Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_010676380.1 [GenBank]
Protein name
putative minor structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,84
Protein sequence
MIYIFDKSGVSIGQFENSVPNACPYLNDKFTENILTGEILLEFEVPLARDESQWLTGYNQVGYKDLDGDIRMFNIIDVYESYYQNEATKRVICEDVSVTELLNSFTKPYNALNLDDAMKSALETSGWSYQLDYNAFLEQDKMIINDTYINTRQAINNIAEAFGVAYKFTVGVNSLGVQNKMIRVLGKYEQNNGKYFTYDRDLVGIERSIDFTTVKTAVIALTKEVDGSVGTIAGFSPSPKVEGFTKELIWDFVVNDVAHSSYDKADEYAYLILDTGVADKQLAYLKACEELAKVALPTYTYKMDVQLLEKVANFEGERVRVGDIVWAKDKAGKQEIGLEARVVEIVSSHTDQSKQKLTFSNYREISVADSDDVKALREQLEKMQNDITNQAVKLNELTIAQEGIVTSLDGKSSISLGDTPKKNPSVGDTWLQPSKDAQGRPTVIIKSWNGTIWATQLDTAEINAIKDTAGIAKAEAVEAARKAGEASEQALENSRNFGNLLQNFTRDSKFDRWIPQPTETVKPYVKITSQTFQGMPTACLSFMGTQAPTSTNAQVYSDWIKVDPAKAYEFSVYMKTPSVTGMAGQDYIRLLTLNAENKPAITDFGNSYVQSVTVATATIADNQQAVDFVIENSSLHTDWKLFRGVIMPTGFNNLDMKGRGQNVTSNVRFKPQNRWMRVCFLANGQPGAKRDTHWANPIISEISSDATQYGSFIKQTVDGIQTTVNGKAEQSQVTQMAGQITSLVKTTDGHTSQITQLSTDINLKVSKGDVVNQINLSPDGILIAANKVQITGDTFIAKAVIEDANIVSVTADKLTAGTIDAGVIRVINLDAGQIKTGSLSAIDIVGSTITNSFNYNRGSGSELINFTGTTVLEKERIQIKSKRTWSTDFNTVTTTWDGAGISSTTFKSNGKIQGSWDLSDSGLRLQDQSGFVGTLNAKALSVTAWQNLTLSSIYTTAEGNTPQFRLIYQLDGSTIVKFRGQVKKKSGQFIANKADAFAFIHASMAPASNEFIQIASSASSGARCVVETNGNIQAMCASNADYIILSAITFILG
Physico‐chemical
properties
protein length:1053 AA
molecular weight: 115503,56240 Da
isoelectric point:5,14037
aromaticity:0,08642
hydropathy:-0,24397

Domains

Domains [InterPro]
DC_1353
STR
1–676
DC_1353 IPR012892
IPR007119
Unmapped
40–359
IPR007119 Coil DC_1626
IPR010572
ENZ
111–364
IPR010572
YP_010676380.1
1 1053
Architecture
STR
RBD
STR 1-676 | RBD 677-1052 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Carnobacterium phage cd2
[NCBI] 		2849244 Uroviricota > Caudoviricetes > Carnodivirus >
Host Carnobacterium divergens
[NCBI] 		2748 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010676380.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_071012 [NCBI]
CDS location
range 18044 -> 21205
strand +
CDS
GTGATTTATATATTTGATAAAAGTGGAGTAAGCATAGGGCAGTTTGAAAACTCTGTCCCTAATGCTTGTCCGTACTTAAACGACAAATTTACAGAAAACATTCTAACTGGGGAAATCTTACTAGAGTTTGAGGTTCCCCTAGCTAGAGATGAGTCACAGTGGCTTACAGGCTACAATCAAGTTGGATATAAAGACTTAGACGGCGATATTCGCATGTTCAACATTATTGATGTTTACGAAAGCTATTACCAAAACGAAGCAACTAAGCGTGTAATCTGTGAAGACGTTTCAGTTACAGAACTTTTAAATAGCTTTACCAAACCTTATAATGCTTTGAACCTTGACGACGCAATGAAATCAGCTTTAGAGACAAGTGGGTGGAGCTATCAATTAGACTACAATGCTTTCCTTGAGCAAGACAAAATGATTATAAACGATACCTACATTAATACTCGCCAAGCTATTAACAACATTGCGGAAGCCTTTGGGGTTGCTTACAAGTTTACAGTAGGCGTTAACTCTTTAGGTGTTCAGAATAAAATGATTAGAGTTTTAGGTAAGTATGAACAAAACAACGGAAAGTATTTCACGTATGACCGAGACTTAGTGGGCATTGAGCGTTCAATAGACTTTACAACTGTTAAGACTGCGGTTATTGCTTTAACTAAAGAAGTTGACGGAAGCGTTGGTACTATTGCAGGTTTCTCACCTAGTCCAAAAGTTGAGGGTTTTACTAAAGAGCTTATATGGGACTTTGTAGTAAACGATGTAGCCCACAGTAGCTATGATAAAGCTGACGAGTATGCTTACCTGATACTTGACACGGGCGTAGCTGACAAGCAATTGGCTTACCTTAAAGCCTGTGAAGAGTTGGCTAAGGTTGCTTTGCCTACCTACACTTATAAGATGGACGTACAACTACTTGAGAAGGTAGCTAACTTTGAAGGAGAGAGAGTTCGTGTTGGGGACATAGTTTGGGCTAAGGACAAGGCTGGTAAGCAGGAGATAGGCTTAGAAGCTCGTGTAGTTGAAATTGTAAGCTCGCATACCGACCAGTCTAAGCAGAAGTTAACTTTCTCTAACTATAGAGAGATTAGCGTTGCAGACTCAGACGATGTTAAAGCATTGCGTGAACAACTTGAGAAAATGCAAAACGACATCACAAACCAAGCTGTTAAGCTTAATGAGCTTACTATTGCTCAGGAAGGTATTGTAACCTCACTGGATGGAAAAAGCTCAATCTCTTTAGGGGACACTCCGAAGAAAAACCCTAGCGTTGGAGATACCTGGTTACAGCCTTCTAAGGACGCACAAGGTAGGCCAACTGTAATTATTAAAAGCTGGAATGGTACTATATGGGCTACCCAACTTGACACGGCTGAGATAAACGCAATAAAGGACACCGCTGGTATAGCCAAAGCTGAGGCAGTTGAAGCTGCTCGTAAAGCCGGTGAAGCTAGCGAACAAGCTTTGGAAAACTCTAGGAACTTTGGTAACTTGTTACAAAACTTTACACGTGATAGTAAGTTTGATAGGTGGATCCCACAGCCTACTGAAACTGTTAAGCCTTATGTTAAAATAACTTCTCAAACTTTTCAAGGCATGCCGACCGCGTGTTTATCATTTATGGGGACACAAGCACCTACGTCAACTAATGCTCAGGTCTACTCTGACTGGATAAAAGTAGATCCAGCTAAAGCTTATGAGTTTTCTGTTTATATGAAGACGCCAAGTGTCACAGGAATGGCAGGTCAGGACTACATTAGATTGCTTACTCTTAACGCTGAAAACAAACCGGCAATCACTGACTTCGGAAACTCTTATGTGCAAAGTGTGACAGTTGCTACAGCTACCATAGCTGACAATCAACAAGCGGTAGACTTTGTAATTGAAAATTCTTCGTTGCATACAGACTGGAAGCTCTTCCGTGGTGTTATTATGCCTACAGGTTTTAACAATCTCGACATGAAAGGTCGGGGTCAGAACGTAACGAGTAACGTTAGGTTTAAGCCTCAAAATAGATGGATGAGAGTTTGTTTCTTAGCAAATGGTCAGCCAGGGGCTAAGCGTGACACTCACTGGGCTAACCCTATTATTAGCGAAATATCGTCAGATGCTACACAGTATGGAAGTTTTATCAAGCAAACAGTAGATGGTATTCAAACTACTGTAAACGGTAAGGCTGAACAGTCTCAGGTTACTCAAATGGCTGGTCAAATTACAAGCTTAGTCAAAACTACTGATGGTCACACTTCTCAAATTACCCAGCTAAGCACAGACATCAACCTTAAAGTTTCTAAAGGTGATGTTGTAAACCAAATTAACCTTAGCCCTGACGGTATACTAATTGCTGCTAACAAGGTTCAAATAACTGGGGACACGTTTATTGCTAAGGCTGTAATCGAGGACGCTAACATTGTAAGTGTGACAGCCGACAAGCTTACTGCTGGTACCATTGACGCTGGTGTTATTAGGGTTATCAACCTTGACGCTGGTCAGATTAAGACAGGCTCACTTAGCGCAATTGATATTGTAGGTTCAACTATTACAAACTCGTTCAACTATAACCGAGGTTCAGGTTCAGAGTTAATTAACTTTACTGGAACAACCGTACTTGAAAAAGAACGTATTCAGATTAAGTCTAAGCGCACTTGGTCAACTGACTTCAATACCGTTACTACAACTTGGGACGGAGCTGGTATAAGCTCAACAACATTTAAGTCCAACGGTAAAATTCAAGGTAGTTGGGATCTCAGTGATTCTGGACTTAGACTTCAAGACCAGTCAGGTTTCGTAGGAACTCTTAATGCTAAGGCGCTTTCAGTTACGGCATGGCAAAATTTGACATTGAGTAGTATATATACTACCGCAGAAGGAAACACTCCTCAGTTTAGACTAATCTATCAGCTAGATGGTTCAACGATTGTTAAGTTTAGAGGTCAAGTTAAGAAAAAGTCAGGTCAGTTTATCGCCAACAAAGCAGACGCGTTTGCATTTATCCACGCCAGTATGGCTCCTGCTTCAAATGAGTTTATTCAAATTGCTTCAAGTGCTAGTTCAGGCGCTCGTTGCGTAGTTGAGACAAACGGTAATATTCAAGCTATGTGTGCTTCTAACGCAGACTACATTATCCTATCAGCTATCACATTTATACTAGGTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
057a23d4ad89e06ae746f0593f990e7760262e29634e3ecfd86931742744c93d
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2850
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50