Protein

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Genbank accession
YP_007674604.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,59
Protein sequence
MPLNKLDSIIKNTEGRILYVSPSDLDSTDSISNQGNSLARPFKTIQRALIESARFSYVKGNNNDETEKTTILLMPGNHVVDNRPGYSINSSGTTSTPDGTAIRDYQLTLDSVFDLTQKDNDLYKFNSVNGGVIVPRGTSIVGLDLRKTKIRPLYVPNPTDDDVLNSAIFRITGACYLWQFSIFDGDEFGTVYTQPDNFELKSTPTFSHHKLTVFEYADGVNDVGTQGVTDLAMYYAKLSKAYSAGSGREVDPLDRFPGNKEGFTSVRPEFEIVGAFASDPIVITSIISGDGATPTRTITVTTQVPHGLDVGTPIRIKDVSDSQYNISTRVTEVSTISDNIFFYTISSDPALISPTATPNEGTVTIETDTVSGASPYIFNISMRSVWGMNGMHTDGSKATGFRSMVVAQFTGISLQKDDRAFVKYIPSSREYRNDFYSSGTTQTGSVLSSKSSSSGIVYHLDSDAIYRKGWEQTHIKMSNDAIVQIVSVFAIGYNKHFEAQSGGDASVTNSNSNFGQLSLISEGFKKEAFEKDNKAFITHIIPPRALHSIEEDIDWLTLDQDATNTSTKLYLFGFDNEDVKPPILTQGYRVGAKVNDKLFLTVGGTEYSADILMSDGSSSFKEYPVTSGPSSNIFTTGTHGIVTGEKVIIISDDGDLPENLRTNTVYYAIAPNNTTVKLAASEAEALADEPITVYGGTNLKILTRVSDKQSGDAGHPVQWDGSQWYINVTNAGTMASAINSLSGATEPTIIKRTPDNRSLDEKIYKVRVVVPSQLSNAKTPEAGFVLQESSTTGYVGTADTNRTTIDSTNYDYNRNPRFISTCSFSNPTDTVTVITELPHSLKVGDSVTIKNVTDSTNTTGLIDKGYNGTYNVDSVSATNDLEFTYTTTSTPGTFTNNVNERTTSLPRFERTDLQSNLYVYRNEIISEYSDGDSNGVYHLYTLNSNNAIQNEFTNLEYSQNVTDLYPQLDRDNPNDDPNSATTYALRSPIGEVQTDDLKKSITRESANLLLTSLGIGLDIASVTNPTSTTPTITFDRNHNFNSIVTGTLGATSGFTPGTYFNVKIYNNIGLTQWNGATAKVSVAGTTINSVEIMNGGSNYSDGTYFLDTGVIGAGTPNTFTVTSADISSHIGDVVQFTGVGIGTDTYHRIDSVTGRNSISIARTTGDPVITSDNYAFITAPSVAFTASGDVVTAPGHGLVVGNKFRVIGINTSNFGDYIVESSTLNEFEVTGGIGTASGFILKHGLSSNSGVSDRSNENLQSRAITVFDGETLTLSESGGIDATSTAFSVSSPGIAGTMTRFPLGSYIQIDNEIMRIASDSLSGTPTDEITVIRGALATSPVTHVENSTIRKIKVPSIEFHRPSIIRASGHTFEYLGYGPGNYSTGLPQVQDRTITEREEFLSQAQERSSGLVVYTGMNNKGDFYIGNQKKSSATGEETNFDIPVPTVTGEDPSRLSAVFDEVTIKERLVVEGGDSGQVLSQFGGPVTFDKDVRIKEELKVTGDTKLKNLSSTTNILPINDNVDVDGSITADQFIATTPSFTNINGNDIYHMLRSNGTQGLITSGEVTNALGFTPASIGSITGDFPLGNSIVVDDISSQFNGTLTDFALLRASAAFIPAGSSANLIVSLGGVIQKPGSDYFIVQSGGENTNTIRFTTAPLSGTSAFIIGLGGQGSLISNLDWDTKGEIIVATGNNSAAKVQVGQNGYALTADSNQTTGVSWQPSVPRGSVFYVATATTPAGYLYCDGTRIPTSGTFQGIAASLLQDLRTLLGTSYGATGTLPNLVNRFAGYSATPGNTGGSANATLVSHSHTVTGSTNQRGGIARWRPATPSPSVTHGGGDVILFDEGNVGDGEETDFNNGVQLRLDTRHTHTVSGTAGNQGSSATNKNLPPYLGMRPIIKY
Physico‐chemical
properties
protein length:1901 AA
molecular weight: 203482,20260 Da
isoelectric point:4,85385
