Protein

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Genbank accession
YP_009140872.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MPAINVAKTDTFEKQRVKINEIGSQIFSISEGGSDLSTGNLKLGDGTKTVPSLAFTSDGSLGIFKPSSKSIGIVSGSKRILDFNEFGVFSFKDILLKKKSLTTELISIVSAGSQYDPGSFAALSLIGGTGLGATADITVDAFIGTTLTTGDDFAVGSFQSSLINGTGQDAEISFDVDGIQGSITQPGSGYAQNTYTNVSLTNVSGTGNGSTADITVTGDVVVSGNISNGGSGYSGPDQVYTNIELTGGSGTGLFADITLTAGVITSVVVTNGGSGYLASNVLGVDNADLSGDGGAPAGSGFAFTISSVVYNGVVTNISITGEGTGYDFGDVLSANQADLGNVGGSGFEFSVSSNPGVPYNIEFITKGSGYTVGDVLSLSGPVTGFATTLGGTIDNVAATVTSGSTTVVLASTTDIVAGMSVSGANSEFVESATVITVDSATDITVSDPSNVSGSTTITFTSNTPFLEVVVSDASNISNGFLVSQSSGTGIIAPNTTVSNVDTGTNTITFDIQPTRAGSATLDFSPGYGNPTTNFTHRVDVLGAISLINIVDGGTGYDVGDELSVSPTDLTETISKSVTVIDVDTIFPVQAIPSNTYSVGDTISVDGGEGGPTNTAIREIVISGGNITALIVNAIGIPDGSTFDTSYTTDTGGFSGHRYLIDGNLSQNLTFYVGSTYKFDTTDATNGSHIFSLSKYRDGSFSPSFIGNINTVLDTNTANITIADTTGILEGMAVSVTSGVGTIPSEVKVLQVVDSTTLTLSLNPDTAGSAVLSFVGVEYTDNVTRDGNNALTIKITSSTPNLYYYCQNHQDMGGYDNQEALITIDPNNPKTFGSGLIFSATDISETDIISGRVNDGTFNVVNSTGTSLDFDSGTVDDITSINTKTSTLTTTTIQSDTNSFENKIDLNSGTSINIVAGDFNIGSTIQVSNLSGDITTSGTLKSTTKISSNDILEIIDNSISVVPGQDLVFEIPSASKQAKFTSTSAVVIPVGDTSQRPLAGDSVSGAIRFNTETNQYEGYSATSTSWSSLGGVRDLDGNTYILAEFTTGANDNTLWFYNDSINTLKVTPEFFDFRSVKTISSTKLGLPTYSEWNSNVPVNVGDYIKYRNNLYEVTGSGSTGSSGSEPTDTSGNAFANGTAQLTWSQTAVAPITFDGVEELRIGPNKNCSLVIGSELKFEDNTISTSVQDLVIQPNAGKQVIVNSNTHFRIPAGTNNEKSIAPAGPGSIRFNTEILQFEGYSGANWSSLGGVRDVDGNTYIIPETAPAANENILYFYNNNSNTLQLTETVLDFTNIDTITTSGGNSLALDTQVFTLNSNDTTIDNSDSTRTFVSTTKQYLDLGLSSGLNVDPVLRLDNQGDVYLNTTFGTGSFNGVKIFDGDLKEFELADYKISSATFVLDKGGLESSSVVLYDTGSKGCKVTVVSKSDSGKRSLTEYAVIDTGTDIFHNEYASLNSSLDQYTASFDFNISNEPRITITLTDDHDVADIINFTVLIQEIK
Physico‐chemical
properties
protein length:1497 AA
molecular weight: 155835,73560 Da
isoelectric point:4,08084
aromaticity:0,07816
hydropathy:-0,04977

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014i
[NCBI] 		1493513 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Chalconvirus > Chalconvirus acg2014i
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009140872.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_027132 [NCBI]
CDS location
range 86812 -> 91305
strand +
CDS
ATGCCCGCAATTAATGTCGCTAAAACTGATACCTTTGAAAAACAAAGGGTCAAAATTAATGAAATTGGATCTCAGATTTTTTCAATTTCTGAAGGTGGAAGTGATCTATCTACGGGAAATTTAAAACTTGGAGATGGTACTAAAACAGTTCCGTCTTTGGCTTTTACTAGTGATGGATCTTTAGGTATTTTCAAACCATCTTCTAAATCTATTGGAATAGTTAGCGGATCAAAAAGAATTTTAGACTTCAATGAATTTGGAGTATTTTCTTTTAAAGATATTCTTTTAAAGAAAAAATCGTTAACTACAGAACTGATTTCCATAGTATCTGCTGGATCACAATATGATCCAGGTTCTTTTGCTGCTTTAAGTTTAATTGGAGGAACTGGACTAGGAGCAACTGCAGATATTACAGTTGATGCTTTTATTGGAACAACTTTAACAACAGGTGATGATTTTGCAGTTGGTTCATTCCAATCTTCATTAATAAATGGAACTGGTCAAGATGCAGAAATTTCTTTTGATGTTGATGGCATCCAAGGGTCAATTACACAACCTGGATCTGGATATGCACAAAATACTTATACTAATGTATCTTTAACAAATGTTTCGGGAACTGGCAATGGATCTACCGCAGACATCACTGTTACTGGTGATGTAGTTGTTTCTGGAAATATTAGTAATGGTGGTAGTGGATATTCTGGTCCAGATCAAGTATATACTAACATAGAATTAACGGGTGGTTCTGGAACTGGTTTATTTGCAGATATAACTCTCACCGCAGGAGTTATTACTTCTGTAGTAGTTACTAATGGTGGATCTGGATATTTAGCAAGTAATGTTCTTGGAGTAGACAATGCAGATCTTTCTGGAGATGGTGGCGCACCTGCTGGTTCAGGATTTGCTTTTACTATTTCTTCCGTCGTATATAATGGCGTAGTTACTAATATATCTATTACTGGAGAAGGAACAGGTTATGATTTTGGAGATGTATTATCTGCTAATCAGGCAGATTTAGGAAATGTTGGTGGAAGTGGATTTGAATTTAGCGTTTCATCAAATCCTGGTGTTCCATACAATATCGAATTTATCACTAAAGGATCTGGATATACAGTTGGTGATGTGTTGTCTTTATCTGGTCCAGTTACTGGATTTGCTACAACTCTTGGAGGAACAATTGACAATGTTGCGGCAACAGTAACATCTGGATCTACAACTGTCGTTCTCGCATCCACTACAGACATTGTAGCAGGAATGTCAGTATCTGGTGCTAATTCAGAATTTGTAGAAAGCGCAACAGTAATTACTGTTGATAGCGCAACAGATATCACTGTTTCTGATCCTTCTAATGTATCTGGTTCAACAACTATTACTTTTACTTCCAATACACCCTTTTTGGAAGTTGTTGTTTCGGATGCTTCCAACATTTCTAATGGATTTTTAGTTTCACAATCTTCTGGTACAGGTATTATCGCCCCTAATACAACGGTATCTAATGTAGATACTGGAACAAACACAATTACTTTTGACATACAACCAACTAGAGCTGGATCTGCTACTCTTGATTTTAGTCCAGGATATGGAAATCCTACTACTAATTTTACTCACAGAGTAGATGTATTAGGAGCAATTTCTTTAATTAATATTGTAGATGGTGGCACTGGATATGATGTTGGAGATGAATTATCAGTATCTCCAACAGATCTCACAGAAACTATCAGTAAATCAGTAACTGTAATAGATGTAGATACAATTTTTCCCGTACAAGCAATTCCATCCAACACATACTCAGTTGGTGATACGATTAGTGTCGATGGTGGAGAAGGAGGACCCACAAATACTGCGATTAGAGAAATTGTAATTTCTGGTGGAAATATTACAGCACTTATTGTAAACGCAATAGGAATTCCAGATGGATCTACTTTTGATACATCATATACAACAGATACAGGTGGATTTTCCGGTCATAGATATCTTATTGATGGAAATCTTTCCCAAAATTTAACATTTTATGTTGGTAGTACTTACAAATTTGATACAACAGATGCTACTAATGGTAGTCATATATTTTCTTTAAGTAAATATAGAGACGGAAGTTTTTCCCCAAGTTTTATTGGAAATATTAATACAGTATTAGATACGAATACTGCAAATATTACTATAGCAGATACAACTGGAATTCTTGAAGGAATGGCAGTTTCTGTTACGTCTGGTGTTGGCACAATTCCATCAGAAGTTAAAGTTTTACAAGTAGTTGATTCTACTACATTAACTCTGAGTCTAAATCCAGATACAGCAGGGTCTGCTGTCTTATCATTTGTTGGAGTTGAATACACAGATAATGTTACTAGAGATGGTAATAATGCATTAACTATAAAAATTACAAGTTCAACACCAAATTTATATTATTATTGTCAGAACCACCAAGATATGGGAGGTTATGACAATCAAGAAGCACTAATTACCATCGATCCAAATAACCCAAAAACTTTTGGATCAGGATTAATTTTTTCTGCTACAGACATTTCAGAAACAGATATTATTTCTGGAAGAGTTAATGATGGTACTTTTAATGTTGTAAATTCTACTGGTACATCATTAGATTTTGATAGTGGAACAGTTGATGATATTACTTCTATTAATACAAAAACATCTACTTTAACAACGACAACAATTCAATCAGATACTAATTCATTTGAAAATAAAATTGATTTAAATTCTGGGACATCTATTAATATTGTAGCGGGTGATTTTAATATCGGTTCTACTATTCAAGTATCTAATTTATCTGGTGATATAACCACTTCGGGAACATTAAAGTCAACAACAAAAATTAGTTCTAATGATATTTTAGAAATTATTGATAATTCAATTTCTGTAGTACCAGGACAAGATTTAGTTTTTGAGATTCCTAGCGCATCAAAACAAGCAAAATTTACATCAACATCAGCAGTTGTTATTCCGGTTGGCGATACATCACAAAGACCTCTTGCTGGTGATTCTGTCAGTGGAGCAATCAGATTTAATACAGAAACAAATCAATATGAAGGATATAGTGCTACATCTACTTCGTGGTCTTCATTAGGTGGTGTTCGTGATTTAGATGGAAACACATATATTTTAGCAGAATTTACTACTGGAGCAAATGACAATACATTATGGTTCTACAATGATTCAATTAATACTCTAAAAGTAACTCCAGAATTTTTTGATTTCAGATCTGTCAAAACAATATCATCTACAAAATTAGGACTTCCAACATATTCAGAGTGGAACTCAAATGTTCCTGTTAATGTGGGAGATTATATTAAGTATAGAAATAATCTTTATGAAGTAACTGGTTCTGGTTCTACGGGTTCATCTGGAAGTGAACCAACAGATACATCAGGAAATGCTTTTGCGAATGGCACTGCACAATTAACTTGGAGTCAAACTGCTGTTGCTCCAATAACATTTGATGGTGTAGAAGAATTAAGAATTGGTCCAAACAAAAATTGTTCTTTAGTTATTGGATCAGAATTAAAATTTGAAGATAATACTATTTCGACTAGTGTGCAAGATTTAGTTATTCAACCAAATGCTGGCAAACAAGTAATTGTTAATTCAAATACACATTTCAGAATTCCTGCTGGTACTAATAACGAAAAATCAATCGCACCAGCTGGACCTGGTTCTATTAGATTCAATACAGAAATTTTACAATTTGAAGGATATAGTGGTGCTAACTGGTCTTCTCTTGGTGGAGTAAGAGATGTTGATGGCAATACGTATATTATTCCAGAAACTGCACCAGCAGCAAACGAAAATATTCTCTACTTTTACAACAATAATTCAAATACATTACAGTTAACAGAAACTGTCCTTGATTTTACTAACATTGATACTATCACTACTTCTGGTGGTAATAGTCTGGCATTAGACACTCAAGTATTTACATTAAATTCTAACGATACTACTATTGATAACAGTGATTCAACTAGAACATTTGTTAGTACTACCAAACAGTATCTGGATTTAGGATTATCTAGTGGATTGAATGTAGATCCAGTTCTTAGATTAGATAATCAAGGTGATGTTTATTTAAACACTACATTTGGAACTGGAAGTTTTAACGGAGTTAAAATTTTTGATGGCGATTTGAAAGAATTTGAATTAGCAGACTACAAAATTTCTTCCGCTACATTTGTTTTAGACAAAGGAGGACTTGAATCTTCTTCTGTGGTTCTTTATGACACAGGATCAAAAGGATGCAAAGTAACTGTTGTGTCTAAATCAGATTCTGGAAAAAGATCTTTAACAGAATATGCAGTTATAGATACTGGTACGGATATTTTCCACAATGAATATGCGTCATTGAATTCTTCACTCGATCAATATACAGCATCATTTGATTTTAATATCAGTAATGAACCAAGAATCACAATAACTTTGACTGATGATCATGATGTAGCTGACATTATTAACTTTACCGTACTAATTCAGGAAATTAAGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f678395a5b1bfa2e83cab11493daba25b82dffbe3839870ca7dd7890d5de3099
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8088
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank