Protein

View in Explore
Genbank accession
AXH68353.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MANSFVRYTGNNSTTSYAIPFSYRHTDDLTVTLAGVATTAYTLNAAGTTLTFNSAPAQDVAIEIRRKTSQTTRLTDYADGSVLTENALDTDSTQAFFMGQEAIDDANDVIKPSSTNFQWDANNKRIINVANPTDNQDVATKHYLENTWLSSADKTTLNNVNSNIAAINTVNSNISAITTANSNSTNINTVATNINSVNTVAADITKVVAVANDLAEAVSEIETVADDLNETSSEIDVVANNITNVNTVGGINANVTTVAGISANVTTVAGIASNVTSVAGNSANINAVNSNSSNINTVAGAITNVNNVGGAITNINTVASNLASVNSFAEIYRIASSAPSTSLNVGDLYFDTTANELKVYKSSGWAAAGSTVNGTAQRYNYTATANQTTFTGADTAGNTLAYDAGYADVYLNGVRLSAADITITSGTSVVLAAGAAAGDILDVVAYGTFSVSSINAANIDSGTINDARLPTTMAGKTLTTATVEANSLTARGDGSSADGKITLNCSQNSHGVKIQSPSHSAAQSYTLVLPTSVGTSGQVLATAGSSTNQLSWIDATETKPTVANVSQTIAPATATTISITGTNFVSIPQVDFINGSTGAVTRANTVSFTNATTLSVNCTLASGNYYVRIENPDGNAGRSTNNIITASTAPTFTTNAGSLGTFAGNFSGNLATIAGTSDSAVTFSEVGSNLTTANVTLSSAGVLATTDFGGSSTTATQYNFTVRITDAEGQTTTRDFSLTSSFGATGGGQFN
Physico‐chemical
properties
protein length:751 AA
molecular weight: 76701,44020 Da
isoelectric point:4,33786
aromaticity:0,05992
hydropathy:-0,03901

Domains

Domains [InterPro]
IPR005604
ATT
3–111
IPR005604 DC_0265 DC_0265
DC_0265
STR
28–163
DC_0265 Coil
DC_0265
STR
229–282
DC_0265
AXH68353.1
1 751
Architecture
ATT
STR
ATT 3-111 | STR 112-751
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC021P
[NCBI] 		2282994 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062
[NCBI] 		335992 Bacteria > Proteobacteria > Alphaproteobacteria > Pelagibacterales > Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXH68353.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH579717.1 [NCBI]
CDS location
range 31975 -> 34230
strand +
CDS
ATGGCTAATAGTTTTGTACGTTATACAGGTAATAACAGTACAACATCTTATGCTATTCCTTTTAGCTACAGGCACACAGATGACCTAACAGTTACTCTGGCAGGGGTGGCTACAACAGCATACACCCTAAATGCGGCAGGAACTACGCTTACATTTAACTCTGCACCTGCACAAGATGTGGCTATTGAGATAAGAAGAAAAACGTCTCAAACAACAAGATTAACAGATTATGCTGATGGTTCAGTATTAACAGAAAACGCTTTAGATACAGATAGTACACAAGCGTTCTTTATGGGTCAGGAAGCTATTGATGATGCTAATGACGTTATCAAACCTTCTAGTACAAACTTTCAATGGGACGCAAACAACAAAAGAATTATAAATGTTGCTAACCCAACAGATAACCAAGATGTTGCTACCAAGCATTATCTTGAAAATACATGGTTATCTAGTGCAGACAAGACTACTCTTAACAATGTTAATAGCAATATAGCGGCAATTAATACTGTTAATAGTAACATATCAGCTATTACAACAGCTAACTCAAATTCTACAAACATCAATACTGTAGCAACTAATATTAATTCAGTAAACACAGTAGCCGCAGATATTACAAAAGTAGTAGCAGTAGCTAATGATTTAGCAGAAGCAGTTTCAGAAATAGAAACAGTTGCAGATGATTTAAATGAAACAAGTTCAGAAATTGATGTAGTTGCAAATAATATTACAAACGTAAATACAGTAGGTGGTATTAATGCTAATGTAACTACAGTAGCAGGAATATCAGCCAATGTAACTACAGTAGCAGGAATTGCATCAAATGTAACTTCAGTAGCAGGTAATTCTGCAAATATTAACGCTGTAAATTCTAACAGTTCTAATATTAATACTGTTGCAGGTGCAATCACTAATGTTAATAATGTTGGTGGTGCTATTACAAATATTAATACAGTTGCTTCTAATTTAGCTTCAGTAAATAGTTTTGCAGAAATTTATAGAATTGCAAGTTCAGCACCAAGCACTTCATTAAATGTGGGTGATTTATATTTTGACACTACTGCTAATGAATTAAAAGTTTACAAAAGTTCAGGTTGGGCGGCGGCAGGTAGCACAGTAAATGGTACAGCTCAAAGGTACAATTACACAGCTACAGCAAACCAAACAACATTTACAGGTGCAGACACAGCAGGAAATACACTTGCGTATGACGCAGGTTACGCTGATGTCTACCTAAATGGTGTCAGATTATCTGCGGCAGATATTACAATTACTTCAGGTACTTCTGTAGTTCTAGCGGCAGGTGCGGCGGCAGGAGATATTTTAGATGTAGTTGCTTATGGAACATTTAGTGTATCTTCTATTAATGCGGCTAACATAGATAGTGGCACGATTAATGATGCAAGATTACCTACAACAATGGCAGGTAAAACACTTACTACTGCTACAGTTGAAGCTAATAGTTTAACTGCAAGAGGAGATGGCTCTTCAGCAGATGGTAAGATTACTTTAAATTGTTCACAAAATTCACATGGAGTTAAAATCCAAAGTCCTTCTCATAGTGCGGCACAGAGTTATACTTTAGTTTTACCTACGTCAGTTGGTACAAGTGGACAGGTTTTAGCCACAGCAGGTTCTAGCACAAACCAATTATCTTGGATTGATGCAACAGAAACTAAACCAACAGTAGCCAATGTTTCGCAAACAATAGCTCCTGCAACTGCTACAACAATAAGTATTACAGGAACAAACTTTGTTTCAATACCACAAGTAGATTTTATAAATGGTTCAACTGGAGCTGTAACAAGAGCAAACACAGTATCATTTACAAACGCTACAACGCTTTCAGTAAACTGTACTTTAGCTTCTGGTAACTACTATGTTAGAATAGAAAACCCAGATGGTAATGCAGGAAGAAGCACAAACAATATTATTACTGCGTCTACTGCTCCTACATTTACTACAAATGCAGGTTCACTAGGAACATTTGCAGGTAACTTTTCAGGAAATCTTGCAACAATCGCAGGTACTTCAGATAGTGCAGTAACATTTTCTGAAGTAGGTTCAAACTTAACAACAGCTAATGTAACTCTTTCGTCAGCAGGAGTTTTAGCAACAACAGATTTTGGTGGTAGTTCAACTACTGCAACACAATACAATTTTACAGTAAGAATAACAGATGCCGAAGGTCAAACAACAACTAGAGATTTTAGTTTAACTTCTAGCTTCGGTGCAACAGGTGGGGGACAATTTAACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
e0d1abb2af0f5e69cd43dd98419d6cfae5b66c7362e670d7c6d9c27cae9fe1b7
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7640
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50