Protein
View in Explore- Genbank accession
- QIA28519.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MAEINLNQSPYNDRFDPEKNRNKVLFNADRPLQQSELNELQSIAEYNNRQLGDSIFADGDIQTGMSFSVADGNITVEDGLVYLAGRVRKFKKQTIPFSGTGTEEIGIVVDQKIVTANDDPTLLDQTQGVESFLSQGADRLEETVKLTNNDDSAPTIYKFVDGNLFVQPERPEFSMINDVLAQRTYEESGSYQVNGFKMWTEKSQDSTKLDLVIDRGTAYVLGYRINKPTSSRIPLNKSRDFKTVAQETHTYDTAVRKNTVGSASVKAINQVIARVQSPAGGITVSKGTADGRDALPAQYTSLDPSTVVLWTTSPEKYYVYNTDYKIIEDSGVQYVDWNTGLNGTEPTTGTSYKMSFEYDRVMQPNVDYKVVTTPEEDTPFWSTDIDFNGMTGLKPKDKGIIRIAYDYYLARADVITLNSNGEFTVIEGQPDRTNAAQPPLHEDPLTLKVGEVFIYPNADEGLAVNNGVVRLTMTQLVNIKERLENVEYNQAIEALENKAIVSDDPLSLRGVFADGFVDFSRMDLNTSSVAMSFDDASITLQVNAPADQMRSPSLSVSDSVAHSWGRLVTAPYSEIKEISQPLASEAMNVNPYSVYNKLGALALTPGADNWIEQEKITVNRETTQTVRMDRWWAHGRQTSVTKSLQNLVKNLDLDGNQNWDMGLGYQYDLKNGRTGTLTDVATSVRSTAIEFIRVREISFSASNLQPMSNNLYLTFDGIRVAVTPTGSTVKGAEAGTIMSDASGKASGKFTIPSGVRTGTREVVLQNASNMAIATYTAQGTLKTTEEVITKTRVTVNLYDPLAQSFVFPQDRVVTSFDAYFASKSSTDNVIVQVRGLSEGGFPNQTVYAERVLTPAQIKTSSNASVATKIALDDPLMCKAGQSYCLVFITDSNQYTMWVATLGQNRIDAPAQKVVSQPYTNGVLFSSSNARTWTVHQESDLKFSVYTAQFEENAIVEFNPMADLNSDMLLLMATYLTPDNTGCTWEIKTVAKSDVGSVSIDSVPWQPLSNYIEQTAAGSVIGLVKLRATFKANRYISPMLTLEDLMFINFISETAGDYVSLNIDSTDAPFNTLTLSYDSTEPTGTKITPKYSLDGGTTWKTFTATDVVTKQSAEYSRHTFTEKVSTGLSTQLKVKLELRADNRFVRPRARRLTAVFKNEV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1159 AA molecular weight: 128032,73470 Da isoelectric point: 4,90136 aromaticity: 0,08714 hydropathy: -0,35099
Domains
Domains [InterPro]
IPR032096
STR
9–617
STR
9–617
Coil
Unmapped
478–498
Unmapped
478–498
1
1159
Architecture
STR 9-617 | RBD 618-1158 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Phage f2b1 [NCBI] |
2708592 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Staphylococcus aureus [NCBI] |
1280 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QIA28519.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN940411.1
[NCBI]
CDS location
range 22325 -> 25804
strand +
strand +
CDS
TTGGCAGAAATCAATCTTAACCAATCACCTTACAATGATCGATTTGACCCGGAAAAGAATCGTAACAAGGTTCTATTTAATGCAGACCGTCCATTACAACAGTCGGAGTTAAATGAGCTACAGTCTATCGCTGAGTACAATAACCGCCAGTTAGGTGACAGTATTTTTGCAGATGGAGATATTCAAACAGGTATGTCTTTTTCTGTTGCAGATGGAAACATCACAGTAGAAGACGGGCTAGTTTATCTTGCTGGACGAGTTCGTAAGTTTAAGAAACAAACGATTCCTTTCTCAGGTACAGGTACAGAGGAAATCGGTATCGTAGTAGATCAAAAGATTGTTACAGCTAACGATGACCCTACACTACTTGACCAAACGCAAGGAGTAGAAAGTTTCCTTTCTCAAGGTGCAGATCGTCTAGAAGAAACGGTTAAGCTTACAAACAACGATGATAGTGCCCCAACAATTTATAAATTCGTTGACGGTAACCTGTTCGTACAGCCGGAACGTCCAGAGTTCTCTATGATTAACGATGTCTTAGCACAGCGTACGTATGAAGAATCTGGTTCGTATCAAGTGAACGGATTTAAAATGTGGACAGAGAAGAGTCAAGACAGTACAAAACTTGACTTAGTAATTGACCGTGGAACAGCCTATGTACTAGGTTACCGTATTAACAAGCCTACGTCAAGCCGTATTCCTTTAAATAAATCACGAGACTTTAAGACAGTAGCTCAGGAGACTCATACGTACGATACAGCTGTTCGAAAGAACACAGTAGGTAGCGCTTCTGTTAAAGCTATTAATCAGGTTATCGCGCGTGTACAATCTCCTGCGGGTGGTATCACTGTTTCTAAAGGTACAGCAGATGGACGAGACGCTTTACCAGCTCAGTACACTAGCTTAGACCCTAGTACAGTTGTTCTTTGGACTACAAGCCCAGAGAAGTACTATGTATACAACACAGATTACAAGATCATCGAAGACAGCGGTGTGCAGTACGTAGACTGGAACACAGGGCTTAACGGAACAGAACCTACTACAGGTACCTCATACAAGATGTCGTTCGAATATGACCGTGTAATGCAGCCTAACGTAGACTACAAGGTTGTAACAACTCCTGAAGAGGATACACCTTTCTGGTCAACAGATATCGACTTTAACGGTATGACCGGTCTTAAGCCAAAGGATAAAGGAATTATTCGTATCGCGTACGATTACTACTTAGCTCGTGCAGATGTTATTACACTTAATAGCAATGGTGAGTTTACAGTAATCGAAGGGCAACCAGATCGTACGAATGCAGCTCAGCCTCCTCTTCACGAAGACCCGTTAACACTTAAAGTCGGTGAAGTATTCATTTACCCTAATGCGGATGAAGGTCTAGCAGTTAACAACGGTGTTGTGCGTTTAACAATGACACAGCTAGTTAACATAAAAGAACGCCTAGAAAACGTAGAATACAACCAAGCGATTGAAGCTTTAGAAAATAAAGCTATCGTTTCGGATGACCCGTTAAGTCTACGTGGAGTATTTGCGGACGGATTTGTAGACTTCTCTCGAATGGACTTAAACACTTCTTCAGTGGCTATGTCTTTCGATGATGCAAGTATCACGCTACAGGTTAATGCTCCTGCAGATCAAATGCGTTCTCCATCTCTTTCAGTAAGTGACTCAGTAGCTCACAGCTGGGGACGATTAGTTACAGCCCCTTATTCAGAGATCAAAGAGATTTCACAGCCGCTTGCTTCTGAAGCAATGAACGTGAACCCTTACTCTGTGTATAACAAGCTAGGTGCTCTAGCACTAACACCGGGAGCTGATAACTGGATTGAGCAAGAGAAAATCACAGTTAACAGAGAAACAACTCAAACAGTTCGTATGGATAGATGGTGGGCTCACGGAAGACAAACATCGGTTACAAAGAGCTTACAAAACCTTGTAAAGAACTTAGACCTTGACGGTAACCAAAACTGGGACATGGGCTTAGGATACCAGTATGATCTCAAGAATGGACGTACAGGTACTCTAACAGACGTAGCCACTTCAGTACGTAGTACGGCTATCGAGTTTATCCGCGTACGAGAAATTTCATTCTCAGCTTCTAATTTGCAGCCTATGTCAAACAACTTATATCTAACGTTCGATGGAATCCGAGTAGCTGTTACACCTACAGGCTCTACAGTGAAGGGTGCGGAAGCAGGAACAATCATGTCGGATGCATCTGGTAAAGCTTCTGGTAAGTTCACAATCCCTTCTGGTGTTCGTACAGGTACTCGTGAAGTTGTGTTACAAAACGCTTCTAACATGGCTATTGCTACGTATACAGCACAAGGTACACTGAAGACAACAGAGGAAGTTATTACAAAAACTCGTGTAACAGTTAACCTGTATGACCCATTAGCACAGTCATTTGTATTCCCACAAGATCGTGTCGTAACTTCATTTGACGCTTACTTTGCTTCTAAGTCTAGCACAGATAACGTCATTGTACAAGTACGTGGACTATCTGAGGGTGGGTTCCCTAACCAGACGGTGTATGCAGAACGCGTACTGACTCCAGCGCAAATCAAGACATCTTCTAACGCTTCTGTAGCAACGAAGATCGCACTAGATGACCCGTTAATGTGTAAAGCTGGTCAGTCATACTGCTTAGTCTTCATCACAGATAGTAACCAGTATACAATGTGGGTAGCTACGCTAGGACAAAATCGAATTGATGCTCCTGCTCAAAAGGTAGTTTCCCAGCCTTATACAAACGGTGTATTATTCAGTTCATCAAATGCTCGTACATGGACTGTACACCAAGAATCAGATTTAAAATTCAGTGTGTACACAGCTCAGTTCGAAGAGAACGCTATTGTAGAATTTAACCCTATGGCAGACTTGAACTCTGATATGCTTCTACTTATGGCTACGTACTTAACACCGGATAACACAGGTTGTACGTGGGAGATTAAGACAGTAGCTAAATCAGACGTAGGTTCTGTATCTATCGATAGTGTACCTTGGCAGCCATTGTCCAACTATATTGAGCAAACAGCAGCAGGTTCTGTAATCGGATTAGTTAAGCTTCGTGCAACATTCAAAGCTAACCGCTACATTTCTCCAATGCTAACATTAGAGGATTTAATGTTTATCAACTTTATCTCTGAAACAGCTGGAGATTATGTATCACTAAACATTGACTCTACGGATGCACCGTTTAACACACTTACGCTTTCATACGACTCTACAGAGCCTACAGGAACGAAGATTACACCTAAGTACTCTCTAGACGGTGGAACAACGTGGAAAACGTTCACAGCAACGGATGTAGTAACAAAGCAATCTGCAGAGTATAGCCGACACACGTTCACTGAGAAAGTCTCTACGGGGCTAAGCACTCAGTTAAAAGTGAAGTTGGAGTTACGAGCAGACAACCGTTTTGTACGTCCTCGTGCTAGACGATTAACAGCAGTATTCAAAAACGAAGTATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
141a474157e1d6cc7c7da706d042e449f20772d29b4c74fa7d0d57befdcdd2ae
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50