Phage RBP Database

Genbank accession

AOV62438.1 [GenBank]

Protein name

hypothetical protein

RBP type

TSP

Evidence DepoScope

Probability 0,97

TF

Evidence RBPdetect2

Probability 0,79

Protein sequence

MISSETKILLKRSGVPGRIPSLADLKLGELGINYYDGKVYLRQENDVVGSRIIEPGQGDDIGRTIFVTVNGNDNNSGLNERDSVRTIKKAAELAQFGDGIKVYPGQYIEDNPITFRDLVAVEGMDLRNVLVTPANPEKDLYLVGDGFHATNHSFVSNQDSRDAAAIISFRPLEGTASDRYFDAARLIRDNLNFISGEAVGFLTSGYSGFAAGQRSQDAARAIELNTNFISEESFQYINSPDYRGPAYTNPDINQCRSDLKDILAGWRYDLISDGNSESTGVGLTYYAPVKFTKTTNITDLVYDNTTGLLVIETELSTQSLPGDEIKLRDIQLDCPPYGNSFLIAGFDYDNVSGVGTVTLPFIHDIQAGDTIKLDDLKFDCPPYGAQAYSVSDFVYDETTGGSTVTLSSNHNLKVGDAIELRDMQFDCPAYGGTFSNVVNIEYNNVSGEAILTYADAADLDAGDVVLLYDIKLSCPAYGNAISITGFDYDNFTGITQASFASPHGLRVGDLVKFENLKFSCESYLSDTYNIVGFEYNNLTGEALASFSSDHNLSGGSNVVLDNLTFACNSYFPEGINVTGFNYTNTTGVSTISLDHAHNLQIGDRFQLEDLVFACNSYSFTDIDVTAATYDNVTGFVNITLAAPHGSSVGEFVKLDGIEYSCPGGSGITTTIFPDGTIGDQFEILSVPSPSALIVNVGPSAIPHSYVGGGTATVGITTTVFPDGTQGNEFVVTDLVDSLTLVTNVGVSTIAHTYAGSGKIFVGFTTTVFPDGTQGNVFPVLGVPAANQIALNVGTSTIEHTYVGGGTASNEDTFLNVSGFTYNDADGTGLVTLGSNHNLVVGDSFILEDLKFTCDSYRNTASTFDISDFQYDNVTGLSTVVITSSHDLRVNDTIALYDIEFSCPNGSGITTTIFPDGSVDNFYDVVAVIDPNTIITRIGTSTIPHSYVQGGLLQVGITTNIFPDGTRPSDNFFDVVSVPAPNQILTNVGLSSIAHTYASGGKFYTGITTNIFPQTFEDPNVKVVNAVYDNVTGAVTVTCDKPHGLLATNTVLLQGLEFSCASGGPGGAPGVLLFPRNQETYEVVSVATPTTYTINVGPNSIPHTYVSGGISTPQNIIDAVYNRANGELTVTLNRQHGYVAGDTASVVDLVFSCLSGGEGNAPGELIFPRPTDEFVLLSISGSEFTVNVGESSGLPHTYVNGGSVSYAGTTAQVTSALYNEETGVLTVTTSAPLGAAVDNVVTMQGLNFACNSGGPGNDPGTIIFPRLDVPVFKVSKVISGVTYVINVGTSTLAHTYVSGGFSSLKKKVNDNNLFRVLGVPTPNTVVTNVGVSSIPHTYVSGGNGFVGITTNIFPDGTRPNGSRFEVLSVLSPNKAVINVGVSTIPHFYESGGQVQYGETNERPILAFDYNNLTGGARVTVRGPHGLSAGDSVKFDGMEFECVNSPGITTTIFPDGTAASLNLFPVTGVVNNTVFDCNVGRVPFTHTYIQGGSAFVGITTNIFPDGTQGYNYTVTGVPSSNKVNVNVGVSSIQHNYVRGGALFAGETNERDIVNFSYDNESGLAILTLRQPEDLYTGNLVKLKGLEFDCPDSTAITTNIFPDGSQGFLFPVTERLNPTQFQLNIGRSTIQHNYVRGTGAAFVGITTDIFPDLSTQPTKLFNVVSIPSPNTVAVQVGTSTIPHNYESGGTLSVGINTDIFPGSSVVSPLGDTFVIDAVTSSGEIVINVGTSSITHNYERGGQVLYGQSSGGELQHITGPGVMDATIAAIDFERQMSKYVLNNRPWGSFIAAETGIVNGIDYDNVTGFATVTVPGINAQRGDMVRMSDIQFVCSDEYAGLTTTFFPDNTRPEGQYFEVESRIDENSFETFIGISSIKHNHLRGGNVYRYRQGIENVIYDRASGLASVTSMAHGYKVDDIIEMGDIRFTCPVFTPDYDIENFTYDNTTGLSQVTTTVDNDIQIGDLVRLDDIQLDCPAYGNERVITDFEYNNLNGYSEITVASPHGLQLNPRTPVAITTAVYDNVSGIVTVTTAAPLNIDLSINNGVQLTGLGFTCSNSTTTTNVVGAVYDNTTGVVRITTNAANNAAVSSKVKLQNLIFSCESGGVPSDQAFPSGVDGFDFLVSEVISATEFNAIVGVSTLTHTYVTGGTAQVGITTNIFPSDDTLIYPITNIESSTKFSLQVGPSAFAHTYTGGGDATKVNRYSVKLADIKFDCPAYGNDIGVTNFIYDNTSGNSLVTVDSNHGLNVGDSIKLANLKFQCPPYGNQFNVIAADYDNVTGIITVTTDRDLDGISVDEVLRLRDLQFDCNSGTPYAIQQVTFDPFNGRIATLSLGQNPQVNPGDLIKLEGLLYRNAAGDEVPYPDGRDASYNIFEARSVTQVNASTWEVTVQFNNITDSLVIFIPNGSSYGTLFTGVTGNIFPENVGPEGGFYNVLSLPSPNQFAIQVGTSTIPHTYIRNGEAFSGVTTNFFPSTDPQNSPLGNLFEVVGVPTPNQVRINVGVSSISHIYDSGGQLLVGITTNIFPDGTQGNLFPVVSIGSSTELRVNVGTSSIPHNYISGGLMFVGITTNIFPGDPQNSPLGNIFEVLGKDDDCGKDRFTINVGVSTIPHAYVEGGTVTTGVTTSRFPDGTNGFEFPVESVLDADTFIVNVGPSSISHTYVDGGYSRRLESPINSFLYDNVTGFADVGITSHRLNVGDLVKLRDIKFDCDPYGGEKFINNVVYNNLTGRLNVNTIEPHGLSLNETIKLSGIQMDCPAYGNQIAITGASYSNTTGVIDVTVTQAHNLSIGDSVKLDGLDFVCPGGSGITTTIFPDGTAASYNIYEVVSVPAANSLTVNVGTSTIPHTYTGGGNIFVGITTNIFPGSAQNSPRGSFFEVLDTPSITEFTLNVGVSSIAHGYIRGGFVQTGVTTDIFPDGTQGDYFQVGEIIDEDNFTIDAGISSITHRYNSGGYGAKYVTYQSRTPQVVDTSVIRVSGGCKAAEARVDQLAGIVTSIIQNGPSAAPGDVPLNVVAASYNKQTGDLSVTTSGETGVAPVDTVKIENLIFQCSKVSNVIGATYDNTTGKAIITTDDDNGISIGTKIRLEGLNFACNDGSLVYPSDPNTVFDVIVVLGDNKFELDLAKSTKVHTWTGGGVCTTVPTTRTFPDNKVFIYNVKSVLSPTTFTVNVGPSDIDHSYISGGHVSPGLRYQVDNAEYNKITGLLTVTTDVDNQLVANTGVKLNDLQFSCTSGGANNQPGILPFPDGRPANVVAATYNNVTGLLRVTTDKPHQAYADVKVRLEGLEFSCPGGSLIYPSNPNQLLRVTKVEDFYTYEVLLEPSSKVHTYVQGGTSSTGTNHYCVDSVINSRTFTVQMAPNNLTHIYVSGGTVASVFCEQILTGINLRTAKCADDVKKIYLAVVHDVTRGGNMKSVAAARKYYDAVGQYQHIAGGEVNQTVAALDYSLNVVRCVINNVSWGGVPRGYFTSRERAFIPTKSNLDAPLANRSLSRDLLRLADMPPSTTQSVVCIEKPFEKGQYTTNKKFIEAFDYDNVTGIASVTTTQAHRLIKYDAIRLDDIKMRCVGSPRITTNLFPDGTQGDIFEVKQTFQDNPIYPVSDATYNNTTGNLLVESLGSNLELEVGTLVNLRNLRFECSSSGAPGTIVYPTNSDYVYEVKKIINGDTILVNVGVSTLVHTFVPTSTTFNVPQFQELPRKFIAHVGTVGFPHIYEQGGTVWKQEPFQTPESATQLRDVSIQNDPLQFTNSTPNACANVFSAIENTVGVVTTIIDVGFEDSGISVRYPGNDGRGVDSFDQMSSQGVGNIIRGPYIRNCTNFVPKSIGMRMDGFDAEPGDEISNGVQGSSNVDSFTQFNPGGIGCSVSNGTYQQLVSIFTICCDQAIVCDSGAQLDLTNSNSSFGRLGLVARGIGDAKSKCIDRYTGIVAEEAQIEDDTVIIRGVGEKRPYDGQGIFFGELFREVIRIDVTDGGSGYDDENPPVATVDLPTGPSGIKAEVSPTVLDGEVVSIELISNGNQYRDISPTVTIAPPRDPEGRQAKAVAITEPIYYDVDSSSAPVEGTVRVVFKQRLNNTVSVGTTVFFSRLSLQIASSHSFEYIGSGNEINGARPSQGGVPIKANEIVKQEGGSIVYTSTDQAGNFNIGDDFVINQFTGTVTGRSFDQSVLNKVTPLIIALDS

