Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_009214098.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYSVLSDGVNVDFFIEENTVQQYDATRGYKKNFAVINDNRIWVAQRDIDAPAGAFTPQYWLATRTDPKWETVASPTRQLNSGEFIAVDSAASFTTFTLPTNPVDGDTIVIKDIGGNVGYNEIKVQSSNVPGGGNQKIVRFGNQYSEVLITKPFSYNMLIFSNRLWQFWEAGNEERGIRVEPSTGRFHAQAGDFIMRRYTTGAPITFILPKYANQGDIVKSVDIDGLGPTFHLMVETFDSSSSLGKAGQHQMEFRTTGDGFFVYNAAEKLWYVWDGDFKTRLRVIRDNVKLLPNESVIVFGEDNSTPATINIDLPTDVLQGDIVKIALNYLRKSQTVNIRAAAGDKIASDIKLLQFPKRSEYPPDSTWVLVDSLTFNGNISYTPVIELSYAEDKLSGTSYWVVAQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALANQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVAKENQRGIARIATTAQVNQNSDFAFVDDVIISPKKLNERTATETRRGLAELATQQETDAGVDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYVPTTGATPATSRELNGTNVYNKNTTNLVISPKALDQYKATYTQQGAVILAVESEVIAGTSQSGWPNAVVTPEMLHRKTALDSRIGLIEIATQTETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKASETLTGIAEIATQSEFDTGTDDTRISTPLKVKTRFNNTARTSVNALSGLVETGTLWDHYNLNILEANETQRGTARLATQGEVNTGTDDKTIVTPLKLMSKKATENAEGIVRIATNAEATAGTSKVLAISPSALKYIAQTETTWEASETLRGFVRLSSGTATSAATTTTGAGFTYENGVYTPDPSKLVNYVKSGYAVSPYELNRVLQNFLPINAMAVNAEKLDSLDSTQFIRRDIAQTVEGVLTLTKQTNLSAPVVSTSTAVFTDVTAGTSTFGTVNVVNGTNKWKITAPSTGTTMTIGDTTNVLTLNTASGNVAVLNNLSAGNDVQAKNNYVLNGRTIATTTGEASGATLALGDNSQNLVLKTLDAGNIIANGGGAFKVLTEKNAVEIVDRNFVNQAGDTMSGMLRVNAPVRVFGTKPSLIAQAPTAETVGFWSVDINDEPTYSQFPGYWTMILKRQINIDTVQTKPAGMSDEVWNSSGWLTENGKNGKLPGGQELGPDGQPITPQPPVVPIHYRKPDGTLGDPVSTPEAPIRGTWFDYSVRDKQIKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKSAWTTFAMVYTADNPPSAEDVGALPADNTTMGNLTILDWLRIGNVRIIPDPTTKSVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1337 AA
molecular weight: 145177,68290 Da
isoelectric point:5,23376
aromaticity:0,07779
hydropathy:-0,31526

Domains

Domains [InterPro]
DC_1946
ATT
1–209
DC_1946 DC_1209 IPR048391 DC_0003
IPR048391
ATT
1112–1172
IPR048391
YP_009214098.1
1 1337
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
RBD
ATT 1-209 | STR 349-1111 | ATT 1112-1172 | STR 1173-1186 | ATT 1224-1285 | RBD 1286-1337
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_VR26
[NCBI] 		1567029 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Gaprivervirus
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009214098.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_028957 [NCBI]
CDS location
range 151325 -> 155338
