Protein

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Genbank accession
BDR26027.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MSSKIKFTDQYILSSVGQTSNNIVYLQVNDDQQLVVTHPMYATEWSTIGGLRVTGDQSKFDGSLEVGYELLVGQTSTFNNDMVVNGLVTVNRDSLDAMLIHGNVTLHGNLTVVGSSSGTTPGQVTISDNIMVVNTDDVGPGVTATYSGFEVQRGIPVGETNSHGEPGQGKLPSAGLVWNEVQKSWDLNYNPILSEKLPQNPRIINLGQPVADNDASTKKYVNDSITAALDDDIYLDRLTDVTISSPANKNILQYDSSTSQWRNLPYSFIRLTDVTGVSVPRGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGALSFLSDVTLSSLSNTQALFYNGTSWVNRLINYSDIQNTPTNNSYSFIGLNDTNNTVVNNGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGSLDYLTDVSIGTASSGNVLRYNGTDWVNQVLSYTDLSNTPTNNSYSFIGLNDTNDTALSGGYLRWNPTGTQIVYQSTIDYAQLTGLSSVAKAGQGALSFLSDVTISSPGASNTLRYDTTSSKWVNTRLAYSDLTGQPTSANYQLVGLSDTASTSVPLGYLRWNAAGTQVTYATTIDISVISGKSTVASAGSATLSNLEDAAVTTPAAGNTLIWNASTNKWTNGILDVSNITNAVPVSRTVSAGTGLSGGGNLSSNITLSVNRTLTDTWYAAASHTHDASNITSGVIANARLPVGSTTAQGILQLTDGVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHDASNITTGTIAVARLPVSSTTAQGIVQLTDGVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANASHTHDASNITSGVIANARLPFASTTVYGIVTLLDSVASTSISTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHTPAQVGLSNISNNGNTITGNTTISGALSVTGNAVFNTSDIKLKDNIQPIKNPVELLSKISGYTYTRNDCNNEKQTGIIAQEVETIQPESVREVDGIKTVNHNGIIALLVSAVNELSKEIEELKQQLSYKKRD
Physico‐chemical
properties
protein length:1008 AA
molecular weight: 106436,08890 Da
isoelectric point:4,93791
aromaticity:0,06448
hydropathy:-0,18155

