Protein

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Genbank accession
ARM68248.1 [GenBank]
Protein name
alanyl-tRNA synthetase
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,60
Protein sequence
MKHTGIHILDFNDKIIDFISQSDGALINAVMSTNAEEKSETFDFTMLNDRAEHLRERNRIIAQDNNGVYREFIISHVVDNFDGTTDVESNASYLEDIDKSRPIKPGKYSSYSTSQALNETLRNTGWEMSDDTEHGGMRTTSWTSYSTPYEVINMLCTTYGMVAEYYIELGSHTVEHRYVTLKKPVSLFKGKEITKGKDLTGMTRTVDMSEVRTALYAIGPENDTGQRLEKIVTDDDAQAQFGLPGRYLWSVYEPESDDSNMTDERLTTLAKTELNKRNKSAISYEITSTDIHRHYPEMVVSLHDTVRIKDRDFRPPLYIEAEVIGVDYNLLTDESNYKFGNVVEYEENNLRDIFNKKLADISKKLNDNVSNVNTIVKDAVAGQLEYFERKIFKQDTPPENPVNDMLWYDTSNPNVAVLRRYWNGEWLNETVDDVEKIGGVTREKALYDSIKNAFENLSIQHAKLMDETYAVLNNEYLVDTDLKTKLQTELNNVDGIYQKINSDLGSITSDTATIGTLIDIQSQFSSYRQKLQNLYKAMRNAQISADKRLKLLQSQYTDEKFNDALNKVASKFGLTVDSNNNMVGTPNVIEKAIQASREDTAEQLKSYVKSMDYQTDKNGIVERLDSADSERKQLNNLISDKVSLSEYKNMAIGTRNLIANSDFLAGLTYWRNVGATTPANSYDTTLTDMPNGFTSVAVYESNDASKEKGIAQDNLSLEIGKEYVLSAWVKILNGAPTFRLQAGKTKWINQNFEGNNTWQRYEFVFTAYESPMNIYILKPNNIVDSKVAITGVQLVQGNKNTDWKASDKDTDTKLTNMTTSITQNGQDIQQRATKEEFNASKKTLSKTISDFTNNVATGMTFTYDKDGAIQNMNIGQDGIKLKGDKVDITVNKDFNVTTQKLDNKVGKDEIVNRLNLSNEGLNIDVNKLGIRGGDDKTYLTIQNKRILSKGYFTRTWANVTDTSNLTVGIRDGYIMASNEDTGYNLYMTEKGLSTMMSGAGDETAGTLEFHSTKYNDRSRGVRLHSTYGAVALESDYSRIILNSNLTVNIESNSGSVYVRPMKDNRTGTNEFRFWVKNNDTGADTDGVLSYGLITGTNNSPYDFGSGIRFDKSPKTNYVYATDKDGNIGSGDFYARALLGDWFAKSSNLYACVDDKLRITNKLSYNNGNPNYRDLQCRDIQSNSIRLNDTNGKDFYIGVSSNELRVTNNLFWNGGDTGYKPVRASDFIKASSEKYKKEIQEWNYDALSVLSNELKLYSYKYKDDEKEVIHHGPVIGDNYDTPVEFILQDGVNTNEMLSWSLRAIQQLNEKVEKLEEQINER
Physico‐chemical
properties
protein length:1320 AA
molecular weight: 149340,15930 Da
isoelectric point:5,10002
aromaticity:0,09167
hydropathy:-0,66591

Domains

Domains [InterPro]
DC_1956
STR
1–511
DC_1956 DC_1746 DC_0203
IPR007119
Unmapped
36–337
IPR007119 G3DSA:2.60.120.260 IPR030392
IPR008979
STR
657–769
IPR008979 Coil
ARM68248.1
1 1320
Architecture
STR
STR
RBD
STR 1-511 | STR 539-878 | RBD 1196-1320
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage IME1367_01
[NCBI] 		1965491 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Staphylococcus warneri
[NCBI] 		1292 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ARM68248.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KY653124 [NCBI]
