Protein
View in Explore- Genbank accession
- QWQ55884.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYSVLSDGVNVDFFIEENTVQQYDATRGYKKNFAVINDNRIWVAQRDIAAPAGAFTPQYWLATRTDPKWETVASPTRQLNSGEFIAVDSAASFTTFTLPPNPVDGDTIVIKDIGGNVGYNEIKIQSSNVPGAGNQKIVRFGNQYPEVLITKPFSYNMLIFSNRLWQFWEAGNEERGIRVEPSTGRFHAQAGDFIMRRYTTGAPITFILPKYANQGDIVKSVDIDGMGPTFHLMVETFDTSSSLGKAGQHQMEFRTTGDGFFVYNAAEKLWYVWDGDFKTRLRVIRDSVKLLPNESVIVFGEDNSTPATINIDLPTDVLQGDIVKIALNYLRKSQTVNIRAAVGDKIASDIKLLQFPKRSEYPPDTTWVMVDSLTFNGNISYTPVIELSYAEDEVSGTSYWVVAQNVPTVERVDSLNDSTRTRLGVIALANQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVAKENQRGIARIATTAQVNQNSDFAFVDDVIISPKKLNERTATETRRGLAELATQQETDAGVDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYVSTTGTTPAASRELNGTNVYNKNTVNLVVSPKALDQYKATYTQQGAVILAVESEVIAGTSQSGWANAVVTPEMLHRKTALDSRIGLIEIATQVETDAGTDYTRAVTPKTLNDRKASETLTGIAEIATQSEFDTGTDDTRISTPLKIKNRFNNTARTSVNALSGLVETGTLWDHYSLNILEANETQRGTARLATQGEVNTGTDDKTIVTPLKLMSKKATENAEGIVRIATNTEATAGTSKVLAISPSALKYIAQTETTWEASETLRGFVRLSSGAATSAATTTTGAGFTYANGVYTPDPSKLVSYAKSGYAVSPYELNRVLQNFLPINAMAVNAEKLDNLDSTQFIRRDIAQTVEGVLTLTKQTNISAPVVSTSTAVFTDVTAGTSTFGTVNVVNGTNKWKITAPSAGTTMTIGDTTNVLTLNTASGNVAVLNNLSAGNDVQAKNNYVLNGRTIATTTGEASGATLALGDNSQNLVLKTLDAGNIIANGGGAFKVLTEKNAVEIVDRNFVNQAGDTMSGVLRVNAPVRVFGTKPSLIAQAPTADTVGFWSVDINDEPTYSQFPGYWTMKLKRQVNIDTVQTKPAGVTDEVWNASGWLTENGTFASPAIRYRNDDGSLGDEVLSSSGQKLRGTWFDYSVRDKQIKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKSAWTTFAMVYTADNPPSAEDVGALPADNTTMGNLTILDWLRIGNVRIIPDPTTKSVKFEWIE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1318 AA molecular weight: 143133,33010 Da isoelectric point: 5,19920 aromaticity: 0,07967 hydropathy: -0,28581
Domains
Domains [InterPro]
DC_1946
ATT
1–208
ATT
1–208
IPR048391
ATT
1112–1145
ATT
1112–1145
1
1318
Architecture
ATT 1-208 | STR 349-1111 | ATT 1112-1145 | STR 1146-1204 | ATT 1205-1266 | STR 1267-1300 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage P479 [NCBI] |
2841874 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Escherichia coli 187 [NCBI] |
55511 | Uroviricota > Caudoviricetes > Phietavirus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QWQ55884.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW269952.1
[NCBI]
CDS location
