Protein

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Genbank accession
XSD93368.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,82
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTSGTLSVDGTTTLKDNVTISPNKAINFETTNLSGAIVRHIVGKCATNDGWYIGAGGTSNSGILEIGTIDDGAETIQFVQRGAGNVEARKLVLLDGSGNTTLPGDLRLSTNKTVKINSGSTLVLEMGVGSNDVYIKNRRGVGVLQLTSDSNLTFRNSQVYYAMDGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYTISAATASTARWVKVATIKHPGMSSSQLDLMISGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTNSLDNWVEWRRVGSPSKTNVPEYYVVKNDSATDADASFDFYAKIPRYGNGLYVTVLNTAGYNGQDSGTVIIYETNQDTGDTGPSGSILVSMKQIFDSLAKPDFGDTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLRTAAVRDVGESNGNLMEVGAFGIGGNGKSLVDITSDVDLMTRLKALGGTVFRANKASGYTGAPYYSHGTGFYGRASDTMAALNIDYATGNVRVFAINDSGLASGRVNYNVLYGTANKPSKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLAAPNLHASGTGTASVYVNAGSGNAHVWFRTDANERGVIWATPNTANLGQINIRAKTTGGTSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLNSIKNDIVSGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGTMADFGSENSDKYSRITLARKIGSGAAVAMLKITPEGYVQFGYQDAVANPSPTKYIRVKPDGLDVEGDLVFNQTYCGTEEAVDISNKTIDLNNLVIKRTDPGTRQLYKCVSSGGGSKIANKPTSDGNFVLEVLSLRKVSDNDWTCKQTFTTKNNTTVGTYVRYCQNGSWTAWEEVVSGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGKGQTVRFGNLVTTDLTANGNARLVGRLNLGSASATGVLRANETGAVVLGSASGQNIHVRAGSAYTSAGETRFEPNGNVTVGGAITASGSLQVNGEAAMSRSLIVSQNIKNTNDNSFILMGKDSDLGFVKKSNSGAKLVFASGKSFIVAKSSATTIANPATETYTDVFKVDADGNQTVYGNSTVSRALTVSSTATVNGVINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGNLDVTGSRLKTTSLWVTGDAAVNGVLTVDGKARFNQEFSVSTSVNVQNTGNSHVFFRKADGTEKGLLWADEPGNVSIRAGGASGPVWNFWTSGSCQFPGAISNYNGISSTTNYPAGQPNGTYNNTAGLVSRFSNGAYASLYFQEYVGNFHQAIINVNGFGRDDSFYFRAGGDFICTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLSGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDIEADGGLLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKGLKAEIEELKSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1477 AA
molecular weight: 155455,60520 Da
isoelectric point:7,17316
aromaticity:0,07109
hydropathy:-0,28653

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–619
DC_1942 cd19958 DC_0246
DC_0468
STR
483–1006
DC_0468 IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
1377–1471
IPR030392
XSD93368.1
1 1477
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-619 | STR 620-1006 | RBD 1080-1477
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XSD93368.1
1 1477
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 1055 1055 0,1421
Central domain 1056 1254 200 0,3844
C-terminal 1255 1477 222 0,8810
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-1055
Central
1056-1254
C-terminal
1255-1477

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage vB_Kpl_K65_evo8
[NCBI] 		3412903 Viruses >
Host Raoultella planticola K59
[NCBI] 		1212665 Ascomycota > Pichiomycetes > Serinales > Metschnikowiaceae > Clavispora >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XSD93368.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ569701.1 [NCBI]
CDS location
range 103066 -> 107499
strand -
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGCGTTGAATACACATGGGCGTACTCTTGCTATCTATACCAAAGATGAAGCTGATAATGTTGTTCAGCTTGCTGGTAAAGGGGTTCCTTTCTTAGATACATCTGGAACTCTTAGCGTTGATGGAACTACTACATTAAAAGACAACGTTACTATTTCTCCGAATAAAGCGATCAATTTTGAAACTACTAATTTAAGCGGAGCAATAGTGCGTCATATCGTTGGCAAATGTGCTACTAACGATGGCTGGTACATCGGTGCCGGTGGTACAAGCAACAGTGGTATTCTTGAGATCGGTACTATTGACGATGGCGCTGAAACTATTCAATTCGTACAACGCGGTGCAGGCAACGTTGAAGCCCGAAAATTGGTATTGCTTGACGGCTCGGGTAATACGACTCTTCCTGGTGATTTAAGATTATCTACCAATAAGACTGTTAAAATTAACAGTGGAAGCACTCTTGTTCTTGAAATGGGTGTAGGCTCTAACGACGTCTATATTAAAAACCGACGAGGCGTAGGTGTTCTTCAATTAACTAGTGATAGCAATTTAACGTTCAGAAATTCCCAAGTTTATTACGCTATGGATGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACAACCGTCAGGCATGGCAATATACTATTTCTGCTGCAACTGCGTCAACTGCTCGCTGGGTAAAAGTAGCTACAATAAAGCATCCAGGAATGTCTTCTTCGCAACTGGATTTAATGATTAGCGGTGGTATTGATTCTGGGCACGGTAGACATTACGTTGATTTTATCACGTTATCAGGACGAAATTTAACATCATGGAGCACCAACAGTTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCCGGGTTGGGTCTCCTTCTAAAACGAACGTTCCAGAGTATTACGTTGTTAAAAACGATTCTGCTACTGATGCGGATGCGTCATTTGATTTTTATGCTAAGATTCCTCGTTATGGCAATGGCCTTTATGTTACAGTGCTAAACACAGCTGGATACAACGGCCAAGATTCAGGTACAGTAATTATCTATGAAACTAATCAGGACACTGGTGATACTGGACCGTCCGGAAGTATTCTTGTTTCAATGAAACAGATTTTTGATAGTTTAGCAAAACCAGATTTCGGTGATACCACAGGTACTCTTCCGGTTAACCGTGGTGGTACAGGTGCTACTAATGTAGGAGATGCCCGAAACAACCTGGGCCTTAGAACTGCAGCTGTTCGCGATGTTGGTGAATCTAACGGAAACTTGATGGAAGTTGGTGCCTTTGGTATTGGCGGTAACGGAAAATCACTGGTAGATATTACTTCTGACGTTGATTTAATGACTCGCCTTAAGGCTCTTGGTGGTACAGTGTTCAGAGCCAACAAAGCGAGTGGCTATACTGGGGCTCCTTATTACTCCCATGGCACCGGGTTTTATGGAAGAGCTTCTGACACAATGGCTGCGCTTAATATAGATTATGCAACTGGTAACGTCAGAGTATTTGCTATAAACGATAGCGGTTTAGCAAGTGGAAGAGTAAATTATAATGTTCTCTACGGCACAGCAAATAAGCCATCTAAGGCTGACGTCGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACCCAAGTTAAGAAAGCTGGCGACACCATGACCGGTGATTTAGCTGCACCTAACCTCCATGCTTCCGGCACCGGTACTGCATCAGTGTATGTTAATGCAGGAAGCGGAAATGCTCATGTATGGTTTAGAACAGACGCCAATGAACGTGGTGTAATTTGGGCAACTCCAAATACTGCTAATTTAGGACAAATTAATATTCGTGCAAAAACTACTGGTGGTACTTCTGCCGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGACGGCCGACTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTTGGTGGGGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGGAACATCACCTCTGGTTCAATGTTTGGCGGTAACCTTAACAACTATTTGAATTCTATTAAAAACGACATCGTTTCTGGGGATAATAAGCAAGTAAGTAAAACCGGTGACACAATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAACCCTAATGGAACAATGGCTGATTTTGGTTCAGAGAACTCAGATAAGTATAGCAGAATAACTCTTGCTCGCAAAATTGGCTCTGGCGCTGCCGTAGCAATGCTTAAAATTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGTTATCAAGATGCAGTTGCTAATCCGTCTCCTACTAAGTACATCCGAGTTAAACCCGATGGCCTTGATGTAGAAGGGGATTTGGTTTTTAATCAGACATATTGCGGTACTGAAGAGGCAGTTGATATTTCTAATAAGACTATTGACCTTAATAATCTTGTCATTAAAAGAACCGATCCAGGTACTCGTCAGCTGTATAAATGTGTATCTTCTGGCGGTGGTTCTAAGATAGCAAACAAACCCACATCTGACGGTAACTTTGTTCTCGAAGTTCTGTCTTTACGTAAAGTTTCTGATAACGATTGGACATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAATAACACCACTGTTGGCACATATGTTCGATACTGCCAAAATGGCTCATGGACTGCATGGGAAGAAGTTGTATCTGGTGTACAACCGATTAATCTTGGTGGTACTGGAGCAACTTCTGTAGCTGCTGCTCGTAACAACCTCGGTGTTGGTAAAGGCCAAACTGTAAGATTCGGTAATTTAGTTACAACCGATTTAACCGCAAACGGAAACGCTAGATTAGTCGGAAGACTGAACCTTGGTTCTGCTTCTGCGACTGGCGTATTACGAGCTAATGAAACGGGTGCTGTTGTTTTAGGGTCTGCAAGTGGTCAAAATATCCATGTTAGAGCAGGAAGTGCCTATACTTCTGCGGGTGAAACTCGCTTTGAACCAAATGGAAACGTCACAGTTGGTGGTGCTATTACAGCTTCCGGAAGCCTGCAAGTAAATGGCGAAGCCGCTATGAGTAGAAGCTTGATCGTTTCTCAAAATATAAAGAATACTAACGATAACAGTTTTATTCTGATGGGAAAAGATTCGGATTTAGGTTTCGTTAAAAAATCTAACTCAGGAGCTAAACTAGTATTTGCTTCAGGAAAATCGTTTATTGTCGCTAAATCGTCAGCAACTACCATAGCTAATCCAGCGACGGAAACTTACACTGATGTGTTTAAAGTTGATGCTGATGGAAACCAAACTGTTTATGGAAATTCAACAGTTTCTAGAGCTTTAACCGTTTCTAGCACAGCGACAGTTAATGGCGTTATTAATGCCAACGGCGGTATCATTGTTCCTACTACTAAGTATGTGCAAATTGCTGATGCTCCTACACAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGACAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCCGGTGATACATATCTTCCATTAGCAGGTGGTACTGTAACTGGTAACTTAGATGTTACAGGAAGCCGGTTAAAAACTACATCGCTCTGGGTTACCGGTGATGCTGCTGTTAACGGTGTTTTAACTGTTGATGGAAAGGCTAGGTTTAATCAAGAGTTCAGTGTATCAACCTCAGTTAACGTTCAGAACACCGGTAATAGCCATGTGTTCTTCCGTAAAGCAGATGGTACAGAAAAAGGTCTTCTTTGGGCTGATGAGCCTGGTAATGTTAGTATAAGAGCCGGCGGTGCTTCTGGACCAGTATGGAATTTCTGGACCAGTGGTTCATGTCAATTCCCAGGAGCCATTTCTAACTATAACGGAATTAGCAGCACTACTAATTATCCTGCAGGACAACCCAATGGCACATATAACAATACCGCTGGGTTAGTAAGCAGATTTAGTAATGGTGCTTATGCCTCTCTGTATTTCCAAGAATATGTTGGTAACTTCCACCAAGCTATCATTAATGTTAATGGATTCGGTCGAGATGACAGTTTCTATTTCAGAGCTGGCGGTGACTTCATCTGTACTCGCAATGGTTCATTTGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCTAAATCTGATATTAAAGTTATTGAAAACGCTTTGGAAAAAGTAGAGACCTTAAGCGGTAATACTTATGAGCTTCATAATACTTCTGGCGGTACTACTCGTTCTGCTGGGTTGATTGCTCAAGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTTACTCAAGATATTGAAGCGGACGGCGGATTATTGCGTCTGAATTACAACTCAGTAATTGCACTTCTTGTTGAATCTGTTAAAGAGCTTTCTGCTGAGGTTAAAGGCCTTAAAGCGGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
045cb71e0e0e53b3a4c0bff226fb350081cd41eb700787aae257f80c423ca2e2
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4973
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50