Protein

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Genbank accession
XSB44650.1 [GenBank]
Protein name
minor head protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,51
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MIHVLDFNSKIIDFISSDDIAVTRAEYTRNKQDKSELLNIEILSERAEHFKKRNRVIIQDKTNAYREFIINRIEESGDILEVECDPSYVEDIGKAKPIPTGNFTKTTVNEALSEILRDSGWVEGLCEYGGIKSMSWTSVRTPYEMISQLTTTYKLEPDYEIEIDGNEVVKRKVNMLEPKPLFKGKEIVYGKDLISMKRTVDMTEVKTALFAFGPEKDDGTRISTVVVDDEAQQQFNLPKRYLWGIYEPESDDQDMTIERLTTLTKIELNKRNSAALSYEIEAFDLEEDYPHEIIRFGDIIRIKNTDFTPSLYAESEVIGFTHELISGELTWTFGNIVEYEEDDLLKYFRSRLKDIEKKFNDDINNVGSIITDRIDEEVERLQRKLHRGPTPPDNPEEGDFWFDTSNPNVAVLREFVNGEWKHASAHDVEQIGGLSREVIIYRQLLEATHSMSAEIANQMERTNVALSSEYLVDLDVKGKLQKALSDMLAKLQIVKNYMDSMTEETATIGRLMEWQSALVDLRNDFYYLIVALIEAEKAIQERLKYLQSQYTEEKFNEAMQNVADKFGFEYTEDGFLVGEGSLISGAIQALREDTEEQFKQVVKSVDYETDKKGIVERLNSADSAREQLDKLIKDRVTLTEYNKMKIGTRNLLLNSKERSDLFGSSTHRRIVYHLTEPLKVGQEYTLTFDMEVTSGDNFGKTTVLPYEPSNGSIDITIDNSTHNKLTFVANVPSTLLLIYSAVNSTPENDTTEIKVTDAMLVEGNKIGDYSQAPKEQEERLETMETGIEQNGIDISLRAKETDLNKTKQTLSKIAAEILVNTTTGVTLKYDENGTVSDVTVGPGGVKINANVFEINDGDVIVKDGVTTIKDAYIDKLFSKQATINYLNSVDITAKRIEAKDNKASVNIENGTITMTRADGHKLDMGINGIEMLNPDGSKRFSMDRLLVTSAALGTSNSNVYLAAQQDFEVRAVDITQIPSDGAWDSYRYVPIRADSFIGNKVMTNGGTNLYLGSDAEVRVTSRGGYNGTDTIYRDVRALGFYGNYLDSNYVTAGQNIYIRPDRGSEVRFTVRGTTDSYVDIRGGTGWLASVSHRGSNARFYIGSDNGVRITGRSLYNGGDIIWRDLAANGLYANFLEINPNTNASNLYLRANNEVRITKRNSTNSYIPIRAASATWTSSERYKYDIENWDIDVLEHLVDRVQLYSYKLYSEMEEDSQRVRHGVVLERETPDEWKNGDGVDSYEMTAWCLKAIQELTKKVRALETELEAKL
Physico‐chemical
properties
protein length:1269 AA
molecular weight: 143752,25910 Da
isoelectric point:4,83304
aromaticity:0,08432
hydropathy:-0,50252

Domains

Domains [InterPro]
DC_1353
STR
1–792
DC_1353
IPR007119
Unmapped
28–330
IPR007119 DC_0497
IPR010572
ENZ
94–324
IPR010572
XSB44650.1
1 1269
Architecture
STR
RBD
STR 1-792 | RBD 793-1269
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Mammaliicoccus phage phi6228
[NCBI] 		3413668 Viruses >
Host Mammaliicoccus sciuri
[NCBI] 		1296 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XSB44650.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV425441 [NCBI]
CDS location
range 35290 -> 39099
strand +
CDS
TTGATCCATGTATTAGATTTTAATAGTAAAATAATTGATTTTATTAGCAGTGATGATATTGCTGTGACTAGAGCTGAATACACGAGAAACAAACAAGACAAAAGTGAACTTTTAAATATAGAAATCTTAAGTGAGAGAGCTGAACACTTTAAAAAGCGTAATCGTGTCATCATACAAGATAAAACCAATGCGTATCGAGAGTTCATTATCAACAGAATTGAAGAAAGTGGCGATATATTAGAAGTTGAATGTGACCCTTCTTATGTAGAAGATATCGGAAAAGCTAAGCCAATACCTACAGGTAACTTTACAAAAACGACTGTCAACGAAGCCTTATCTGAAATATTAAGAGATTCTGGTTGGGTTGAAGGTTTATGTGAATATGGCGGAATTAAATCGATGTCATGGACGTCAGTAAGAACACCATATGAAATGATAAGCCAATTAACCACAACTTATAAATTAGAGCCAGATTATGAAATAGAGATTGATGGTAATGAAGTTGTTAAAAGAAAAGTAAATATGCTTGAACCAAAGCCATTATTTAAAGGTAAGGAGATTGTATATGGTAAAGATTTAATTTCTATGAAACGTACGGTTGATATGACAGAGGTTAAAACTGCCTTATTTGCTTTTGGGCCTGAAAAAGATGACGGAACACGTATCAGTACAGTTGTAGTAGATGATGAAGCACAACAACAATTCAATTTACCAAAGCGTTATTTATGGGGTATCTATGAACCTGAATCAGATGACCAAGATATGACAATTGAAAGATTGACGACACTTACAAAAATAGAACTAAATAAACGTAACAGTGCAGCTTTAAGTTATGAAATAGAAGCGTTTGATTTAGAAGAAGACTATCCACATGAAATTATAAGGTTTGGAGATATTATCAGAATTAAGAATACTGATTTCACACCTAGTTTATATGCTGAAAGTGAAGTGATTGGCTTCACACATGAATTGATATCAGGGGAGTTAACTTGGACGTTTGGCAATATCGTTGAGTATGAAGAAGATGATTTACTTAAATATTTTAGAAGTCGTCTAAAAGATATAGAGAAGAAATTTAATGACGATATAAACAATGTTGGCTCAATCATTACAGATCGTATTGATGAAGAAGTTGAACGTCTACAAAGGAAACTACATCGTGGGCCAACACCACCTGATAATCCTGAAGAAGGTGATTTTTGGTTTGACACATCAAATCCAAATGTAGCTGTTTTAAGAGAGTTTGTAAATGGCGAATGGAAACATGCTTCGGCACATGATGTGGAGCAAATCGGTGGTTTAAGCAGAGAAGTCATTATTTATAGACAATTATTAGAAGCTACACATTCAATGAGTGCTGAAATAGCTAATCAGATGGAAAGAACTAATGTTGCATTAAGCTCAGAGTATCTCGTTGATTTAGATGTTAAAGGTAAATTGCAAAAAGCTTTAAGTGATATGCTGGCGAAATTACAAATCGTTAAAAATTACATGGATAGCATGACTGAAGAAACTGCCACTATTGGTAGACTAATGGAATGGCAAAGCGCATTAGTAGACTTGAGAAATGACTTTTATTATCTAATCGTGGCGCTAATCGAAGCAGAGAAAGCTATTCAAGAACGTTTGAAATACTTACAATCACAATACACAGAAGAAAAATTCAATGAAGCCATGCAAAATGTAGCTGATAAATTTGGGTTTGAATATACAGAAGATGGTTTTCTTGTTGGAGAGGGTTCTTTAATCAGCGGTGCTATTCAAGCATTACGAGAAGATACCGAAGAACAATTTAAACAAGTAGTGAAAAGTGTTGATTATGAAACAGATAAGAAAGGTATTGTTGAACGTTTAAATAGTGCAGATAGCGCAAGAGAACAATTAGATAAATTGATAAAAGACCGTGTAACTTTGACCGAATACAACAAGATGAAAATAGGTACACGTAACTTATTGTTGAATAGTAAAGAACGTTCGGATTTATTTGGAAGTTCCACGCATAGAAGAATTGTTTACCATTTAACAGAGCCTTTAAAAGTTGGGCAAGAGTATACATTAACATTCGATATGGAAGTTACAAGTGGAGATAATTTTGGGAAAACAACTGTATTGCCATATGAACCGAGTAATGGATCAATAGATATAACAATTGATAATAGCACCCATAATAAACTTACTTTTGTAGCAAATGTTCCAAGTACACTTTTATTGATTTATTCAGCGGTTAATTCAACACCAGAGAATGACACAACTGAAATTAAAGTTACAGACGCAATGCTAGTTGAAGGGAATAAGATTGGCGATTATTCACAGGCACCAAAAGAACAAGAAGAACGTCTTGAAACAATGGAAACAGGCATTGAACAAAATGGTATAGACATATCCTTAAGAGCCAAAGAAACAGACTTGAACAAGACAAAACAAACGCTATCTAAAATTGCAGCCGAAATTTTAGTGAACACGACAACAGGCGTGACATTAAAGTATGACGAAAATGGTACGGTTAGTGATGTTACAGTTGGACCAGGTGGCGTTAAAATTAATGCCAATGTATTTGAAATTAATGATGGAGATGTCATTGTTAAAGATGGTGTCACAACAATTAAGGACGCTTATATAGATAAACTATTCTCTAAACAAGCGACTATCAATTACTTAAACAGTGTTGATATTACCGCAAAACGTATTGAGGCGAAAGACAATAAAGCGTCAGTAAATATTGAAAATGGCACTATAACTATGACTAGAGCAGATGGTCATAAACTTGATATGGGTATCAATGGTATTGAGATGTTAAACCCCGATGGGTCTAAACGTTTTAGTATGGATAGATTATTGGTTACAAGTGCAGCATTAGGAACATCTAATTCCAATGTGTATTTAGCAGCTCAACAAGACTTTGAAGTTCGAGCAGTTGACATTACACAAATACCAAGTGACGGTGCGTGGGATAGTTATCGCTATGTACCCATTAGAGCAGATAGTTTTATAGGTAATAAGGTTATGACTAATGGAGGTACTAATCTTTACTTGGGCAGTGATGCAGAAGTACGTGTGACATCTCGTGGTGGATATAATGGTACAGATACGATTTATAGAGATGTTAGAGCATTAGGTTTTTATGGTAATTATTTAGATTCAAACTATGTCACAGCGGGCCAAAATATTTATATTCGACCTGACAGAGGCTCAGAGGTGAGGTTTACTGTTAGAGGTACGACAGATAGCTATGTTGATATAAGAGGTGGTACGGGTTGGCTAGCATCAGTATCTCATCGAGGTTCAAACGCTCGCTTTTATATCGGAAGTGATAATGGCGTTAGAATCACTGGACGTTCTCTATATAATGGTGGGGATATTATTTGGCGCGACTTAGCTGCCAATGGACTATATGCAAATTTCTTGGAAATCAATCCGAATACAAACGCCTCTAATTTATATTTAAGAGCGAATAACGAAGTCCGTATTACAAAGCGGAATTCCACTAATTCATATATACCTATTAGAGCAGCAAGTGCAACGTGGACGTCCTCTGAACGTTATAAATATGATATTGAGAATTGGGATATAGATGTATTAGAACATTTGGTTGATCGAGTGCAATTATATAGTTATAAGCTATATTCAGAAATGGAAGAAGACAGTCAACGAGTTAGGCATGGTGTTGTCTTAGAAAGAGAAACGCCAGACGAATGGAAAAACGGAGACGGTGTCGATTCTTACGAAATGACGGCATGGTGTCTTAAAGCTATACAAGAATTAACTAAAAAAGTCCGTGCATTAGAAACGGAATTGGAGGCAAAATTATGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
87519c2d79340fefaa29b1f74165d022c8b619d033e70f700a4c7aeb7a4579a8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2811
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterisation of phylogenetically distinct temperate phages from Kenyan Mammaliicoccus sciuri Cherbuin,J.D.R. 2025-12-01 — GenBank