Protein

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Genbank accession
XAO14083.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,57
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNTPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLLFVFSNRLWQMYIIDYGKESITVTPATPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIIHLVDLDKLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIREGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATTGTINLTLPSGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTVAGTRYWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATETRRGIAKIATTAQVNQDSTATFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETDAGTDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTASATPAATRGTAGTNVYNKDTTTLTISPKALDQYKATSTQQGATILALESEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQEETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNTGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIAQSEPTWAATTAIRGFVKTSFGSITFVGDDTQGSTQDLNLYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNSGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTIRVWGNQFGGGSDTSRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPINVNASGSLNANGVATFGSSVTANGEFISKSANAFRVISGDYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLLINNQSGQITIGEGLIVAKGATINSGGLTVNSRIRSHGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139514,55240 Da
isoelectric point:5,37568
aromaticity:0,07281
hydropathy:-0,32169

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–140
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
981–1094
IPR048390
DC_1209
STR
1001–1276
DC_1209
XAO14083.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-140 | STR 343-980 | ATT 981-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1276 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage JM10
[NCBI] 		3128064 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655
[NCBI] 		511145 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XAO14083.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP400777.1 [NCBI]
CDS location
range 43087 -> 46962
strand +
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACTGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACGTTGCCGAATACGCCGGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGCCCACGTTCACAACTATTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATTATCGATTATGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGACACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCCACCTAGTTGATTTAGATAAATTAAACCCACTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATCGGTGAAGTCGGGACTCATATTGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATACGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAACGCTACAACCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCTTCTGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCATTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCGTATATCGAAGACACCGTTGCTGGTACACGTTATTGGGTTGTTCAACAAAACGTCCCGACTGTAGAACGTGTTGATGCTGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTGGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAACTCGACGCGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAATCAGGATTCTACTGCAACATTTGTGGATGATACTATCGTTACGCCTAAGAAATTAAATGAGCGTACAGCGACTGAAACTCGTCGCGGTTTAGCAGAAATAGCTACTCAAGCAGAGACTGATGCTGGGACTGATGATACAACTATTATCACTCCTAAGAAATTACAGGCACGTCAGGGTTCAGAAACTCTGTCTGGTATAGTTAAATATGTATCGACTGCTTCAGCTACTCCTGCTGCTACTCGTGGAACTGCAGGCACTAACGTTTATAATAAAGACACAACTACGTTAACTATTTCGCCTAAAGCTCTCGATCAGTATAAAGCGACTTCTACTCAACAGGGTGCTACTATTCTGGCTCTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGTCAATCCCAAGCAGGTTATTCTCACGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGAAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAACTTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGACGATACTCGTATCTCAACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGCACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATACAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAGGTTGCTACTCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGCGCAGAGTGAACCTACCTGGGCAGCTACTACTGCGATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATTCGGTTCTATTACATTTGTTGGCGACGATACTCAAGGTAGTACACAGGACCTGAATCTTTACGAGAAAAATAGTTATGCTATTTCTCCATATGAATTAAATCGCGTATTAGCAAATTATTTGCCATTGAAAGCTAAAGCTGTAGATAGTAATTTATTAGATGGACTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAACTCTGGAACAGCAACTCGTCTGATTTTTGAAAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCCAGCGCAGACGATGACTATCAGAGTTTGGGGAAATCAGTTTGGCGGCGGATCAGATACATCACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGAGATGAAACATCTAATCACTTTTATTCTCAACGTAATAAAGCTGGGAATATAACGTTTAGCATTAACGGTACTGTGATGCCGATAAATGTTAACGCTTCAGGTTCTTTGAACGCTAACGGCGTTGCAACATTTGGTAGTTCAGTTACAGCCAATGGTGAATTCATTAGCAAGTCTGCAAATGCATTTAGAGTAATTAGTGGTGATTACGGATTCTTTATTCGTAATGATGCTGCTAATACCTATTTTATGCTCACTGCATCAGGTGATCAGACCGGTGGTTTTAATGGATTACGCCCATTATTAATTAATAATCAATCCGGTCAGATTACAATTGGTGAAGGCTTAATCGTTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTGACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCATGGTACTAAAACATCTGATTTATATACCCGTGCACCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATAGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAATTCCCTGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAAGCACGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAACCATCTGATATTGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTCGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f0516ec3687c79cf095b1db3d4fbcceb7f78db9f097c7380d6460822d56ff639
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5582
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Gp38 adhesins of Straboviridae phages target specific extracellular receptor loops Lutz,V.T., De Sousa,V.K., Taylor,N.M.I., Nugen,S.R., Gambino,M. and Brondsted,L. 2025-04-25 — GenBank