Protein

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Genbank accession
UYL22793.1 [GenBank]
Protein name
long-tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,64
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,66
Protein sequence
MADLVKQQFRATNGLDAAGEKVINVAKANRTVLTDAVNVAFFIEENTIQTYDSTRGYVQNFAVMYDGRIWVSNRAITSPAGTFVQDYWTAVRTDAKYEFINTSGKQLKSGDFISADSSSSDLTFTLPNSPNEGDSIVIRDIGGNVGYKSVNIVASNQRIAFNQHQLTSLGLTNPYSQILFVFSNRLWQTFITPRETFGRLTPNSEGTYSAQAGDAIFARYTTSGPLEVILPKYANTGDYIQFIDTENKEPINHLIVSTFDDTTSVDTQGTKEKEYRTSGKSVFIYDAVDKLWRYWTADIRDRIRIIRDDVTMNPNESVMVWGTNNSTIKTINIKLPTSIAPGDKARVAMNYMRKGQTVVITPSGTDTIATNKTMMQFPRRSEYPPETAWVQVTSLTFNGTTDYVPIVEFSYVEDTSGTNFWVVSDVSPRVERVDASNPDRLGVIALATQDQANVDKGSTPATELAITPSTLANRTATESRQGIAAIATTALVNQDSTASYNDLTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAEVTTGTDDTTIVTPLKLATRRATETLAGLAPIVVSGGNKPALKNTPGTGVYDYTDNSSIVTPKALREIKASVVAQGTIFLATDTDVIEAPAYDAVYPLAVSPSALHKKTATESRIGFTQTATQAEITTGTDDFKYVTPLKLATRKATETLDGIIRVGTSAEYAAGTLDNVVVTPLKLKTFLTGARTTVNTTSGLVQTGNIWDGVSLNIQQATDTQRGTARIATQDEIDKGVDDTTFVTPKRLQLKKATETTEGSIRFATAAEVTTGTADMLAVSPKNLKYVIQQESTWDASVSLRGPVKLSEKAITWSGNATSGSTVDLETYVKSGYAISPYEFNRVLGNYLPRLAQAADSLLLAGVASTNWVRRDIDQTINGALTLTKATTVQAPLTSTSTGKFSSLNLDTSATVGNGSGSAVINLNAKSNAWTLTAGDSLSALVLSTGSINPVIVSNSGDMTVLQSLTAGNLVSATKGVVVNALPAITPENGGMTFGNTTSPIVVKSSNASTIVATDSSGSYNFVTKKNYLTELGTDFVRKNVADTVTGQLTFTKARKDTIDSTINAAYINSTEGNFNVEVTTAAVYNNLPGYVVPTYDTSSATPVIVSYTQVNAPGTLSQFGTSANGKYQIWAPRPTAAGENVVAQTFWIRNWNTVTAAWDSWARMYTSATPPTASDIGAVPVTGSTFDNLTVRDYLKIGNVIMRPDPNTRTVTFEWVD
Physico‐chemical
properties
protein length:1242 AA
molecular weight: 133701,82720 Da
isoelectric point:5,40757
aromaticity:0,07810
hydropathy:-0,20773

Domains

Domains [InterPro]
DC_1946
ATT
1–204
DC_1946 DC_1209
IPR048391
ATT
1094–1190
IPR048391
UYL22793.1
1 1242
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-204 | STR 343-1093 | ATT 1094-1190 | STR 1191-1239 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Erwinia phage IT22
[NCBI] 		2986386 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Erwinia amylovora
[NCBI] 		552 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UYL22793.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP586623 [NCBI]
CDS location
range 156965 -> 160693
strand +
CDS
ATGGCCGATTTAGTTAAACAGCAATTCAGAGCGACGAACGGTCTGGATGCAGCCGGTGAAAAAGTTATTAACGTTGCCAAAGCAAACCGTACTGTTTTAACAGATGCGGTCAACGTTGCATTCTTTATAGAAGAAAATACAATTCAAACCTATGACTCGACTCGTGGATACGTTCAGAACTTCGCTGTAATGTATGATGGTCGTATTTGGGTGAGCAACAGAGCAATTACTTCACCTGCTGGTACATTCGTTCAAGATTACTGGACTGCAGTGCGCACAGACGCAAAATATGAATTCATTAATACATCTGGTAAACAATTAAAATCCGGTGATTTCATTTCAGCAGATTCAAGTTCATCAGATCTTACTTTTACTTTACCAAATTCACCTAACGAAGGTGATTCTATTGTTATTCGCGACATCGGTGGAAACGTTGGTTACAAATCAGTTAACATTGTAGCTTCTAATCAAAGAATTGCATTTAATCAGCACCAACTTACAAGTCTTGGATTAACTAATCCTTATTCTCAGATTTTGTTTGTTTTTAGTAACCGTTTATGGCAGACATTTATCACTCCTCGTGAGACTTTCGGACGCTTGACTCCAAATTCTGAAGGTACATATTCTGCTCAAGCTGGCGATGCTATTTTTGCACGATACACCACTTCTGGTCCGTTAGAAGTTATTCTGCCTAAGTACGCAAATACTGGTGACTATATTCAGTTCATCGACACAGAGAACAAAGAACCGATTAATCATTTAATCGTTTCTACTTTTGATGATACTACAAGTGTAGACACTCAGGGTACTAAAGAAAAAGAATATCGTACATCAGGAAAAAGCGTATTCATCTATGATGCTGTAGATAAATTGTGGCGTTACTGGACTGCTGATATTCGCGATCGTATTCGTATCATCCGAGATGATGTGACTATGAATCCAAATGAATCAGTAATGGTTTGGGGAACAAATAACAGCACGATCAAAACCATTAATATCAAGCTTCCGACTTCTATCGCTCCAGGCGATAAAGCTCGTGTAGCAATGAATTATATGCGTAAAGGTCAGACTGTAGTTATCACTCCTTCTGGAACTGATACTATCGCTACTAATAAGACAATGATGCAGTTCCCTCGTCGTTCAGAATATCCACCTGAAACTGCATGGGTTCAAGTAACTTCATTGACTTTCAATGGAACTACAGATTATGTACCGATCGTTGAATTCAGTTATGTTGAAGATACTTCAGGAACTAACTTCTGGGTTGTCTCAGATGTTTCTCCACGTGTAGAACGTGTCGATGCAAGCAATCCTGATCGTTTAGGTGTTATTGCTTTAGCTACTCAAGATCAAGCGAATGTTGATAAAGGTTCTACTCCAGCTACTGAGCTGGCGATTACTCCTTCAACATTAGCTAATCGTACTGCGACAGAATCTCGTCAAGGTATCGCGGCTATTGCTACTACAGCATTAGTTAATCAAGATTCTACTGCGAGTTACAACGATTTAACTATCGTTACTCCTAAGAAACTTAATGAGCGTACTGCAACTGAGACACGCCGTGGATTAGCAGAAATTGCTACACAAGCTGAAGTTACAACAGGAACTGATGATACCACTATCGTTACTCCTTTGAAATTAGCTACTCGTCGTGCAACTGAAACTCTTGCTGGACTTGCTCCAATTGTTGTTTCAGGCGGTAATAAACCTGCTCTGAAGAACACTCCAGGAACAGGTGTTTATGATTATACTGATAATTCTAGTATAGTTACGCCAAAAGCACTAAGAGAAATTAAAGCTTCTGTTGTTGCACAAGGTACTATTTTCTTGGCTACTGATACGGACGTTATCGAAGCACCTGCTTACGATGCTGTATATCCGTTAGCAGTATCTCCAAGTGCATTGCATAAGAAGACTGCTACTGAATCTCGTATTGGTTTTACTCAGACAGCTACGCAAGCAGAAATTACTACAGGAACTGACGATTTCAAATATGTCACTCCTTTGAAATTAGCTACTCGTAAAGCTACTGAAACTCTGGACGGTATTATTCGTGTAGGTACTTCAGCTGAATATGCCGCAGGTACTCTTGACAATGTTGTTGTTACACCACTTAAGTTGAAAACTTTCTTAACTGGTGCACGTACCACAGTGAACACTACTTCTGGTTTAGTGCAGACTGGTAACATTTGGGACGGTGTTAGTCTTAATATTCAGCAAGCTACTGATACGCAACGTGGTACAGCTCGTATTGCTACTCAAGACGAGATTGATAAAGGTGTAGATGATACTACCTTCGTTACTCCTAAACGTCTTCAGTTGAAAAAAGCTACTGAAACCACTGAAGGTTCAATTCGTTTCGCGACAGCAGCAGAAGTGACGACAGGTACAGCTGATATGCTCGCTGTGTCACCGAAAAACCTTAAGTATGTAATCCAACAGGAATCTACTTGGGATGCCTCTGTGTCACTTAGAGGGCCTGTTAAGCTGTCTGAAAAAGCTATTACCTGGTCAGGTAATGCAACTTCAGGTTCTACAGTTGATCTAGAAACGTATGTTAAAAGCGGATACGCAATATCTCCATATGAATTTAACCGAGTTCTTGGAAATTATTTACCGCGTTTAGCACAAGCAGCAGATTCATTGTTACTTGCAGGCGTTGCATCTACTAATTGGGTTCGTCGTGATATTGATCAGACAATTAATGGTGCATTGACCTTAACTAAAGCAACTACAGTTCAAGCTCCTCTGACATCTACCTCTACAGGTAAATTCAGTTCATTGAACTTAGATACTTCTGCTACAGTCGGTAATGGTTCAGGTTCTGCAGTAATTAACTTGAACGCTAAATCTAATGCTTGGACTTTGACAGCTGGCGATTCATTATCAGCATTAGTACTTTCTACCGGTTCAATTAACCCAGTGATCGTTAGTAACTCTGGTGATATGACTGTACTTCAATCGTTGACTGCCGGAAATCTAGTGAGTGCTACTAAAGGTGTAGTTGTTAATGCTCTTCCAGCTATCACTCCTGAAAATGGTGGAATGACATTCGGAAACACAACTAGTCCTATTGTAGTTAAGTCTTCTAACGCTAGCACAATTGTGGCGACTGATAGCTCAGGTTCATATAATTTTGTCACTAAGAAAAATTATCTGACAGAACTTGGAACAGACTTTGTTCGTAAGAATGTTGCAGATACTGTGACTGGTCAATTGACATTCACTAAAGCTCGTAAAGATACGATTGATTCTACTATCAATGCTGCTTATATCAATAGTACTGAAGGTAATTTCAACGTTGAAGTAACTACAGCTGCGGTGTATAATAACTTACCTGGATATGTTGTTCCTACTTATGATACAAGCTCAGCGACTCCGGTCATTGTGTCTTATACACAAGTGAATGCTCCTGGTACTTTATCTCAGTTTGGCACAAGTGCAAATGGTAAATATCAGATCTGGGCACCACGCCCTACAGCTGCTGGCGAAAATGTTGTTGCACAGACATTCTGGATTCGTAACTGGAATACAGTGACTGCAGCTTGGGATTCATGGGCAAGAATGTATACTTCGGCTACACCTCCTACTGCTTCTGATATCGGTGCAGTTCCTGTAACAGGTTCTACATTTGATAACTTAACTGTAAGAGATTATCTGAAAATTGGTAATGTGATTATGCGCCCAGATCCAAACACTCGCACTGTTACTTTCGAATGGGTTGATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6d00463b826e1d137859285a395dd32839cb726186c894f7ef723b4453770634
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2787
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50