Protein

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Genbank accession
QXV72340.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVRPTPAQLAEGELAINLKDRLLFTKDDTGAIIDLGFAKGGNIDGNVIHNGNYNQTGDYTLNGTFTQTGDFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELISKSASTSHLRFFDGASRERGIIFSPNNAGATTQVVNIRVQDYATSGESTYAFSGNGQFTSPEVSALKSISSPQILTDKVITNGKKTGDYDIYSLANNNSNTDKNNLRVVRTDPAAAMLHEICENNGISWYSGSTPTDYMISFAYSGGFQAGHSIAVGMESGPMTYSTLGKGSIVLGDNDTGLKWHQDGYYFSVNNGTRTFLYGPAETTSLRKMVMGYSVNGTDLTTPPTENYALATVVTYHDNNAFGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNVNTAGGLLVTPGNIDVVGGSVNIDGRNNASTLMFRGNTTGSSSVDNMTIAVWGNTFTNVDGDRKNVMEISDATSWIQYYQRLSSGAIQSHLNGTLGVNESINVGQEVNVSGTIAGNAVNALRIWNDDYAAIFRRSENSLHIIPTAFGEGKTGDIGPLRPFRMDLDTGKVSIPNMDTTNLTMNPNGYIKFAGHGSGAGGYDIQYAQAAPVFQEIDDDAVSKYYPIVKQKFLNSKAVWSLGTEINSGDFVLHHMKEDGTQSHLSRFNADGTVNFPDSVKVGGDKATIGKDGNIWSDIWKTFTSAGDVTNLLGAVYSRVSKEGDTLTGRLTLKTNSDAVVIDYPADEAGYVKGKKGGVNNWYVGNGGADNNLSFYSFQTNSGVNIHNSGEIGLAPQGSDTFYFNRDRLYIKGAQWTAHQSGAWGDQWGLEAPVFVDFGNVSNDCYYPIIKGRSGITNEGYISGVDFGMRRITNTWAQGIIRVGNQENGQDPQAIYEFHHNGVFYAPSLLKSGRVSAGGGDPAWTGPCIVIGDNDTGLVHGGDGRINMVANGVHIASWSDSYHIHEGLWDTNGALWTEHGRAIISFGHLVQQNDSYSTFVRDVYVRSDIRVKKDLVKFENASQTLSKINGYTYMQKRGLDEEGNQKWEPNAGLIAQEVQAILPELVEGDPDGEALLRLNYNGVIGLNTAAINEHTAEIAELKSEIEELKALIKSLLK
Physico‐chemical
properties
protein length:1097 AA
molecular weight: 118616,94170 Da
isoelectric point:5,40609
aromaticity:0,09480
hydropathy:-0,36992

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–686
DC_0538 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392 Coil
DC_0339
STR
610–1018
DC_0339
IPR030392
CHP
987–1085
IPR030392
DC_0247
RBD
989–1097
DC_0247
QXV72340.1
1 1097
Architecture
STR
RBD
STR 1-1018 | RBD 1019-1097
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QXV72340.1
1 1097
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 634 634 0,0686
Central domain 635 833 200 0,2287
C-terminal 834 1097 263 0,8759
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-634
Central
635-833
C-terminal
834-1097

