Protein

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Genbank accession
YP_009005250.1 [GenBank]
Protein name
collagen-like protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MIIQTAAATAAWKASQRTLDTVVTIDGTDYHTSDITSIAYDGGAFTGDTFSIGSTYENSVTITFSHLVEGFVQGQLVAPKVGVKLADGTFEYSPLGIFVISDDIEMDRNNDVTTIKAYDLMCMLEGTYTSKLTYPAKMTDVIAEIASLSGVPLNSDDIARLPLMNNLAKAITGQTYRNAIGWIAQFYSGFALFDRDGKLTIRTINDTDYAIDAGQYLQGGLTKNEAAYVIGGIQCQVTTTTTDSDGNSTDDTVTLQSGSSAGSQVQLTNNVMTQERLDAIWTKLQNLTFYPFSLNWFGNPAIEAGDWFALQDTKGNRFNVPNCSYTMTFDGSFSSVSSAQQTSTSSDIYSYNGDLTSAINKLKSQTAGLNSYTHIAYADDATGKGFSQDPTGKAYLGVYTDSNSIDSKDPAKYVWMKTKGSDGTAGEKGDTGPAGPQGIKGDAGSNGQTSYLHIAYADSADGKTNFSITSAGLRQYIGTYTDFTSTSSSDPTKYVWQQTKGDTGAQGPAGTDITAITYGSTAPSSPKEGDVWYKPNGNSIQIEIYHNGSWVLDIDDSIGQRITDATKDVLASAKTYTDDTAKNVIAELSSANKIVNSEFDTDTAQKNVVESSTTVPTPNSKGYADQTIVGRNLLRNTSAFANTDHWSNSGGGSSLAIVSHAFYQNGQGKLLKLSTSGTTEVFLMSEHFSVQAGESYTFQLKAFNNSNVASMDFFVLGRPTGSTSDYTKIVASKLNMQPSISGIGTFSFSFTVPDGIGELYIRVDNNGSKVSGSSADLYVAEMKLEVGSLTPYIKASEDLAIANWQDTIVHDPVDGTYVVSGTTSTKASTVQVKNSAGTIVASQDLSQPKNSDQTFTQGSFSAVTHDNDDGTGTASIPTPAAGTSLIVVDELNKNIYSNNNMSVPNLAKDSEMLLGLSGTDSDPHFSYNLAGFVSIVANGYNGHNVLDIKRSSGSGTLVAITAYQNSVPGDAWSMGFYYRVLTDTTFSNDSSCYFDPRTSTGTAATVQGKTILTAGTAWKHVKVEDAVMPSTTAKVRFRFDMLGTGHIQIALPMMVKAVKAVDYVSDTIDVSKWAATLPADGKSYKATIKAPKDTTATILNFNMLTAIDRYNFSFSFPAIMGNYTLALSEATYSFAVQQNLFPVTSNGYVVSKTGVISGKAPNNTSVIYLLSSSAGSYSTGVQSDGSFAIAVNTDGSSYTIHAEYQQSYLGLTDWHDFSPDLPASSYISANELVSGSKVIEVTNNTLYADDIPSFANVAISVGAQFKLISGTAKLAVVFYKNDGTNLGTQSVSIAGSDWTNFSLINIVTPANVDYIRVMVQALSGTVRFTRAILVFSASLPAYTPGIGISGKGVLGLFNNNYVLGMLSNAGAVVSGINGNADGLRLTGKTISLDGDTVATGDFWASQINAIKINAANIVAGELDANIIHVIHLDVSSLTGDITSFIKSNWADPYGNNIDIEGSEISLHDNQKNYEMLIKASEIDINNLNDGSYTKISNGNIEMANSSPTGHIESVGGLLLGENVVDERLNGIYLIANTYGKGGTNHNIDSDSYWAADDVGIAYRNDSTNENFGVAYRYNVTSGLNLFFAPVDFNGYKFNIQGAGETFNLTWVSWSDLSSGWKYPAIHSYGSAAKGGIAIGGNAVYAFGLAGRTQLI
Physico‐chemical
properties
protein length:1655 AA
molecular weight: 176217,90110 Da