Physico‐chemical properties

protein length:	4168 AA
molecular weight:	444742,78660 Da
isoelectric point:	4,52571
aromaticity:	0,08973
hydropathy:	-0,06951

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_0066	STR	DC_0066	4	179	Novel HMM	DC_0066	Central	Low	Positional only	99 proteins / 99 hits
IPR011050	STR	IPR011050	82	612	Merged direct domain	Pectin lyase fold/virulence factor	Central	Low	Positional only	572 proteins / 572 hits
DC_0419	STR	DC_0419	617	757	Novel HMM	DC_0419	Central	Low	Positional only	24 proteins / 24 hits
DC_0419	STR	DC_0419	856	1016	Novel HMM	DC_0419	Central	Low	Positional only	24 proteins / 24 hits
DC_0419	STR	DC_0419	981	1116	Novel HMM	DC_0419	Central	Low	Positional only	24 proteins / 24 hits
DC_0419	STR	DC_0419	1108	1211	Novel HMM	DC_0419	Central	Low	Positional only	24 proteins / 24 hits
DC_0419	STR	DC_0419	1199	1399	Novel HMM	DC_0419	Central	Low	Positional only	24 proteins / 24 hits
DC_0419	STR	DC_0419	1367	1547	Novel HMM	DC_0419	Central	Low	Positional only	24 proteins / 24 hits
DC_0419	STR	DC_0419	1775	1924	Novel HMM	DC_0419	Central	Low	Positional only	24 proteins / 24 hits
DC_0419	STR	DC_0419	2052	2215	Novel HMM	DC_0419	Central	Low	Positional only	24 proteins / 24 hits
DC_0419	STR	DC_0419	2712	3023	Novel HMM	DC_0419	Central	Low	Positional only	24 proteins / 24 hits
DC_0419	STR	DC_0419	3238	3454	Novel HMM	DC_0419	Central	Low	Positional only	24 proteins / 24 hits
DC_0763	STR	DC_0763	3449	4168	Novel HMM	DC_0763	Central	Low	Positional only	71 proteins / 71 hits

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout

N-terminal

Central

C-terminal

AOV62438.1

1 4168

Domain	Start	End	Length (AA)	Confidence
N-terminal	1	181	181	0,9164
Central domain	182	4157	3977	0,0155
C-terminal	4158	4168	10	0,0469

Note: Constraints were applied during segmentation.
C-terminal too short, adjusted boundary

Legend: N-terminal Central domain C-terminal

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Synechococcus phage S-CAM7 [NCBI]	1883368	Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Mazuvirus > Mazuvirus scam7
Host	Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI]	32051	Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

AOV62438.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

KU686213 [NCBI]

CDS location

range 189546 -> 202052
strand +

CDS

ATGATTTCATCAGAAACCAAGATTTTACTTAAGCGTTCTGGCGTTCCAGGACGTATTCCATCCTTAGCGGACCTAAAACTAGGCGAGTTGGGTATCAACTATTATGACGGTAAGGTATACCTCCGTCAAGAAAATGATGTAGTTGGTTCCCGTATCATCGAGCCTGGTCAGGGTGACGATATTGGTAGGACTATTTTCGTAACCGTAAATGGTAACGACAACAACTCCGGTCTTAACGAGAGAGACTCCGTAAGAACCATCAAAAAAGCCGCTGAGTTAGCTCAGTTTGGCGATGGTATCAAGGTGTATCCTGGTCAGTATATCGAAGACAACCCCATTACATTCCGCGATTTGGTTGCGGTTGAGGGTATGGATCTTCGTAACGTCCTAGTTACTCCTGCTAATCCAGAGAAAGATTTATATTTAGTTGGTGACGGTTTCCACGCAACTAACCATTCATTCGTATCAAACCAAGATTCTCGCGATGCTGCCGCGATCATCTCATTCCGCCCTCTAGAAGGAACCGCATCTGATCGCTACTTTGATGCTGCCCGTCTAATCAGGGACAACCTAAACTTCATTTCAGGCGAAGCTGTAGGTTTCTTGACTAGTGGCTATTCAGGCTTTGCTGCTGGTCAAAGATCTCAAGATGCTGCTCGTGCTATTGAACTCAACACAAACTTTATTAGTGAAGAGTCCTTCCAGTATATCAACAGCCCAGATTATAGGGGTCCAGCATACACTAATCCAGATATCAACCAGTGTCGTAGTGACCTAAAGGATATTCTAGCTGGATGGAGATATGACTTAATCTCTGATGGTAACTCCGAGTCAACTGGTGTAGGTCTAACCTACTACGCACCAGTCAAGTTCACCAAGACTACAAATATTACTGACCTAGTTTATGATAACACAACTGGTTTGTTGGTTATTGAGACTGAACTAAGTACTCAATCACTACCTGGTGATGAGATTAAGCTAAGAGATATTCAACTAGATTGCCCTCCTTATGGTAATTCATTCCTAATTGCTGGATTTGATTATGATAATGTAAGTGGTGTTGGTACAGTAACTCTACCTTTCATCCACGATATTCAAGCTGGTGATACAATCAAGCTAGATGATCTCAAGTTTGACTGCCCTCCATATGGCGCTCAAGCATATTCAGTATCTGACTTTGTTTATGATGAGACTACTGGCGGAAGCACAGTAACTCTATCAAGTAACCATAACCTTAAAGTTGGTGATGCAATTGAACTCCGCGATATGCAGTTTGATTGCCCAGCTTATGGTGGTACTTTCTCCAACGTTGTAAACATTGAGTATAACAATGTAAGTGGAGAAGCAATCCTAACTTATGCGGATGCTGCTGACCTAGACGCTGGTGATGTTGTTCTTCTATATGATATCAAGCTATCCTGCCCAGCATACGGCAATGCTATTTCAATCACTGGCTTCGATTACGACAACTTTACTGGTATAACACAAGCTTCTTTCGCATCACCTCACGGTCTACGGGTTGGTGATCTTGTTAAGTTTGAGAACCTTAAGTTTAGCTGTGAGAGCTACTTGAGCGACACTTATAATATCGTTGGATTTGAGTACAACAATCTAACTGGTGAAGCTCTAGCATCATTCTCTTCTGATCACAATCTATCTGGTGGAAGTAATGTTGTACTAGATAATCTAACCTTTGCTTGTAATAGCTACTTCCCAGAGGGAATCAATGTTACTGGATTTAACTACACCAATACAACTGGCGTAAGTACAATCAGCCTAGATCACGCACATAACTTACAGATTGGTGATCGTTTCCAACTAGAAGACCTAGTATTTGCTTGTAACAGCTACTCATTCACTGATATTGATGTTACCGCAGCAACTTACGATAACGTTACTGGCTTTGTAAACATCACTCTAGCTGCTCCTCACGGCAGTTCTGTTGGTGAGTTCGTCAAGCTAGACGGTATTGAGTACTCTTGCCCTGGTGGTTCTGGTATCACAACTACAATCTTCCCTGATGGAACGATTGGTGATCAGTTTGAGATCCTTTCAGTACCTTCACCTAGTGCTTTGATTGTAAATGTAGGTCCTTCTGCAATCCCACACAGCTATGTTGGTGGAGGAACTGCTACGGTTGGTATTACTACAACAGTATTCCCTGATGGAACTCAAGGTAATGAGTTTGTTGTAACCGACCTAGTTGACTCCCTAACATTGGTAACAAACGTTGGTGTATCTACTATCGCTCACACATATGCTGGTAGTGGTAAGATCTTTGTTGGCTTCACAACAACAGTATTCCCCGATGGAACACAAGGTAATGTATTCCCAGTTCTAGGAGTACCTGCTGCTAATCAAATAGCACTAAATGTTGGTACTAGCACCATCGAACATACTTATGTTGGTGGTGGTACAGCTTCTAATGAAGACACATTCCTAAATGTATCTGGCTTCACCTATAACGATGCCGATGGAACTGGATTAGTAACATTGGGTTCCAACCACAACCTAGTTGTTGGTGATAGTTTCATCCTAGAAGACCTCAAGTTTACTTGTGATAGTTACAGAAATACCGCAAGCACATTTGATATCAGTGACTTCCAGTATGATAATGTAACTGGTCTATCCACCGTTGTTATCACATCATCTCACGATCTACGGGTCAATGATACGATTGCTCTTTATGATATTGAGTTCTCTTGCCCCAATGGTTCTGGTATCACAACTACAATCTTCCCCGATGGAAGCGTAGATAACTTCTATGATGTTGTTGCGGTTATTGACCCCAACACAATCATCACAAGAATTGGTACCTCCACAATCCCACACTCATATGTTCAGGGTGGTTTGCTTCAGGTTGGTATCACTACTAACATCTTCCCAGATGGAACACGTCCAAGTGATAACTTCTTTGATGTTGTTTCAGTTCCAGCACCTAATCAGATCCTAACTAACGTTGGTTTGAGTTCTATTGCTCACACCTATGCTTCTGGCGGTAAGTTCTACACAGGTATCACAACTAATATCTTCCCCCAGACATTTGAAGATCCTAATGTAAAAGTTGTTAATGCCGTATATGATAATGTAACTGGTGCCGTAACAGTCACCTGTGATAAGCCCCACGGTCTATTAGCTACTAATACAGTACTTCTCCAAGGGCTAGAGTTCTCCTGTGCTTCAGGCGGTCCTGGTGGTGCTCCTGGTGTATTGCTATTCCCACGTAACCAAGAAACTTATGAGGTTGTATCTGTAGCTACTCCTACAACTTACACCATCAATGTTGGTCCAAACAGCATCCCACATACCTATGTTAGTGGTGGTATTTCTACTCCACAAAACATCATTGATGCGGTATACAACAGAGCCAACGGAGAACTAACAGTTACTCTAAACAGACAGCACGGATATGTAGCAGGAGACACTGCTAGTGTTGTTGATTTAGTATTCTCCTGCCTATCTGGTGGAGAAGGTAATGCTCCAGGTGAACTAATCTTCCCTCGTCCTACTGATGAGTTTGTACTACTATCAATCTCTGGTAGTGAGTTTACTGTAAATGTAGGTGAGTCAAGTGGACTACCCCACACCTATGTAAATGGTGGTTCTGTAAGCTATGCTGGAACAACCGCACAAGTAACAAGTGCATTATACAATGAAGAGACTGGTGTTCTAACAGTTACAACTAGTGCTCCATTGGGTGCTGCTGTTGATAACGTAGTCACAATGCAGGGTCTAAACTTTGCTTGTAACTCCGGTGGTCCTGGTAATGACCCAGGCACAATCATCTTCCCACGCCTAGATGTTCCTGTATTCAAAGTATCTAAAGTTATCAGTGGCGTAACTTATGTAATCAACGTCGGTACTTCCACTCTAGCACATACTTATGTGTCTGGTGGATTCTCAAGCCTAAAGAAAAAGGTTAATGATAACAACCTATTCAGAGTATTGGGCGTACCTACTCCCAACACAGTAGTAACTAATGTTGGTGTAAGCTCCATCCCACACACATATGTAAGTGGTGGTAATGGTTTCGTAGGAATTACAACTAACATCTTCCCTGACGGTACACGCCCTAACGGTAGCCGCTTTGAAGTGTTGAGTGTCCTATCACCTAACAAGGCAGTCATCAACGTAGGTGTCTCTACAATCCCACACTTCTATGAGAGTGGTGGTCAGGTTCAGTATGGTGAGACAAATGAGCGTCCTATCCTAGCATTTGATTACAATAATCTAACTGGTGGAGCCAGAGTCACGGTTCGTGGTCCTCACGGTCTATCAGCTGGCGATAGCGTCAAGTTTGATGGTATGGAGTTTGAGTGTGTTAATAGCCCAGGCATTACAACTACAATCTTCCCTGACGGAACAGCAGCAAGTCTTAACCTCTTCCCTGTAACTGGTGTAGTAAACAACACCGTATTTGATTGTAATGTTGGACGGGTTCCTTTCACTCACACATATATTCAGGGTGGTTCTGCTTTCGTAGGAATTACAACTAACATCTTCCCTGACGGCACACAAGGTTATAACTACACTGTTACTGGTGTTCCTTCATCCAATAAGGTCAACGTAAACGTCGGTGTTTCAAGCATCCAACACAACTATGTTCGTGGTGGAGCACTATTTGCTGGCGAAACTAACGAGCGTGATATTGTTAACTTCAGCTATGATAATGAGTCTGGTCTAGCTATTCTAACTCTACGTCAGCCTGAAGATTTATACACAGGCAACCTTGTTAAGTTGAAGGGGCTTGAGTTTGATTGCCCCGATAGTACTGCTATCACTACAAATATCTTCCCTGATGGTTCACAAGGCTTCCTATTCCCAGTCACCGAGAGACTAAATCCAACACAATTCCAGTTGAATATTGGTCGCTCAACAATCCAGCACAACTATGTACGGGGAACTGGCGCAGCATTCGTTGGTATCACTACTGATATCTTCCCTGACCTATCAACACAACCAACAAAACTATTCAATGTTGTTTCTATCCCTTCACCCAA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Protein

Domains

Domains [InterPro]

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Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure