Protein

View in Explore
Genbank accession
XHB27079.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
Protein sequence
MADGSVTIKVDLDGSSAQSGVSKLKTLLGGLESTGSKVGSVFKSVLGANLISSALTTGIGVVTGGIREMAGELNSSQKAWKTFEGNLQAFGRSPEVIKAAKTEMQDFATKTIYSASDMASTYSQLDAVGTKNVGSLVKAFGGLAASAENPAQAMKSLSTQATQMASKPKVAWMDFKIMMEQAPAGMAAVAKEMGMSTAELVSAVQDGKVKTEDFFDAMNRAGNSDAFQKMATEFKTVDQAIDGAKESLANKLMPMFEHLNKFGIKVVNALSDALESIDFGGMADGLGKFLESINLEGIVAKVSGTISSLVGKVKTFWTAFANTGAVSAFIGAIQSIAGAIGHVWESLTASSVLNTLASVLGNVVKWLSQAATVAANFISSLPAGAIQAIVGGLVGLVAGFKAFNFLKSFNPFSLFKKGAEEAVDVATNSVKRSKSTITQLFNGLSNVIKSLGTAIKAAATGIGQGLKAALSGLAPVIRAFGAALKTAGVANILAFGGAIAIAAVGIGAGVAIIAAGFALLATQSQGVSTILQAVGSVIVSVGTAIGTILNLALQGLANALVIVAPVLPTIASAFAQLSPLITAAGSAIATVINSFSSLAPVITALGSALSQVIASISSGIAQIATAVTPIVEIISSAFVQVVTVVSQAIVQIIQALAPFIPAISAMVQAVAPVLQSLVEAFNNLISQISPIIDSLTQLFQTFGEQVSSILESAGSVVESFGSAIRSVLDGVAGIFESMGNAAKNAGQGVKLMAQGVKMLVDLRLGDLVGTLAAVATGLGAVANSGIASAGPGLQQAGNGLRLIAISAQTASLAMQALPSVFSTLNSSIGTLPSVMTTASSAMTTFASATISSFAGLVGSTASISALQSRITALSISMLMAQVGASTMSAGFSSVSSVLGMLGGVLGAITGQFTAITAAAMIARTSIMQLATSVPLVASGFANISSAATSAMSQLNLAVRSAMAQAVATMTSSMAQMVSVVRSSASQMTQAGQQAGRGVSDGVTNGIRSGIGSATAAMSAMVNAIRSTGMAGASAMRGVGAMIGQGLAQGMYSALGAVTAAANALVAQAERAAQAKAKIHSPSRLFRDNVGRYIAQGIAVGIEKNTSDVTDSLAYVQKEMSAFKFEAEELLGVGNSKFTKVVQIKTEIAQAVKAKVEITKHKSDELMSKALDVAKKATEQPVHIDVSGETIATASKKETYKVQKEMKENIDRIEGLFDE
Physico‐chemical
properties
protein length:1218 AA
molecular weight: 123228,91880 Da
isoelectric point:9,27650
aromaticity:0,04844
hydropathy:0,48194

Domains

Domains [InterPro]
DC_1817
ATT
1–76
DC_1817 IPR013491 IPR016024
IPR013491
TAS
139–214
IPR013491
XHB27079.1
1 1218
Architecture
ATT
TAS
STR
ATT 1-76 | TAS 78-260 | STR 333-739 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage phiGBSVK-F1_GBSInt11.2
[NCBI] 		3345078 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Streptococcus agalactiae
[NCBI] 		1311 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XHB27079.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP766240.1 [NCBI]