CDS location
range 32238 -> 36200
strand +
CDS
TTGAAACATACAGGCATTCATATTTTAGATTTTAATGACAAAATCATAGACTTTATTAGTCAAAGTGATGGTGCTTTAATCAATGCAGTGATGAGTACCAACGCCGAAGAAAAATCAGAAACATTCGATTTCACAATGTTAAATGATCGTGCTGAACATTTGCGTGAACGTAATCGTATTATTGCACAAGATAATAATGGTGTTTATCGTGAGTTCATTATTTCTCATGTGGTAGATAACTTTGATGGTACAACTGATGTAGAAAGTAATGCTTCATATTTAGAAGATATCGATAAATCACGTCCAATTAAACCCGGGAAATATAGTTCGTATAGCACGTCTCAAGCCTTGAATGAGACGCTACGTAATACTGGTTGGGAGATGTCAGACGACACTGAACACGGTGGTATGAGAACAACATCATGGACATCTTATTCAACACCGTATGAAGTTATCAACATGTTATGCACAACATACGGTATGGTGGCAGAATACTATATAGAACTTGGTTCTCATACGGTAGAACATAGATATGTAACGTTAAAGAAACCAGTTAGTCTATTTAAAGGTAAAGAAATTACTAAAGGTAAAGATTTAACAGGAATGACACGTACCGTTGATATGTCAGAAGTACGGACTGCATTATATGCGATTGGTCCTGAAAACGACACTGGACAACGATTAGAAAAAATAGTTACAGATGATGACGCTCAGGCACAGTTTGGATTGCCTGGGCGTTACTTATGGAGTGTGTATGAACCAGAATCAGACGATAGCAATATGACTGATGAGCGTTTAACCACGCTTGCTAAAACTGAACTTAACAAGCGTAATAAATCGGCAATCAGTTATGAAATCACTTCTACAGATATTCATAGACACTATCCAGAAATGGTTGTATCCCTCCACGACACAGTACGTATTAAAGATAGAGATTTCAGACCACCGCTTTATATAGAAGCAGAAGTCATCGGCGTTGATTACAACTTACTCACTGATGAAAGTAACTATAAATTCGGCAACGTAGTTGAATATGAAGAAAATAACTTAAGAGATATATTCAATAAAAAACTTGCCGATATAAGTAAGAAATTGAATGATAATGTGAGTAATGTTAATACGATTGTTAAAGATGCAGTAGCAGGCCAATTAGAATACTTTGAACGTAAGATATTTAAACAAGATACGCCACCGGAAAATCCGGTTAACGATATGCTTTGGTACGATACGAGCAATCCAAATGTTGCAGTATTAAGACGATATTGGAACGGTGAATGGTTAAATGAAACTGTAGATGATGTTGAGAAAATTGGTGGTGTAACTAGGGAAAAAGCACTATACGATAGCATAAAAAATGCTTTTGAAAATCTATCAATCCAACATGCCAAATTAATGGATGAAACTTATGCGGTATTAAATAACGAATATCTCGTTGATACAGATTTAAAAACAAAATTACAAACTGAATTAAATAATGTTGATGGTATCTATCAAAAAATCAATAGTGATTTAGGTTCTATCACAAGTGATACTGCCACTATAGGTACATTAATAGATATTCAAAGTCAATTTAGTTCTTATCGACAAAAGTTACAAAACTTGTATAAAGCTATGCGTAACGCTCAAATATCTGCAGATAAACGTTTGAAATTACTTCAATCACAATACACTGATGAGAAATTTAATGACGCATTGAATAAGGTAGCTAGTAAGTTTGGTCTAACTGTTGATAGTAATAACAATATGGTTGGCACACCGAATGTGATTGAAAAGGCAATACAAGCCTCACGAGAAGATACTGCCGAGCAATTAAAAAGTTATGTAAAGAGTATGGATTATCAAACTGATAAGAACGGCATTGTCGAACGTTTAGATAGCGCAGATAGTGAACGTAAACAGTTAAATAATTTAATTAGCGATAAAGTGAGCTTGAGTGAGTACAAGAATATGGCTATTGGTACAAGAAATTTAATTGCTAATAGTGATTTTTTAGCGGGATTAACATATTGGCGAAATGTTGGAGCTACTACACCCGCAAATTCTTATGATACAACTCTTACAGATATGCCAAATGGTTTTACTAGTGTGGCAGTGTATGAAAGTAACGACGCTTCAAAAGAAAAAGGGATAGCTCAAGACAACTTATCTCTTGAGATCGGTAAAGAGTATGTATTGAGTGCTTGGGTTAAAATTTTAAATGGCGCACCGACATTCAGGTTGCAAGCAGGTAAAACGAAATGGATTAATCAAAATTTTGAAGGCAATAACACATGGCAAAGATACGAGTTTGTATTTACTGCTTATGAATCGCCAATGAACATCTATATTTTAAAACCTAATAACATAGTAGACTCTAAAGTTGCTATTACCGGAGTTCAACTCGTTCAGGGTAATAAAAATACGGATTGGAAAGCTTCAGATAAAGACACCGACACAAAACTAACCAACATGACGACCTCTATTACACAAAATGGTCAAGATATTCAACAAAGAGCGACTAAAGAAGAATTTAATGCTAGTAAGAAAACGTTAAGCAAAACAATTAGTGATTTCACAAACAACGTCGCAACAGGTATGACCTTTACTTACGACAAAGACGGTGCCATTCAGAACATGAATATCGGTCAAGATGGCATTAAATTGAAAGGCGATAAAGTCGATATCACAGTGAATAAAGACTTTAATGTGACAACACAGAAGTTAGACAACAAAGTTGGTAAAGATGAAATTGTAAATAGACTTAACCTTTCAAATGAGGGTTTAAATATAGATGTAAACAAATTAGGTATTCGTGGTGGAGATGATAAGACCTATCTTACTATCCAAAATAAACGTATTTTATCTAAAGGTTATTTCACTAGAACTTGGGCGAACGTAACAGACACATCAAATTTAACGGTTGGTATTAGAGATGGTTATATTATGGCTTCAAATGAAGATACAGGATATAACTTATATATGACAGAAAAAGGTTTGTCCACAATGATGAGTGGTGCAGGAGATGAAACTGCAGGAACGTTAGAGTTTCATTCAACTAAGTATAATGATCGTTCGAGAGGTGTTAGATTACATTCGACTTATGGAGCTGTAGCATTAGAGAGTGATTATAGTAGAATAATTCTTAACTCTAACCTAACTGTTAATATTGAAAGTAATTCCGGTTCTGTTTATGTTAGACCGATGAAAGATAACAGAACAGGTACCAATGAGTTTAGATTTTGGGTTAAAAATAATGATACAGGAGCCGATACCGATGGTGTTTTATCCTATGGTTTGATCACTGGTACGAATAATAGTCCTTATGACTTTGGTTCGGGTATCAGATTTGATAAATCGCCAAAAACGAATTATGTATACGCAACTGATAAAGATGGAAATATTGGCTCAGGAGACTTCTATGCTAGAGCTTTATTAGGTGATTGGTTTGCTAAAAGTTCAAACTTATATGCTTGTGTCGATGACAAGTTAAGAATAACTAATAAATTAAGTTACAATAACGGAAATCCTAATTATAGAGATTTACAATGTAGAGATATCCAATCTAATTCAATAAGACTTAATGATACGAATGGTAAAGACTTTTATATTGGGGTGTCATCAAACGAATTACGTGTAACGAACAATTTATTTTGGAATGGTGGAGACACTGGGTATAAACCGGTTAGAGCAAGTGACTTTATTAAAGCCTCAAGTGAGAAGTATAAAAAAGAAATTCAAGAATGGAATTATGACGCATTATCAGTGTTGAGCAACGAACTAAAACTCTATAGTTATAAGTATAAAGATGATGAAAAAGAAGTAATTCATCATGGCCCTGTTATTGGAGATAACTATGATACCCCAGTCGAATTTATACTACAAGATGGCGTTAACACTAACGAAATGTTGTCATGGTCTTTAAGAGCGATACAACAATTAAACGAAAAAGTTGAGAAACTGGAGGAACAAATCAATGAAAGATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
2fccede2111579f32c8b1f7f8d1a841c0fbe7dea1298cef5df54d742dc64b636
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7802
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Analysis of active prophages from bacterial high-throughput sequencing data Sun,Q., Zhang,X., Xing,S. and Tong,Y.-G. 2018-12-28 — GenBank