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage PSD9
[NCBI] 		2861000 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Shigella dysenteriae
[NCBI] 		622 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QXV72340.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ561532.1 [NCBI]
CDS location
range 39726 -> 43019
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAGCAAATCCAATTTAAAAGAAGTAAAGTAGCCGGTGTACGTCCGACACCGGCCCAGTTGGCTGAAGGTGAACTGGCTATTAACTTAAAGGACCGATTACTTTTTACTAAAGACGATACTGGAGCGATTATCGACCTTGGCTTTGCTAAAGGTGGTAATATTGACGGTAATGTTATTCATAACGGTAACTACAACCAGACTGGCGATTACACCCTAAATGGTACCTTTACCCAAACAGGTGATTTTAATTTAACCGGTATTGCTCGTGTAACTCGTGACATTATTGCCGCTGGCCAGATAATGACCGAAGGTGGCGAGCTTATTTCTAAGAGTGCATCGACGTCCCATTTGAGATTTTTTGACGGCGCATCCCGCGAACGTGGCATTATCTTTTCGCCAAATAATGCTGGAGCGACCACTCAGGTAGTTAATATTCGCGTACAAGATTATGCGACAAGTGGCGAAAGCACTTATGCATTTTCAGGCAATGGACAATTTACTTCACCTGAAGTATCAGCATTGAAATCTATTTCGTCTCCACAAATTCTGACCGATAAAGTTATTACAAACGGGAAGAAGACAGGCGATTATGATATCTATTCATTGGCAAATAATAATTCTAACACAGATAAAAATAATTTACGCGTTGTGCGTACTGATCCAGCGGCCGCAATGCTCCATGAAATTTGTGAAAATAACGGTATCAGTTGGTATTCCGGTTCAACCCCTACTGATTATATGATATCTTTTGCTTATTCCGGTGGTTTTCAAGCTGGACATTCGATTGCAGTAGGTATGGAATCAGGGCCTATGACCTATTCAACCTTAGGTAAAGGTTCTATTGTTTTAGGTGATAATGACACTGGGCTAAAATGGCATCAGGATGGATATTATTTCAGCGTTAATAACGGCACAAGAACTTTCCTGTACGGCCCTGCAGAAACCACCAGTCTTAGAAAAATGGTTATGGGTTATTCTGTAAACGGTACCGATTTAACTACTCCTCCAACTGAAAACTATGCTTTGGCTACTGTTGTTACTTACCATGATAATAACGCATTTGGTGATGGTCAAACTCTTTTAGGTTATTACCAAGGTGGCAATTATCACCACTATTTCCGCGGTAAAGGTACTACAAACGTTAACACCGCTGGTGGTTTGTTAGTTACTCCTGGTAATATTGATGTTGTTGGTGGTTCTGTTAATATCGATGGTCGTAATAATGCTTCTACGCTGATGTTTAGAGGTAACACGACCGGAAGTAGTTCAGTTGATAATATGACTATCGCCGTTTGGGGTAATACCTTTACTAATGTTGATGGCGACCGTAAAAACGTAATGGAAATATCTGATGCCACTAGCTGGATTCAATATTATCAACGACTGTCTTCAGGTGCTATTCAAAGCCATTTAAATGGAACTTTGGGTGTAAACGAAAGTATAAATGTCGGCCAGGAAGTTAACGTCTCCGGCACTATTGCTGGTAATGCGGTCAATGCTCTTAGAATTTGGAACGACGATTACGCCGCTATTTTCCGCCGTTCAGAAAACAGTCTTCATATTATTCCTACCGCCTTTGGCGAAGGTAAAACTGGTGATATTGGTCCACTTCGCCCGTTTCGTATGGACCTTGATACAGGTAAAGTAAGTATTCCTAATATGGATACTACTAATTTGACTATGAACCCAAATGGCTATATTAAATTTGCTGGTCATGGCTCAGGCGCTGGTGGTTATGATATTCAGTATGCACAAGCAGCTCCTGTTTTCCAGGAAATCGATGATGATGCTGTAAGTAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAGTTTTTAAACAGTAAAGCTGTTTGGTCTTTAGGTACTGAAATTAATTCCGGGGATTTTGTTTTACACCATATGAAAGAAGATGGAACACAATCTCATCTCTCAAGATTTAATGCTGACGGTACAGTTAACTTCCCGGATAGCGTTAAAGTCGGTGGCGATAAAGCTACTATCGGCAAAGATGGTAACATCTGGTCTGATATCTGGAAAACGTTTACTTCTGCCGGTGACGTAACCAATCTTCTTGGTGCTGTCTATAGCCGGGTTTCTAAAGAAGGCGATACGTTGACAGGCCGCTTAACTCTTAAAACCAACTCAGACGCCGTTGTTATTGATTATCCAGCAGATGAAGCAGGTTATGTTAAGGGTAAAAAAGGTGGTGTTAATAACTGGTATGTTGGTAATGGCGGTGCTGATAATAACTTATCGTTTTATAGTTTCCAAACTAATTCAGGCGTTAATATTCATAATAGTGGAGAAATTGGTTTAGCTCCTCAAGGGTCGGATACTTTTTATTTTAATAGGGACCGACTTTATATAAAGGGTGCACAATGGACAGCTCATCAATCTGGTGCATGGGGTGACCAATGGGGTTTAGAAGCGCCTGTATTTGTGGATTTTGGCAATGTCAGTAATGACTGTTATTATCCAATTATCAAAGGAAGATCTGGTATTACTAACGAAGGATACATATCGGGTGTAGATTTTGGTATGCGACGCATTACTAATACCTGGGCACAAGGTATTATTCGTGTAGGTAACCAGGAAAATGGTCAAGACCCACAAGCTATATATGAATTCCACCATAATGGGGTTTTTTATGCTCCAAGCTTACTTAAGAGCGGCAGAGTATCGGCCGGTGGTGGTGACCCGGCATGGACTGGGCCATGTATTGTTATTGGTGATAATGATACTGGTTTAGTCCATGGCGGTGATGGTCGTATTAACATGGTTGCCAATGGTGTGCATATTGCATCTTGGTCTGACTCTTACCATATCCATGAAGGTCTTTGGGATACCAATGGTGCTTTGTGGACTGAACACGGAAGAGCTATTATTTCTTTTGGCCATTTAGTCCAACAAAACGATAGCTATTCAACATTTGTTCGTGACGTTTATGTTCGTTCTGATATTCGTGTTAAAAAAGACCTTGTTAAATTTGAAAATGCTTCACAGACACTTTCAAAAATTAACGGTTACACTTATATGCAGAAACGTGGCCTGGATGAAGAAGGTAATCAGAAATGGGAACCTAATGCCGGTTTAATTGCTCAAGAAGTTCAAGCTATTTTACCGGAATTAGTTGAAGGTGACCCTGATGGTGAAGCTTTACTTCGTTTGAACTATAACGGTGTAATTGGTTTAAATACGGCTGCAATCAATGAGCACACTGCAGAAATAGCAGAATTGAAATCAGAGATTGAAGAACTTAAAGCACTAATTAAATCATTGTTAAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
22fcbd999e39588205b46f31d7732348c322c3f895b0a0a3170240229bfa63ed
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5235
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50