAATTATTTCTCCGAAAAAACTCAATGAACGTACGGCAACAGAAACGAGACGTGGGCTCGCAGAACTCGCCACACAGCAAGAAACCGATGCAGGTGTAGATGATACCACAATTATCACTCCAAAGAAACTGCAAGCGCGTCAGGGCTCAGAATCGCTATCTGGTATTGTAACTTACGTTTCAACGACTGGTACAACTCCTGCTGCTTCACGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAATACGGTTAATCTGGTTGTTTCCCCGAAAGCTCTTGACCAGTACAAAGCTACTTACACTCAGCAAGGCGCGGTTATTCTTGCGGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGTACTTCTCAATCTGGATGGGCAAACGCAGTCGTTACTCCAGAAATGTTACATCGCAAAACTGCTCTTGATTCCCGTATCGGTTTAATCGAGATTGCTACCCAGGTTGAAACAGATGCAGGAACCGATTATACCAGAGCTGTGACTCCCAAAACGTTAAATGACCGTAAAGCATCAGAAACGTTAACCGGCATAGCCGAGATTGCTACGCAATCAGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCAACCCCATTAAAAATTAAAAATAGATTTAATAATACTGCTCGTACTTCTGTTAATGCATTAAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACGCTCTGGGACCATTATAGCCTGAATATTCTTGAAGCAAATGAGACTCAGCGTGGCACAGCAAGATTAGCAACTCAGGGCGAAGTCAATACTGGCACTGACGATAAAACAATCGTTACTCCGCTTAAATTGATGTCGAAAAAAGCTACTGAAAATGCCGAAGGTATTGTTCGCATCGCGACAAACGCAGAAGCAACAGCAGGCACATCAAAAGTCTTGGCCATTAGTCCGTCTGCGCTGAAATATATTGCACAAACGGAAACAACCTGGGAAGCATCTGAAACACTGCGTGGATTTGTTCGTTTATCTTCTGGTGCAGCTACTTCGGCCGCAACTACAACGACTGGTGCAGGATTTACATATGCAAATGGTGTGTATACTCCGGACCCAAGTAAACTGGTTAGCTATGCAAAATCTGGATATGCAGTTTCGCCTTACGAATTAAACCGCGTATTGCAAAACTTCTTACCGATAAATGCAATGGCTGTTAATGCCGAAAAACTGGATAACCTCGATTCGACCCAGTTTATTCGTCGTGATATTGCTCAGACTGTTGAAGGTGCGTTAACTCTTACTAAACAGACAAATATCTCTGCTCCGGTTGTATCGACGAGCACTGCAGTGTTTACTGATGTAACGGCTGGCACTTCGACGTTCGGAACTGTGAATGTTGTTAACGGAACTAACAAGTGGAAAATCACTGCTCCTTCCGCCGGAACGACAATGACTATTGGCGATACGACTAACGTATTGACATTAAACACCGCCTCGGGTAATGTTGCTGTATTGAACAACCTCAGCGCCGGTAACGATGTTCAAGCCAAAAATAATTACGTTCTAAATGGTCGTACTATTGCAACCACGACGGGTGAAGCTTCTGGCGCAACTCTGGCTCTGGGTGATAACTCGCAGAATTTAGTGCTTAAAACTCTTGATGCTGGTAATATCATAGCAAACGGTGGCGGTGCATTTAAAGTCCTGACCGAGAAAAACGCTGTTGAGATTGTAGATAGAAACTTTGTTAACCAAGCCGGTGATACAATGTCTGGTGTGCTCCGTGTGAATGCTCCAGTCCGCGTATTCGGTACGAAACCAAGTCTTATCGCACAAGCCCCGACCGCAGATACTGTTGGCTTCTGGTCTGTCGATATCAATGATGAACCGACTTACAGCCAGTTCCCTGGCTACTGGACAATGAAGTTAAAACGTCAGGTAAACATTGATACAGTTCAAACTAAACCTGCTGGGGTAACTGATGAAGTTTGGAATGCTTCTGGTTGGTTAACTGAAAACGGAACTTTCGCCTCGCCTGCTATTCGTTATCGTAATGATGACGGCTCGCTCGGTGACGAAGTATTGAGTAGTTCTGGTCAGAAACTGCGCGGAACCTGGTTTGACTATTCAGTTCGTGATAAACAAATTAAATATCCTGGTACATTGACTCAGTTCGGTAATACGCTGGATTCGTGCTATCAAGATTGGGTTTGCTATCCAACTGGATTGAACGGTGGTACTATTCGTTATACCCGTACCTGGCAGAAAAATAAATCTGCATGGACGACTTTCGCAATGGTTTACACCGCGGATAACCCTCCATCTGCAGAGGATGTTGGTGCATTACCGGCTGACAACACAACGATGGGGAACTTAACCATTCTCGATTGGTTGCGTATCGGTAACGTGCGTATCATCCCAGACCCGACCACTAAATCCGTTAAGTTTGAATGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
35d09f8fd59438a332b3e8cd498422962caebcbf0cf3f3371867203d09c307db
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5451
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50