Genbank accession
QWQ55884.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,60
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,63
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYSVLSDGVNVDFFIEENTVQQYDATRGYKKNFAVINDNRIWVAQRDIAAPAGAFTPQYWLATRTDPKWETVASPTRQLNSGEFIAVDSAASFTTFTLPPNPVDGDTIVIKDIGGNVGYNEIKIQSSNVPGAGNQKIVRFGNQYPEVLITKPFSYNMLIFSNRLWQFWEAGNEERGIRVEPSTGRFHAQAGDFIMRRYTTGAPITFILPKYANQGDIVKSVDIDGMGPTFHLMVETFDTSSSLGKAGQHQMEFRTTGDGFFVYNAAEKLWYVWDGDFKTRLRVIRDSVKLLPNESVIVFGEDNSTPATINIDLPTDVLQGDIVKIALNYLRKSQTVNIRAAVGDKIASDIKLLQFPKRSEYPPDTTWVMVDSLTFNGNISYTPVIELSYAEDEVSGTSYWVVAQNVPTVERVDSLNDSTRTRLGVIALANQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVAKENQRGIARIATTAQVNQNSDFAFVDDVIISPKKLNERTATETRRGLAELATQQETDAGVDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYVSTTGTTPAASRELNGTNVYNKNTVNLVVSPKALDQYKATYTQQGAVILAVESEVIAGTSQSGWANAVVTPEMLHRKTALDSRIGLIEIATQVETDAGTDYTRAVTPKTLNDRKASETLTGIAEIATQSEFDTGTDDTRISTPLKIKNRFNNTARTSVNALSGLVETGTLWDHYSLNILEANETQRGTARLATQGEVNTGTDDKTIVTPLKLMSKKATENAEGIVRIATNTEATAGTSKVLAISPSALKYIAQTETTWEASETLRGFVRLSSGAATSAATTTTGAGFTYANGVYTPDPSKLVSYAKSGYAVSPYELNRVLQNFLPINAMAVNAEKLDNLDSTQFIRRDIAQTVEGVLTLTKQTNISAPVVSTSTAVFTDVTAGTSTFGTVNVVNGTNKWKITAPSAGTTMTIGDTTNVLTLNTASGNVAVLNNLSAGNDVQAKNNYVLNGRTIATTTGEASGATLALGDNSQNLVLKTLDAGNIIANGGGAFKVLTEKNAVEIVDRNFVNQAGDTMSGVLRVNAPVRVFGTKPSLIAQAPTADTVGFWSVDINDEPTYSQFPGYWTMKLKRQVNIDTVQTKPAGVTDEVWNASGWLTENGTFASPAIRYRNDDGSLGDEVLSSSGQKLRGTWFDYSVRDKQIKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKSAWTTFAMVYTADNPPSAEDVGALPADNTTMGNLTILDWLRIGNVRIIPDPTTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1318 AA
molecular weight: 143133,33010 Da
isoelectric point:5,19920
aromaticity:0,07967
hydropathy:-0,28581

Domains

Domains [InterPro]
DC_1946
ATT
1–208
IPR048391
ATT
1112–1145
QWQ55884.1
1 1318
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-208 | STR 349-1111 | ATT 1112-1145 | STR 1146-1204 | ATT 1205-1266 | STR 1267-1300 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage P479
[NCBI]
2841874 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli 187
[NCBI]
55511 Uroviricota > Caudoviricetes > Phietavirus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QWQ55884.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW269952.1 [NCBI]
CDS location
range 75382 -> 79338
strand -
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCAGCATTCAGAGCAACATCCGGTCTCGATGCTGCTGGTGAGAAAGTCATTAATGTCGCAAAAGCTGATTACTCAGTTTTATCAGACGGCGTTAACGTAGATTTCTTTATAGAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATGCAACACGCGGATACAAAAAGAACTTTGCAGTTATTAATGATAACCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATCGCGGCTCCTGCGGGAGCATTTACCCCTCAGTATTGGTTAGCAACTCGTACTGACCCTAAATGGGAAACTGTTGCATCTCCAACTCGTCAGCTTAACTCGGGCGAATTTATCGCCGTCGACTCTGCTGCAAGCTTTACCACATTTACATTGCCTCCAAACCCGGTTGATGGTGATACCATCGTTATTAAAGATATCGGTGGGAACGTTGGTTACAATGAAATTAAAATCCAGTCAAGCAACGTACCAGGGGCAGGTAACCAAAAGATTGTTCGCTTTGGTAATCAATATCCGGAAGTTTTAATTACCAAACCATTCTCTTATAACATGCTTATTTTTTCAAACCGCTTATGGCAATTTTGGGAAGCTGGCAACGAAGAACGTGGCATCAGAGTAGAACCATCGACAGGTCGTTTCCATGCACAAGCTGGCGACTTTATTATGCGTCGTTATACAACTGGTGCACCGATTACTTTCATTCTTCCTAAGTATGCAAACCAGGGTGATATTGTCAAATCTGTTGATATCGATGGCATGGGACCAACGTTCCACCTGATGGTTGAAACCTTTGACACCAGTTCTAGTCTTGGTAAAGCTGGTCAGCATCAAATGGAATTCCGTACCACAGGTGATGGTTTCTTCGTTTATAATGCTGCCGAAAAACTCTGGTATGTTTGGGATGGTGATTTTAAAACTCGTCTGCGCGTTATTCGTGACAGTGTTAAACTTTTACCAAACGAAAGCGTCATTGTATTTGGCGAAGATAACTCAACTCCGGCAACGATTAATATCGATTTACCAACTGATGTTTTGCAAGGCGACATTGTTAAGATTGCACTGAACTATCTCCGTAAATCACAGACCGTTAATATAAGAGCTGCTGTTGGTGATAAGATTGCATCTGACATTAAATTGCTGCAATTCCCTAAACGTTCCGAGTATCCACCGGATACAACTTGGGTGATGGTTGATTCATTGACCTTTAATGGTAATATCAGTTATACTCCAGTTATTGAATTGTCATATGCAGAAGATGAAGTGTCTGGAACAAGTTATTGGGTTGTTGCTCAAAACGTTCCGACTGTTGAACGGGTTGACTCATTAAATGATTCCACGCGTACGCGTCTTGGTGTTATTGCTCTGGCAAACCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCAGAGAAAGAACTCGCAATTACCCCTCAGACTTTGGCCAACCGTGTTGCTAAAGAGAACCAACGAGGCATTGCCAGAATCGCAACGACTGCTCAAGTAAATCAGAACAGTGATTTTGCATTTGTTGATGATGTAATTATTTCCCCGAAAAAACTCAATGAACGTACGGCAACAGAAACGAGACGTGGGCTCGCAGAACTCGCCACACAGCAAGAAACCGATGCAGGTGTAGATGATACCACAATTATCACTCCAAAGAAACTGCAAGCGCGTCAGGGCTCAGAATCGCTATCTGGTATTGTAACTTACGTTTCAACGACTGGTACAACTCCTGCTGCTTCACGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAATACGGTTAATCTGGTTGTTTCCCCGAAAGCTCTTGACCAGTACAAAGCTACTTACACTCAGCAAGGCGCGGTTATTCTTGCGGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGTACTTCTCAATCTGGATGGGCAAACGCAGTCGTTACTCCAGAAATGTTACATCGCAAAACTGCTCTTGATTCCCGTATCGGTTTAATCGAGATTGCTACCCAGGTTGAAACAGATGCAGGAACCGATTATACCAGAGCTGTGACTCCCAAAACGTTAAATGACCGTAAAGCATCAGAAACGTTAACCGGCATAGCCGAGATTGCTACGCAATCAGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCAACCCCATTAAAAATTAAAAATAGATTTAATAATACTGCTCGTACTTCTGTTAATGCATTAAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACGCTCTGGGACCATTATAGCCTGAATATTCTTGAAGCAAATGAGACTCAGCGTGGTACGGCAAGATTAGCAACTCAGGGTGAAGTCAATACCGGCACTGACGATAAAACAATCGTTACTCCGCTTAAATTGATGTCGAAAAAAGCCACTGAAAATGCCGAAGGTATTGTTCGCATCGCGACAAACACAGAAGCAACAGCAGGCACATCAAAAGTCTTGGCCATCAGTCCGTCGGCGCTGAAATATATTGCACAAACGGAAACAACCTGGGAAGCATCTGAAACACTGCGTGGATTTGTTCGTTTATCTTCTGGTGCAGCTACTTCGGCCGCAACTACAACGACTGGTGCAGGATTTACATATGCAAATGGTGTGTATACTCCGGACCCAAGTAAACTGGTTAGCTATGCAAAATCTGGATATGCGGTTTCGCCTTACGAATTAAACCGCGTATTGCAAAACTTCTTACCGATAAATGCGATGGCTGTTAATGCTGAAAAACTGGATAACCTTGATTCGACCCAGTTTATTCGTCGTGATATTGCTCAGACTGTTGAAGGTGTGTTAACTCTTACTAAACAGACAAATATCTCTGCTCCGGTTGTATCGACGAGCACTGCAGTGTTTACTGATGTAACGGCTGGCACTTCGACGTTCGGAACTGTGAATGTTGTTAACGGAACTAACAAGTGGAAAATCACTGCTCCTTCCGCCGGAACGACAATGACTATTGGCGATACGACTAACGTATTGACATTAAACACCGCCTCGGGTAATGTTGCTGTATTGAACAACCTCAGCGCCGGTAACGATGTTCAAGCCAAAAATAATTACGTTCTAAATGGTCGTACTATTGCAACCACGACGGGTGAAGCTTCTGGCGCAACTCTGGCTCTGGGTGATAACTCGCAGAATTTAGTGCTTAAAACTCTTGATGCTGGTAATATCATAGCAAACGGTGGCGGTGCATTTAAAGTCCTGACCGAGAAAAACGCTGTTGAGATTGTAGATAGAAACTTTGTTAACCAAGCCGGTGATACAATGTCTGGTGTGCTCCGTGTGAATGCTCCGGTCCGTGTATTCGGTACGAAACCAAGTCTTATCGCACAAGCTCCGACTGCAGATACTGTTGGCTTCTGGTCTGTCGATATCAATGATGAACCGACTTATAGCCAGTTCCCTGGCTACTGGACAATGAAGTTAAAACGTCAGGTAAACATTGATACAGTTCAAACTAAACCTGCTGGGGTAACTGATGAAGTTTGGAATGCTTCTGGTTGGTTAACTGAAAACGGAACTTTCGCCTCGCCTGCTATTCGTTATCGTAATGATGACGGCTCGCTCGGTGACGAAGTATTGAGTAGTTCTGGTCAGAAACTGCGCGGAACCTGGTTTGACTATTCAGTTCGTGATAAACAAATTAAATATCCTGGTACATTGACTCAGTTCGGTAATACGCTGGATTCGTGCTATCAAGATTGGGTTTGCTATCCAACTGGATTGAACGGTGGTACTATTCGTTATACCCGTACCTGGCAGAAAAATAAATCTGCATGGACGACTTTCGCAATGGTTTACACCGCGGATAACCCTCCATCTGCAGAGGATGTTGGTGCATTACCGGCTGACAACACAACGATGGGGAACTTAACCATTCTCGATTGGTTGCGTATCGGTAACGTGCGTATCATCCCAGACCCGACCACTAAATCCGTTAAGTTCGAATGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7cd40d2c7761aed8f1ac0adc02855bd41f463c472342d69d332c5fd3bde58d45
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5476
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50