Protein

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Genbank accession
AYH92087.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,60
Protein sequence
MADISIPEGDNPVRYQASLGGNQKYRNMGNVSGQAYLVRGQVTNVYYQKGTLDFNTYGSSVTSGVTDGSGSAPIPVDFWGKNTDGKVFGCYRPVQKGSQILVAYIGGDTSRPIVIGVYPDNEASYELISPVHYNTGDDSTDDVQNDALGERKIYPNQQMMYESGKGDILRSMGGKSFLYISENGSGYLDDINYAYDEISDFYDADANEIEPTMTKAQSWLLVHEDNESDEASDGHRTRFYVNRSGELMVTFANKEDPNNIVVLEASKDSGFKLTKRFDSSNLKEESEDYVQLGIGNGNNVSIKSVDSGDATSFYLDNGNIKLDTPKEGSITFDGISVNAILGRVSDAENAANNASDKADNAAIAGEHAESAASDAASQALAASQAGEDAKSAAVEAKAAGEDAKNQAKDTQDRIIYYASISNETDVAVPGKYIIVNTDTYIANGTIKTAHIADAAITTAKIALAAIGTAQIEDAAITKAKIGNLAVGTAQIEDAAITDAKVGNLSANHLNAGTIDFSVINGTNINASNITVGKLVANQLEIKSLDELSNNLGTIDSGTLGNLNNWGSVKLYADVYAHTFSNLTGTFTADANGAVVASNLTVRGVTNLVYNASLLGGVGGSNSSIPGWTMGTMGYFSNITLHDGVPSIRFNGSTGDSTWQLIARSKLYPLNGLTGQPYSASIWFIDIGSEAAMNYQFSLAFFDTNGNRLASGLVGNTWNGNPNSQDWTYKTINNAVSPSTAAYVAIQLYAYNGTGNVAFSSPMLAQTAQSTGYMPDTGNVVNAGIINGSTINATTFNGGDIINDANNTSNFYPFTIEPTGKASTTLFNSMDAIRTEISGGGLRTRYRAINSSGSQYEAYDGNFSGDIISLNSGFTNGKDMSFSQSVSGNQLTGQVVLSPLNGIHLWGSTQSIHFSGLQMNGTGISFNSYGNIIADQASTWWRVVDFSGKEIANFGTDVAGSNAIEFNRELDIGNFHINTGHTFTSWDKGAINFAKGGGGAADIYAGAVNYTSLVKSSLLSVKRDVKKADTAYWAQLVNSIDLATYQYKTDDNTSHIRLSSIVDDVNDTKQWQLPDVFISRDENGKLSGVDDSVLLNATLATVQEQQKEIDQLNGHNMELEARLNKLEAKLNG
Physico‐chemical
properties
protein length:1131 AA
molecular weight: 120498,84320 Da
isoelectric point:4,58915
aromaticity:0,08665
hydropathy:-0,30840

Domains

Domains [InterPro]
DC_1631
STR
194–1111
DC_1631
Coil
Unmapped
393–413
Coil IPR030392
Coil
Unmapped
1094–1128
Coil
AYH92087.1
1 1131
Architecture
STR
STR 194-1115 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage Dionysus
[NCBI] 		2315484 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AYH92087.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH809530.1 [NCBI]
CDS location
range 25224 -> 28619
strand +
CDS
ATGGCTGATATTAGTATTCCAGAAGGTGACAACCCTGTACGCTATCAAGCATCATTAGGTGGTAACCAAAAATACCGTAATATGGGGAATGTTTCTGGTCAAGCATACCTTGTCAGAGGACAAGTAACTAATGTTTATTATCAAAAAGGTACTCTAGACTTTAATACGTATGGGTCTAGTGTCACTAGTGGTGTTACTGATGGTTCTGGTAGTGCACCTATTCCAGTTGATTTCTGGGGTAAAAATACAGATGGAAAAGTATTTGGATGTTATCGACCGGTGCAGAAAGGTTCTCAAATACTGGTAGCCTATATTGGTGGTGACACTTCTCGGCCAATTGTAATCGGTGTTTACCCTGATAATGAAGCTTCATACGAGTTAATTTCACCAGTGCATTATAATACGGGTGACGATAGCACAGACGATGTTCAAAATGATGCTTTAGGCGAGAGGAAAATATACCCTAACCAGCAAATGATGTATGAGTCTGGTAAGGGAGACATCCTCAGAAGTATGGGTGGCAAGTCTTTCTTATATATATCTGAAAACGGTAGTGGCTACCTAGATGATATAAACTATGCTTATGATGAAATTAGCGATTTCTATGATGCTGATGCAAACGAAATCGAGCCAACAATGACTAAGGCTCAATCTTGGCTGTTAGTTCATGAAGACAATGAAAGTGATGAAGCATCAGACGGTCACAGAACAAGATTCTATGTTAATCGTTCTGGTGAACTAATGGTTACCTTTGCTAATAAAGAAGACCCCAATAACATTGTTGTTTTAGAAGCTAGCAAAGATTCTGGATTTAAGCTAACAAAGAGGTTCGATAGTAGCAATCTTAAAGAAGAATCAGAAGATTATGTTCAGCTTGGTATAGGAAATGGCAATAATGTTAGCATTAAGAGCGTTGACAGCGGGGATGCTACTTCTTTTTATTTAGATAACGGCAATATTAAACTTGACACTCCAAAAGAAGGTTCAATAACCTTTGATGGCATATCAGTAAACGCCATATTAGGTAGGGTATCAGATGCAGAAAATGCTGCTAATAACGCTAGTGATAAGGCAGATAATGCTGCTATCGCTGGAGAACATGCTGAGTCTGCTGCTAGTGATGCAGCAAGCCAAGCACTAGCAGCAAGTCAGGCAGGAGAAGATGCTAAGAGTGCTGCTGTTGAAGCTAAGGCTGCTGGTGAAGATGCTAAGAATCAAGCTAAAGATACCCAAGATAGAATAATATATTATGCGTCAATTTCTAATGAAACAGATGTAGCTGTACCCGGTAAGTATATTATAGTTAACACAGATACTTATATTGCAAACGGTACAATCAAAACTGCGCATATTGCAGATGCCGCTATTACAACTGCTAAGATTGCGTTAGCAGCTATTGGTACTGCACAAATTGAAGATGCTGCTATTACTAAGGCAAAGATAGGTAATCTTGCAGTTGGTACTGCACAAATTGAGGACGCCGCTATCACTGATGCAAAAGTTGGTAACTTAAGTGCTAACCATTTGAATGCAGGAACCATAGATTTTAGTGTTATCAACGGTACTAACATTAACGCTTCAAACATTACCGTTGGAAAATTAGTCGCTAACCAGCTTGAAATAAAAAGTCTTGATGAGCTTTCTAACAATTTAGGTACTATTGATAGTGGTACTCTAGGTAATCTTAATAACTGGGGTTCAGTTAAACTATACGCTGATGTTTATGCTCATACTTTTAGTAACTTGACAGGAACATTTACAGCTGACGCTAACGGTGCTGTTGTCGCTAGCAATTTAACCGTACGAGGTGTCACTAACCTTGTTTATAACGCATCATTGCTGGGTGGAGTTGGTGGTAGCAACTCTAGTATCCCCGGTTGGACGATGGGTACAATGGGATACTTCTCAAATATTACGTTGCATGATGGTGTCCCTTCAATTAGGTTTAATGGTAGTACGGGTGATTCCACCTGGCAATTAATTGCACGGTCCAAGCTATACCCATTAAATGGGTTAACTGGTCAGCCTTATAGCGCATCAATTTGGTTCATTGACATTGGTAGTGAAGCTGCCATGAATTATCAATTTTCACTGGCCTTCTTTGATACCAACGGTAACCGATTGGCTAGTGGACTTGTCGGTAACACGTGGAATGGTAATCCAAATTCACAAGATTGGACATACAAAACAATTAATAACGCAGTTTCACCAAGTACAGCTGCCTATGTTGCCATTCAGTTGTATGCTTACAACGGTACGGGAAATGTAGCATTTAGTTCACCTATGCTAGCCCAAACTGCTCAATCAACCGGTTATATGCCAGATACAGGTAATGTTGTTAACGCCGGTATTATTAATGGCTCTACAATTAATGCAACTACTTTTAACGGTGGTGACATTATCAATGACGCTAACAATACTAGTAATTTTTATCCATTCACCATTGAACCTACTGGCAAAGCTTCCACGACACTCTTTAACTCAATGGACGCTATAAGGACAGAGATTAGTGGTGGCGGACTAAGAACCAGGTATCGCGCCATAAACTCTTCCGGAAGTCAATATGAAGCTTATGATGGCAATTTTAGTGGCGATATAATTTCTTTGAACTCTGGCTTTACTAATGGCAAGGATATGTCATTCTCACAATCTGTTTCCGGTAATCAATTAACAGGCCAAGTCGTGCTTAGCCCGTTAAACGGGATCCATTTATGGGGAAGCACGCAATCTATTCATTTTAGTGGTCTTCAAATGAACGGAACAGGTATCTCATTTAATAGTTACGGCAACATTATTGCAGACCAAGCTTCTACGTGGTGGCGTGTTGTAGACTTTTCTGGCAAAGAGATTGCTAATTTTGGCACGGATGTCGCAGGAAGCAATGCGATTGAGTTTAATCGTGAATTAGATATTGGCAATTTCCATATTAATACCGGACATACTTTCACTAGTTGGGACAAAGGGGCTATTAACTTTGCCAAGGGCGGTGGCGGTGCAGCTGACATTTATGCAGGCGCCGTTAACTATACTAGTTTGGTTAAATCATCCCTATTAAGTGTTAAGCGGGACGTTAAAAAGGCTGATACAGCTTATTGGGCACAACTAGTTAACTCAATCGACTTAGCAACCTACCAGTACAAAACTGACGATAACACCAGTCATATTAGGTTGTCTTCCATTGTCGATGATGTAAATGACACTAAGCAGTGGCAATTGCCAGACGTATTTATCAGTCGTGATGAAAATGGCAAGCTAAGCGGTGTAGACGACAGTGTGCTATTAAATGCCACCCTAGCTACGGTACAGGAACAGCAGAAAGAAATTGACCAATTAAATGGTCACAACATGGAATTGGAAGCTAGATTAAACAAATTGGAGGCCAAATTAAATGGATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
943de5f476d80631ae0ebc2176f15643590e37ccf1bb8efd93f4e0f4b752d3b6
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5248
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Lactobacillus phages that infect wine-derived L. plantarum strains Kyrkou,I., Byth Carstens,A., Ellegaard-Jensen,L., Kot,W. and Hestbjerg Hansen,L. 2018-12-03 — GenBank