Protein

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Genbank accession
UYE93569.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
Protein sequence
MSDNFDDDFDWGDDPFEGDMSFDDDFDSSKPKSKLKSFVTGFLAGATDSTYGDTSTNLRTLERVLPNSFKPFFSNISRLEQQRSELIQEIKNNTHESMVNLQSIAKSSKDKIDRYLPNKISEGVESFSKHDFSDWEKSSSSSDDTIKMEETSDEEVNQLVSTVAQSGDNTVSALSTVGDAISQTITQTASHLLGSSNAIASGMGQMNRTLQDIVIYQQRVQTANDKAKISLLARQYATSAKFYKFMEKAQHRAIQELKAINKQTAMSDFQKTTTSQFVKKNLRESIYNTAVSKSGGIREMLNEKFGKDSRSEKYDALNTLTSAIEMTASMSEGMELDMFNIAGGLAGEYAVNALIPKLLKSGWTKKRIRSFIRKNPKLYKQLKGKYAWLDDKGGRLSYLTSNTEGLVNLAAKHSSSYDDYEGQDLSYDDYVERMQEEGKKPLNKVVWWTQEKIKAGATHVGNRLTEDLYNSSGTRITNKLRRHADLANPAKWSLRNDLTLNEVIPAHLANINLSLEKIRTGNNSLKAEHYDIVKARFIGQKERDSSVMSRVFAKNEVGSYADSSLRVVDKLDKDGVLTNDKTLRGKLAALVARNQDKGLAFSPYSYLELEGEGFTKAEAEKVRQLMISQWGLTQDDIDKFKSGNLGSVLEALAGIKDIKRLNEVSESYNYLGQSAQSIADRFDEMKAAGNTDALRRAGILKEDDTFDNELRWRLIEEYAKGNDPLSKTMEKAESKSKSNFNNGGFNSLQTPKANQDTEQPTAIDYTVFRELNENIKKLDFSKFDLGGLKNLEPTLAKINSGIADVAKNTADMKALLERVAKEGITTKTIVSRKEKQEKDEAEVQKQGILERIKGFGSGLFSGGMDKILKHDPLILGGLLGGLAATAFHDPKMAMLIGGVSALTVGYMKFHEKAQARGVYDDEDIYEEGAESPLLEAERLKRGEYYCAVAKKVLTSWKEIIGAVVTKTGALVASAYQLSKKLWTSKGKPILLAGLNKGKDLLFRAFRWLDPLNRLTKLKDAAVTRVKQSAVYLKTDTGVSRTPVLTRKGFQEGWYFDENGNPVTSWSDIKGPVYDRDMEPLITQTDYDNGLCNIFGVSLDTTKSTLGKVSKWLGEKFGIMKERFNPAMNRAKEMTKNAFTTDLTPVVSSVDRIYDLLMAHWKYSKTPPRFNDPVTGEPMPAEPGTAGVTPPVSSDKSKEGTVDPISKQRRKKAKGETPTTDKDGKPFVRENSFEDLKQEKEEKEEKEYRRSFLDMVRGLGKDKEKKEEKKGGLLSLLTSGFGLISGLLPKIATGILSIGGTLVSGIAAIVGALGGSWIPDFGGDKDLTPEQRKQNKADKEKAKREKVKAGNKGKAVSRFLKGGKLLGAGAALSYGTSALVSSGIVEEGGLVDDVSGVASTALGVAGTWGMANSVLGLGGYSVGGLLSSAAAGIAGLLSWPVVIGAAAVGAVGYGAYKAYKHFDKPKLPAQIRMAQYGVADSQSDLAARVFNLERFLEEYVVIKGTSASLSEQADVEGMLRLFLQNPKDGKEVEAFLSWFTYRFKPVFLNYCGTMQALDVKGMEAYDSDEDIIRYRIAKDVQRAINGITPNVYDVTPRIDKDTLLINLDNTTTFTDNLFEDWKELLGDALKTDVTTQLKMESKASLEAKRDELKQIARDDNFNGKNYFERTANLRELQDVEQKLKFLNNEAVVKFKSGNDLSVTDLMPEDGTLDPFVALRVGMYGVSLINQSEVEAVLYLERYCEKYVSINGQEVTFSKTPIDVYSEVSSVFGNNVSNRGTWINWFNSRFLPAFLGYMSYYNEYGTGAPGKNWTKLSATAKYKIAKALTLTKSLTGRRNLVIETTSYSAFKDGIDDELGEKILAYLSVLEEKSSRANLIDPIAEAKRTSTKAYLGKIVETNTKGQETLYTSNRTTGNDAKSRKDFMLAGGYGGNTYTKTYFEPIKGNTDTKMLDYGGVTANEGDDQGISVPRELAEQLIIKEMLARGFTDPREIALVLANAYVESGGFKKSTENLKYTDPKRMVDLFSEVKTIEQARSLMKAGPVTTANTVYGGAKGLSLGNTNPGDGWRYRGRGFIQLTGKNNYKSIGDRLGLDLVGNPKLASEDPNIMAKILVEYFASNKKMRTITENDNFAFASQGVNANLPDMDKRFGYYKDYLSSLVDGTLTAENKDEDKKAETVSTAAIPKKAPYQKSSIPFAGVAAPDDSVVNKQVATQPTGTTKPDGVPASLAPLPKETPAAPTPVQVINNNDELKKLLAGGINTNDPNSSKLLANILVELQKMNQSKNDPMTVALK
Physico‐chemical
properties
protein length:2293 AA
molecular weight: 252763,91390 Da
isoelectric point:8,45408
aromaticity:0,08068
hydropathy:-0,49878

Domains

Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–2097
DC_0124
Coil
Unmapped
76–96
Coil Coil Coil G3DSA:1.10.530.10
IPR023346
STR
1985–2159
IPR023346
IPR000726
ENZ
2066–2119
IPR000726
UYE93569.1
1 2293
Architecture
STR
STR 1-2159 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shewanella phage FishSpeaker
[NCBI] 		2985553 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Shewanella oneidensis MR-1
[NCBI] 		211586 Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Alteromonadales > Shewanellaceae > Shewanella > Shewanella oneidensis

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UYE93569.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP589283.1 [NCBI]
CDS location
range 175445 -> 182326
strand -
CDS
ATGAGTGATAATTTCGATGATGATTTCGATTGGGGAGATGACCCATTTGAAGGTGATATGAGTTTTGATGATGATTTCGATTCGTCAAAACCTAAAAGCAAATTAAAAAGTTTTGTTACTGGATTTTTGGCAGGTGCGACTGATTCAACCTACGGTGACACTTCTACGAATCTACGTACATTAGAACGCGTTCTCCCCAACAGTTTTAAACCTTTCTTTAGTAATATTTCACGTCTTGAACAACAACGCAGTGAGTTGATTCAAGAAATTAAAAATAACACCCATGAAAGTATGGTCAACCTGCAATCTATCGCAAAATCTTCAAAAGATAAGATTGACCGGTACTTGCCTAATAAGATTTCAGAGGGGGTTGAAAGCTTTTCTAAACACGACTTCAGTGATTGGGAGAAGTCAAGCTCAAGTAGTGATGACACGATTAAGATGGAAGAAACTTCTGATGAAGAAGTTAACCAATTAGTTAGCACAGTGGCACAAAGCGGAGACAACACCGTTTCTGCATTATCTACTGTGGGAGATGCAATTAGTCAAACAATCACTCAGACTGCAAGTCACCTGTTAGGTAGCAGCAACGCTATTGCATCCGGCATGGGTCAAATGAACAGAACGTTGCAAGATATTGTCATCTATCAGCAACGTGTTCAAACGGCTAACGATAAGGCTAAAATCAGCTTATTAGCGAGACAATATGCTACCAGCGCTAAGTTCTATAAGTTCATGGAAAAAGCTCAACACAGAGCGATTCAGGAGCTTAAAGCCATTAACAAACAAACAGCGATGTCTGATTTCCAAAAGACTACCACCAGTCAGTTTGTTAAAAAGAATTTAAGAGAAAGCATCTACAATACCGCAGTTAGTAAATCTGGCGGTATTCGTGAAATGTTAAACGAGAAGTTTGGTAAAGACTCCCGGAGTGAAAAGTATGATGCGTTAAATACCTTAACCAGTGCTATTGAAATGACTGCTTCCATGTCAGAAGGTATGGAACTAGACATGTTCAACATTGCGGGCGGTCTGGCGGGTGAATATGCTGTTAACGCGTTAATCCCCAAACTTCTTAAATCAGGGTGGACGAAGAAACGTATTCGCAGTTTTATCCGTAAGAACCCTAAACTGTATAAACAGTTAAAAGGTAAATACGCTTGGTTAGACGACAAGGGTGGTCGGTTAAGTTATTTAACCAGTAACACTGAAGGGTTGGTTAACCTAGCCGCCAAACATTCTTCTAGTTACGATGATTACGAAGGACAAGATTTGTCTTACGATGATTACGTAGAACGTATGCAAGAAGAAGGCAAGAAACCCCTCAATAAAGTAGTGTGGTGGACGCAGGAAAAAATAAAGGCAGGTGCTACTCATGTAGGTAATCGTCTAACAGAGGATTTATACAACTCTTCTGGTACACGTATCACCAACAAACTTCGCCGTCATGCTGATTTAGCTAATCCTGCAAAATGGTCTCTACGTAATGATTTGACATTGAACGAAGTGATTCCAGCTCATCTAGCCAACATTAACCTAAGCTTAGAAAAAATCCGCACGGGTAACAATTCTTTAAAAGCCGAACACTACGACATTGTTAAAGCCCGATTCATAGGGCAGAAAGAACGTGACAGTTCTGTTATGTCTCGTGTGTTTGCTAAAAATGAAGTAGGTAGCTATGCTGATTCTTCTTTACGCGTTGTGGATAAGTTAGATAAAGATGGTGTGTTAACTAATGATAAAACACTTCGTGGGAAATTAGCTGCCTTAGTTGCACGTAATCAAGATAAAGGATTAGCGTTCAGCCCTTACAGCTATTTGGAATTAGAAGGGGAAGGGTTTACTAAAGCCGAAGCTGAGAAAGTACGGCAGTTGATGATCTCTCAATGGGGATTAACCCAAGATGATATCGACAAATTCAAAAGTGGTAATTTAGGTAGTGTGCTTGAAGCGCTTGCTGGTATCAAAGACATTAAACGCTTAAACGAGGTGAGCGAGTCTTACAACTACCTTGGACAAAGTGCACAAAGCATTGCAGACCGTTTTGACGAAATGAAAGCTGCGGGTAATACCGATGCTTTACGTCGTGCAGGTATTTTGAAAGAAGATGATACATTTGATAATGAACTCCGTTGGCGTTTGATTGAGGAATATGCCAAAGGTAATGACCCATTGTCTAAGACGATGGAGAAAGCAGAATCAAAAAGTAAATCTAATTTCAATAACGGTGGATTTAATTCACTGCAAACTCCTAAGGCTAATCAAGACACCGAACAACCTACTGCTATCGATTACACCGTCTTCCGCGAACTTAATGAAAACATTAAGAAGTTGGATTTCAGTAAATTTGATTTGGGTGGGTTAAAGAATCTTGAACCTACTTTAGCGAAAATCAATTCTGGTATTGCTGATGTTGCTAAAAATACGGCTGACATGAAAGCACTACTTGAACGAGTAGCAAAAGAAGGTATCACCACTAAAACAATTGTGAGTCGTAAAGAGAAGCAAGAGAAAGATGAAGCAGAAGTTCAGAAGCAAGGTATCCTAGAACGCATCAAGGGCTTCGGTAGTGGATTATTCTCTGGTGGGATGGATAAGATACTTAAACATGACCCACTCATCTTAGGCGGCTTATTAGGGGGCTTAGCAGCCACCGCATTCCATGATCCCAAAATGGCGATGTTAATTGGTGGGGTGAGTGCGCTTACTGTGGGATACATGAAGTTCCATGAGAAGGCACAAGCACGTGGTGTGTATGACGACGAAGACATTTATGAAGAAGGTGCGGAATCTCCGTTACTGGAAGCAGAACGTCTGAAACGGGGTGAGTACTATTGTGCGGTAGCTAAAAAGGTATTAACGTCTTGGAAAGAAATCATTGGTGCCGTTGTCACTAAAACCGGTGCATTGGTTGCTTCTGCTTATCAATTAAGTAAGAAGCTGTGGACGAGTAAAGGTAAACCTATTCTGTTGGCAGGATTAAACAAAGGTAAGGATTTACTTTTTAGAGCGTTTAGATGGTTAGACCCTTTAAATCGTTTAACTAAGTTAAAAGATGCAGCGGTCACAAGAGTTAAACAATCTGCGGTGTATCTGAAAACAGATACCGGAGTAAGCCGTACCCCAGTATTAACACGGAAAGGTTTCCAAGAAGGTTGGTACTTTGATGAGAATGGTAACCCAGTTACTTCATGGTCGGATATTAAAGGTCCTGTCTATGACCGTGATATGGAACCTCTTATTACCCAAACAGATTACGATAATGGATTATGCAATATCTTTGGGGTAAGTTTAGATACTACCAAATCAACTCTTGGAAAAGTCAGTAAATGGTTAGGTGAAAAGTTCGGGATTATGAAGGAACGTTTTAATCCTGCAATGAACCGCGCTAAAGAAATGACAAAGAATGCGTTTACTACTGACTTAACCCCAGTGGTGTCTTCGGTAGACCGCATCTATGACTTATTGATGGCACACTGGAAGTACAGCAAAACCCCACCTCGTTTTAACGACCCTGTAACAGGGGAACCAATGCCTGCTGAACCCGGAACCGCTGGGGTGACTCCTCCCGTGTCGTCTGATAAGAGTAAAGAGGGAACGGTAGACCCTATTAGTAAACAACGCCGTAAGAAAGCGAAGGGTGAAACACCAACCACTGATAAAGACGGGAAGCCATTTGTCCGTGAAAACTCTTTTGAAGATTTGAAACAAGAAAAAGAGGAGAAAGAAGAGAAGGAGTATCGTCGTTCCTTCTTAGACATGGTCAGAGGGTTAGGTAAAGACAAAGAGAAGAAGGAGGAGAAGAAAGGAGGCTTACTCAGTTTATTGACTTCTGGCTTTGGATTAATCAGTGGATTGTTACCCAAAATCGCTACTGGTATTCTATCTATTGGTGGAACATTGGTTAGTGGTATCGCAGCAATTGTGGGGGCGTTAGGAGGAAGTTGGATTCCTGATTTTGGGGGAGATAAAGACCTAACTCCAGAACAACGCAAACAAAATAAAGCTGACAAAGAAAAAGCCAAGCGAGAAAAAGTAAAAGCGGGTAATAAAGGTAAAGCCGTTTCTCGTTTCCTTAAAGGAGGTAAACTGTTAGGGGCTGGCGCAGCATTAAGTTATGGCACCAGTGCTTTAGTGTCTTCTGGTATAGTGGAAGAAGGTGGTCTTGTTGATGACGTCTCTGGTGTAGCGTCTACCGCATTAGGGGTAGCAGGTACATGGGGTATGGCAAACTCTGTGTTAGGATTAGGTGGTTACAGTGTAGGTGGTTTATTAAGCAGTGCAGCGGCTGGTATTGCAGGATTGTTATCTTGGCCTGTGGTAATCGGTGCAGCGGCCGTAGGTGCGGTTGGTTACGGCGCATACAAAGCTTATAAACATTTTGATAAACCAAAACTTCCTGCTCAAATTCGTATGGCACAGTATGGTGTTGCTGATTCCCAAAGTGACCTTGCTGCTCGGGTATTCAACTTAGAACGTTTCTTAGAAGAATATGTTGTCATTAAAGGTACATCTGCAAGTTTATCAGAACAAGCTGATGTGGAAGGGATGCTAAGACTTTTCTTACAAAATCCAAAAGATGGTAAAGAAGTAGAAGCGTTCTTATCTTGGTTTACTTACCGGTTTAAACCTGTGTTCCTGAATTACTGTGGAACCATGCAGGCTTTAGACGTTAAAGGCATGGAAGCTTATGACAGTGACGAAGATATTATTCGTTATCGTATCGCTAAAGACGTTCAACGTGCAATCAACGGTATCACCCCTAATGTCTACGACGTCACCCCACGTATTGATAAAGATACCTTACTGATTAACTTGGATAATACCACAACCTTTACCGATAATCTTTTTGAAGATTGGAAAGAGTTGTTAGGTGATGCGTTAAAGACTGATGTAACAACACAGTTAAAAATGGAATCTAAGGCGTCATTAGAAGCTAAACGCGATGAGTTAAAACAAATCGCTAGGGATGATAACTTTAACGGTAAAAACTATTTTGA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
29e44ef69ebccb8657542a031165b45e074a4059d5c349bccbd98dcb5a68c90e
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4859
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The outer-membrane cytochrome OmcA is essential for infection of Shewanella oneidensis by a zebrafish-associated bacteriophage Grenfell,A.W., Intile,P., McFarlane,J., Leung,D., Abdalla,K., Wold,M., Kees,E. and Gralnick,J. — — GenBank