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCAGCATTCAGAGCAACATCCGGTCTCGATGCTGCTGGTGAGAAAGTCATTAATGTCGCGAAAGCTGATTACTCAGTTTTGTCAGACGGCGTTAACGTAGATTTCTTTATAGAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATGCAACGCGTGGATACAAAAAGAACTTCGCAGTTATTAATGATAACCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATTGATGCTCCTGCTGGAGCATTTACCCCTCAGTATTGGTTAGCAACTCGTACTGACCCTAAATGGGAAACTGTTGCATCTCCGACTCGTCAGCTTAATTCGGGTGAATTTATCGCAGTTGACTCTGCTGCAAGCTTTACCACATTTACATTGCCTACAAACCCGGTCGATGGCGATACCATCGTTATTAAAGATATCGGCGGCAATGTTGGTTACAACGAAATTAAAGTGCAGTCAAGCAACGTACCAGGCGGCGGTAACCAAAAGATTGTTCGTTTTGGTAATCAGTATTCAGAAGTTTTAATTACCAAACCGTTCTCTTATAATATGCTTATCTTCTCGAATCGCTTATGGCAATTCTGGGAAGCTGGCAACGAAGAACGTGGCATCAGAGTAGAACCATCAACTGGTCGTTTCCATGCGCAAGCCGGCGACTTTATTATGCGTCGTTATACAACCGGTGCACCGATTACTTTCATTCTTCCTAAGTATGCGAACCAGGGCGATATTGTCAAATCTGTTGATATCGATGGCCTGGGGCCAACATTCCACCTGATGGTTGAAACCTTTGACTCCAGTTCCAGTCTTGGTAAAGCTGGACAGCATCAAATGGAATTCCGCACCACGGGCGATGGCTTCTTTGTTTATAATGCCGCCGAAAAACTCTGGTATGTTTGGGACGGTGATTTTAAAACTCGTCTTCGCGTTATTCGCGATAACGTTAAACTTTTACCGAACGAAAGTGTCATTGTATTTGGTGAAGATAACTCAACTCCAGCGACGATTAATATCGATTTGCCAACGGATGTTTTGCAAGGTGACATTGTTAAAATTGCACTGAACTATCTCCGCAAATCACAGACTGTTAATATAAGAGCTGCTGCTGGTGATAAGATTGCATCTGACATTAAATTGTTGCAATTTCCTAAACGCTCCGAGTATCCACCAGATTCAACTTGGGTATTGGTTGATTCATTGACCTTTAATGGTAACATCAGTTATACTCCAGTTATTGAATTGTCTTATGCCGAAGATAAATTGTCTGGAACAAGTTATTGGGTTGTTGCTCAAAACGTTCCGACTGTTGAGCGAGTTGACTCATTAAATGATTCCACGCGTGCTCGTCTTGGTGTTATTGCTCTGGCAAACCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCAGAAAAAGAACTCGCAATTACTCCTCAGACTTTGGCTAACCGTGTTGCTAAAGAGAACCAACGAGGCATTGCCAGAATCGCAACGACTGCCCAAGTAAATCAGAACAGTGATTTTGCATTTGTTGATGATGTAATTATTTCTCCGAAAAAACTCAATGAACGTACGGCAACAGAAACGAGACGTGGGCTCGCAGAACTCGCCACACAGCAAGAAACTGATGCAGGTGTAGATGATACCACAATTATCACTCCAAAGAAACTGCAAGCGCGTCAGGGCTCAGAATCGCTGTCCGGTATCGTGACTTACGTCCCGACCACTGGTGCAACTCCAGCTACTTCGCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAATACCACTAATCTGGTAATTTCTCCGAAAGCTCTTGACCAATACAAAGCTACTTACACTCAGCAAGGCGCAGTTATTCTGGCCGTTGAAAGTGAAGTAATTGCAGGTACATCGCAATCTGGCTGGCCAAACGCTGTTGTTACTCCGGAGATGTTGCATCGTAAAACAGCTCTTGATTCCCGTATCGGTTTAATCGAAATTGCTACTCAGACAGAAACAAATGCAGGAACCGATTATACCAGAGCCGTGACTCCTAAAACGTTAAATGACCGTAAAGCATCAGAAACGTTAACCGGCATAGCCGAGATTGCTACGCAATCAGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCAACTCCATTAAAAGTTAAAACTAGATTTAATAATACTGCTCGTACTTCTGTTAATGCATTAAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACGCTCTGGGACCATTATAACCTGAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACGGCAAGATTAGCAACTCAGGGTGAAGTTAATACCGGTACTGACGATAAAACAATCGTTACTCCGCTTAAATTGATGTCGAAAAAAGCCACTGAAAATGCCGAAGGTATTGTTCGCATTGCGACAAACGCAGAAGCGACTGCCGGTACATCGAAAGTTCTGGCCATCAGTCCGTCTGCGCTGAAATATATTGCACAAACGGAAACAACCTGGGAAGCATCTGAAACACTGCGTGGATTTGTTCGTTTATCTTCTGGCACAGCTACTTCGGCCGCAACTACAACGACTGGTGCAGGATTTACATATGAGAATGGTGTATATACCCCGGACCCAAGTAAACTGGTTAACTACGTAAAATCTGGCTATGCAGTTTCGCCTTACGAATTAAACCGCGTATTGCAAAACTTCTTACCGATAAATGCGATGGCTGTTAATGCCGAAAAACTTGATAGCCTCGATTCAACCCAGTTTATTCGTCGTGATATTGCTCAGACTGTTGAAGGTGTGTTAACTCTCACCAAACAGACAAATTTATCCGCTCCGGTTGTATCGACGAGCACTGCAGTGTTTACTGATGTAACGGCTGGCACTTCGACGTTCGGAACTGTGAATGTTGTTAATGGAACCAACAAGTGGAAAATCACTGCTCCTTCCACCGGAACGACAATGACTATTGGCGATACGACTAACGTATTGACATTAAACACTGCCTCGGGCAATGTTGCTGTATTGAACAACCTTAGTGCCGGAAACGATGTTCAAGCCAAAAATAATTACGTTCTAAACGGTCGTACTATTGCAACCACGACGGGTGAAGCTTCTGGTGCAACTCTGGCCCTGGGTGATAACTCGCAGAATTTAGTGCTCAAAACTCTTGATGCTGGTAATATCATAGCAAATGGTGGCGGTGCATTTAAAGTCCTGACCGAGAAAAACGCTGTTGAGATTGTTGATAGAAACTTTGTTAACCAAGCGGGCGATACAATGTCTGGTATGCTCCGTGTGAATGCTCCGGTCCGTGTATTCGGTACGAAACCAAGTCTTATCGCACAAGCCCCAACTGCGGAAACTGTTGGCTTCTGGTCTGTTGATATTAATGATGAACCGACTTACAGTCAGTTCCCCGGTTATTGGACAATGATTTTAAAACGTCAAATAAACATTGATACCGTTCAAACTAAACCGGCCGGTATGTCCGATGAAGTTTGGAATAGTTCTGGTTGGTTAACAGAAAACGGCAAGAATGGTAAATTACCCGGTGGACAAGAATTGGGTCCCGATGGACAACCGATTACACCACAGCCTCCGGTTGTACCAATTCATTATCGTAAACCAGATGGAACTTTAGGTGACCCAGTTAGTACACCAGAGGCTCCTATACGTGGTACATGGTTTGACTATTCAGTTCGTGACAAACAAATTAAATATCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACGCTGGATTCATGCTATCAAGATTGGGTTTGCTATCCTACTGGATTAAACGGTGGTACTATTCGTTATACTCGCACATGGCAGAAAAATAAATCAGCCTGGACGACTTTCGCAATGGTTTACACCGCGGATAACCCTCCGTCTGCAGAGGATGTTGGTGCATTACCGGCGGACAACACAACAATGGGGAACTTGACCATTCTTGATTGGTTACGTATCGGTAACGTGCGTATCATCCCAGACCCGACCACTAAATCCGTTAAGTTTGAATGGGTTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
e14b4b81e9763ae6ba7f41ea4ea8a29969532165a6336c009fccbbf796a0b56a
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5459
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
VR bacteriophages - a small but diverse group of low-temperature viruses Kaliniene,L., Meskys,R., Simoliunas,E., Zajanckauskaite,A. and Truncaite,L. 2015-03-10 — GenBank