Protein

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Genbank accession
QBX25417.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
Protein sequence
MADGKVTITVDLDGTSAQQGVKSLKSLLQGLGDTSSSGFGKGSKSALGFGAITGVASALVQKGMQMVNNSVGGAIDRFDTLKKYPVVMNALGYSAKDVAKSTKLLSDGIDGLPTTLSDITKSAQVFAPLTGSATSAAKSAVALNNAFLASGASLSDTSRGMQQYTQMLSTGKVDMMSWRTLMETMPVALDKVAKSFGFTGKSAKTDLFNALKNGEITIDDLNKKFVELNEGQNGFAELAKKNSAGIGTSFANLKNAVIKNLANMIEAIDKGFAKAGLGSIAKTIDGLKGAINSTFETITPIITDFVANAIKAAKKMWDSFKDTGAISAISNAFAHIKDAAEHVWDSLTKGKEIDFGELGSKIGEIAKWLAEAATKASNFISNLPPGTIQSIAGAVLGMVGAFKTVSTATKAIKGLKNSFGLLKTALSNPWGLAIAGIGMLIGWFIQAYTTSETFRNKVNEVAKVIGEVASKIAEFVSGLDPSMFTLIMPALAMLIAKFKSFSSLGSLNPFKLFKKNAKDAFTGASGSATQSKGIIEQVFSGLGTLITSIAQGISTVLQGLATAISTVAQGFGQAAAMASPTQWLSMGAAMLMVGAGVALAASGIYILVQAAIQLASAGTGAQIAMLALGVGIAALAGIFALLGPALTASAVGILAFGASVALIGAGIAIAAVGLSVLVNAFANAQGAITATGQAISAAAQGIGQGIQSALSGAAQVVQSFGTAIQSALDGVANVFRSVGDSVKSAFEGIGNVIKSVGSSIKSVLDGISGVIESIGKAALNAGKGFDKLADGVVKITNTKLGDMAASLAAVAKGVGKIAAHSEGLSQAGSGMKNLGAGMRTVSTAASTAVSGLTMFDSKINSLKTVVMSLPQMLTSAASGFSRFTSQAVSGVAGLSAINAPIATFKSQIMTITPALMMAGVSFASFGSKAMVISVAFATVGGLITAFNARVMTISTTMTMASTSFAMLGSRILAVGTALMTVSTSFMQVSSSATNASSQVRNMATSTQAVISAFNAMRGQVQSSMQAILAVIRSVGSQMKSQGRQIGQQTARNLAQGLSSGRGQAVSAMTSIMSAIRSAGMSGVGAMRGIGAMIGQGLAAGMMSALGAVTAAANALVAQAERAARAKAQIHSPSRLFRDSVGRFLPMGVAVGIEKNTKYVDKAMGGMYDNIQAFSYKAEDVIGVGKTKLSKVVQVKSDFENAIKTKVEVAKEKGNDLMKKALDIAEKAVERPSELILDDGTLVAKTGDKYDQYQTEQTRRKNRMRGIRL
Physico‐chemical
properties
protein length:1268 AA
molecular weight: 129403,31810 Da
isoelectric point:9,86374
aromaticity:0,05521
hydropathy:0,30954

Domains

Domains [InterPro]
IPR013491
TAS
73–265
IPR013491 G3DSA:1.20.120.20
IPR013491
TAS
143–220
IPR013491
QBX25417.1
1 1268
Architecture
TAS
STR
TAS 73-265 | STR 674-799 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage Javan258
[NCBI] 		2548076 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Streptococcus hyovaginalis DSM_12219
[NCBI] 		1123305 Bacillota > Bacilli > Lactobacillales > Streptococcaceae > Streptococcus > Streptococcus hyovaginalis

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX25417.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448887.1 [NCBI]
