Genbank accession
AUO78257.1 [GenBank]
Protein name
RCC1 domain-containing protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MKENKLIQRGRYFDTIYEIEDFEPEFDKYDFVKMFTSKYIDCTYGLKSDETLWVTGNNQVVGKYSPRNNNISRRVDTFTKIDGVSNIKDIAIGSEHTVILKKDGTLLGVGQNSNGALGLGGDITVATTFTKLPIEDVVKVVVGSGLTIALKSNGELYFTGYNGSQQFDNLENTNTFIKLSITDVKDIDCGDGFTFILKTNGELYSCGSNSYGQLGLGDNTNRNTFTKVNIDNVKEISCGRYNSFIIKNDDSLYGCGYNTEGQLGLGDITNRNVFTNMALNVKKVVYGINSTIILKNDDSLYGCGRNTYGQLGLRNVPNPKTFIKIGINNIKDIYCGNNHTIMIRNDNKLLFCGTNRESQIGNPNNINYPVDVFTEYKSAEVLGYNKSVTMNNKNYLIKENGDYICYGNIKKIVSVEGSTYALLENGELWVSGNNTDGQLGLNHKVTQNYFTRVPIDNIRDVVCGAYYAFIIKNDDTVWVTGLNNSGQLGTGNTSQLQKFTKISIDNVKKIACGRSHVLILKNDNSIWGAGAGYYLGIGTTSSTGITSFTKVPIDDVRDIACGYECSIILKNDNSIWGAGANHSGQLGKTSNNSVEKYFIELSINKAVKVKEIYCGIYHTLILKTNGELYGCGSNTQGQLGRRISTDKLEQFTLIETDTTHICNNHCESYNTLIIDSIGRLKATGQNNYNQLGLENNKTTLIESFTPTNIVIGQGNNRYIAGGSDCTFLVKTDGKVYGIGNRLNGRFGTGSDSVAASTFTRIGFEFNSTEIDYNNDFRIATTNVNDYMSVFLKKSNGELYGVGNNTYGQLGIGNNSTCHYFYPINIKNIKDVICGLNYTLILKKDGELLVTGNTSSQKALDTKTLLTSEPYRFNQVSTISNVEKVVCGSLIVFALLGDGRLYSTGTNTYGQLGLGDIANRDSFARVNINNVKEIACGISHTLILTSNGELYATGRNDEGQLGLGDNTNRNTFTKVNINNVRKVICGAYYTLVLTNDGELYATGRNKEGQLGLGDIVNRDTFTKVNIDNVKEISCGLDHTLVLKNNGELYGCGSNGQGQLGLGDNTGRNTFTKINIDNVKGINAGGRSSYIYKNDGSVFSTGQNTYGLLGLGDVTNRNIFTKVNIKIFDFEKITDCIVNNNFNLVNNKFLIPTKDTKYQHYVTSSDDFNYNEILGSQYPVSPYANEVLELPFNNIKEFWMSKTHSLIVNTDGELYGCGKNTYGQLLNPLTTTSLLEFTKLNFDNIKQASCGNGFSYFVRNDGALFSCGLNSNGQLGLGHNNDVSEPQLITTISNVKKVMCDNNFTLALLNNNELYAQGYNRFGNFGLGEEKKDTIIPLFTKIATNVEDVEIGTNYILLRKTDNTVYISGRIRDCYNIEENNIYVFNEIKTPSSIYKENLVWVNPVNDETVSLIYKVNSVNSTIEIIEKTISGIKLKINDDGNEIIKIEMYINNELITTMTEFTNKYSQFTIPLDKLVLGRNNIVFKGYDNFKGNIYTSLTINKENNSIYVSENSSLLINGKRYTVQSVSESEGKVTVNLDRGLEGNVNVGDIIYQLINRLNVQIKTNNTGMHKDAKLLEMKKVDTGYQEIYEFKENGIKEVEPKIIVNGNEDTAIKRPSMIFSIDETTL
Physico‐chemical
properties
protein length:1627 AA
molecular weight: 180287,49690 Da
isoelectric point:5,90423
aromaticity:0,09342
hydropathy:-0,34087

Domains

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
AUO78257.1
1 1627
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 10 10 0,1910
Central domain 11 279 270 0,7206
C-terminal 280 1627 1347 0,1816
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-10
Central
11-279
C-terminal
280-1627

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Clostridioides phage LIBA6276
[NCBI]
2069614 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Clostridioides difficile
[NCBI]
1496 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Clostridia > Peptostreptococcales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AUO78257.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MF547662 [NCBI]
