Protein

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Genbank accession
YP_006906382.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,61
Protein sequence
MIINNATEKLVIQSLAPSYTKLYVLHSIYRDYDVVGRSFWTYGSGVASERRDITDTSINFATLSGFNSSTEYSLRGAFFDAMVDAELLEAQIGINLSDATSFTTKQMPTITSVQSIAESVDVGVGPPRVSISTLGDADYCILEFKEVGASTWRRYYTGALAPTITFSGVPIGEYNVRIVGFITLPDGSTTEASTPFEFPQVLTVLYNFIPPSAPKNIQFKAARIQDGKERYDVRVEWDWEKDIGANVREFSLHYVEFDEFAVSGWEKAQVINVGAARAATITSFPFNRRYKFKVSSIAWGPDTQAITEAPSVEYILTEDTILDSSFTNETGIEVNYAHIKGSFKDGTIWRQSFLIDAATGAVSLGALDSEGRAPISFDPLSRTVNVDGSVITKSIYSANFILTNLTGEDNPAIFSQGKNWGDNNSGIWMGMDNTTLKPKFELGNSTQFIRYDGDTLRISGDTVIGTPSGDIDISTGLQGKQTVFIYRLAPPVITSPPASPDYPPEGWSTTPPARTSSLQSIYVSTGLLNPITNKLVDGEVWSNPSMWTGVRGADGTSAKNFSISSTAQSFSFTGEGAVKSASTITFTGNRSNAAGTITWTARNNSSAIVPLSITGDTATLSVANFGASLFVTVTATCDGISDVITIVRLIDGSNALTGYLTNESVSVPASSTGVVSSFSAATGQFKVFYGTWDVSSACTFSLVASSAATGAIGSASGTYNISAMSANLGSITLRASHPTYGTVEKIFSISKSIAGVEGIAGTAAKGFSITSTAQSFVYTGIGTLKSAPSIVFTALRQSTTANVTWSAVSNTGATVALTSVSNTGATLTSANQGGFAWVTVTATCDGMSDKITIVLLTDGSNVMSGYLTNEAVVLDSNSDGYVQVYTSATGYFKVYFGTADITSQCTFSVSNPSNLTTSINSAGLYSTTAMAPGVGVTQGYSDLTATHPTYGSITKRLSISKSLAGRGYNVIYTTNFENSSRGSWNGSPIQDDSALVPLGFTKYMPCYERDTLEANNIVSVVAGEKYKVRALINTEASQQTVYLGARLLNAEKEHVTWAIADGAGRAPTPGWGVIQGTLTIPNGVAYIIPWIQRSGPHGTANGYSRVTDISFEDLSMKGIDGTDGNDGTSVLVQWSVNGVNNWHDTYVAGDKYMRQQVSGAWGPAAKVVGEDGTNGTAGTYVSFIFRASTTRPPQPLGQNPPGWTDSPPSSGVVWMSSATKTGDTGFLLSAWSVPVKLTGETGAKGDSITGPAGTRGVGTYTQAVAGLANFDTTIAWNFFISNFGSGPVAGDVLTQYRTGAPNIAFTRYWNGAAWTAAALVVHGDMIVNGTIPSAKIIDASITSAKIQDAAITNAKIANGTITNAKIQDAAITRAKISTTLESDNFVNNSTGTSINFATGQIQMNSTGAGGRMTITNERIDIYDENNRLRVRIGKL
Physico‐chemical
properties
protein length:1435 AA
molecular weight: 151916,49910 Da
isoelectric point:5,14031
aromaticity:0,09547
hydropathy:-0,05150

Domains

Domains [InterPro]
IPR057550
STR
10–98
IPR057550 IPR057551 IPR057552 IPR057549 DC_0456 DC_1191
DC_1191
STR
229–616
DC_1191 IPR057549 IPR015406
YP_006906382.1
1 1435
Architecture
STR
STR
STR
STR
STR
STR 10-98 | STR 104-195 | STR 210-616 | STR 761-967 | STR 1148-1434 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pectobacterium phage My1
[NCBI] 		1204539 Uroviricota > Caudoviricetes > Demerecviridae > Myunavirus > Myunavirus My1
Host Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum
[NCBI] 		555 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Pectobacterium

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_006906382.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_018837 [NCBI]
CDS location
range 85495 -> 89802
strand -
CDS
ATGATAATAAATAACGCTACGGAAAAGCTAGTGATTCAGTCACTAGCCCCTTCTTACACAAAACTTTATGTTCTACATAGTATATACAGAGACTATGACGTAGTTGGTAGGTCTTTCTGGACGTACGGATCTGGAGTAGCTTCTGAGCGTAGAGACATAACAGATACATCAATAAACTTTGCAACACTATCAGGATTTAATTCTAGCACTGAATATTCCTTAAGAGGAGCATTCTTTGACGCCATGGTTGATGCCGAACTTTTAGAGGCCCAAATTGGTATTAACCTGTCAGATGCCACCTCTTTTACAACAAAACAAATGCCTACCATTACCTCAGTTCAATCTATAGCAGAGTCTGTAGACGTAGGGGTAGGCCCACCAAGAGTCAGTATTAGTACTCTTGGTGACGCTGATTACTGCATTCTAGAGTTTAAAGAAGTAGGGGCATCAACATGGAGACGTTATTACACAGGTGCTCTAGCTCCTACCATAACCTTTAGTGGTGTTCCTATTGGTGAGTATAATGTTCGTATAGTGGGGTTTATAACTCTTCCTGATGGATCTACTACAGAAGCATCCACTCCATTTGAATTCCCACAGGTACTGACAGTTTTATATAACTTCATACCTCCTAGTGCTCCAAAGAATATACAATTTAAAGCTGCGCGTATTCAAGACGGTAAAGAACGTTATGATGTTAGGGTAGAGTGGGATTGGGAAAAAGATATAGGTGCCAATGTAAGAGAGTTCTCTCTCCACTATGTAGAGTTCGATGAGTTTGCAGTAAGTGGGTGGGAAAAAGCTCAGGTAATTAACGTGGGTGCAGCTAGAGCAGCAACTATAACTTCGTTCCCATTCAACAGACGATACAAATTCAAAGTCTCTTCTATAGCATGGGGGCCAGATACTCAAGCTATAACTGAGGCACCTTCTGTAGAGTACATCCTTACTGAGGATACTATACTTGATTCAAGCTTTACTAATGAAACTGGTATAGAAGTTAACTATGCACATATAAAGGGTAGTTTTAAGGATGGAACTATATGGAGACAGTCTTTCCTTATAGATGCTGCTACTGGTGCTGTAAGCTTAGGGGCACTGGATTCCGAAGGTAGAGCACCAATATCTTTTGACCCTCTAAGTAGAACTGTTAACGTGGATGGTTCCGTTATAACCAAGAGTATATACTCCGCTAACTTTATTCTTACTAATCTTACTGGAGAAGATAACCCAGCAATATTTAGTCAGGGAAAGAATTGGGGTGATAATAACTCAGGAATCTGGATGGGTATGGATAATACTACCCTAAAGCCTAAGTTCGAATTAGGTAACTCCACTCAGTTTATACGCTATGATGGGGATACTCTTAGGATTTCAGGGGATACAGTAATAGGAACCCCTAGTGGGGATATAGATATTAGCACTGGTTTACAAGGTAAACAGACAGTATTTATATATAGGTTAGCTCCCCCTGTTATTACATCTCCACCAGCTAGTCCTGATTACCCTCCAGAAGGTTGGTCAACTACCCCTCCTGCGAGAACTTCTAGCCTTCAGTCTATATACGTTTCTACAGGTCTTTTAAACCCTATAACAAACAAACTAGTAGACGGAGAGGTCTGGAGTAATCCTTCTATGTGGACAGGAGTAAGGGGTGCTGACGGTACTTCTGCTAAAAATTTCAGTATTAGTAGTACAGCTCAGTCTTTCTCTTTCACAGGGGAAGGTGCAGTTAAGAGTGCTAGTACTATTACCTTCACAGGTAATAGATCAAATGCCGCGGGTACTATAACGTGGACTGCACGTAATAACTCTAGTGCTATAGTACCTTTAAGTATAACAGGAGATACTGCTACTCTATCTGTAGCTAACTTTGGTGCTTCCTTGTTTGTTACAGTTACTGCAACTTGCGATGGAATATCCGATGTTATAACTATAGTAAGACTGATTGACGGATCTAACGCACTGACTGGGTACCTAACTAACGAGTCCGTGTCTGTACCTGCAAGTTCTACTGGAGTGGTTTCTAGTTTTTCTGCTGCTACAGGACAGTTTAAGGTATTTTATGGGACTTGGGATGTGTCTTCCGCATGTACGTTCTCACTAGTAGCTTCTAGCGCTGCTACTGGTGCAATAGGTAGTGCTTCCGGAACATATAATATATCTGCAATGTCAGCCAATTTAGGTAGTATTACTCTTAGAGCATCTCATCCTACTTATGGTACTGTAGAGAAAATCTTTAGCATCTCTAAATCTATAGCAGGTGTGGAAGGTATTGCAGGTACTGCTGCTAAAGGGTTCAGTATTACTTCTACCGCTCAAAGTTTTGTATATACGGGTATCGGTACTCTTAAATCTGCCCCTAGTATAGTGTTCACAGCCCTTAGACAGAGTACTACTGCAAACGTTACCTGGTCAGCGGTGTCCAATACGGGAGCTACTGTAGCTTTAACATCTGTTAGTAATACAGGTGCTACTCTTACTTCAGCTAACCAAGGGGGTTTTGCTTGGGTTACTGTAACTGCAACATGTGATGGGATGTCTGATAAGATAACTATAGTACTGCTTACTGATGGTTCTAACGTTATGAGTGGGTACTTAACTAACGAAGCTGTAGTTTTAGATTCTAACTCAGACGGCTACGTACAAGTGTATACTTCGGCTACAGGGTATTTTAAGGTATATTTTGGCACAGCAGATATAACGTCTCAGTGTACCTTTTCAGTGTCTAACCCATCTAACTTAACAACTAGCATTAACTCTGCAGGGCTGTATAGCACTACTGCAATGGCTCCCGGGGTAGGAGTAACTCAAGGGTATTCTGATTTGACTGCTACCCATCCTACTTATGGTTCCATAACCAAAAGACTAAGTATTTCTAAGTCTTTAGCTGGTAGAGGGTACAATGTAATATACACTACTAACTTTGAAAACAGTTCACGAGGTTCTTGGAATGGTTCTCCTATACAAGATGATTCTGCACTTGTACCTTTAGGCTTTACAAAGTACATGCCTTGCTATGAAAGGGACACCCTAGAGGCTAATAATATTGTATCAGTAGTAGCTGGAGAAAAGTATAAGGTTAGAGCACTGATCAACACAGAAGCATCACAGCAGACGGTATACCTAGGTGCTAGGCTATTAAATGCTGAGAAAGAACACGTCACATGGGCTATCGCAGATGGAGCTGGTAGGGCACCTACTCCTGGGTGGGGTGTTATACAAGGTACGCTTACAATACCTAATGGTGTCGCGTATATAATACCATGGATACAGAGAAGTGGGCCGCATGGTACTGCTAATGGGTACTCTAGGGTTACTGATATATCCTTTGAAGATTTATCTATGAAGGGTATAGATGGGACCGACGGTAATGATGGTACCAGTGTTCTTGTTCAATGGTCTGTAAATGGAGTTAATAACTGGCACGATACTTATGTTGCTGGGGATAAGTACATGAGACAACAAGTTTCTGGAGCTTGGGGTCCAGCTGCAAAAGTAGTAGGGGAAGACGGTACAAACGGTACTGCAGGAACTTATGTATCATTTATCTTCAGAGCCTCTACTACCCGACCTCCTCAGCCTCTAGGACAGAATCCCCCTGGATGGACTGACTCACCTCCTTCTAGTGGTGTTGTATGGATGAGTAGTGCCACGAAAACAGGGGATACCGGTTTTCTATTATCTGCTTGGTCTGTACCAGTTAAACTTACTGGGGAGACTGGTGCTAAAGGGGACTCTATAACAGGGCCTGCGGGTACTAGAGGGGTTGGTACATATACTCAAGCAGTAGCTGGCTTAGCAAACTTTGACACTACTATTGCTTGGAATTTCTTTATAAGTAATTTCGGGTCTGGGCCTGTAGCTGGTGATGTATTAACTCAATATAGAACAGGTGCTCCTAACATAGCATTTACAAGGTACTGGAATGGAGCAGCTTGGACAGCCGCAGCATTGGTGGTTCATGGGGATATGATAGTAAATGGTACTATACCAAGTGCTAAGATTATCGATGCGTCTATTACTAGTGCCAAGATTCAGGATGCGGCTATTACTAATGCTAAGATAGCTAATGGTACTATCACTAATGCTAAGATTCAGGATGCTGCTATTACTAGGGCTAAGATATCTACTACTCTAGAGTCTGATAACTTTGTTAACAACTCTACCGGTACGTCTATAAATTTTGCTACAGGGCAAATCCAGATGAATAGTACAGGGGCAGGGGGTAGAATGACCATAACCAATGAGAGGATAGATATTTATGACGAGAATAACAGACTCAGAGTTAGAATAGGAAAACTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
4efa470d8ad163ca11db92ab12ece1d0463fbaf658f01b3a13b7cb750d6f24bd
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8210
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50