Protein

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Genbank accession
YAL64451.1 [GenBank]
Protein name
LamG domain-containing protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MRSNITLTWDYNGLYCDIYKSNKEIDVNFMPEPYVSGISANTYTDYDVIDGKYYYYIVCTYDETGVYRMTKQFKILCGDKYNFESINKLIWLDETSLTLNGTTVTKWSDKSGNNNDFVADVGTVTFNESTGVFFNTGTNGLKNTNRGLLKEKSYIWNAIVFKTNSTGVTFFQVHDGSSTTYFPKYVNQIENNCISTFVTNTTFDSNNFKLVGDTNVIDGNYHIYFSYIDLIANKAYIYLDGKLESCVNYYMTTSGKTNNINTAQDNVLGRYLTSPAVTHYQKMFVLGDTKLSQSDIDKINLYIGNKYDIKLKNDLYDDYEDVILNKVKNLKITQDRNITWETDYVDKEFKIVKNISDINKDNYEDSTIVVDVNSSKTFIDTDNKPINYYNVSTVDNIEVNKLSTKKYVNISKIDEEYTNRHVIIKPEKSFYLSDYSINNKIINNTNKYKVVKNKFNDVMAFSGINSSSYNSTNSRLSSSISALGTSDFTLEIWMMPDYSYDNYIPYNRMVQIGPNSTGDNTALGGLFLVRSDNSNSDIILFDIVELNYTRLYTSTEQVFKSSYWSHFCVQRKDGVFYIYKDGKLLGYNDKHLTYNISRTDLYIGANNIGAEYSYMFVDSFRITKQCRYDVNGFDLPTEDFAEDTTKDTMYNNVDVLIKSKNGVIKDFSKNNRTINQVTINKYIKNNSSVYLNATGHISVPINTLGTSDFTLEGYFNLPSTQIDWARLFQINNNAIQGGLWLFVKANTLKLQAQGYLSSNRSYFDLGKYSALDLNINEWNHICMMRRNGIFYIYINGVLQSTSSINKTYSIEGNTLFIGSNSNNNTGEAFKGNFGGARLSYKVCYDIEGFEPPKRFPIYDQPKFKYTTAYYNKESSHVKLVWNCIGNENAKYTIYRSLTQFTKDNLPEPLDTNIIGDFYIDDDSTKTVEYYYMIKYDDGIFVEYSDLFKYVSENLLVHLPLLHDFETNEGSASNKFKHNGIVDNHNYALYISHNTASYIYSDFSLDTNINFKISFELLRLTSYGVSYPDIISFSENLVANDFALSLGGDYGSSLKDKFFVGQSNYYTKESSKTIVNNVYYNVIFERKDGYINLYLNGEIVINYLQSETTGALNLFNVYNYIRLGYAKGNTTSGQFHGYIRNFKIYDLSS
Physico‐chemical
properties
protein length:1148 AA
molecular weight: 131931,62680 Da
isoelectric point:5,48237
aromaticity:0,14808
hydropathy:-0,43763

Domains

Domains [InterPro]
DC_1652
STR
57–424
DC_1652 G3DSA:2.60.120.200 G3DSA:2.60.120.200 IPR013320
IPR013320
STR
431–626
IPR013320 IPR013320 G3DSA:2.60.120.200
PF13385
LEC
473–624
PF13385 PF13385
YAL64451.1
1 1148
Architecture
STR
STR
STR
STR 57-628 | STR 656-838 | STR 1001-1146 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
YAL64451.1
1 1148
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 115 115 0,3963
Central domain 116 552 438 0,7091
C-terminal 553 1148 595 0,2250
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-115
Central
116-552
C-terminal
553-1148

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage AbIJP1
[NCBI] 		3411817 No lineage information
Host Acinetobacter sp.
[NCBI] 		472 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Moraxellales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YAL64451.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV126534 [NCBI]
CDS location
range 319318 -> 322764
strand +
CDS
ATGCGTAGTAATATCACACTAACATGGGATTATAATGGTTTATATTGTGATATATATAAATCAAATAAAGAAATAGATGTAAATTTTATGCCTGAACCTTATGTTTCAGGCATTTCAGCCAATACTTACACTGATTATGATGTAATAGATGGAAAATATTACTACTATATTGTTTGTACATATGATGAAACAGGTGTTTATCGTATGACTAAACAATTTAAAATATTATGTGGTGATAAGTATAATTTTGAATCAATCAATAAACTTATTTGGCTTGATGAAACAAGTTTAACTTTAAATGGAACAACTGTTACTAAATGGTCTGATAAGTCAGGCAATAATAATGATTTTGTTGCTGATGTTGGTACAGTAACATTTAATGAATCAACAGGTGTATTTTTTAATACTGGTACAAATGGTTTAAAAAATACAAATAGAGGTTTATTAAAAGAAAAATCATATATATGGAATGCTATAGTTTTTAAGACTAATTCAACAGGGGTAACATTTTTTCAAGTGCATGATGGTTCTAGCACGACATATTTTCCAAAATATGTAAATCAAATTGAAAATAATTGTATATCAACATTTGTAACAAACACAACTTTTGATTCAAATAATTTTAAATTAGTTGGTGATACGAATGTTATAGATGGTAATTATCATATTTATTTTTCTTATATTGATTTAATAGCAAACAAAGCTTATATATATCTTGATGGTAAATTAGAAAGTTGTGTAAATTATTATATGACAACATCGGGTAAAACAAACAATATTAATACTGCACAAGATAACGTATTAGGTAGGTACTTGACATCACCAGCAGTTACACATTATCAAAAAATGTTTGTATTAGGTGATACTAAACTTTCACAAAGTGATATTGATAAAATTAACTTATATATTGGTAATAAGTATGATATTAAATTAAAAAATGATTTATATGATGATTATGAAGATGTTATTTTAAACAAGGTTAAAAATCTTAAAATAACTCAAGATAGAAATATTACTTGGGAAACTGATTATGTAGATAAAGAATTTAAAATTGTTAAAAATATATCTGATATTAATAAAGATAATTATGAAGATTCAACTATAGTTGTTGATGTTAATTCATCTAAAACTTTTATTGATACAGATAATAAACCTATTAATTATTATAATGTTTCAACAGTTGACAATATTGAAGTAAATAAATTATCAACAAAAAAATATGTTAATATTTCTAAGATTGATGAAGAATATACAAATCGTCATGTTATTATTAAACCTGAAAAAAGTTTTTACTTATCAGATTATTCAATAAATAATAAAATTATAAATAATACCAATAAATATAAAGTTGTTAAAAATAAATTTAATGATGTTATGGCATTTAGTGGTATAAATAGTTCTTCATATAATAGTACAAATTCACGTTTATCTTCATCTATTTCAGCTTTAGGTACAAGTGATTTTACACTTGAAATATGGATGATGCCTGATTACTCATATGATAACTACATACCGTATAATCGTATGGTTCAAATTGGTCCAAATAGTACAGGTGACAATACAGCATTAGGTGGTTTATTTTTAGTAAGAAGTGATAATAGTAATAGTGATATTATTTTATTTGATATTGTTGAATTAAATTATACTAGGTTATATACATCAACTGAACAGGTTTTTAAATCTTCTTATTGGTCACATTTTTGTGTTCAACGTAAAGATGGTGTTTTCTACATTTATAAAGATGGTAAATTACTTGGTTATAATGATAAACATTTGACATATAATATATCAAGAACTGATTTATATATTGGTGCTAATAATATTGGTGCTGAATATTCTTATATGTTTGTTGATAGTTTTAGAATAACCAAACAATGTAGATATGATGTTAATGGTTTTGATTTACCAACTGAAGATTTTGCTGAAGATACAACAAAAGATACTATGTATAATAATGTTGATGTTTTAATTAAATCAAAAAATGGTGTAATTAAAGATTTTAGTAAAAATAATAGAACTATTAATCAAGTTACTATTAATAAGTATATTAAAAATAATTCATCAGTTTATTTAAATGCAACAGGTCATATATCTGTACCAATTAATACATTAGGTACAAGTGATTTTACTTTAGAAGGTTATTTTAATTTACCATCAACTCAAATAGATTGGGCTAGATTATTTCAAATAAATAATAATGCAATACAAGGTGGATTATGGTTATTTGTTAAAGCAAACACATTAAAATTACAAGCACAAGGATATTTATCTTCTAATCGTTCTTATTTTGACTTAGGTAAATATAGTGCATTAGACCTAAATATTAATGAATGGAATCATATTTGTATGATGCGCCGTAATGGTATATTTTACATTTATATAAATGGTGTACTTCAATCAACAAGTAGTATAAATAAAACGTATTCAATTGAAGGTAATACTTTATTTATAGGTTCTAATTCTAATAATAATACAGGTGAAGCATTTAAAGGTAATTTTGGTGGTGCTAGACTTAGTTATAAAGTTTGTTATGATATTGAAGGTTTTGAACCACCTAAGCGATTCCCTATATATGATCAACCAAAATTTAAATATACTACGGCGTATTATAATAAAGAAAGTAGCCATGTAAAATTAGTTTGGAATTGTATAGGTAATGAAAATGCAAAATATACAATTTATAGAAGCTTAACACAATTCACTAAAGATAATTTACCTGAACCATTAGATACTAATATTATTGGTGATTTTTATATTGATGATGATTCAACAAAAACTGTTGAATATTATTACATGATAAAATATGATGATGGTATTTTTGTTGAATATAGTGATTTATTTAAATATGTTTCTGAAAATTTATTAGTACATTTGCCATTATTGCATGATTTTGAAACTAATGAAGGTTCAGCAAGCAATAAGTTTAAACATAATGGCATTGTTGATAATCATAATTATGCACTTTATATTAGCCATAATACAGCTTCATATATATATTCTGATTTTTCATTAGATACTAACATTAATTTTAAAATATCTTTTGAATTATTAAGATTAACAAGTTATGGTGTTTCATATCCTGATATAATTTCATTTAGTGAAAATTTGGTAGCTAATGATTTTGCCCTTAGTTTAGGTGGTGATTATGGTAGTTCATTAAAAGATAAATTTTTTGTTGGTCAATCAAATTATTACACTAAAGAATCATCTAAAACTATTGTTAATAATGTTTATTATAATGTTATTTTTGAAAGAAAAGATGGTTATATTAATCTTTATCTTAATGGGGAAATTGTAATAAACTATTTACAATCTGAAACTACAGGTGCATTAAATTTATTCAATGTATATAATTATATTAGACTTGGTTATGCAAAAGGCAATACAACAAGTGGTCAATTTCATGGTTATATTAGAAATTTTAAAATTTATGATTTATCATCTTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
62fcba0e9709ff9832d01956d0d1078b85f5e4da93cef02237ccee01cba2c6c9
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5532
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50