CDS location
range 43489 -> 48372
strand +
CDS
TTGAAAGAAAATAAATTAATACAGCGTGGAAGATATTTTGATACTATTTATGAGATTGAGGATTTTGAACCAGAATTTGATAAATATGATTTTGTTAAAATGTTTACTTCAAAATATATAGACTGTACATATGGTTTGAAATCTGATGAAACATTGTGGGTAACAGGAAATAATCAAGTGGTTGGAAAATATAGTCCAAGAAATAATAACATTTCACGTAGAGTAGATACATTTACAAAAATTGATGGGGTATCCAATATAAAAGATATTGCAATAGGAAGTGAGCATACTGTAATTTTAAAAAAAGATGGAACTTTATTAGGTGTTGGTCAAAATTCAAATGGAGCATTAGGGCTTGGGGGAGATATTACAGTAGCAACAACTTTTACTAAACTACCTATAGAAGATGTTGTGAAAGTTGTTGTTGGAAGTGGACTTACTATAGCATTAAAATCTAATGGAGAGTTGTATTTTACTGGTTATAATGGTAGTCAACAATTTGATAACTTAGAGAATACAAATACTTTTATTAAATTATCAATAACAGATGTAAAGGATATAGATTGTGGTGATGGTTTTACTTTTATATTAAAAACTAATGGGGAATTATATTCATGTGGTAGTAATTCATATGGACAATTAGGACTAGGAGACAATACTAATAGAAATACTTTTACTAAAGTTAATATAGATAATGTAAAAGAAATATCTTGTGGTAGATACAATTCATTTATAATAAAAAATGATGATTCTTTATATGGATGTGGATACAATACAGAAGGTCAATTAGGATTAGGTGATATTACCAATAGAAATGTATTTACCAACATGGCTCTTAATGTAAAAAAAGTTGTATATGGAATAAATTCTACTATAATTCTAAAAAATGATGATTCTTTATATGGATGTGGACGAAATACATATGGACAATTAGGTTTGAGAAATGTTCCTAATCCTAAAACATTCATTAAAATTGGTATAAATAATATAAAGGACATATATTGCGGAAATAATCATACGATTATGATAAGAAATGATAATAAACTTTTATTCTGTGGAACTAATAGAGAATCACAAATAGGCAATCCAAATAATATAAATTATCCTGTAGACGTATTTACAGAATATAAAAGTGCTGAGGTGTTGGGATATAATAAATCTGTTACCATGAACAATAAAAACTATCTTATAAAAGAAAATGGGGATTATATTTGTTATGGAAACATAAAAAAAATTGTATCTGTTGAAGGTTCGACTTATGCATTACTAGAAAATGGTGAACTATGGGTATCTGGGAATAATACAGATGGACAATTAGGATTAAATCATAAAGTAACTCAAAATTATTTTACTAGAGTTCCAATAGATAATATAAGAGATGTTGTTTGTGGTGCTTACTATGCTTTTATAATAAAAAACGATGATACTGTATGGGTGACTGGACTTAATAATTCTGGGCAATTAGGAACTGGCAATACTTCTCAACTACAAAAATTTACAAAAATCTCCATAGATAATGTAAAAAAAATTGCATGTGGTCGTTCTCATGTTTTAATATTAAAAAATGATAATAGTATATGGGGTGCAGGAGCAGGTTATTATTTAGGAATAGGTACTACTAGTAGTACAGGTATAACATCCTTTACAAAAGTTCCTATAGATGATGTAAGAGATATAGCATGTGGATATGAATGCTCTATAATATTAAAAAATGATAATAGTATATGGGGTGCAGGAGCAAATCATAGTGGTCAATTAGGGAAAACCTCAAATAATAGTGTGGAAAAATATTTTATAGAATTATCTATAAATAAAGCAGTAAAGGTGAAAGAAATATATTGTGGGATTTATCATACATTAATATTGAAAACTAATGGAGAATTATATGGATGTGGTAGTAATACACAAGGACAATTAGGAAGAAGGATTTCTACAGACAAATTAGAACAATTTACTTTAATAGAAACTGATACCACTCATATATGTAACAATCATTGCGAATCATATAATACACTTATAATAGATTCTATCGGAAGGTTAAAAGCTACTGGTCAAAATAATTATAATCAATTAGGTTTAGAAAATAATAAAACTACACTAATAGAAAGTTTTACTCCTACAAATATTGTAATCGGACAAGGTAATAATAGATATATTGCTGGTGGTAGTGATTGTACATTTTTAGTAAAAACTGATGGTAAAGTGTATGGTATAGGAAATAGACTTAATGGAAGGTTTGGTACAGGTTCAGATAGTGTAGCAGCATCTACATTTACAAGAATTGGTTTTGAATTTAATAGTACAGAAATAGACTATAATAATGATTTTAGGATAGCAACTACTAATGTAAATGATTATATGAGTGTCTTTTTAAAAAAAAGTAATGGAGAATTATATGGTGTGGGGAATAACACATATGGTCAATTAGGTATCGGAAACAATTCTACATGTCATTACTTTTATCCAATAAATATAAAAAATATAAAAGATGTGATATGTGGATTAAATTATACCTTAATATTAAAAAAAGATGGAGAGTTATTAGTTACAGGTAATACTTCAAGTCAAAAAGCATTAGACACCAAAACCTTGTTAACTAGTGAACCGTATAGATTTAATCAAGTGAGTACTATAAGTAATGTAGAAAAGGTTGTATGTGGTTCACTAATTGTTTTTGCGTTACTTGGTGATGGAAGATTATATAGTACAGGAACTAATACATATGGTCAATTAGGATTAGGTGATATTGCCAATAGAGATAGTTTTGCAAGGGTCAATATAAATAATGTAAAAGAAATTGCGTGTGGGATAAGTCATACATTAATATTAACAAGTAATGGAGAATTATATGCCACAGGGAGAAATGATGAAGGTCAATTAGGACTAGGAGACAATACTAATAGAAATACTTTTACTAAAGTTAATATAAATAATGTAAGAAAAGTAATATGTGGTGCTTATTACACATTGGTGTTAACAAATGATGGAGAATTATATGCTACTGGAAGAAATAAAGAGGGGCAGTTGGGACTAGGTGATATTGTTAATAGAGATACTTTTACTAAAGTTAATATAGATAATGTGAAGGAAATATCCTGTGGTCTTGACCATACATTAGTATTGAAAAATAATGGAGAATTATATGGATGTGGGAGTAATGGACAGGGGCAATTAGGATTAGGAGATAACACTGGCAGAAATACTTTTACTAAGATTAATATAGATAATGTTAAAGGTATTAATGCAGGTGGTCGTTCATCTTATATTTATAAAAACGATGGAAGTGTTTTTTCTACTGGACAAAATACATATGGATTATTAGGATTGGGTGATGTTACTAACAGAAATATTTTTACTAAGGTTAATATTAAAATTTTTGACTTTGAAAAAATAACAGATTGTATAGTCAATAATAATTTTAATTTAGTAAATAATAAATTTTTAATACCTACAAAAGATACTAAATATCAACATTATGTAACTTCGTCTGATGATTTTAATTACAACGAAATACTAGGCTCTCAATATCCTGTTTCACCTTATGCTAATGAAGTATTAGAATTGCCTTTCAATAATATAAAAGAATTTTGGATGTCTAAAACACATTCTTTAATTGTTAATACTGATGGAGAATTATATGGATGTGGTAAAAATACTTATGGACAATTATTAAATCCATTAACAACAACTTCTTTGCTAGAGTTTACTAAGTTAAACTTTGATAATATTAAACAAGCTTCATGTGGAAATGGATTTTCATATTTTGTTAGAAATGATGGAGCTTTATTTTCTTGTGGTTTAAATTCAAATGGTCAATTAGGACTGGGTCATAATAATGATGTTTCTGAACCTCAACTGATTACAACAATATCTAATGTAAAAAAAGTAATGTGTGATAATAATTTTACATTAGCTTTATTAAATAACAATGAATTGTATGCACAAGGATACAATAGATTTGGTAACTTTGGTTTAGGTGAAGAGAAAAAAGATACTATAATACCTTTATTCACTAAAATTGCTACAAATGTGGAAGATGTAGAAATAGGCACTAATTATATTTTACTTAGAAAAACAGATAATACAGTTTATATTAGTGGTAGAATAAGAGATTGTTATAATATAGAAGAAAACAATATATATGTTTTTAATGAAATTAAAACACCTTCTAGTATATACAAAGAAAATTTAGTATGGGTTAATCCTGTAAATGATGAAACTGTATCTTTAATTTATAAAGTAAATTCAGTTAATTCAACTATTGAAATTATTGAAAAAACAATCTCTGGAATAAAGTTAAAAATAAATGATGATGGTAATGAAATTATAAAAATAGAAATGTATATAAATAATGAGTTGATTACTACTATGACAGAATTTACAAATAAATATTCTCAATTTACCATACCATTAGATAAATTAGTTCTTGGGAGAAATAATATTGTATTTAAAGGATATGATAATTTTAAAGGAAATATATATACTTCTTTGACAATAAATAAAGAAAATAATTCTATATATGTATCTGAAAATTCAAGTTTATTAATTAATGGAAAAAGATATACTGTTCAATCTGTTTCAGAATCTGAGGGTAAGGTCACAGTAAATTTAGATAGAGGTTTAGAAGGAAATGTTAATGTGGGTGATATAATATATCAATTAATCAATAGGTTAAATGTTCAAATAAAAACTAATAACACTGGTATGCATAAAGATGCTAAATTGCTAGAAATGAAAAAAGTTGACACAGGTTATCAAGAAATATATGAGTTTAAAGAAAATGGAATTAAAGAAGTAGAACCTAAAATTATTGTAAATGGAAATGAAGATACAGCAATAAAAAGACCATCTATGATATTTTCTATAGATGAGACTACACTTTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8775e13228eac161341cc6b464d6c8981d7bcef507112601666e71ca05e1cd09
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6981
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50