range 75382 -> 79338
strand -
strand -
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCAGCATTCAGAGCAACATCCGGTCTCGATGCTGCTGGTGAGAAAGTCATTAATGTCGCAAAAGCTGATTACTCAGTTTTATCAGACGGCGTTAACGTAGATTTCTTTATAGAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATGCAACACGCGGATACAAAAAGAACTTTGCAGTTATTAATGATAACCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATCGCGGCTCCTGCGGGAGCATTTACCCCTCAGTATTGGTTAGCAACTCGTACTGACCCTAAATGGGAAACTGTTGCATCTCCAACTCGTCAGCTTAACTCGGGCGAATTTATCGCCGTCGACTCTGCTGCAAGCTTTACCACATTTACATTGCCTCCAAACCCGGTTGATGGTGATACCATCGTTATTAAAGATATCGGTGGGAACGTTGGTTACAATGAAATTAAAATCCAGTCAAGCAACGTACCAGGGGCAGGTAACCAAAAGATTGTTCGCTTTGGTAATCAATATCCGGAAGTTTTAATTACCAAACCATTCTCTTATAACATGCTTATTTTTTCAAACCGCTTATGGCAATTTTGGGAAGCTGGCAACGAAGAACGTGGCATCAGAGTAGAACCATCGACAGGTCGTTTCCATGCACAAGCTGGCGACTTTATTATGCGTCGTTATACAACTGGTGCACCGATTACTTTCATTCTTCCTAAGTATGCAAACCAGGGTGATATTGTCAAATCTGTTGATATCGATGGCATGGGACCAACGTTCCACCTGATGGTTGAAACCTTTGACACCAGTTCTAGTCTTGGTAAAGCTGGTCAGCATCAAATGGAATTCCGTACCACAGGTGATGGTTTCTTCGTTTATAATGCTGCCGAAAAACTCTGGTATGTTTGGGATGGTGATTTTAAAACTCGTCTGCGCGTTATTCGTGACAGTGTTAAACTTTTACCAAACGAAAGCGTCATTGTATTTGGCGAAGATAACTCAACTCCGGCAACGATTAATATCGATTTACCAACTGATGTTTTGCAAGGCGACATTGTTAAGATTGCACTGAACTATCTCCGTAAATCACAGACCGTTAATATAAGAGCTGCTGTTGGTGATAAGATTGCATCTGACATTAAATTGCTGCAATTCCCTAAACGTTCCGAGTATCCACCGGATACAACTTGGGTGATGGTTGATTCATTGACCTTTAATGGTAATATCAGTTATACTCCAGTTATTGAATTGTCATATGCAGAAGATGAAGTGTCTGGAACAAGTTATTGGGTTGTTGCTCAAAACGTTCCGACTGTTGAACGGGTTGACTCATTAAATGATTCCACGCGTACGCGTCTTGGTGTTATTGCTCTGGCAAACCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCAGAGAAAGAACTCGCAATTACCCCTCAGACTTTGGCCAACCGTGTTGCTAAAGAGAACCAACGAGGCATTGCCAGAATCGCAACGACTGCTCAAGTAAATCAGAACAGTGATTTTGCATTTGTTGATGATGTAATTATTTCCCCGAAAAAACTCAATGAACGTACGGCAACAGAAACGAGACGTGGGCTCGCAGAACTCGCCACACAGCAAGAAACCGATGCAGGTGTAGATGATACCACAATTATCACTCCAAAGAAACTGCAAGCGCGTCAGGGCTCAGAATCGCTATCTGGTATTGTAACTTACGTTTCAACGACTGGTACAACTCCTGCTGCTTCACGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAATACGGTTAATCTGGTTGTTTCCCCGAAAGCTCTTGACCAGTACAAAGCTACTTACACTCAGCAAGGCGCGGTTATTCTTGCGGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGTACTTCTCAATCTGGATGGGCAAACGCAGTCGTTACTCCAGAAATGTTACATCGCAAAACTGCTCTTGATTCCCGTATCGGTTTAATCGAGATTGCTACCCAGGTTGAAACAGATGCAGGAACCGATTATACCAGAGCTGTGACTCCCAAAACGTTAAATGACCGTAAAGCATCAGAAACGTTAACCGGCATAGCCGAGATTGCTACGCAATCAGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCAACCCCATTAAAAATTAAAAATAGATTTAATAATACTGCTCGTACTTCTGTTAATGCATTAAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACGCTCTGGGACCATTATAGCCTGAATATTCTTGAAGCAAATGAGACTCAGCGTGGTACGGCAAGATTAGCAACTCAGGGTGAAGTCAATACCGGCACTGACGATAAAACAATCGTTACTCCGCTTAAATTGATGTCGAAAAAAGCCACTGAAAATGCCGAAGGTATTGTTCGCATCGCGACAAACACAGAAGCAACAGCAGGCACATCAAAAGTCTTGGCCATCAGTCCGTCGGCGCTGAAATATATTGCACAAACGGAAACAACCTGGGAAGCATCTGAAACACTGCGTGGATTTGTTCGTTTATCTTCTGGTGCAGCTACTTCGGCCGCAACTACAACGACTGGTGCAGGATTTACATATGCAAATGGTGTGTATACTCCGGACCCAAGTAAACTGGTTAGCTATGCAAAATCTGGATATGCGGTTTCGCCTTACGAATTAAACCGCGTATTGCAAAACTTCTTACCGATAAATGCGATGGCTGTTAATGCTGAAAAACTGGATAACCTTGATTCGACCCAGTTTATTCGTCGTGATATTGCTCAGACTGTTGAAGGTGTGTTAACTCTTACTAAACAGACAAATATCTCTGCTCCGGTTGTATCGACGAGCACTGCAGTGTTTACTGATGTAACGGCTGGCACTTCGACGTTCGGAACTGTGAATGTTGTTAACGGAACTAACAAGTGGAAAATCACTGCTCCTTCCGCCGGAACGACAATGACTATTGGCGATACGACTAACGTATTGACATTAAACACCGCCTCGGGTAATGTTGCTGTATTGAACAACCTCAGCGCCGGTAACGATGTTCAAGCCAAAAATAATTACGTTCTAAATGGTCGTACTATTGCAACCACGACGGGTGAAGCTTCTGGCGCAACTCTGGCTCTGGGTGATAACTCGCAGAATTTAGTGCTTAAAACTCTTGATGCTGGTAATATCATAGCAAACGGTGGCGGTGCATTTAAAGTCCTGACCGAGAAAAACGCTGTTGAGATTGTAGATAGAAACTTTGTTAACCAAGCCGGTGATACAATGTCTGGTGTGCTCCGTGTGAATGCTCCGGTCCGTGTATTCGGTACGAAACCAAGTCTTATCGCACAAGCTCCGACTGCAGATACTGTTGGCTTCTGGTCTGTCGATATCAATGATGAACCGACTTATAGCCAGTTCCCTGGCTACTGGACAATGAAGTTAAAACGTCAGGTAAACATTGATACAGTTCAAACTAAACCTGCTGGGGTAACTGATGAAGTTTGGAATGCTTCTGGTTGGTTAACTGAAAACGGAACTTTCGCCTCGCCTGCTATTCGTTATCGTAATGATGACGGCTCGCTCGGTGACGAAGTATTGAGTAGTTCTGGTCAGAAACTGCGCGGAACCTGGTTTGACTATTCAGTTCGTGATAAACAAATTAAATATCCTGGTACATTGACTCAGTTCGGTAATACGCTGGATTCGTGCTATCAAGATTGGGTTTGCTATCCAACTGGATTGAACGGTGGTACTATTCGTTATACCCGTACCTGGCAGAAAAATAAATCTGCATGGACGACTTTCGCAATGGTTTACACCGCGGATAACCCTCCATCTGCAGAGGATGTTGGTGCATTACCGGCTGACAACACAACGATGGGGAACTTAACCATTCTCGATTGGTTGCGTATCGGTAACGTGCGTATCATCCCAGACCCGACCACTAAATCCGTTAAGTTCGAATGGATTGAATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
7cd40d2c7761aed8f1ac0adc02855bd41f463c472342d69d332c5fd3bde58d45
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50