aromaticity:0,08206
hydropathy:-0,27685

Domains

Domains [InterPro]
DC_0066
STR
1–1085
DC_0066 SSF88874
IPR023366
STR
819–899
IPR023366 DC_0066
YP_007674604.1
1 1901
Architecture
STR
STR 1-1901
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-SKS1
[NCBI] 		754042 Uroviricota > Caudoviricetes > Llyrvirus >
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_007674604.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_020851.1 [NCBI]
CDS location
range 172009 -> 177714
strand -
CDS
ATGCCATTGAATAAACTAGATTCTATTATTAAGAACACTGAAGGTCGTATATTATATGTAAGTCCATCAGATTTAGACTCGACTGATAGTATTAGTAATCAAGGAAACTCACTTGCTCGTCCGTTTAAGACAATTCAGAGAGCATTAATTGAGTCTGCGAGATTTTCATATGTAAAGGGAAATAATAACGACGAAACAGAGAAAACTACAATTCTCTTGATGCCTGGTAATCATGTAGTTGATAATCGTCCAGGTTATTCTATTAATAGTAGTGGAACAACAAGCACTCCTGATGGAACTGCGATAAGGGATTATCAGTTAACATTGGATTCCGTTTTTGACTTAACACAAAAAGATAATGACCTTTATAAGTTTAATAGTGTAAATGGTGGTGTAATTGTTCCTCGTGGAACTTCAATTGTCGGTCTTGATTTAAGAAAGACCAAGATACGCCCTCTTTATGTTCCGAATCCAACTGATGATGATGTACTAAATTCTGCAATATTTAGAATTACTGGAGCATGTTATCTCTGGCAGTTCTCTATTTTTGATGGAGATGAATTTGGAACAGTTTATACACAACCAGATAATTTTGAACTTAAATCAACTCCAACATTTTCACACCATAAACTTACGGTATTTGAATATGCCGATGGTGTAAATGATGTCGGCACTCAAGGTGTAACAGACCTTGCGATGTATTATGCAAAACTATCAAAAGCATATAGTGCCGGATCAGGTCGAGAAGTTGATCCTTTAGATAGATTCCCTGGAAATAAAGAAGGGTTTACTTCAGTAAGACCAGAGTTTGAGATTGTTGGTGCATTTGCATCAGATCCTATTGTAATCACATCAATTATATCAGGTGATGGTGCAACACCAACAAGAACAATTACTGTCACAACACAAGTTCCTCATGGATTAGATGTAGGAACACCAATTCGTATTAAGGATGTATCAGATTCTCAGTATAATATTTCAACTAGAGTTACAGAAGTTAGTACTATTAGTGATAATATCTTTTTCTATACTATATCATCTGATCCAGCACTAATTTCACCTACAGCAACACCAAACGAAGGAACCGTAACAATTGAAACTGATACTGTTTCTGGTGCTTCTCCTTACATCTTTAATATCTCTATGCGTTCTGTATGGGGTATGAATGGAATGCATACTGATGGATCCAAAGCAACTGGATTCCGTAGTATGGTCGTGGCTCAATTTACTGGGATTAGTCTTCAAAAAGATGATAGAGCCTTTGTAAAGTATATTCCATCATCTAGAGAATATAGAAATGATTTTTATTCATCAGGAACAACACAAACTGGTTCAGTATTATCTTCAAAATCTTCATCTAGTGGAATTGTATACCATTTAGATTCTGATGCAATCTATAGAAAAGGATGGGAACAAACTCATATTAAGATGAGCAATGATGCAATTGTTCAAATTGTTTCAGTTTTTGCGATTGGATATAACAAGCACTTTGAGGCACAGAGTGGTGGAGATGCCTCTGTAACCAACTCAAACTCCAACTTTGGTCAATTATCACTAATCTCTGAAGGATTTAAGAAAGAAGCATTTGAGAAGGATAATAAGGCATTTATTACTCATATTATTCCTCCAAGAGCATTACATTCAATTGAAGAGGATATTGATTGGTTGACTCTTGATCAGGATGCAACAAATACTTCAACTAAATTATATCTCTTTGGATTTGATAATGAGGATGTAAAACCACCAATTCTTACACAAGGTTATCGTGTTGGTGCAAAAGTAAATGATAAACTTTTCCTTACTGTTGGAGGAACAGAATATTCGGCAGATATTTTAATGTCGGATGGTTCTTCATCATTCAAAGAGTATCCGGTAACTTCTGGACCTTCATCAAATATATTCACGACAGGAACACATGGAATAGTAACAGGTGAAAAAGTTATCATTATTAGTGATGATGGAGATCTACCAGAAAATTTAAGAACTAACACAGTTTATTATGCAATTGCTCCAAATAATACGACTGTTAAACTTGCCGCATCAGAAGCAGAAGCACTTGCAGATGAACCAATTACAGTATATGGTGGAACAAATCTAAAAATTCTTACGAGAGTTTCTGATAAACAATCTGGTGATGCCGGACACCCAGTTCAGTGGGATGGAAGTCAATGGTATATTAATGTAACTAATGCCGGTACTATGGCATCAGCCATAAATTCCCTATCTGGTGCGACAGAACCAACTATTATTAAGAGAACACCAGATAATAGAAGTTTAGATGAGAAAATTTATAAAGTTAGAGTTGTAGTTCCAAGTCAACTTTCAAATGCAAAGACACCAGAAGCAGGATTTGTTCTTCAAGAATCTAGCACAACTGGATATGTAGGAACTGCTGATACGAATAGAACTACTATCGATTCTACTAATTATGATTACAATCGTAACCCAAGATTCATTAGCACTTGTTCATTCTCAAACCCAACAGATACAGTCACTGTTATTACAGAATTACCTCACAGTTTAAAAGTTGGAGATTCAGTCACTATTAAAAATGTAACTGATTCCACAAACACGACTGGATTAATTGATAAGGGATATAATGGAACATATAATGTCGATAGTGTTTCTGCAACAAATGATTTAGAATTTACATATACAACAACATCAACTCCAGGAACATTTACAAATAATGTAAATGAAAGAACAACATCACTTCCAAGATTTGAGAGAACTGACCTACAGTCAAATCTTTATGTTTATAGGAACGAGATAATCTCTGAATATAGTGATGGAGATTCAAATGGTGTGTATCACCTTTATACGCTGAATTCTAATAATGCAATTCAGAATGAATTTACAAATCTCGAATATAGTCAAAATGTAACTGATTTGTATCCACAACTTGATAGAGATAATCCTAATGATGACCCCAATTCAGCAACCACATATGCCTTAAGGTCTCCAATTGGAGAAGTTCAGACAGATGACCTTAAAAAGAGTATTACAAGAGAAAGTGCCAACTTATTACTAACATCACTCGGCATTGGTCTTGATATTGCATCAGTCACAAATCCAACATCAACAACACCAACTATTACTTTTGATAGAAATCACAACTTTAATAGTATTGTAACTGGAACTCTTGGTGCAACATCAGGGTTTACTCCAGGAACTTATTTTAATGTAAAAATTTACAATAATATAGGATTGACCCAATGGAATGGAGCAACGGCAAAAGTTTCTGTTGCCGGAACTACTATAAATTCTGTAGAAATAATGAACGGAGGTTCTAATTATTCTGACGGAACATATTTCTTAGATACTGGTGTAATCGGAGCAGGAACTCCTAATACATTTACGGTCACTTCTGCTGATATTTCATCTCATATTGGAGATGTAGTTCAGTTTACTGGTGTTGGAATAGGAACTGATACTTATCATCGTATTGATAGTGTCACTGGTAGAAATAGTATTTCAATTGCAAGAACAACTGGTGATCCGGTAATTACTTCAGATAATTATGCATTTATAACGGCACCTTCTGTTGCATTTACTGCTTCTGGGGATGTTGTTACTGCCCCTGGTCATGGATTAGTAGTCGGTAATAAGTTTAGAGTAATCGGTATTAACACTAGTAATTTTGGAGATTATATTGTTGAATCCTCCACACTTAATGAATTTGAAGTTACTGGTGGAATTGGAACAGCATCAGGATTTATTCTGAAGCACGGATTATCATCAAATAGTGGTGTTTCTGATAGGTCAAATGAAAATCTTCAGTCAAGAGCAATTACTGTTTTTGATGGAGAAACATTAACTCTTTCTGAATCTGGTGGTATTGATGCTACTTCAACAGCATTCTCTGTAAGTAGTCCTGGTATTGCCGGAACTATGACAAGGTTCCCATTAGGTTCTTATATTCAGATTGATAATGAAATTATGAGAATTGCGAGTGATTCTCTGAGTGGAACTCCTACAGATGAAATTACCGTTATTCGTGGAGCACTTGCTACTTCACCCGTAACACACGTTGAGAATTCAACAATTAGAAAGATTAAAGTTCCTTCAATTGAGTTCCATAGACCATCAATTATTCGTGCTTCTGGTCATACATTTGAGTATCTTGGATATGGTCCTGGAAACTATTCTACGGGTCTTCCACAGGTTCAGGACAGAACAATCACAGAAAGAGAAGAGTTCTTGTCACAGGCACAGGAAAGGTCTTCTGGTCTCGTTGTTTATACTGGTATGAATAACAAAGGTGATTTCTATATTGGAAATCAGAAGAAATCATCTGCAACTGGTGAAGAAACTAATTTTGATATTCCAGTTCCGACTGTGACTGGTGAAGACCCATCAAGATTAAGTGCAGTATTTGATGAAGTTACAATTAAAGAAAGATTAGTTGTAGAAGGTGGAGATTCTGGACAGGTTCTCTCACAATTTGGTGGTCCTGTTACTTTTGATAAAGATGTAAGAATCAAAGAAGAACTTAAAGTTACTGGTGACACTAAATTAAAAAATCTTTCATCAACCACAAATATTCTACCTATTAATGATAATGTTGATGTTGATGGATCTATCACAGCAGATCAGTTTATTGCAACAACACCATCATTCACAAATATAAATGGAAACGACATATATCATATGTTGCGTTCCAATGGAACTCAAGGTCTCATAACAAGTGGAGAAGTTACAAATGCACTTGGATTTACTCCTGCTTCGATTGGATCAATTACTGGAGATTTTCCTCTTGGCAACTCTATTGTAGTTGATGATATTTCATCACAATTTAATGGAACTCTTACAGATTTTGCATTACTTCGTGCTAGTGCCGCATTTATACCTGCCGGAAGTTCTGCAAACTTAATTGTTTCTCTTGGTGGAGTTATTCAAAAACCAGGGTCTGATTATTTTATTGTTCAATCTGGAGGAGAAAACACAAATACAATAAGGTTCACGACAGCACCTTTATCTGGAACAAGTGCTTTTATTATTGGACTTGGTGGACAAGGAAGTTTAATTAGTAATCTTGATTGGGATACTAAAGGTGAAATTATTGTAGCAACCGGAAATAATTCTGCTGCAAAAGTTCAGGTTGGGCAGAATGGATATGCTTTAACTGCCGATAGTAATCAAACTACCGGAGTGAGTTGGCAACCATCAGTGCCTCGTGGTTCTGTATTTTACGTGGCAACAGCAACAACACCAGCAGGGTATTTGTATTGTGATGGTACTAGAATTCCAACATCAGGAACGTTCCAAGGCATTGCTGCATCATTATTACAAGACCTTCGCACTTTATTGGGCACATCATATGGAGCAACGGGAACTCTTCCCAATTTAGTGAATAGATTTGCAGGTTATTCTGCAACACCTGGTAATACTGGTGGTAGTGCTAATGCCACATTAGTTTCTCATAGTCACACCGTTACTGGATCTACAAATCAAAGAGGTGGAATTGCTAGATGGAGACCTGCTACTCCAAGCCCCAGTGTAACACATGGTGGTGGTGATGTGATATTATTCGATGAAGGTAATGTAGGTGATGGTGAGGAAACTGATTTTAATAATGGTGTTCAGTTAAGATTGGATACTCGACATACTCATACTGTCAGTGGAACTGCCGGTAATCAAGGTTCTTCTGCAACCAATAAAAACCTACCACCATATCTTGGAATGCGTCCAATTATTAAATACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6e8a5bec529203bc26e55ec562eb64a3871d5a9239eaf27942fd98f072e1d2e4
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8368
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Synechococcus phage S-SKS1 Henn,M.R., Clokie,M., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank