Protein

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Genbank accession
WJZ47903.1 [GenBank]
Protein name
short tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MADQNFRVKHGIGIGTNTFADANRNINAGIATLRHAKVTGITTVGIISAVDGNGAQGIVTFQSRVGISSNGNQITISPPSAGAGITASYELILPPRAGTDGQTLTIGPNGQLGFTTAGLYENRLYVSAANGDDNNDGRALPVKTLKKAAQLASFRSFNLPGGRFLDAGNLLESNKEFIQNEVVSYLEFNYPNITTDKPDYDRSTCIRDVGYIVDAIVYDISYGGNSKTVEAALAYWSGGVSYVAGEEEEALFAYNYIGFIAQYIINNQTPPTLYQTAVSQTFDFTIVDDPDNVNANYFHRRKDARNLIVNNRQEIIDKSLAAVAIAHSDFYFPGEEQTNLRSRYYDSYRLIQQNRQTIIDYAYAGISSAYPSFSDPNPNKCKRDLGYYVDAVSTDVFTGGNNYSREFVIKYFNGTGAGSLTGEEQETIYAYGYAGTLMKEAITNQLPIKDLTLTADPLTGSNTDPASCADVQSNIDNLIGIVTSVIGAGSTAGIGTTANYGYFAGITTSCNVVCGGIGIGSTNVVGGRKCARDLGYIVDAIAQDVSYGSNQHIVYATKKYFDGVGAALTTGLFGEEQQSITAFQAARDYAKKAITNQLNVQDLTIIADPLTGFNTDPSSCANIQTNIDNLVGILTVAIGNSSLSSVPASGIGTITDCADVRSAIVSYVGIITTVIGIGSTAAPNVTLPSTQSQPIAIIVEAGDYQEDNPIILYEDVAVLGDNLRNTIIRPLNAGKDLFRVRNGCYVTNFAMKDYVDPAGIPQFTFDNAVAFDDPADPQTSRAGYATKLTKPVITRSPYIQNCSILSFLGANGILVDGAKVVTPNTPLIAEEAETPVVGAQPEQGRSMVAAAFTMVSFGGIGWRCINEGYAQVVSCFQIFCKYGSLCQSGGYLSITNSATNFGYYALRSTGWSPNSFAFDRGRVAATGISGGLQTLKVIGVGRTDQDLYVLRFYNNANQDQTSNFKPVTVQAQFNATTGINTATDTFLIASHPFSNQDTVLYIGDEGAVPPKVIGGLVSGNQYYLSYVDENSFQLYEDNSLTQLVNLTTPVVGIHTFQKGNLEFFVNEMLSSHGVYQSVGLATTALNFVSGRQILQQVPGGNAVGYALTFKSETKQLIVSVEESGGVRRLFGVSDGSLYLNIADHSGSPVSVAVTSVSGITTYRTVEFKVDSTPSGTTITGIANLPEDYQLWFHRPSIVNSSSHTWEYSGSGIDYNALPQNGGQTRVESEQVFELGGRVYSSGTNELGDFKIGSFITAFNRTGNIIFNNKVTIGVLASLRLSLSGGVEIEAFSTDVGLGDNEIGGAADSKVPTQKAVRTFLNNRLGNFIDKNLTTNAVPSAVVQLNATGQINADLIPPKVVNYYRANVSGGRTDLVNLIPTTNLQNGDTVIEPGNGYVLISDVYGQYLILSDDTRDYNFNNEDVVISANSAGGAIGIVTGPPVNAVGYGTTGLVKGVLLGVTITNGGNGYTNPGVYTCVLDRSGVGIGTSARAAITVGAGGTVTRVSVNFGGRYYASGDVITINDDNLIGGRSGGAKFTAVVNDIETRLYLALTNNQKFTGNVLLPDYIQDNDAVAISTDTSVGYGKTFDPTDTSTGGSVDFTNDRIIIGTSEFTDGDPIVYSANGGNLVGGLTQNNTYYIKKVGISSVELYSSYALSSKIDFTSSGTGTATITRVGVNTVTEQIIFTNHGYTTGDAVKTSGTTPTGITTDAYYFVGSVTTNSITLHATRADAVSSVNGLILNAVGIADTNGGTFSLTKQNVVYSSTINTSSAIFDNWTVLSSASIDGANITSGTVSPARLGSGNATDTTFLAGDSSYKKVITSVGIGTTQPLSATGTTFDAAPGGIGINTYYGKVELRLNRAAGTGDLYSTLGVAKFKTSTFSVDADGAVSIKPSSTGDIDAATLGGVAGAFFLDPANFTGNIPISRGGTGLSALPSLGAILQGNGLSYDLVTSPTFYGDVSVSNNGRLNALGIAATNISVTGATGIATFQNARITNQVISGVSTFSGSGNNINQTAGTAALNRLTVTGVTTVSTLFFESLGGTAGATIPYMTNTNTIHTGIVTFTSSANNIQQQAGTAELNNLTVAGVSTFVSLTNFGTANFGTVNITGTLDYANSQTSGISTFSGSGNNINQTAGTAKLNRLTVAGVSTLGVTTTSSLYATNLSVSGVTTFIGQVNAGILTSSDIRGPLTNTLTIQSPLTGNSYNNTNAVTLGINATSANTANYVVQRDSAGGFSAGIVTATFSGNASGTTATFTTGNITTVNSTNNYSTVGLITHLSGTNSNYSGISTASRFVSTVAQGTAPVSVASSTVVSNLNASYLEGYATASANSSGTIVRRDNSGDFTSNVITVNQLIATNNGNGTNVKIGDDAWIGDINVANTFRISGVSDATKGYITFGNQSNTALGRDGTGALTWGGETIWHSGNDGSTSGLDADLLDGLELHTGRNNEANKVVRTNGVGYLQTGWIDTDAPLMNQHIQPLRHYVSQDQYIRYLTTDRYKMWLGLTYKYTNARNLDTTDTNYWTGVMGWGQTDFNTVLTWGSGFIDTWNTPGNRPSTSYTHFTGHQVLHYTNGSTDGTGAYGYQMVIGSTRDSPLYLRSFWNAMGSWRVIPQYGMSTAAGDLYASIYYDSDNSAYYTNPASTSILNALIVNSVSLLQNPVGTTYGNGVSASPTYAISQTVGDSDGWRIYGESTATNNVRMVFELIDDIETAFEDQWLFRNKRTYGDYAATSPFYISGGGNSYSSSSSRAPIFYDQNDTGYYCDPNSSSFFVRLYGFRNNGGRCGSTSDGALQAYSTGNNSAFISFHKGGYYAVNMGLDDDNVLRIGGWSASANRWELDMSGNMWAASSVRAPIFYDTDNTGYYVSPQSDSQFSAVYANNWFRPQGDCGVYFQSYGRGLWAAESGGNSYGNTTTYGGGRNGWQGWGIGSRHVFMSTGGDNVGVHDNSRGWIWYWDGSYTRWDYGYTQFNDARSQIFYDSNNTAYYADPNSVSYFNDFRMNVIYDFNNTGYYLDPNGTSRINRIRSPNTFNATSGSAANVRMPGAESDWVRFTSSIEFKKDVETLEDSYVDHVLENVRPVWYRSKCNADNPLHSFYGFIAEEVEEIDPRLVGHDENMKPIDVQYTSFVPHLVNYIMRQKKKIESQQALIEDLINRVTNLETK
Physico‐chemical
properties
protein length:3161 AA
molecular weight: 336211,86870 Da
isoelectric point:4,86140
aromaticity:0,10092
hydropathy:-0,15501

Domains

Domains [InterPro]
DC_0231
STR
156–293
DC_0231 IPR009050 DC_0763 DC_0508
DC_0231
STR
289–402
DC_0231 IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
3053–3148
IPR030392
WJZ47903.1
1 3161
Architecture
STR
STR
STR
STR 156-413 | STR 461-1405 | STR 2599-3161
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage DSL-LC03
[NCBI] 		3058961 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WJZ47903.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR003938.1 [NCBI]
CDS location
range 55370 -> 64855
strand +
CDS
TTGGCAGATCAAAATTTTAGGGTAAAACATGGTATTGGTATCGGCACCAATACCTTCGCGGATGCAAATAGAAATATTAATGCTGGAATCGCTACGCTTCGTCATGCTAAAGTCACTGGCATTACAACTGTAGGTATTATTTCTGCAGTTGATGGGAATGGTGCTCAGGGTATTGTAACATTTCAATCAAGAGTTGGTATATCTTCTAATGGAAATCAAATTACAATTTCTCCTCCTAGTGCAGGAGCTGGAATTACTGCATCTTATGAATTAATTTTACCTCCAAGAGCAGGAACTGATGGTCAGACTTTAACAATAGGTCCAAACGGTCAGTTAGGTTTTACCACTGCTGGTTTATATGAAAATAGACTTTATGTTTCTGCAGCAAATGGTGATGATAATAATGATGGTAGAGCACTTCCTGTTAAAACACTTAAGAAAGCTGCCCAATTAGCATCTTTCAGAAGTTTTAATCTTCCTGGCGGAAGATTTCTTGATGCTGGTAACTTACTTGAGTCTAACAAAGAGTTTATTCAGAATGAAGTCGTATCATATCTAGAATTTAATTATCCTAATATTACAACTGATAAACCAGATTATGATCGCTCAACTTGTATTCGTGATGTCGGTTACATTGTAGATGCAATTGTATATGATATTTCTTACGGTGGTAACTCCAAAACTGTAGAGGCAGCACTAGCATATTGGAGTGGTGGTGTATCTTATGTTGCTGGTGAGGAAGAGGAGGCACTATTTGCATATAATTATATTGGCTTTATTGCACAATATATCATTAATAATCAAACTCCACCTACATTATATCAAACTGCAGTATCGCAAACATTTGATTTTACTATCGTTGATGATCCTGATAATGTAAATGCAAACTATTTCCACCGCAGAAAAGACGCTAGAAATCTAATTGTTAACAATAGACAAGAAATTATTGATAAATCTCTTGCTGCTGTAGCAATTGCACACTCAGATTTCTATTTTCCTGGTGAAGAGCAAACTAATTTAAGATCACGTTATTACGATTCTTATCGTCTAATTCAGCAAAATCGTCAAACAATTATTGACTATGCTTATGCTGGTATTTCCTCAGCATACCCATCATTTAGTGATCCAAATCCTAATAAGTGTAAGAGAGATCTTGGATACTATGTTGACGCAGTTTCAACTGACGTATTTACTGGTGGTAATAACTACTCTAGAGAATTTGTAATCAAATATTTTAATGGCACTGGCGCTGGTAGTCTAACTGGAGAAGAGCAAGAGACTATCTATGCATATGGTTATGCTGGAACATTGATGAAGGAAGCGATTACTAATCAACTTCCAATTAAAGATCTTACTTTAACTGCTGATCCTTTAACTGGATCAAATACTGATCCAGCATCTTGTGCTGATGTTCAGTCAAACATTGATAACCTTATTGGCATTGTTACTTCTGTAATTGGTGCTGGTAGCACTGCAGGAATTGGTACGACTGCTAATTATGGTTATTTTGCTGGCATTACAACCTCATGTAATGTAGTTTGTGGAGGTATTGGTATTGGTTCCACCAATGTTGTCGGTGGTCGTAAGTGTGCTAGAGATCTTGGATACATTGTTGATGCAATTGCACAAGACGTTTCATATGGTTCAAATCAACATATTGTATATGCTACTAAGAAATACTTTGACGGTGTTGGTGCTGCTTTAACAACTGGACTTTTTGGTGAAGAACAACAGTCGATCACTGCATTCCAAGCAGCAAGAGATTATGCTAAGAAGGCAATTACTAATCAATTGAATGTACAAGATTTAACTATTATTGCGGATCCCCTTACAGGATTTAATACTGATCCATCATCTTGTGCAAACATTCAAACCAACATTGACAACCTTGTAGGAATTCTTACAGTTGCAATTGGCAATAGCAGCCTTTCATCTGTTCCTGCATCAGGTATTGGTACTATCACTGATTGTGCTGATGTAAGATCTGCAATCGTATCATATGTTGGAATTATTACAACTGTTATTGGTATTGGTTCAACAGCTGCACCAAACGTAACGTTACCATCCACACAATCTCAGCCAATTGCAATCATCGTTGAAGCTGGTGATTATCAAGAAGATAACCCAATTATTCTTTATGAAGATGTTGCAGTACTTGGTGACAACCTCAGAAACACGATCATCCGACCATTAAATGCGGGTAAGGATCTATTCCGTGTAAGAAATGGTTGTTATGTAACAAACTTTGCGATGAAGGATTACGTGGATCCTGCTGGTATTCCACAATTTACTTTTGATAACGCTGTCGCATTTGATGACCCAGCAGATCCACAAACAAGTAGAGCTGGTTATGCAACTAAATTAACAAAACCAGTTATTACAAGATCGCCATATATTCAAAACTGCTCAATTCTATCGTTCTTAGGTGCAAACGGTATTCTTGTAGATGGTGCTAAAGTTGTAACTCCTAATACGCCGTTAATTGCAGAAGAAGCTGAAACACCTGTTGTAGGAGCACAACCAGAACAGGGTAGATCTATGGTTGCTGCGGCATTTACCATGGTATCCTTTGGTGGTATTGGATGGCGTTGTATTAACGAAGGATATGCTCAGGTAGTTTCTTGTTTCCAAATTTTCTGTAAGTATGGATCCCTTTGTCAGTCTGGTGGATACTTATCGATTACAAACTCAGCAACTAACTTTGGTTATTATGCACTAAGATCTACTGGTTGGTCTCCAAATTCATTTGCTTTTGACCGTGGTAGAGTTGCTGCTACTGGTATTAGCGGTGGTTTACAAACACTTAAAGTCATTGGTGTTGGTAGAACTGATCAAGATCTTTATGTCTTGAGATTCTACAATAATGCAAATCAGGATCAAACATCAAACTTTAAACCAGTTACCGTACAAGCCCAGTTTAATGCTACAACTGGAATTAATACCGCAACTGATACATTTTTAATTGCATCTCATCCATTCTCCAACCAAGATACTGTTCTTTACATTGGTGATGAAGGTGCAGTTCCACCTAAAGTTATTGGTGGATTAGTCAGTGGAAACCAATATTATTTAAGTTATGTTGATGAAAATAGCTTCCAATTATATGAAGATAACTCACTAACACAGCTTGTTAATTTAACAACTCCTGTAGTTGGTATTCATACATTCCAAAAGGGTAATTTGGAATTCTTTGTTAATGAAATGTTGAGTAGCCATGGTGTATATCAATCAGTTGGTCTTGCTACTACTGCTTTAAACTTTGTTTCTGGTAGACAAATTCTTCAGCAAGTTCCTGGTGGTAATGCTGTTGGATATGCGTTAACATTTAAATCAGAAACTAAACAGCTGATTGTTTCTGTCGAAGAATCTGGTGGAGTTCGCAGACTATTTGGTGTTTCTGATGGTTCTCTTTATTTAAACATTGCAGATCATAGTGGAAGTCCAGTTTCAGTAGCTGTAACAAGCGTAAGTGGAATTACTACATATCGTACTGTAGAATTTAAGGTTGATTCTACACCATCGGGAACAACAATTACAGGTATTGCAAATCTTCCCGAAGATTATCAATTATGGTTCCATAGACCATCAATTGTTAACTCATCTTCACATACTTGGGAATATTCTGGTTCAGGTATTGACTATAATGCTTTACCACAAAACGGTGGTCAAACTAGAGTAGAATCTGAACAGGTATTTGAACTTGGTGGACGTGTTTATTCATCAGGTACTAATGAACTTGGTGACTTTAAGATTGGTTCATTCATTACTGCATTCAACAGAACTGGTAATATTATCTTCAACAACAAGGTTACCATTGGTGTTCTTGCTAGCTTGAGATTGAGTCTATCTGGTGGTGTTGAAATTGAGGCATTCTCAACAGATGTTGGTCTTGGTGACAATGAAATTGGTGGTGCTGCAGATTCAAAAGTACCAACACAAAAAGCGGTTAGAACGTTCTTAAACAATAGACTTGGAAACTTTATTGATAAAAACTTAACGACTAATGCTGTTCCAAGTGCTGTTGTTCAGTTAAATGCTACTGGACAAATTAACGCAGATCTTATTCCACCAAAGGTTGTTAACTACTATCGTGCAAATGTATCTGGTGGAAGAACAGATCTTGTTAACTTAATTCCTACAACTAATCTACAAAATGGTGATACTGTTATTGAACCTGGAAATGGATATGTTCTCATCTCTGATGTTTATGGTCAATATTTAATTCTTTCAGATGATACTAGAGATTATAACTTTAATAATGAAGATGTTGTAATCAGTGCTAACAGTGCTGGTGGTGCAATTGGTATTGTTACTGGTCCTCCAGTAAATGCAGTTGGATATGGTACAACAGGTCTTGTTAAAGGTGTTCTCTTAGGAGTCACAATTACAAATGGTGGTAATGGATACACTAATCCTGGTGTTTATACTTGTGTTCTTGATAGAAGTGGTGTTGGTATTGGTACAAGTGCAAGAGCTGCAATCACGGTTGGTGCTGGAGGAACTGTTACTAGAGTTAGTGTTAACTTTGGTGGTAGATATTATGCTTCTGGAGATGTAATTACAATCAATGATGATAATTTGATTGGTGGTAGAAGTGGTGGAGCTAAATTTACTGCTGTTGTAAACGATATTGAAACAAGATTATACTTAGCGTTAACAAATAATCAGAAATTTACTGGAAATGTTTTACTACCTGATTATATTCAAGATAATGATGCAGTAGCAATTAGTACTGATACCTCTGTTGGTTATGGTAAGACTTTTGATCCAACCGACACTTCAACAGGAGGTAGCGTAGACTTTACTAATGATAGAATTATCATTGGGACAAGTGAATTTACTGATGGAGATCCAATTGTTTATTCTGCAAATGGTGGTAATCTTGTTGGTGGATTGACACAAAATAATACTTACTATATTAAGAAAGTTGGCATTTCTTCAGTTGAACTTTATAGTTCTTATGCATTATCATCTAAAATTGATTTTACTAGCAGTGGAAC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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
74b7373d4de70321509a3b3c112c1d4e49d10a3e62aaad717ef3d347d8f825ad
AlphaFold3
Source AlphaFold3
Method AlphaFold3
Resolution 0,7617
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50