Protein
View in Explore- Genbank accession
- XPO94831.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MANFNELKEAIKQVIKTNGNEEITGAVMQNTLLSLISSLSSNRTYAGIANVQTIPGTPDGNVFYIASQTGDYPNFGLSLKSGETAIFYNDSSGAWVKASSEFASTTANRDYLYLGGKSKSTRVINAGLVDAVLDAYIDYTPIDGKYYVLSLWNKTEAGDFFFALYERDIETDEYQQKIYFPKSSGVKIFNDIYLHIVGNSKVLVNWGALPSAPWSMSVTQADGMELSPRIFSVGTLNDVTKIASDLANFKTYVDNWIALNQITENVLSNNLHNYVTDTKNKSLSDSGLTETETASYNLSQYIKVEPGASYICNNTMRKIWDFPDKGIAATMTENKTTFTPTGKYIRFIYLNTILPQDIKFGKLGNNINDDYKSNLFWQGNEILTPYSGVINDLYKQIQYKPGNNLHNPDTDTLNKSIQSDGSLLDNPLYNTTDYIEVLPGTNYYMLGQTMMRRVVQFDANKGAVLSADKVTQVLTGTTTAFVRFMYANTGKTPRDIKFGKLGTDISQDFGQFPYDKYNRRIALYGDSPVGDEDEKFVTLENSDKILFVGSSSTESHYTLKNKSWFMKLNDVLDWLFVTYAFSGNSATQLTNRLKNNQPSPTANGLPPSQIKPSYVHVGQFGNMSDDGLNAGTSSQFIEANRKLMLVAQSVFNAQLIVGTGYHIYDQYQLETALRDLADEFGADFIPWGYYNNKVMRIVDGYRSYKGFYGSAHPGTRSNNFYYQEALNFFEKWQKPKQCIKLFKPRTGTVDYNYRDNYERSQKFYSVEVGEQSLSDASAGRYDSLEPVDYTPFTINQSEYYTLIKKQDVSFGNILAVEFILPVIAFDKVNIYITTTETLTVKLYNNLTNQFVEISNIEALANNIYKIPVENFAYFMNDKVKLLLSGNVTISDIYIGYVGGREKQRIDKMQLLDYAGRHLIGGTGFADDWTTIWSNTGAATAYKQAERYGAEFVDIPGYLNAANANIIELAYDATTRKNIMKTFTQSELYGDRSANAPLHLRVEVYARMWCKIYDPEKFALWEGENNPFTDTPILTTDSYDFGTMQVGITGANNRTAILNKPVGMFWARIPFDVYLPPFSGNQTISISRKPGDVNNAFVLEISDVIISVID
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1109 AA molecular weight: 124710,50840 Da isoelectric point: 5,22796 aromaticity: 0,12804 hydropathy: -0,34022
Domains
Domains [InterPro]
DC_1005
STR
1–774
STR
1–774
SSF52266
STR
540–689
STR
540–689
1
1109
Architecture
STR 1-774 | RBD 859-1109
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Bacteroides phage BKO1-3 [NCBI] |
3385215 | Viruses > unclassified bacterial viruses > |
| Host |
Bacteroides ovatus [NCBI] |
28116 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > FCB group > Bacteroidota/Chlorobiota group > Bacteroidota |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XPO94831.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ571267.1
[NCBI]
CDS location
range 16323 -> 19652
strand -
strand -
CDS
ATGGCAAATTTTAATGAATTGAAAGAGGCAATTAAACAGGTTATAAAAACCAATGGTAACGAAGAGATTACGGGGGCAGTAATGCAAAATACATTATTATCTCTTATTAGTAGTCTTAGTTCTAATCGCACGTATGCGGGTATTGCTAATGTACAAACTATTCCGGGAACCCCGGACGGTAATGTTTTTTATATAGCATCACAGACCGGAGATTATCCCAATTTTGGGTTATCTCTAAAATCGGGTGAAACTGCAATTTTTTACAATGATAGTTCGGGTGCATGGGTTAAGGCATCAAGTGAATTTGCGAGTACAACTGCAAATCGGGATTATCTGTATTTAGGTGGAAAATCTAAAAGTACAAGGGTTATTAATGCCGGGTTAGTTGATGCTGTATTAGATGCGTATATAGATTATACGCCGATAGATGGTAAATATTATGTTCTTTCGTTGTGGAATAAAACGGAGGCGGGCGATTTCTTTTTTGCACTTTACGAACGTGATATTGAAACGGACGAATACCAACAAAAAATATATTTCCCAAAATCATCCGGGGTTAAGATTTTTAACGATATTTATTTACATATAGTAGGTAATTCCAAAGTGTTAGTAAATTGGGGGGCATTGCCTTCCGCCCCGTGGTCTATGTCCGTAACACAGGCGGACGGCATGGAATTAAGCCCCCGAATATTTTCCGTTGGAACATTAAACGATGTTACCAAAATTGCATCCGATTTGGCTAATTTTAAAACGTATGTTGATAATTGGATTGCATTAAATCAAATTACAGAAAATGTATTATCCAATAACTTGCATAATTATGTAACCGACACAAAAAATAAATCGTTATCAGATAGCGGATTAACGGAAACGGAAACAGCAAGTTATAACCTTTCGCAATATATTAAAGTTGAGCCGGGAGCATCTTATATTTGTAATAATACAATGCGAAAGATATGGGATTTTCCCGACAAAGGGATTGCAGCAACCATGACCGAGAACAAAACAACATTTACGCCAACCGGGAAATATATCCGGTTCATTTATTTAAATACAATATTACCCCAAGATATTAAGTTTGGAAAATTGGGCAATAATATAAATGATGATTATAAAAGTAATTTGTTTTGGCAGGGTAATGAAATATTAACTCCTTATTCGGGCGTTATTAACGATTTATATAAGCAAATACAATATAAACCGGGCAATAATTTACATAATCCGGATACAGATACATTAAATAAATCCATTCAATCAGATGGAAGTTTGTTAGATAACCCATTGTATAACACAACGGACTATATAGAGGTATTGCCCGGAACAAATTATTATATGTTGGGGCAAACAATGATGCGCCGTGTTGTTCAGTTTGATGCTAATAAGGGGGCTGTTTTATCAGCGGATAAGGTAACCCAAGTATTGACGGGAACAACAACTGCATTTGTTAGATTTATGTATGCAAACACAGGCAAAACGCCAAGAGATATTAAGTTTGGAAAATTGGGGACGGATATTAGCCAAGATTTCGGGCAATTTCCGTATGATAAATATAATCGTCGTATTGCTTTGTATGGAGATAGTCCGGTTGGGGATGAAGACGAAAAGTTTGTTACTTTGGAAAATTCCGATAAAATATTATTTGTCGGTTCGTCATCAACTGAAAGTCATTATACTTTAAAAAATAAAAGTTGGTTTATGAAGCTAAATGACGTTTTGGATTGGCTATTTGTTACCTATGCTTTTTCGGGCAATAGTGCAACTCAATTGACTAATAGATTGAAAAACAACCAACCGTCACCAACGGCAAACGGTTTACCCCCGTCACAAATTAAGCCGTCTTATGTTCATGTAGGACAATTTGGTAATATGTCGGATGATGGATTGAACGCCGGAACATCATCCCAATTTATCGAAGCAAACAGGAAATTAATGTTAGTTGCTCAAAGTGTATTTAACGCTCAACTTATTGTTGGAACGGGTTATCATATATACGACCAATACCAATTAGAAACGGCATTGCGTGATTTAGCAGATGAATTTGGAGCGGATTTTATTCCGTGGGGCTATTACAATAATAAAGTAATGCGAATTGTTGACGGTTATAGGTCGTATAAGGGATTTTATGGAAGTGCGCACCCCGGAACCCGTAGCAATAATTTCTACTATCAAGAGGCATTAAATTTCTTTGAAAAATGGCAGAAACCGAAACAATGTATAAAGTTATTTAAACCCCGTACCGGAACGGTCGATTATAATTATAGAGATAATTACGAACGGTCGCAAAAATTTTACTCTGTAGAGGTTGGGGAGCAATCATTAAGTGATGCAAGTGCAGGACGTTATGATAGTTTGGAACCCGTAGATTACACGCCGTTTACTATTAATCAAAGCGAATATTATACGTTGATTAAAAAACAAGATGTTTCATTTGGTAATATTTTAGCGGTAGAGTTTATTTTGCCAGTAATTGCATTTGATAAGGTTAATATCTATATTACGACAACAGAAACATTAACCGTTAAATTATATAACAACTTAACAAACCAATTTGTCGAGATTAGTAATATTGAGGCGTTGGCAAATAATATTTATAAAATTCCGGTAGAAAACTTTGCCTATTTTATGAATGATAAGGTTAAGTTGTTGTTATCCGGGAACGTTACAATATCAGATATATATATAGGTTATGTAGGCGGACGGGAAAAACAACGTATTGATAAAATGCAGTTATTAGATTATGCCGGTAGGCATTTGATTGGAGGAACCGGATTTGCAGATGATTGGACGACCATTTGGAGCAATACCGGAGCGGCGACCGCATATAAACAGGCTGAACGATATGGAGCCGAATTTGTTGATATTCCCGGTTATCTTAATGCGGCAAATGCTAATATCATAGAATTAGCATACGACGCCACAACCCGAAAGAATATAATGAAAACGTTCACTCAATCCGAATTGTATGGAGATAGAAGTGCAAACGCCCCGTTACATTTACGTGTTGAGGTTTACGCTCGTATGTGGTGTAAGATATACGACCCCGAAAAGTTTGCACTTTGGGAGGGGGAAAATAATCCATTTACTGACACACCAATACTAACAACAGATAGTTATGATTTTGGTACAATGCAAGTAGGTATAACCGGAGCCAATAACCGAACAGCTATATTAAACAAACCAGTAGGGATGTTTTGGGCGCGAATACCATTTGATGTGTATTTGCCCCCATTTTCCGGCAATCAAACAATCAGCATATCACGAAAGCCGGGCGATGTAAATAATGCATTTGTATTGGAAATTTCTGACGTGATAATTAGCGTAATAGATTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
10d0efa72d0e3ceaf1cfdb017b3a1178b88d2a7a565a6771e72ca7d0b8de1336
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50