Protein
- Genbank accession
- YP_010355789.1 [GenBank]
- Protein name
- virion structural protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MADRFPLIVNAISKKIEEIVSGDNLELTGNGIVVSGDTGAGKYLSSDGTTVFWDSPGDVYLDQSQVITNKIFEACVISGALNTLSDIPNSSLVNSGITVNGTTIALGGTVITPDNNTTYSISAQDGLTASEKIVRLTSGGNIGAGIDDDVTFGVAVPSSVPTGSNALSLFIDRSGEKITISGHVIDNNTITTIDAPGGTATSGAISFTSTGAATVSMTGSTVNIDALDTDTRTKIRAGSGGTYGPADTTEGRFTFLDGTGTTVSQGVDGSGDATITYTSTDTVTQIRGGSTGSYKPSTSGTATTQISIEGGTALGGNVQVTESGNIILIDSTDTNTVTKVGSDNNGSPIAPQAGDFILKQAGATTITQTTNGSGQVEVVISSINSDTGASLTANNGLILSGSDFGLKNYNNLSGNTVMKWDNGNGQFADSIITDDGSTVIIDGDLTVSGTQTIFNTSVLQVEDNIIELRKGNNLVGFDGGIQVNRTSDPSGVITSYKGFQWHESGGYWRSWDGSVEQRFVTETETQVLTNKTLTNPTFTTPTLGAATATSVNGLEIATTASAVFDLQSGKTLDVDNDLTFTSDNSTGNVNVNFRVGGDVAYKSDTLASFASTTATQLRTLISGTTGIDDLVFQTNPVILTGLTTTSTGFSLINSGAQSIQFGGAATQIEIGNTSGTTTVSGDLVVEKDLTVGGANTDLLTCNARIDVANSDILIRGGSSDPMTVGRGNSEVASNTAIGKQALLSVVSGSQNTAVGYETGLTINSGAGNTGYGYQVLRSNGVGDLNTAMGRAAMISNLSGDGNTAIGSNALQTNTTGDANVCIGYYAGFAATGSGNVLIGPADSSDPVNDATYTPPTPGGNRQLVIGSGTEFWIKGDANFDVTISNDLTVNRTITVKGDLVVNGTTTTVKSNVVEIADKNIELAKVVSTTFTCSTADGSANITSISPTLGLIPGMVVTSNTGGVSVPNGTTIVSITGNSAVLSNNVTGTGTPTFSAIGPSDTAADGGGIILAGNTQHTFLWSNANDAWQSSEDMEVAQGKTYNIIDGSGNAREMLSLTQIGPTAGSGVVAGLGTGVTSSALTSIGTLTSLTVSGNVNFTGTGYLQLPSGTDAQQPGASGQPAAAEGMLRWNNTSNVFEGYDGNIWGKIGGGAAVQSAAPSPANPGDLWYDTDDGRMFVYYTDSSSSQWVDASPNGMPTDLTLDGTLTVDGTTNLIGDLSVGTETTNSNAGSQTLSVGSLAAGQSGGIQIWANSTNGNSFVQFGDGTASADQYRGYINYTHSNDRLGFGTAGENRFLIDNTGNIEPGADATQDLGSATKRFANIYSADLQLSNEGAANEVDGTWGQYTIQEGEEDLFLINRRSGKKYKFMLQEVN
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1373 AA molecular weight: 140263,42060 Da isoelectric point: 4,13108 aromaticity: 0,05899 hydropathy: -0,13518
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage ACG-2014e [NCBI] |
1493510 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] |
32051 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010355789.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_062736
[NCBI]
CDS location
range 162483 -> 166604
strand +
strand +
CDS