Domains

Domains [InterPro]
DC_0911
ATT
1–387
DC_0911 DC_0165 IPR005068 DC_1854 IPR005068 DC_0203
DC_2293
STR
527–764
DC_2293 IPR005068 IPR030392 Coil
DC_1854
STR
807–886
DC_1854 IPR030392
BDR26027.1
1 1008
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 1-387 | STR 443-886 | RBD 887-1008
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudomonas phage sp. 30-3
[NCBI] 		2972143 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Pseudomonas aeruginosa
[NCBI] 		287 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BDR26027.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LC727698 [NCBI]
CDS location
range 61938 -> 64964
strand +
CDS
ATGTCGAGTAAAATTAAATTCACGGATCAATATATCCTATCTAGTGTTGGGCAAACTTCTAATAATATAGTATATTTGCAAGTAAATGATGATCAGCAATTAGTTGTTACTCATCCTATGTATGCAACTGAATGGTCTACAATAGGTGGGCTTAGAGTAACGGGTGATCAATCTAAATTCGATGGATCATTAGAAGTTGGATATGAATTGCTAGTAGGACAAACATCTACCTTTAACAACGACATGGTAGTAAACGGTTTAGTTACAGTAAATAGAGATTCTCTAGATGCAATGCTCATTCACGGGAATGTTACATTACATGGCAACTTAACTGTAGTAGGTAGCAGCTCAGGGACTACACCCGGGCAAGTAACTATTTCCGACAACATTATGGTCGTGAATACAGATGACGTAGGTCCGGGCGTCACTGCAACATATTCTGGTTTTGAAGTCCAGCGTGGAATTCCCGTAGGCGAAACTAATAGTCACGGTGAACCTGGCCAAGGTAAATTGCCTTCTGCTGGATTAGTTTGGAATGAAGTGCAAAAATCCTGGGATCTTAATTATAACCCTATTCTTTCTGAAAAATTACCACAAAATCCTAGAATAATTAACTTAGGGCAGCCAGTTGCTGACAACGATGCTTCTACAAAAAAATATGTGAATGATAGCATAACTGCTGCACTTGACGATGATATTTATTTAGATAGACTTACTGATGTAACAATTTCTTCTCCGGCTAATAAAAATATACTACAGTACGATTCTTCTACATCGCAGTGGAGAAATTTACCATATTCGTTTATACGATTAACGGATGTAACTGGTGTATCTGTCCCGAGAGGATATGTAAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGATTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGACAAGGGGCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACGTTATCATCGTTATCTAATACACAGGCATTATTTTATAATGGAACCTCTTGGGTTAATAGACTAATTAATTACTCCGACATTCAAAATACTCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGATTAAATGATACAAATAATACAGTTGTTAATAACGGATATGTAAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGATTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGACAAGGATCGTTAGATTATTTAACAGATGTTAGTATAGGAACTGCTAGCTCTGGTAATGTACTAAGATATAACGGAACTGATTGGGTAAACCAAGTATTATCATATACTGATCTTTCTAATACCCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGGTTAAATGATACTAATGATACTGCACTTTCGGGTGGTTATTTACGATGGAATCCCACCGGAACACAGATAGTATATCAATCCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGGTTATCTTCTGTTGCTAAAGCAGGACAAGGGGCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACTATATCGTCACCTGGCGCTAGTAATACATTGCGATACGATACTACTTCATCTAAATGGGTAAACACTAGACTTGCTTATTCCGATTTAACAGGTCAACCAACCTCTGCTAATTATCAACTAGTTGGGTTAAGCGATACTGCAAGCACATCTGTACCATTGGGATATCTTAGATGGAACGCCGCTGGAACTCAAGTAACATATGCTACTACGATAGATATATCAGTTATATCTGGTAAATCTACTGTAGCTTCTGCTGGTTCAGCAACACTATCTAATCTAGAAGATGCTGCTGTTACAACGCCTGCTGCTGGGAATACTTTAATATGGAATGCGTCTACAAATAAATGGACAAACGGCATATTGGATGTATCTAATATTACTAATGCTGTACCTGTTAGTAGAACAGTATCTGCAGGAACTGGTCTATCTGGCGGAGGAAATTTATCTAGTAATATTACGTTGTCGGTTAATAGAACATTAACTGATACATGGTATGCTGCTGCATCACATACACATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGACTGCCAGTTGGAAGCACAACAGCACAAGGTATTTTACAGTTAACAGATGGTGTTGCTAGCACATCTACAACTACTGCCGCTACACCTAATTCGGTAAAAACTGCATATGACTTAGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACTCATGATGCATCTAATATTACTACTGGTACTATTGCTGTAGCCAGACTTCCGGTTTCGTCTACTACTGCACAAGGTATAGTTCAGCTTACTGACGGTGTTGCCAGCACATCTACAACTACTGCTGCTACGCCTAATTCAGTGAAAACTGCATATGATTTAGCAACGACAAAAGCTAATGCTTCTCACACCCATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGATTACCGTTTGCCTCGACTACTGTATATGGTATAGTAACTCTGTTAGATTCAGTTGCCAGTACGTCTATATCTACTGCTGCTACACCTAATTCGGTAAAAACTGCATATGACTTAGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACACATACTCCTGCTCAAGTAGGTTTATCGAATATTTCTAATAACGGAAATACTATAACGGGAAATACAACTATATCTGGTGCATTGTCGGTAACAGGAAATGCTGTTTTTAATACATCTGATATAAAATTAAAAGATAATATACAGCCTATTAAAAATCCAGTAGAACTTCTTAGCAAAATTTCAGGATATACCTATACTAGAAATGATTGTAATAACGAAAAACAAACCGGTATTATTGCGCAGGAAGTTGAAACGATACAACCTGAAAGTGTAAGAGAAGTAGACGGTATAAAAACTGTAAACCATAATGGAATAATTGCACTGTTAGTTAGTGCAGTTAATGAACTTTCTAAAGAAATAGAAGAATTAAAACAACAACTTTCTTACAAAAAAAGGGACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7015928351d5cf9708740687cf2d740f33ad3567d09ff1b4280a562272f46760
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2919
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Whole-Genome Sequence of Pseudomonas phage 30-3 Fujiki,J., Nakamura,T., Nakamura,K., Tamamura,K., Ichikawa,N., Ishiguro,Y. and Iwano,H. 2021-07 — GenBank