isoelectric point:4,71482
aromaticity:0,09728
hydropathy:-0,16381

Domains

Domains [InterPro]
DC_1421
STR
1–808
DC_1421 DC_1862 IPR012892 DC_1944
G3DSA:1.20.5.320
STR
420–469
G3DSA:1.20.5.320
YP_009005250.1
1 1655
Architecture
STR
STR
RBD
STR 1-808 | STR 849-1182 | RBD 1369-1653 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Oenococcus phage phiS13
[NCBI] 		1432848 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009005250.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_023560 [NCBI]
CDS location
range 27491 -> 32458
strand +
CDS
TTGATTATACAAACTGCAGCTGCCACGGCTGCCTGGAAAGCATCCCAAAGAACGCTTGATACAGTGGTGACAATTGACGGAACGGATTATCACACGTCTGATATAACATCAATTGCCTATGACGGCGGGGCATTTACCGGCGATACATTTTCGATCGGGTCGACTTATGAAAACAGTGTCACGATAACTTTTTCCCACTTGGTCGAGGGTTTTGTTCAAGGACAATTAGTGGCGCCAAAAGTCGGTGTCAAATTGGCGGATGGAACTTTCGAGTACAGTCCGTTGGGAATATTCGTTATTTCAGACGATATCGAAATGGACCGGAACAATGATGTAACGACTATCAAAGCTTACGACTTGATGTGTATGCTGGAAGGAACTTATACCTCAAAACTCACTTATCCGGCCAAAATGACAGACGTTATTGCCGAGATTGCGAGTTTGTCCGGAGTACCGTTGAATTCTGACGATATTGCCCGTTTGCCTCTTATGAATAACCTGGCCAAAGCAATTACCGGACAGACTTATCGAAATGCGATCGGGTGGATAGCCCAGTTTTATAGCGGTTTTGCCTTGTTTGATCGTGACGGCAAGCTGACAATCAGAACGATTAACGATACGGATTATGCGATTGATGCCGGCCAGTATTTACAAGGTGGCCTGACCAAAAACGAAGCTGCCTATGTGATCGGCGGGATTCAATGCCAGGTCACGACCACTACGACTGATTCGGACGGCAATTCGACTGACGACACGGTCACTTTACAGTCCGGCAGCAGTGCGGGCTCGCAGGTTCAATTGACTAATAACGTCATGACCCAAGAACGGCTTGACGCAATCTGGACCAAACTGCAGAATCTGACTTTCTATCCTTTTAGTCTGAATTGGTTCGGCAATCCAGCGATTGAAGCAGGCGACTGGTTTGCTTTGCAGGACACGAAGGGCAATCGATTCAACGTACCGAATTGTTCTTACACGATGACCTTTGACGGCAGTTTTTCTTCTGTTTCGTCGGCCCAACAGACTTCGACATCGTCCGACATTTATTCTTACAATGGCGATTTAACATCGGCTATCAATAAATTAAAATCGCAAACGGCCGGGTTAAATTCCTATACGCATATTGCTTATGCCGATGACGCTACTGGAAAAGGTTTCTCACAAGACCCCACTGGCAAAGCCTATCTGGGCGTTTACACGGATTCCAATTCTATCGATAGTAAGGATCCGGCTAAATACGTTTGGATGAAAACAAAAGGCAGCGATGGAACAGCTGGAGAAAAAGGAGACACTGGACCCGCCGGGCCGCAAGGCATTAAAGGCGATGCGGGTTCCAATGGCCAAACTTCTTATCTTCATATTGCTTATGCCGATTCTGCCGATGGAAAAACGAATTTCAGTATTACTTCTGCTGGATTAAGGCAGTATATCGGAACTTATACGGATTTTACATCGACAAGTAGTTCTGATCCGACTAAATATGTCTGGCAGCAGACTAAAGGAGATACTGGTGCACAGGGACCGGCTGGAACTGATATCACAGCGATCACTTATGGATCGACTGCTCCAAGCAGCCCTAAAGAAGGGGATGTTTGGTATAAGCCCAACGGCAATTCTATTCAGATTGAAATTTATCATAACGGTTCATGGGTGCTCGATATCGATGATTCGATCGGGCAGAGAATTACCGATGCAACCAAAGACGTGCTGGCCAGTGCCAAAACTTATACCGATGATACGGCAAAAAATGTAATTGCCGAATTAAGTTCGGCCAACAAAATTGTCAATTCGGAGTTTGATACAGATACAGCTCAAAAGAATGTTGTTGAAAGTTCAACAACTGTGCCGACTCCTAATTCAAAAGGGTATGCCGATCAAACAATTGTCGGACGCAATCTGCTGAGAAACACGAGTGCTTTTGCTAATACGGATCACTGGAGCAATTCCGGTGGCGGTTCTTCTTTAGCAATTGTTTCTCATGCTTTTTATCAAAACGGTCAAGGTAAATTACTAAAACTTTCGACTTCCGGAACTACGGAAGTATTTTTAATGTCCGAGCACTTTTCCGTTCAAGCCGGTGAAAGCTATACCTTTCAGCTTAAAGCCTTCAATAACTCCAATGTTGCTTCAATGGATTTCTTTGTTTTGGGACGCCCAACGGGCAGCACTTCTGATTACACAAAAATCGTCGCAAGTAAATTAAACATGCAGCCTTCGATTAGCGGTATTGGCACTTTCTCATTTTCTTTTACAGTTCCCGATGGTATCGGAGAACTTTATATAAGAGTTGATAACAATGGTTCTAAGGTTTCCGGCAGCAGTGCCGATCTTTATGTTGCTGAAATGAAATTGGAAGTCGGATCTTTGACTCCTTACATTAAAGCGTCTGAAGATTTAGCTATTGCCAATTGGCAGGATACGATTGTTCATGATCCGGTAGATGGAACTTATGTTGTTTCCGGTACGACATCAACTAAAGCCTCAACGGTTCAAGTAAAGAACTCAGCCGGTACGATTGTTGCATCTCAGGATCTTAGCCAGCCTAAAAATTCCGATCAGACATTTACCCAAGGTAGCTTTTCGGCTGTGACTCACGATAACGACGATGGGACCGGCACGGCCAGTATTCCTACTCCGGCTGCTGGTACTTCTTTGATAGTTGTCGATGAATTAAATAAAAATATTTATTCGAACAACAATATGAGTGTTCCTAATCTAGCTAAGGATAGCGAAATGCTATTGGGACTGAGTGGAACTGATTCGGATCCGCATTTTTCTTATAACTTGGCAGGCTTTGTATCGATTGTTGCCAACGGATATAACGGCCACAATGTCTTGGATATCAAAAGATCCAGCGGTTCCGGAACTTTGGTGGCGATTACGGCATATCAAAATTCGGTTCCAGGAGATGCCTGGTCGATGGGATTTTATTACCGGGTTCTCACTGATACAACTTTTTCAAATGATTCTTCCTGTTACTTTGATCCAAGAACATCAACCGGGACCGCAGCAACTGTACAAGGGAAAACCATTTTAACCGCTGGAACCGCATGGAAGCATGTAAAAGTCGAAGATGCAGTAATGCCAAGTACGACTGCCAAGGTACGCTTTCGTTTCGATATGTTGGGGACTGGTCATATACAGATCGCACTCCCAATGATGGTTAAAGCTGTAAAAGCAGTCGATTATGTATCGGATACAATTGACGTTTCCAAGTGGGCGGCAACACTGCCAGCAGATGGAAAAAGCTATAAAGCTACGATCAAAGCGCCTAAAGATACGACAGCAACAATTTTGAATTTTAATATGCTGACAGCGATTGATCGATATAATTTTTCGTTTTCTTTTCCGGCGATTATGGGAAATTACACGCTGGCTTTGTCGGAGGCGACTTATTCTTTTGCAGTTCAGCAGAATCTTTTTCCAGTTACTTCGAACGGATATGTAGTTTCAAAGACTGGTGTCATTTCCGGAAAAGCACCTAATAATACTTCTGTGATTTACCTTCTGTCCAGTTCGGCAGGAAGCTATTCGACCGGCGTTCAATCAGATGGCAGTTTTGCTATTGCAGTCAACACGGACGGCAGCAGCTATACGATTCATGCCGAATACCAGCAAAGCTATCTTGGCCTGACCGACTGGCACGATTTCAGTCCGGACCTGCCGGCTTCTTCCTATATATCAGCTAATGAACTTGTTTCTGGATCCAAAGTTATCGAAGTGACTAACAATACACTTTATGCTGATGATATTCCGAGCTTTGCCAATGTTGCGATCTCTGTTGGCGCTCAGTTTAAATTGATTTCTGGGACGGCTAAATTGGCCGTTGTTTTTTATAAAAACGATGGAACCAATCTGGGAACCCAATCGGTTTCGATTGCTGGCAGCGATTGGACGAATTTTAGTTTGATAAATATCGTTACACCGGCAAACGTCGATTATATCCGGGTTATGGTCCAGGCACTATCCGGGACCGTTCGCTTTACTCGGGCCATTTTGGTATTTTCGGCCAGTCTGCCGGCTTATACGCCGGGCATCGGGATTTCCGGCAAAGGCGTTCTTGGTTTGTTCAACAACAATTATGTGTTGGGGATGTTAAGCAATGCCGGAGCTGTGGTTTCCGGTATCAACGGCAATGCAGACGGTCTGCGTTTGACAGGCAAAACAATTTCTTTGGATGGCGATACGGTGGCCACTGGCGATTTTTGGGCAAGCCAGATTAATGCGATCAAAATTAACGCTGCCAACATCGTAGCCGGTGAGCTCGATGCCAATATTATTCACGTTATCCACCTGGATGTTTCCAGTCTGACCGGCGATATTACTTCGTTTATTAAATCTAATTGGGCAGATCCTTATGGAAACAATATTGATATTGAAGGATCGGAAATTTCTCTGCATGACAACCAAAAAAACTACGAAATGCTTATCAAGGCCAGCGAGATCGATATCAATAACCTAAACGACGGTTCCTACACGAAAATAAGTAATGGAAATATTGAAATGGCTAATAGTTCGCCAACTGGTCACATCGAAAGCGTCGGCGGTTTATTGCTCGGAGAAAATGTTGTCGACGAACGCTTGAATGGCATCTATTTAATTGCCAACACTTATGGCAAAGGCGGGACAAACCATAATATCGATAGCGATAGTTATTGGGCTGCCGATGATGTCGGGATTGCATATAGAAACGATTCCACAAATGAAAATTTCGGTGTCGCTTATCGCTACAACGTCACCAGCGGGCTCAACCTGTTTTTTGCTCCGGTCGATTTCAATGGCTATAAATTCAATATCCAGGGAGCTGGGGAAACTTTTAATCTGACATGGGTATCATGGTCCGATCTTTCTTCCGGCTGGAAGTACCCAGCCATTCATTCTTATGGTTCAGCAGCTAAAGGCGGTATCGCAATTGGCGGAAATGCCGTCTATGCATTTGGATTAGCCGGGCGTACGCAATTAATTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f56535bdc61a1866e99805e519959bd2fee582faba9c9ca2f04fed53e2868261
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6703
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50