Protein

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Genbank accession
QBO62670.1 [GenBank]
Protein name
putative long tail fiber, proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,68
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNAPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLLFVFSNRLWQMYITDYGKESITVTPAAPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIISLVDLDKLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHTAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATAGTINLTLPSGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELSYIEDTVAGTRYWVVQQNVPTVERVDAGTDTTRARVGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTASFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETITGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTRQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGASTRLIFEKGPQTGNNPAQAMNIRVWGNQFAGGSDTSRATIFEVGDETSNHFYSQRDNLGNITFSINGTVRPINVNASGTLNANGAATFGRSVTAQGEFITYSANAFRAISGNYGFFIRNDGGSTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSHGTKTADLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPDARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139288,25140 Da
isoelectric point:5,46782
aromaticity:0,07436
hydropathy:-0,30891

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–141
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
981–1094
IPR048390
DC_1209
STR
1067–1274
DC_1209
QBO62670.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-141 | STR 343-980 | ATT 981-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1274 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_G2285
[NCBI] 		2502414 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBO62670.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK327933 [NCBI]
CDS location
range 148823 -> 152698
strand +
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGATTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACCGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGTAATGATATGGTTTTCACATTACCAAATGCGCCGGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGCCCACGTTCACAACTATTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATTACCGATTATGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCTGCACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTCGATTTAGATAAATTAAACCCACTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGACGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATACTGCCGAAGGCAGAAATGACTCCGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAACGCTACAGCCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCTTCCGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCATTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTATCGTATATCGAAGACACCGTTGCTGGTACACGTTATTGGGTTGTTCAACAAAACGTCCCTACGGTAGAACGTGTTGATGCTGGAACTGATACAACTAGAGCTCGTGTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTGGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAATCAGAATTCCACAGCATCATTTGTGGACGATACTATTGTTACGCCTAAAAAACTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGGCTGAAACCGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACACCTAAGAAACTGCAGGCACGTCAGGGTTCAGAAACACTATCTGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACTCCTGCTGAAACTCGTGGGGCCGCAGGCACTAACGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTATGCTCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTGTTGATAGTGAAGTAATTGCTGGTCAATCCCAAGCAGGTTATTCTCACGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAACTTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGACGATACTCGTATCTCAACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAGGTTGCTACTCAGGCTGAAACTATAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAATGAACCAACATGGGCTGCTACTACAGCAATTCGTGGATTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCAACACAACCTTTAGAATCATATGAAAAAAATAGCTATGCTATATCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTACTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCAAATTTATTAGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCGACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACGGCTACGTTTGGTGGTTCGGTATCTGCTAATAGTACATTAACTATTTCTAATACAGGTGCTTCAACTCGCTTAATATTTGAAAAAGGTCCACAAACTGGAAACAACCCTGCTCAGGCGATGAATATCCGTGTATGGGGTAACCAATTCGCCGGCGGTTCTGATACATCTCGTGCTACGATATTTGAAGTTGGTGATGAAACATCTAACCACTTTTATTCACAACGGGATAACCTTGGTAATATTACTTTCAGCATCAACGGTACAGTTCGGCCGATTAATGTTAATGCATCCGGAACATTGAATGCTAATGGTGCGGCAACATTTGGACGTTCGGTGACAGCACAGGGTGAATTTATAACCTATAGCGCAAACGCATTCAGAGCAATTAGTGGTAATTACGGATTCTTTATTCGTAATGATGGCGGCAGCACATATTTTATGCTTACTGCATCTGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCCGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCATGGCACTAAAACCGCTGATTTATACACCCGTGCACCGACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGACATTAATGATTCAGCTACTTATAACCAATTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGACGCACGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGTGGAAACCCTCCTCAACCTTCTGATATTGGAGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTCGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
948531fce672b3ef546108ffd1c99303f308c8a935330dfb34d49df4ead620cb
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8159
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Still something new to discover - new insights into E. coli phage diversity and taxonomy Korf,I.H.E., Adriaennsens,E., Dreiseikelmann,B., Kropinski,A., Nimtz,M., Meier-Kolthoff,J.P., Rohde,M., van Raaij,M. and Wittmann,J. 2019-05-17 — GenBank