Protein

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Genbank accession
XEN29346.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKTVFDPTGSSEITIGDVLKTFKLNANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSGTQQIQGDANLLRLRNQNANNAQYIEGVDLDGSARWWVGIGRNGGDTVNLYNNKYDSALTVASNISVNKSLVITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAGNNTFSGANTFNRMLSIQTNDAALRLKSTVASGALYIKAETNDGADRWYVGNGNETPSVLIHNYTYGSNIRLDNGYVLVNKNFRITGQVQPSDWTNIDSRYIPAGTLSTIARTNAANTFTFQQIIQANGEAIRLKNSSENSPLYIRGQDSTGANRWYVGNGSGSDDVTISNYKTGSYVNLANDITLNKTVKITGQVQPSDFSNLDARYYTQSSANSRYMLASVTGLASEKDGDGVAWNAKTGLYSVTDKTASSTQLVYHMCQGMGSTPAAQLKFLYRNGGFWYRTARDGYGFEGVWSKVYTDQDKPTPSEIGAYTKSETDQKIAQAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGAHTHSVSGSTNNTGAHTHTVGGRYGGDSIGGKQRVQVSGTNQVSSSAGAHAHTVSGTAASNGNHAHTVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:780 AA
molecular weight: 83908,37990 Da
isoelectric point:8,87931
aromaticity:0,08718
hydropathy:-0,44692

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–265
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 DC_1993
IPR048388
ATT
159–247
IPR048388 IPR048388 G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
G3DSA:6.20.80.10
STR
159–218
G3DSA:6.20.80.10 DC_1993 IPR048388 IPR022246 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
XEN29346.1
1 780
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-355 | STR 356-381 | ATT 382-473 | STR 474-776 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage vB_CECAV_041
[NCBI] 		3242747 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Salmonella enterica subsp. enterica serovar Kedougou
[NCBI] 		358771 Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales > Enterobacteriaceae > Salmonella > Salmonella enterica

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XEN29346.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ064465.1 [NCBI]
CDS location
range 49628 -> 51970
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGATACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCATCTTTTAAGCTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGTACTATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGACAGTCTTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAACTTAACGCAAATGGTCTTAAACTGACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGTCCTAATGAGCTTGGTATGAGAACTAATGAAGAGAATGACGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTCACAAACACATTCTCTGGGACTCAGCAAATTCAAGGTGATGCTAACTTACTTCGCCTTAGAAACCAAAATGCAAATAATGCACAATATATTGAAGGTGTAGACCTAGATGGTTCGGCTAGATGGTGGGTCGGTATTGGTCGCAATGGCGGTGATACAGTAAACCTGTATAACAACAAATACGACTCAGCCTTGACTGTTGCAAGTAATATTTCTGTTAATAAGTCTTTAGTAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGGTAATAATACTTTTAGTGGTGCAAACACATTTAATCGAATGTTATCGATTCAGACGAATGATGCAGCTTTAAGACTGAAAAGCACAGTAGCAAGTGGTGCACTATACATTAAAGCTGAAACCAATGATGGTGCTGATAGATGGTATGTGGGTAATGGTAATGAAACCCCCTCTGTATTGATTCACAACTATACATATGGTTCAAATATTAGGCTTGATAATGGGTATGTCTTAGTCAACAAGAACTTCAGAATCACTGGTCAAGTTCAACCATCTGATTGGACTAATATCGACTCTAGATATATTCCAGCAGGAACTTTAAGTACAATTGCAAGAACTAATGCTGCTAACACTTTCACTTTCCAACAAATTATCCAAGCAAACGGTGAAGCCATTAGGCTAAAAAACTCTTCTGAGAACTCACCATTGTACATTAGAGGTCAGGACAGCACTGGTGCTAATAGGTGGTATGTAGGTAATGGTTCAGGGAGTGATGATGTTACTATCTCCAACTACAAGACTGGTTCCTATGTTAATCTTGCTAACGATATTACTCTCAATAAAACTGTTAAAATCACTGGTCAAGTTCAGCCTTCTGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTACACCCAGTCTTCCGCAAACTCAAGATATATGCTCGCAAGTGTCACTGGTCTAGCTTCTGAAAAGGATGGTGATGGTGTTGCATGGAATGCAAAAACAGGTCTGTATAGTGTTACGGATAAAACTGCTAGTTCAACACAGCTAGTCTACCATATGTGTCAGGGTATGGGTTCTACACCAGCCGCTCAGTTAAAATTTCTCTACAGAAATGGGGGTTTTTGGTATAGAACAGCCAGAGATGGGTATGGTTTTGAGGGGGTATGGTCTAAAGTCTACACAGACCAAGATAAACCAACCCCTTCAGAAATTGGTGCATACACTAAATCTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAATTAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACATGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTTCCTGGATTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATTAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGAGGTTCAGATTCTGTTACGTTAGCAGTTGGAAACTTGCCTTCACACACTCATAGCTTCTCTGCGACAACCTCTAGCTTTGACTACGGTACTAAGACCACTAATACAACTGGTGCTCACACCCACTCAGTGAGTGGTTCTACTAACAACACGGGTGCTCACACACATACTGTAGGTGGTCGTTACGGGGGTGACTCTATTGGTGGTAAACAACGTGTTCAGGTATCAGGGACTAATCAGGTTTCTAGCTCTGCTGGTGCTCACGCTCACACTGTGTCTGGTACTGCTGCCTCTAACGGAAACCATGCTCACACTGTTGGTATTGGTGCTCACAGCCATACAGTAAGCGGCAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGCTGATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7ec0765e91fa0d55f914f3b2cbb7c2279aed5d6ca5f12080b3c1750fb7a7c400
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6943
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50