ATGGCTGACCGCTTTCCGTTAATTGTTAATGCAATTTCAAAGAAGATTGAAGAAATTGTATCAGGAGACAATTTAGAATTAACTGGCAACGGAATTGTTGTTAGTGGTGATACTGGTGCTGGTAAGTATTTGAGTAGTGATGGAACTACGGTATTTTGGGACAGTCCGGGTGATGTTTATCTAGATCAGTCTCAGGTAATAACTAATAAAATTTTTGAAGCGTGTGTTATTTCTGGTGCTCTTAATACACTTTCTGATATTCCAAATAGTTCCTTAGTTAATTCTGGAATTACTGTTAATGGAACTACTATTGCTTTGGGTGGTACTGTTATAACACCAGATAATAATACTACATATTCTATTTCTGCTCAAGATGGATTAACCGCATCTGAAAAAATTGTACGTTTAACTTCTGGTGGTAATATTGGCGCTGGTATTGACGATGATGTTACTTTTGGTGTTGCGGTTCCATCATCTGTTCCAACTGGTTCAAATGCTTTATCTTTATTCATTGACAGATCTGGTGAAAAAATTACAATATCTGGACATGTAATAGATAACAATACAATTACTACTATTGATGCTCCTGGTGGAACTGCAACTTCTGGAGCAATTAGTTTTACTTCTACTGGTGCTGCTACAGTTTCTATGACTGGAAGCACGGTTAATATTGATGCTCTTGATACAGATACAAGAACTAAAATTCGTGCAGGATCTGGTGGTACATATGGTCCTGCTGACACAACAGAAGGTAGATTCACATTTCTTGATGGAACTGGAACAACAGTATCTCAAGGTGTAGATGGCAGTGGTGATGCTACTATTACTTATACTTCTACAGATACTGTAACTCAAATTCGTGGTGGATCTACTGGAAGTTATAAACCATCTACTTCTGGAACAGCAACTACACAAATTTCTATTGAGGGTGGCACTGCTTTAGGAGGTAATGTACAAGTAACAGAATCTGGAAATATTATCTTAATTGATAGCACAGATACTAATACTGTTACGAAAGTTGGTAGTGATAACAATGGAAGTCCTATTGCACCACAGGCAGGAGACTTTATTCTCAAACAAGCTGGCGCTACAACTATTACACAGACTACAAATGGAAGTGGTCAAGTCGAAGTTGTAATTAGTTCAATTAATAGTGATACTGGTGCTAGTTTAACCGCTAATAATGGTCTTATATTATCAGGATCTGATTTTGGATTAAAGAATTATAATAATCTTAGTGGAAACACTGTGATGAAATGGGATAATGGTAATGGTCAGTTTGCTGATAGTATTATTACTGATGATGGTAGTACTGTTATTATTGATGGAGACTTAACTGTCTCAGGAACGCAAACTATTTTTAATACTAGTGTTCTTCAGGTAGAAGATAATATTATTGAACTAAGAAAAGGTAATAACTTAGTTGGATTTGATGGTGGTATTCAAGTTAATAGAACTTCTGATCCTTCTGGTGTTATTACTTCATATAAAGGATTCCAATGGCATGAAAGTGGTGGATACTGGAGATCTTGGGATGGTTCTGTTGAGCAAAGATTTGTAACAGAAACAGAGACGCAAGTTTTAACAAATAAAACTTTAACCAATCCTACATTTACAACACCAACACTTGGTGCTGCTACCGCAACTTCAGTCAATGGTTTGGAGATTGCTACTACTGCTTCTGCTGTTTTTGATCTCCAGTCTGGTAAAACACTTGATGTTGATAATGATTTAACGTTTACCTCTGATAATTCTACAGGAAATGTAAATGTAAACTTTAGAGTTGGTGGTGATGTAGCATATAAGTCAGATACTCTAGCATCATTTGCTTCTACGACAGCAACTCAATTGAGAACATTAATCAGTGGAACCACTGGTATTGATGATCTTGTTTTTCAAACTAATCCCGTTATCTTAACTGGTCTTACTACTACATCTACTGGTTTCTCACTAATTAATTCTGGTGCTCAATCTATTCAGTTTGGTGGTGCTGCAACTCAGATTGAAATTGGTAATACATCTGGTACTACAACTGTTAGTGGTGATTTAGTTGTTGAAAAAGATCTTACAGTTGGTGGTGCTAATACAGACCTCTTAACTTGTAATGCTAGAATTGATGTTGCTAACTCGGACATCTTGATTAGAGGTGGATCGAGTGATCCTATGACTGTAGGTAGAGGAAATAGTGAAGTAGCATCTAATACCGCGATTGGTAAGCAAGCATTATTATCTGTTGTTTCTGGTTCTCAAAATACTGCTGTTGGATATGAAACTGGATTAACAATAAATTCTGGAGCTGGAAATACTGGGTATGGATATCAAGTATTAAGATCCAATGGTGTTGGGGATCTTAACACTGCTATGGGTCGTGCTGCTATGATCTCCAACCTTTCTGGGGATGGCAATACGGCAATTGGTTCTAACGCACTTCAAACAAATACCACAGGAGATGCTAACGTTTGTATTGGATACTATGCTGGATTTGCTGCTACTGGATCTGGTAATGTTTTGATTGGTCCCGCTGACAGTTCAGATCCAGTTAATGATGCTACTTATACTCCGCCAACTCCTGGTGGTAATAGACAACTTGTTATTGGATCTGGTACTGAGTTCTGGATTAAAGGTGATGCAAACTTTGACGTTACTATTAGCAATGATCTAACAGTTAACCGTACTATTACAGTTAAGGGTGATTTAGTTGTCAATGGAACTACAACTACTGTAAAATCTAACGTTGTTGAAATTGCCGATAAAAATATTGAACTTGCCAAAGTTGTAAGTACTACATTTACTTGTTCTACTGCTGATGGTTCTGCAAATATTACATCAATCTCTCCAACTCTAGGATTGATTCCTGGTATGGTAGTTACATCTAATACAGGTGGAGTTAGCGTTCCTAATGGCACAACGATTGTATCTATCACTGGAAACAGTGCTGTGCTTTCCAATAATGTAACGGGAACTGGAACACCAACGTTTAGTGCTATCGGTCCTTCTGATACTGCAGCAGATGGCGGTGGTATTATTCTTGCTGGTAATACACAACACACTTTCTTATGGTCTAATGCTAATGATGCTTGGCAGTCTTCTGAAGACATGGAGGTTGCTCAAGGTAAGACTTACAACATTATTGATGGTTCTGGAAATGCTCGTGAAATGCTGAGTTTGACTCAGATCGGACCCACTGCTGGTAGTGGCGTTGTTGCTGGTCTTGGAACCGGTGTTACTAGTTCTGCTCTAACTTCTATTGGAACTCTAACTTCACTAACAGTATCTGGTAATGTTAACTTTACTGGAACAGGATATCTACAACTACCTTCTGGAACTGATGCTCAACAACCCGGAGCTTCTGGTCAACCTGCAGCAGCAGAAGGTATGCTACGTTGGAATAATACTTCCAATGTATTTGAGGGATATGATGGTAATATCTGGGGTAAGATTGGTGGCGGTGCTGCTGTTCAATCTGCTGCTCCTTCTCCTGCTAACCCCGGAGACCTTTGGTATGACACAGACGACGGACGCATGTTCGTATACTATACTGATAGCAGTTCAAGTCAGTGGGTTGATGCTTCACCAAACGGAATGCCAACTGATCTAACTCTTGATGGCACACTAACTGTTGATGGAACTACTAATTTGATTGGTGATCTTTCGGTTGGAACTGAAACAACAAATAGTAATGCTGGATCACAAACACTTTCTGTTGGATCACTTGCTGCTGGACAGTCTGGTGGAATTCAGATTTGGGCAAACTCAACAAATGGAAATTCTTTTGTTCAGTTTGGTGATGGAACTGCGAGTGCTGATCAATACCGTGGATATATCAATTATACACACTCCAATGACAGATTGGGATTTGGAACAGCAGGAGAAAACCGTTTCCTTATTGACAATACTGGAAACATTGAACCAGGAGCAGATGCCACACAAGATCTTGGTTCAGCAACTAAGCGTTTCGCAAACATCTACTCTGCTGACCTTCAACTATCTAACGAGGGTGCTGCTAACGAGGTAGATGGAACTTGGGGTCAGTACACTATTCAAGAGGGTGAGGAAGACCTGTTCCTGATAAATAGAAGAAGCGGTAAGAAGTACAAATTCATGCTTCAGGAGGTAAACTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
559121d98c1710e6f8a3bb607e0526d8ac287cd2cfb01808419124dd7488eaa9
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community | Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. | 2015-03-20 | — | GenBank |