Protein

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Genbank accession
AOO11978.1 [GenBank]
Protein name
short tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPLTRLDNLYSSKTGKYLYVSPDDFNATDELDNRGNSPLRPFKTIQRAFIEVSRYSYLPGANNDRFDQFSIMLMPGNHYIDNRPGLVTETAVEARYFDAGNLLEGNRQEVIDRSVAQVSVQHPDFYYPGDPQTGAWSRFKDAYRLIQKNRDLLIDRATAQIPVDHEDFVYPGDPTVGEWSRYKDAYRLIQKNKDLIAQDAFDLMNANPPSPLPDGYASKCIRDIKILIDSLSLDVHEGGGNKYTRKYIQTYFLDDGTDWVNGSLRGEETQSLVAFAEAARLMKLAITNNYTSTSSPGNEYQDLTVVIGAPNYETDSANDVPNTDPTACSDVQTFIDNLYAIVNTTFSDSDLAANNGNFDLTNVLPAETVSDKISAGHAKCKRDTGFVLDALSLDVHEGGGNRYTRKLLQNYFDSTGNNWVVNGLQGETAESLTAFGQLFTEMKRALTNQLYFKDLTITPGDAIFGNTNSPQENLPSGNPAACADIQTQIDTLGAIVTQIINDENLTNLPDETLSDVISAGLAKCKRDAGIITDGIINDLRTEGNANTITNAKAYFDRFGNPIANGLLGEESESITAFNGIATFAKQAVTNQLFFKDLTISPGPAYANANTPEIPNLASGNAATCVDVQATIDTLIKILTDVIEVGNLDELAAIKVTGVLPSFNYNRALEEWQDNSIVDLANPDNVLYKFNAADGGCIVPRGCSLIGYDLRRTVVRPLYVPDPADTSQPRTSIFNLTGGCYIWQFTIKDGDLSAQSPLYDASAGVGKVYYKKGSTDLAIPEYSHHKICIMEYADSKDLDNYYEKVGKSFQQFQPTIDDGGLEALVQENRIVGPLSDSRTIESIRIDDSATFTGNASNSTILNNVTNAESLEVGYEITSPDVSVVISPNTRIESISGTSVTLNQSISGSGNVSFLASFGYANITIQTKIDHGYFEGQYVAIINSGLSDEINGTWKVTKIDGVNPKIFEYEVYNNTAASLGLVSGQTYLSGEVGGVSTNAVVLAEIDSVESASPYVFNCSIRSTWGQCGMWADGSKATGFKSMVVAQYTGVSLQKDDRAFIRYDALTNTWNQASLTDAFATVPYHTKGDAYWKDDWRNFHIRASDDSFVQCVSVFAVGFFDHFLMESGGDMSITNSNSNFGNTSLHSVGFKGFSFNQDKGGYITDIVPPEIVSTSNEVINQWYTLDVPASNSRTNHTRLYLAGDDIENPDDRPASSINGYRIGAKSGETLSVDLARYAIEPTGPIEFSQTLEPNGFKSYTVGIETLTPNSANVDNYAQDSANQIEDNKALIQAEGYQYIIAKYPELLTKPNITIGKCERDIGYFVDAVVNDLRIGGNINSIQAAEGYYIAGEVAYIAGELNETIDSLDYVKNIMIAAMRNFDYLVRDAETFSGSAIVNVPSTQGLMIGMRVVEYDPSDFTNGLLNIANTPIYTNIPQNAFIKNIISDTQIELGIPGAKLNQGSTRNATGSVSGAFLYFTLENPAWASISPAVDPTITQDAQLDGNGNPLPECQNIATTIEGYFNEIFLVLNTGYTALGGREVDAYNAIIDNKRFIAAEAVYRIANDAAYAGTKLGQGLLASTGETIQDACVDDVENVLSQIAYNVKFGGNNRIYDAAELYLTGAHVQGEEAESIAVFNLARDLAINAMRQETITVQGNHGLTQTINNQVLPEYDQNGQLVTPPCADVALTISTLTALVTTAINGGSIGNKTLPAFSAVTRVEPTSDLTGLSARATLFTLATGGFGGNPNPHDLETGTPVRLVPRPKVGTNPDKRVIRLPKGFDTNTKYYVIAPGRNLYPENFSISNSVITVTEAAGTSFSTANATRATVAGIYRSLVAQPKIDTDGTALARGTGLRYNLTVNADGSIEFGNAVNNLDGIANGGSRYEIGDIVVISDGQLGGSGAPDLEIEITAVSPAEYPGVFDGTETNKLMLATSPENAAAGIYMYSSETDSVDSEVEIVINRFVLDTKYDLHKYKSNVVGASEIETNVAHIFDVPAPNTTPQIVFVRLADDIQGSTLPQLSGSASSISTQTEYFVRYVSNKRVTLHLTAADAESGDRALTFVSGTGSNFYIYANKRPSPLRFDPTYSTASNQTGLWYLNVADESSNGTANYNRYSILSRFHGGNELANDFQTKTDPTLDTRYTRVEDKREKEERVYRMRYVVPSYLETVRDPLNGFVIKTRTDDKRRLIPQRVLLKPIAGNPNNVASFYNPVGANEQIGLNKDELIADQIRTIDPSVVDLLPEQQNLYDPYLAPKVVEFDSKIAATVQSARKVIPAGESDEFIELTLFDHTIVNQSVKNEIFTVVRTNFLQGGFLQPNATQSNENNKITWETVSGNTASSGSAYLQAWFNDVNTAQITLVLKDVQGDIYYDPAGNVIFTQSNGANVQLTDVPNSFGEISPTPRDKSLRDNYLYRVEGSNVYTICPGDTITDDTGQNTYYVHTIEDQGDFDDCFYIFDIDTLQKRIPNQQDGIYYLTCLRGNISPFPTGSGVGENFRNFKFSQPISQLYPINYKNDPLWFQVDGTTGVRDTSIVDVPQTFSAADNYVHGLVTVNDAKGSETKEMVEDIIRNTALDQYSYTNSTTDSSSGDIIDNRIQAQEGNATSGSEDRLIPISGDSQFPTERKLYIELRRPSIARSGNHTFEYLGFGPGNYSTGFPLRQEVVLTDKQDFYAQAKREDGGIVFYTGLNSNGDLYIGNKKVNAITGEETFLESAALVDSEDEDEDIGTLVTTFDSPVTFNSTITVAGKSTLNAPVEINVEANEGDALRVFSNIGAGDDPTLFNGSWRTQSDGDVVISKNQIKAAVFYLNARPKPGAQYGQSYTWRTNYLAGEPSNIVPWQETNYFYASQTVSYGGNDPEAGDIIYKGSSIGQSGSIGWILTNQFKSAETSVQTITADGTQNLTITWIATETNDSIGIKGNSTIRISNFSNPVVNGTWEIVGWDETTSPGQQTLKFRISTPIENGTIYNWADQNTGADLQFSVSNWKETGVLGAETLRTYTEQRGDFRLGINTVSRAAHSAVLTANVDDFTTPRATLDVVGTTFISGKTLVEYNAAGDVSDNRYDDNNLNSDQREGLNGAPLLTQGFIPQDNALLVGGDSNDLEQRATLRVATTDAATVDQGIGYQTGGRLGINTTLGLQARDELDRNLVVVGDGRITGNMLLEQDISVDGGDINTTSETFNLINNNANIINFAGDAQLIDMFSNTTNDQTITIGSNANFQTVRIGNNSGRSIFSVHALSANALVDIASVADDATNASQVFIGGAWANTDSKVALGSAQTLAAGNLEIGYKVAAGTGVSRIFTQTGKARLFDDDRTQVIEAFTKANDITIASLGGSTTIRNSLKVQASATVDSNIILDGGTTAGIIEIVRARFSTPLNLHNLGSLDVPNLDFYKYSTTGRFLDTEGNRFWGGSQDQSGGGRIGAFDNLQAAPDPLRVSGQYTFRFADGGTGSGAAFDVGVAFDGTVTVELVAAGSGYADNQTLTIRDNQLGGGGAPDITFDINGVTDASEVFILPITTPAASDFDIGDLILLDRGNAASPDEVTPAGGTSVINLRDQQYSEIMRVVGLDNLTNPNDPQGFRLSVTRAQEGTGDPATGDGWTNHPDGCVIAKLDKQPAASYITGKDVGSFADPNVPDGILDEPRAGIDGTSGNVRIGVAEFGGVLTTLDLLRIDQSEIVAIADVVSTDIQSLIVTDGGDPAVTNFKVESTTGNTVIAGNVGIGLGFNQFTIAGGSGNTNIAGTLTVEDTITLNGSTIPSTEFFTITNGGPSFEDDGVTVITPLRTTFQVDSATGNLLMNGGNINIFGVDGTTPRLTFNNSSGDFTTYGSFSALGDGMSSFGGPVTMAGDLTVNGGDLTVNQNGVEVFAVDDDGSLNIGGISNYFSSTGGRKWVVSNTNIINAEANVNYFVDISGTALFKLPANAQMGDMIRIIDIGGILSYDKSLVVRAPNLVRIQGSVSNTGTTVTGNTLGENFSLTHDGGELVVQTPNAAFGLVFAGTSDADGGPGANPNKAGWYLMDV