CDS location
range 25062 -> 28868
strand +
CDS
ATGGCAGACGGAAAAGTTACTATCACAGTTGACCTTGATGGTACAAGTGCCCAACAGGGAGTTAAATCGTTAAAAAGTTTATTGCAGGGGTTGGGTGATACCTCATCATCAGGATTTGGTAAAGGTTCTAAATCTGCCCTTGGTTTTGGCGCTATTACGGGTGTTGCTAGTGCTTTAGTACAAAAGGGTATGCAGATGGTTAATAACTCTGTTGGTGGAGCAATAGACCGCTTTGATACTCTCAAGAAATATCCAGTAGTCATGAATGCGCTAGGTTACTCAGCTAAAGATGTAGCTAAATCAACAAAATTACTCAGTGACGGTATTGATGGGTTGCCAACAACGCTTAGTGATATTACCAAATCAGCTCAAGTGTTTGCTCCTCTAACAGGTAGTGCAACTAGTGCAGCAAAGTCAGCTGTAGCCCTTAATAATGCTTTTTTGGCTAGTGGTGCAAGCTTGTCAGACACCAGTCGAGGTATGCAACAGTATACGCAGATGCTATCAACAGGTAAGGTTGATATGATGAGCTGGCGAACATTGATGGAAACTATGCCAGTAGCTTTAGATAAAGTAGCTAAGTCTTTTGGATTTACAGGTAAGTCTGCTAAAACAGATTTATTTAATGCTCTAAAAAATGGGGAGATAACCATTGATGACTTAAATAAAAAATTCGTTGAGCTTAACGAGGGTCAAAATGGATTTGCAGAACTCGCCAAGAAAAATAGCGCAGGTATTGGTACATCATTTGCGAACCTTAAAAATGCTGTTATCAAAAACTTAGCCAATATGATTGAGGCTATTGATAAAGGGTTTGCAAAAGCAGGTTTAGGTAGTATTGCAAAGACAATTGACGGTTTAAAGGGTGCTATTAATAGTACTTTCGAAACAATTACGCCAATAATTACAGACTTTGTCGCCAATGCTATCAAAGCTGCTAAAAAGATGTGGGATAGCTTTAAAGATACTGGGGCTATATCGGCAATTTCTAATGCTTTTGCCCACATTAAGGATGCTGCTGAACATGTTTGGGATAGTTTAACCAAAGGAAAAGAGATTGATTTTGGCGAATTAGGAAGTAAAATCGGAGAGATTGCTAAATGGTTAGCTGAAGCAGCGACCAAGGCATCTAATTTTATTTCAAACTTGCCACCCGGCACAATTCAATCAATAGCTGGTGCTGTACTTGGTATGGTTGGGGCTTTTAAAACAGTATCAACAGCAACTAAAGCCATCAAGGGTTTAAAAAATTCGTTTGGTTTACTAAAAACAGCTTTATCTAACCCATGGGGGCTAGCTATCGCTGGTATTGGTATGTTAATTGGTTGGTTTATTCAAGCATACACAACTAGTGAGACTTTTAGAAATAAGGTTAATGAAGTTGCAAAAGTGATTGGTGAGGTGGCTTCTAAGATTGCAGAATTTGTATCTGGCTTAGACCCATCTATGTTTACTTTGATTATGCCAGCATTAGCTATGCTGATTGCTAAATTCAAGAGTTTTAGCTCATTGGGTAGCTTGAATCCATTTAAGCTATTCAAAAAGAATGCCAAAGATGCCTTTACTGGTGCAAGTGGGTCAGCAACGCAGTCTAAAGGTATCATTGAGCAAGTCTTCTCTGGTCTAGGTACGTTAATAACCTCAATAGCGCAGGGCATATCTACTGTTTTACAGGGTCTTGCAACAGCGATATCAACAGTTGCACAGGGATTTGGTCAAGCAGCAGCTATGGCAAGTCCTACGCAATGGTTATCGATGGGGGCTGCAATGCTCATGGTTGGTGCAGGTGTAGCTTTAGCTGCTAGTGGTATCTATATATTAGTGCAAGCAGCAATACAGCTAGCAAGTGCAGGAACAGGTGCACAAATTGCAATGTTGGCACTTGGTGTTGGTATAGCAGCTTTAGCAGGTATATTTGCATTATTAGGTCCAGCTTTGACGGCGAGTGCTGTCGGTATCTTAGCCTTTGGTGCATCTGTTGCCTTAATTGGTGCAGGTATAGCAATTGCAGCGGTTGGCTTATCGGTATTGGTTAATGCTTTTGCTAACGCCCAAGGAGCTATTACTGCTACAGGTCAAGCGATAAGTGCTGCAGCTCAAGGTATAGGACAAGGTATTCAATCTGCTCTTTCTGGCGCTGCTCAAGTAGTACAGAGTTTTGGCACAGCCATTCAATCAGCGCTGGATGGTGTCGCTAATGTTTTTAGAAGTGTTGGAGACTCTGTTAAATCAGCTTTCGAAGGCATAGGTAATGTCATTAAAAGTGTGGGTAGTTCCATCAAGTCTGTCTTAGACGGTATATCTGGTGTAATTGAATCTATTGGAAAAGCTGCCTTAAATGCAGGTAAAGGATTTGATAAGTTAGCTGATGGTGTTGTCAAAATAACTAATACAAAGTTAGGTGATATGGCAGCATCTTTAGCGGCAGTTGCAAAAGGTGTTGGGAAAATTGCAGCTCATTCAGAAGGACTATCGCAAGCTGGTTCAGGAATGAAGAATTTAGGTGCAGGGATGCGGACTGTTTCAACAGCTGCTAGTACAGCTGTATCTGGTTTGACAATGTTTGATAGCAAAATTAACAGTTTAAAGACAGTTGTAATGAGTTTGCCACAAATGTTGACAAGTGCAGCTTCTGGATTTTCAAGATTTACTAGCCAAGCAGTTTCTGGTGTTGCAGGGTTATCTGCTATCAATGCACCGATTGCAACATTTAAGAGTCAAATTATGACAATTACCCCAGCATTAATGATGGCAGGTGTCAGCTTTGCCTCATTTGGTTCAAAAGCAATGGTTATTAGTGTAGCTTTTGCTACTGTTGGCGGTCTTATAACTGCATTTAATGCACGTGTAATGACAATTTCAACTACTATGACAATGGCAAGCACCTCATTTGCTATGTTAGGTTCAAGGATTTTGGCTGTTGGCACAGCTCTCATGACTGTATCTACTAGTTTTATGCAAGTATCATCTAGTGCAACTAACGCATCATCTCAAGTAAGAAATATGGCAACCAGCACACAAGCTGTTATTTCAGCCTTTAATGCTATGCGTGGACAAGTGCAATCATCAATGCAAGCTATTCTGGCTGTTATTAGGTCAGTTGGTAGTCAAATGAAGTCTCAAGGTCGCCAAATAGGGCAGCAGACAGCACGTAATTTAGCACAAGGCTTGAGTAGCGGAAGAGGGCAAGCAGTCAGTGCTATGACCTCTATAATGTCTGCTATAAGGTCTGCCGGGATGTCTGGTGTCGGTGCTATGCGCGGGATTGGTGCGATGATAGGGCAAGGGTTAGCCGCTGGTATGATGTCAGCTTTAGGAGCTGTAACAGCTGCAGCTAATGCCTTAGTAGCTCAAGCAGAAAGAGCAGCACGAGCTAAAGCACAAATTCACTCACCATCAAGGTTGTTTAGAGATAGCGTAGGGCGTTTCTTACCAATGGGGGTTGCTGTTGGTATTGAGAAAAACACCAAATATGTTGATAAGGCTATGGGTGGCATGTATGACAACATACAGGCATTTAGCTATAAAGCAGAGGATGTCATTGGTGTTGGTAAAACTAAGTTATCTAAAGTAGTGCAAGTTAAATCAGACTTTGAGAACGCTATTAAAACTAAAGTAGAAGTTGCTAAAGAGAAAGGTAACGACCTTATGAAAAAAGCTCTTGATATTGCCGAAAAAGCAGTAGAGCGACCATCCGAACTCATACTTGATGATGGCACTTTAGTTGCCAAAACAGGTGATAAGTATGACCAGTACCAAACAGAGCAAACTAGACGAAAAAATAGAATGAGAGGGATAAGACTATGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
4c992e82889f2dc14d30ee558549ff3bc8128bc27d15d263eb4aefe625a01432
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5095
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Prophages and satellite prophages are widespread among Streptococcus species and may play a role in pneumococcal pathogenesis Rezaei Javan,R., Ramos-Sevillano,E., Akter,A., Brown,J. and Brueggemann,A.B. 2018-12-20 — GenBank