CDS location
range 23865 -> 27521
strand +
CDS
ATGGCAGATGGTTCAGTTACTATTAAGGTTGACCTAGACGGCTCTAGCGCCCAATCAGGCGTTAGCAAACTTAAAACCTTGTTAGGTGGACTAGAAAGCACAGGCTCAAAAGTTGGGTCTGTTTTTAAGTCAGTTCTAGGAGCTAACCTGATTAGTTCTGCTCTCACTACTGGTATTGGAGTTGTCACTGGTGGTATCCGTGAAATGGCTGGAGAACTGAACAGCTCACAAAAGGCATGGAAGACCTTTGAGGGTAACCTACAAGCCTTTGGGCGTTCTCCCGAGGTCATCAAGGCAGCTAAGACTGAAATGCAAGACTTTGCCACCAAGACCATTTACTCAGCCTCTGATATGGCTAGTACTTACTCTCAACTTGATGCTGTAGGAACTAAAAATGTTGGTAGCTTGGTTAAGGCTTTTGGTGGACTTGCAGCCTCAGCAGAAAATCCAGCCCAAGCCATGAAATCTTTATCTACTCAGGCGACACAAATGGCAAGTAAGCCTAAGGTTGCCTGGATGGACTTTAAGATTATGATGGAACAAGCGCCCGCTGGTATGGCGGCAGTTGCCAAAGAGATGGGCATGTCTACGGCTGAACTGGTTTCAGCGGTTCAAGATGGTAAAGTCAAGACAGAAGATTTCTTTGACGCTATGAACCGTGCAGGTAACTCTGACGCTTTCCAAAAAATGGCTACTGAGTTCAAGACAGTTGACCAGGCAATAGATGGAGCAAAGGAGAGCCTAGCTAATAAGCTAATGCCTATGTTTGAACATCTCAACAAGTTTGGTATTAAGGTGGTCAATGCCCTATCAGACGCTTTGGAAAGCATAGATTTTGGCGGAATGGCTGACGGCCTAGGTAAATTCCTTGAGAGTATCAATTTAGAGGGTATTGTAGCTAAAGTTAGCGGTACTATCTCAAGCCTAGTGGGTAAGGTTAAGACCTTTTGGACTGCCTTTGCCAACACAGGAGCAGTATCTGCCTTTATTGGGGCTATTCAGAGTATCGCGGGAGCTATCGGTCACGTTTGGGAAAGTCTAACCGCCTCAAGCGTGCTGAACACTCTTGCTAGTGTCCTAGGCAACGTGGTCAAGTGGCTTTCACAGGCTGCAACCGTAGCAGCTAACTTTATCAGCTCACTACCTGCTGGAGCAATCCAGGCGATAGTGGGCGGTTTGGTTGGTTTAGTTGCTGGTTTCAAAGCCTTTAACTTTCTGAAATCCTTTAACCCATTCAGTCTATTCAAGAAAGGTGCAGAGGAAGCTGTAGACGTAGCTACAAACAGTGTTAAACGCTCAAAAAGTACCATTACTCAACTATTCAATGGACTGTCAAATGTCATTAAGTCACTAGGGACAGCTATAAAAGCTGCCGCAACTGGAATAGGTCAAGGGTTAAAAGCGGCACTATCAGGACTTGCTCCTGTTATCCGTGCCTTTGGCGCAGCCTTAAAAACAGCAGGAGTTGCAAATATTCTCGCCTTTGGTGGTGCTATTGCTATTGCAGCGGTTGGGATTGGTGCAGGAGTTGCAATTATAGCGGCTGGTTTTGCACTTTTGGCAACACAGAGCCAAGGCGTTTCAACTATCTTACAGGCGGTTGGTAGCGTCATTGTCAGCGTAGGAACAGCTATAGGTACAATCCTTAACTTAGCACTCCAAGGCTTGGCTAATGCTCTTGTCATTGTGGCACCAGTACTACCTACCATTGCCTCGGCTTTTGCTCAACTGTCACCGCTCATCACAGCGGCTGGCTCTGCAATCGCTACGGTAATCAACTCCTTTAGTAGCCTTGCCCCTGTAATAACCGCCCTAGGTTCTGCCCTAAGTCAGGTCATAGCGTCGATAAGCTCAGGAATAGCCCAAATTGCTACGGCAGTGACCCCTATTGTTGAGATTATTTCTAGCGCCTTTGTCCAAGTTGTAACCGTGGTATCTCAGGCAATCGTCCAAATCATTCAGGCACTAGCTCCATTCATTCCAGCTATTTCAGCAATGGTTCAGGCGGTCGCTCCTGTACTCCAATCCCTAGTAGAGGCGTTTAATAACCTCATCAGTCAAATCAGCCCTATCATTGATAGCTTGACCCAGCTATTCCAAACTTTTGGAGAGCAGGTCAGCTCAATTTTAGAAAGTGCTGGTAGCGTGGTAGAGAGTTTTGGCTCTGCTATCCGAAGTGTACTTGACGGGGTTGCTGGCATTTTTGAAAGTATGGGTAATGCGGCTAAGAACGCTGGTCAAGGCGTTAAGTTGATGGCTCAAGGTGTTAAAATGCTGGTAGACCTAAGGCTTGGAGATTTGGTAGGAACTTTAGCAGCCGTAGCAACTGGATTAGGGGCTGTTGCTAATTCAGGTATCGCCTCAGCCGGTCCAGGTTTGCAACAAGCAGGAAATGGCTTGAGACTTATAGCTATATCAGCTCAAACAGCTAGCTTAGCTATGCAAGCCTTACCTAGTGTTTTTAGCACGCTTAACTCAAGTATTGGTACACTACCTAGCGTAATGACTACAGCCAGTTCAGCTATGACTACCTTTGCAAGTGCCACTATTTCCTCTTTTGCAGGTTTAGTAGGTTCAACAGCTAGTATTTCAGCGTTACAAAGTCGAATTACAGCCTTGTCAATCTCAATGCTTATGGCTCAAGTTGGAGCCTCAACAATGTCAGCAGGTTTTTCATCAGTTTCATCAGTGCTTGGAATGCTTGGAGGAGTTCTAGGAGCAATAACTGGACAATTTACAGCAATAACTGCAGCGGCTATGATAGCTAGAACATCAATCATGCAACTAGCTACCTCAGTTCCTTTGGTTGCCTCAGGTTTTGCTAATATTTCAAGTGCTGCTACCTCAGCAATGAGTCAGCTTAACTTAGCTGTACGTTCAGCTATGGCACAAGCAGTAGCAACTATGACATCAAGCATGGCTCAAATGGTATCCGTGGTTCGTTCATCAGCCAGTCAGATGACACAAGCAGGACAACAAGCTGGGCGTGGAGTATCAGACGGTGTTACTAATGGTATACGTAGTGGAATTGGTTCAGCAACAGCTGCTATGTCAGCTATGGTAAATGCTATCCGCTCTACTGGGATGGCTGGTGCTAGTGCTATGCGTGGAGTTGGTGCAATGATTGGCCAAGGTTTGGCTCAAGGTATGTATTCAGCGCTGGGAGCAGTTACAGCTGCAGCTAATGCACTAGTTGCCCAAGCTGAGAGAGCAGCACAAGCTAAGGCTAAAATTCACTCACCGTCTCGACTCTTTAGGGACAATGTAGGCCGTTACATCGCCCAAGGTATTGCTGTAGGTATTGAGAAAAATACTTCTGATGTGACTGATAGCTTAGCGTATGTTCAGAAAGAGATGTCAGCCTTTAAATTTGAAGCCGAGGAGTTACTAGGCGTTGGTAATAGTAAGTTTACTAAGGTTGTTCAAATCAAAACAGAAATAGCACAAGCTGTTAAAGCAAAAGTTGAGATTACTAAACATAAATCAGATGAACTGATGAGCAAGGCACTTGATGTTGCTAAGAAAGCAACAGAACAACCTGTACATATTGATGTAAGTGGTGAAACAATTGCTACTGCATCAAAAAAAGAGACTTATAAAGTCCAAAAAGAAATGAAAGAGAATATAGATAGAATTGAGGGGCTATTTGATGAGTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
547a5bffeca41571102c754eea678ed85e66412e9df9c759d3893302ec84a1d0
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5170
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50