Physico‐chemical
properties
protein length:4017 AA
molecular weight: 432922,05130 Da
isoelectric point:4,43176
aromaticity:0,08713
hydropathy:-0,25980

Domains

Domains [InterPro]
DC_0231
STR
1–324
DC_0231 DC_0231
DC_0231
STR
318–583
DC_0231 IPR009050
AOO11978.1
1 4017
Architecture
STR
STR
STR 1-583 | STR 821-4017
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM44
[NCBI] 		1278485 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Vellamovirus > Vellamovirus rhodeisland44
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO11978.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349293.1 [NCBI]
CDS location
range 22213 -> 34266
strand +
CDS
ATGCCGCTAACAAGACTTGATAATCTGTATTCAAGTAAGACTGGTAAGTATCTTTACGTATCACCAGATGACTTTAATGCAACTGATGAACTAGACAATAGAGGTAACTCACCTTTACGTCCATTCAAGACAATCCAGAGGGCATTTATTGAAGTATCGAGATATTCATATCTCCCTGGTGCCAACAACGACAGATTCGACCAGTTCAGCATCATGCTGATGCCTGGTAATCACTATATTGATAACCGTCCTGGTCTTGTAACAGAGACTGCTGTTGAGGCACGTTATTTTGATGCTGGAAATCTTCTTGAGGGTAACCGTCAGGAAGTTATCGATCGTTCTGTAGCACAAGTATCTGTTCAGCATCCTGATTTCTATTATCCTGGTGATCCTCAGACTGGTGCATGGTCTCGCTTCAAAGATGCATACCGTCTGATTCAGAAGAACAGAGATCTTCTGATCGATAGAGCAACAGCACAGATTCCTGTTGATCATGAAGATTTCGTTTATCCTGGTGACCCAACTGTAGGTGAGTGGTCACGTTATAAGGATGCATATCGTCTAATCCAAAAAAATAAAGATCTTATTGCACAAGATGCGTTCGATTTGATGAACGCAAATCCACCATCTCCTCTACCTGATGGTTATGCTAGTAAGTGTATTCGTGACATCAAGATCCTGATTGATTCACTTTCTCTTGATGTTCATGAAGGTGGTGGTAACAAATATACTAGAAAGTATATCCAAACTTATTTCCTTGATGATGGCACAGATTGGGTAAATGGTAGTCTTCGTGGTGAAGAGACTCAATCTTTAGTTGCATTTGCTGAAGCAGCTAGATTAATGAAGTTGGCAATCACCAACAACTACACTTCCACATCTTCTCCTGGTAACGAGTATCAGGATCTGACAGTTGTTATCGGTGCTCCTAACTATGAGACCGATTCTGCAAACGACGTTCCTAACACCGATCCTACAGCATGTTCTGACGTTCAGACTTTCATTGATAACCTGTATGCAATCGTAAACACTACCTTTAGTGATTCTGACCTTGCTGCAAATAATGGTAACTTTGATCTAACTAATGTTCTCCCTGCTGAAACTGTATCTGATAAGATCTCTGCAGGTCATGCTAAGTGTAAGCGTGACACAGGATTTGTTCTAGATGCACTTTCACTAGACGTTCATGAAGGTGGTGGTAACCGCTACACCAGAAAACTACTCCAGAACTATTTCGACTCTACAGGTAACAACTGGGTAGTCAATGGTTTACAAGGAGAAACTGCAGAATCTCTAACTGCATTTGGTCAACTCTTCACTGAGATGAAGAGAGCACTTACAAACCAACTGTATTTTAAAGATTTAACAATCACCCCTGGTGATGCAATCTTTGGTAACACCAACAGTCCACAGGAGAATCTACCTTCTGGTAACCCTGCTGCGTGTGCTGACATTCAAACCCAGATTGATACTCTAGGTGCAATCGTTACGCAAATCATTAACGATGAGAACCTAACCAATTTACCTGACGAAACTCTATCTGATGTTATCTCTGCTGGTCTTGCTAAGTGTAAGCGTGATGCTGGTATCATTACTGATGGCATCATCAATGACCTTCGCACAGAAGGTAATGCAAACACGATTACTAATGCAAAAGCATACTTCGATCGCTTCGGCAATCCTATTGCTAATGGTCTTCTGGGTGAAGAATCAGAATCTATCACTGCATTCAACGGCATTGCAACATTTGCTAAGCAAGCAGTTACTAACCAACTGTTCTTTAAGGATCTGACTATCTCTCCTGGTCCTGCATATGCCAATGCAAATACACCTGAGATTCCAAATCTAGCATCAGGTAATGCTGCTACTTGTGTAGATGTTCAGGCAACAATTGATACTCTCATCAAAATTCTGACTGATGTTATCGAAGTTGGTAATTTAGATGAATTAGCAGCAATCAAAGTTACAGGTGTTCTTCCTTCATTCAACTACAATAGAGCACTCGAAGAGTGGCAGGATAACTCTATTGTTGATCTAGCAAACCCTGACAACGTTCTTTACAAATTCAATGCTGCTGATGGTGGTTGTATTGTTCCTAGAGGTTGTTCACTGATTGGTTACGACCTGAGAAGAACAGTTGTTCGTCCTCTGTATGTTCCTGATCCTGCTGATACTTCGCAACCAAGAACTTCTATCTTTAACCTGACTGGTGGTTGTTACATCTGGCAGTTCACTATTAAAGATGGTGACCTATCTGCACAATCTCCTCTATATGATGCCTCTGCTGGTGTTGGTAAAGTTTACTATAAGAAAGGTTCAACTGATCTTGCAATTCCTGAGTATTCTCACCACAAGATCTGCATCATGGAGTATGCAGATTCTAAAGATCTTGACAACTACTATGAAAAAGTAGGAAAATCATTCCAACAGTTCCAACCAACTATCGATGATGGTGGACTGGAAGCACTGGTTCAGGAAAACAGAATCGTTGGTCCTCTGTCTGACAGCAGAACTATCGAAAGTATCAGAATTGATGACTCTGCAACCTTCACTGGCAATGCATCTAACAGCACAATTCTGAATAATGTTACTAATGCTGAGAGTCTTGAAGTTGGATACGAGATTACATCACCTGATGTCAGTGTTGTTATCTCTCCAAACACTAGAATTGAGAGCATCTCTGGCACTTCAGTTACGCTGAACCAATCGATTTCAGGATCTGGTAATGTATCATTCCTTGCATCCTTTGGTTATGCTAACATCACAATTCAGACAAAAATTGATCATGGATACTTTGAAGGTCAGTATGTTGCTATCATCAACTCTGGACTATCTGATGAAATTAATGGAACCTGGAAGGTTACCAAGATTGATGGCGTAAATCCCAAAATCTTTGAGTATGAAGTATACAATAATACTGCAGCATCCCTTGGATTGGTATCTGGACAGACCTATCTGTCAGGTGAAGTCGGTGGAGTTAGCACAAACGCGGTAGTTCTTGCGGAAATTGACTCTGTTGAGTCCGCATCTCCGTATGTTTTCAACTGCTCGATTCGTTCTACCTGGGGTCAGTGTGGCATGTGGGCGGATGGATCCAAGGCCACTGGATTCAAGTCAATGGTCGTGGCTCAATATACTGGAGTTTCACTTCAGAAAGATGATAGAGCATTCATCCGTTATGATGCACTAACTAATACTTGGAACCAAGCATCACTTACTGACGCATTTGCTACTGTTCCTTATCATACCAAAGGTGATGCATACTGGAAAGATGACTGGAGAAACTTCCACATCCGTGCTTCGGATGACTCTTTCGTTCAGTGCGTCTCGGTCTTCGCTGTTGGTTTCTTCGATCACTTCCTGATGGAAAGTGGTGGAGATATGTCCATCACGAACTCCAACTCTAACTTCGGTAATACATCACTTCACTCTGTTGGTTTCAAAGGATTCTCCTTTAACCAAGATAAGGGTGGTTACATCACTGACATTGTTCCTCCTGAGATTGTATCTACAAGCAACGAAGTTATCAATCAGTGGTATACTCTAGATGTTCCTGCATCTAACTCAAGAACTAACCACACCAGACTGTATCTTGCTGGTGATGACATTGAAAATCCAGATGATCGTCCAGCATCTTCTATCAATGGATACAGAATTGGTGCTAAGTCTGGTGAAACTCTATCTGTTGACCTTGCACGTTATGCAATTGAACCAACTGGTCCTATTGAGTTCTCTCAGACTTTGGAACCAAATGGATTCAAATCCTATACAGTTGGCATTGAGACACTGACACCTAACAGTGCAAATGTTGACAACTATGCACAGGATTCTGCTAATCAGATTGAAGATAACAAGGCACTAATTCAAGCAGAAGGTTATCAGTATATCATTGCTAAGTATCCTGAGCTACTCACCAAACCAAACATCACGATTGGTAAGTGCGAAAGAGACATCGGATATTTTGTTGATGCTGTTGTCAATGACTTGAGAATCGGTGGTAACATCAACTCTATTCAAGCAGCAGAAGGTTATTACATCGCTGGTGAAGTTGCATACATTGCTGGTGAACTAAACGAAACGATTGATTCTCTTGATTATGTCAAGAATATCATGATCGCAGCAATGCGTAACTTTGATTATCTGGTTAGAGATGCTGAGACATTTAGCGGTTCTGCAATTGTCAATGTTCCCTCTACTCAGGGTCTGATGATTGGTATGAGAGTTGTTGAGTATGATCCTAGCGATTTTACCAACGGTCTTCTCAACATTGCCAATACACCAATCTACACCAACATTCCTCAGAATGCATTCATTAAGAACATCATTAGTGATACTCAGATTGAACTTGGTATCCCTGGTGCTAAACTAAATCAAGGTTCTACTAGAAACGCTACTGGTAGTGTTAGTGGTGCATTCCTCTACTTTACTCTAGAGAATCCTGCATGGGCAAGTATCTCACCTGCTGTTGATCCTACGATCACTCAGGATGCTCAACTTGATGGTAATGGTAATCCTTTACCTGAGTGTCAGAACATTGCAACCACAATCGAAGGTTACTTCAATGAAATCTTCCTGGTTCTGAACACTGGTTACACTGCACTTGGTGGTAGAGAAGTTGATGCATACAATGCTATCATCGATAACAAGCGTTTCATTGCTGCAGAAGCAGTTTACAGAATTGCTAACGATGCTGCATATGCTGGCACTAAACTGGGTCAAGGTCTACTAGCATCGACTGGTGAGACCATTCAGGATGCTTGTGTAGACGACGTTGAGAACGTTCTTAGTCAGATTGCTTACAACGTCAAGTTTGGCGGCAACAACAGAATCTACGACGCAGCAGAACTGTATCTGACTGGTGCTCATGTTCAAGGTGAAGAAGCAGAATCTATTGCTGTATTCAACTTGGCAAGAGACTTGGCAATCAATGCAATGCGCCAGGAAACAATTACAGTTCAAGGTAATCATGGTTTAACTCAGACAATTAATAATCAAGTTCT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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6979131d0c5dd9cad2afdb7e042086594100492396941259d0eb6b525584f3ee
AlphaFold3
Source AlphaFold3
Method AlphaFold3
Resolution 0,8497
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50