Protein

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Genbank accession
UPW39678.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITIGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSGTQNILSDNEALIFKNITQGMPLYIRGQDADGTNRWYLGNDNRNTDNLVLKNVKSGAYVAILANLISVNKSIQITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLTADNTFSGSNTFNQLNVFKKDGEVIRLQNANAAQPLYIKAIDSTGANRWYIGNNNGGDNVALENYKTSGKITVGTSVDINKTLTVTGQVQPSDWTNIDSRYIPAGTLSNLAKLSDVNTFRSAQVINQNGSLLRLKNTTQDNELYIGGYNADNARRWYIGSGERDNPTRLIIHNDRTLTTIYMQDDFLLNKTVKITGQVQPSDWSNLDARYFLKTKLLNQSLMVRTTNRLEDTASFNKDYSGFVRNNDIEQGLKDLAIHVAHSAGIAHARGIAFTYGSRGLDVFTYAYGSDGEYVGEAQLYSTAFKPTPSDIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVDPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGNHNHAISWIGQNSTHYSGGGGGRIGTGPGYTDSAGAHTHTISGTAASNGNHAHSVGIGAHTHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:781 AA
molecular weight: 84527,44100 Da
isoelectric point:7,81442
aromaticity:0,08451
hydropathy:-0,42190

Domains

Domains [InterPro]
DC_1566
STR
60–781
DC_1566
G3DSA:6.20.80.10
STR
158–219
G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
ATT
159–248
IPR048388 IPR048388 IPR048388
UPW39678.1
1 781
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 60-158 | ATT 159-248 | STR 249-273 | ATT 274-359 | STR 360-381 | ATT 382-467 | STR 468-781
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_ESCO50
[NCBI] 		2918872 Uroviricota > Caudoviricetes > Andersonviridae > Felixounavirus > Felixounavirus ESCO50
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UPW39678.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OM386664.1 [NCBI]
CDS location
range 47938 -> 50283
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTTCTTCATGTCAGAGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTATTTGACCCAACAGGCTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAACGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTTTGAATAAACCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAAAATGATGCAAGATATGCAAGGCTTGCTGTAACAAACACATTCTCTGGGACTCAAAATATTCTCTCTGACAATGAAGCCCTTATTTTTAAGAATATCACACAAGGGATGCCACTCTATATTCGTGGTCAAGATGCAGATGGCACTAACAGATGGTATCTAGGTAATGATAATAGAAACACAGACAACCTTGTTTTAAAAAACGTTAAATCTGGTGCATACGTAGCGATTTTAGCTAACCTAATCTCTGTGAATAAATCAATTCAAATCACTGGCCAAGTTCAACCTTCGGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGACAGTAGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAACTGCTGATAATACTTTTAGTGGCTCTAACACTTTCAACCAACTAAATGTTTTCAAAAAAGATGGTGAAGTAATTAGGCTACAGAATGCCAATGCTGCACAACCATTGTACATTAAAGCGATTGATAGCACAGGTGCCAACAGATGGTACATTGGTAATAATAATGGAGGTGATAACGTAGCTCTAGAAAACTACAAAACTAGTGGCAAAATTACTGTAGGGACAAGTGTTGATATCAATAAAACACTAACTGTAACTGGTCAAGTACAACCTTCTGACTGGACTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGGGACTTTGAGTAATCTTGCTAAGCTAAGTGATGTAAACACTTTCAGGTCTGCGCAAGTTATCAACCAGAATGGCTCACTGTTACGGCTAAAGAACACCACACAAGACAATGAGCTATATATTGGTGGTTATAATGCTGATAATGCGAGAAGATGGTACATTGGTAGCGGGGAAAGAGACAACCCAACAAGGCTTATTATCCACAACGACAGAACTTTAACTACGATTTATATGCAAGATGATTTCTTGTTGAATAAAACTGTCAAAATCACTGGACAAGTACAGCCTTCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGGTATTTCTTAAAAACAAAACTGCTAAACCAATCTTTAATGGTAAGGACAACTAATAGGTTGGAGGACACAGCGTCATTCAATAAAGATTATTCAGGGTTTGTAAGAAATAACGATATTGAGCAGGGTCTGAAAGATTTAGCCATCCATGTAGCACACTCTGCTGGTATTGCTCATGCCAGAGGCATTGCTTTTACATATGGGTCTAGAGGTCTTGATGTCTTCACATATGCTTATGGGTCAGATGGAGAATATGTTGGAGAGGCACAGTTGTATTCAACGGCATTTAAACCAACCCCTTCAGATATTGGCGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCGCAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTGAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTGACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTATCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACAGGTGGTTCAGATTCTGTTACGTTAGCAGTTGGAAACTTACCTTCACACACGCACAGTTTTTCTGCGACTACCTCATCGTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACACACTCTGTAAGTGGTTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAACCACGCTATCTCATGGATTGGTCAGAACTCTACACACTATTCTGGCGGTGGTGGTGGTAGAATCGGTACAGGACCGGGTTACACTGATTCTGCTGGTGCTCACACCCACACAATCTCTGGTACTGCTGCATCAAATGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACACCCATACAGTAAGCGGTAACACTGGCGGTACAGGCTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGCTGATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6e4f6092b6dd0413bac3f5083ac7b874182bf0e2b3ffff1049d839f937b7c246
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6857
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Avian Pathogenic Escherichia coli bacteriophages Nicolas,M., Trotereau,A. and Schouler,C. 2015-06 — GenBank