Protein

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Genbank accession
XYM57790.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPQNTNLNASPYFEDFDPKKNFYKVLFRPGYAVQTRELIQLQSVLQTQLENFGRNIFKQGDLVVPGEVGLNVRLNYVKLSSVSEVAVADDAGNVTYKKYDIKTLVGLKVQGVSSGVVATVVEVDYGSDTQSDTLYVNYLDSGSSGDEETFRQGENLEVIGGVNSPLLVVGTDGVSLPTSIGVTNPDTGESTVIDSPALGYASAVKVEEGIYFANGYFVRNAEQLLVIDKFYDKPSAKVGFTIEETLVTPEQDSSLYDNSRGSSNFSAPGAHRLKITLTLVKYDYFQLTDKNFIQLLLVKEGVIQKQLQATDYSLVEAALARKTFDQSGDYVVDEFPIQVREYYQQNDNLGFYTAGNDGLVNGLTAIDAEKKLIATVGSGKAYVKGYEVKNKETKYLEIDKARDELKRDNETIKTNGLSSFYVTNVYGTIPLNAEGAELTAYPTLYFHSVFNDGSIGLNKTEAAGDPKRTVSRRGQGFTVADGIKTVYCTISDSTKDMDDFDDDAIGDILDKLWFIKTRSDSGSVNTYGYAEVVSFSKVKRPELGNSTYLEITVKGVRSDLDLYLTNNDATDSIAQIRYLYPSEANVQVKANELLRILDYNETVTPVIGVAKPKNIAIQQVSDGFNVDTDKVLSKGKLAGGVEKYNTVFDLSYFAPQFFTRLTLTDFVSSTFTTGKYVTGTLSGAKAVIEGGTDNVYSSTNKLFVLMISGKFIPGETIINEDGDTIKIARNNTVSHFIVTDRGSGYSAGSLFKLDGVVYDQNKIAWVRGGGGTVQSIRIVDRDAVSVEYAKPPTIEVQTNDVINAEDVVKVTPVLFRDTVYTFDPSNVKSVSTAFGSGNKNAFTADVELEKTAFVNTKSITDFTFTGKEGYKYIECNGFSGDATVSLVIGDIVQFADDTGAVYRYCVQYATRPDGVNRSRIYLDRALQANATGASVVVQKPVITNANGTLVFATGDKKISSLIDSSEDSKIVYNFRRDFITTASSGSGNLTFAAQLPFGTQRFVPFSEENFLITVLDPGITIHGLDTNGDFVPNGGSLVMGDVVYINPEFISITESDSELTAGSVTVNFPENHFGDIDEIRTKAEAYNIANPGSAVTLPDNNFPTLKLTATLQVSKARPRLKTVVRNKRIIVQAGGTTAVPFRGQDYDGENIQITSYSDAFKLRYVYEGSVSSPPTVDSVGGLVSGTDVTSRYIFDDGQRDTYYDISRIVLKPGQTAPTGQMVIAFDYFEHSQGDFCTIDSYLHEAGVPSTEVPFFNSTVNGLISLRDAIDFRPKADDSNIISGYLDKTILSSDGYISFSGTSGIPASTPADDANLTYTVKYNKTQYLDRIDGVFLDTKGNFIVKKGNASLNPSRPESISDAISLYYLYVPAYTDSNRDVRIIPVENKRYTMKDIGKLDSRIERLEYYTSLSVLEQQALNMQISDEVGLDRFKCGFFVDNFETHKGDVNSIDHKVAVDTQQSVLRPQVNEESLGVKEINTRNDQREVDGYVINNGVISLPYTETKLVGNSFATKTINPNPFVVIQYVGDLDISPRVDSWYDRSIVPLITDNNTNLFIPFLAKEDVVDAFSCIYNSFIITWTGAERSFFNINPLATTNSEISQSRVDSATVASSSNISPQNNETPKGVATTNRRGKEIVTSLKYFARSVPVKFTLRRLKPKTEVFVYLEGKNIGRWVAPDSRFSGIPGNSVSAFGTPITTDERGNASGILLIPAGAPPTFATTWTGDVDTVSYDEAGEDIRITTGDKTLRFTSSKTNGSKELVETFAETKFYASGLLPNNPGSIISTQPAYFKANEGLQLVQNNTEQEQKPNPLAQTFKIEGYEGGVFTTGLDLFFSQKSDTVPLRVYLTDVESEKPGKNIIPGTEVVMEPYTFLKVYFTNTVTIFRGETVSGVNSNASGPILKVMDKNDNELAISEDGEITLTNEQVYTIVLSNHNGLDFTPDERLTIPSIIVFNNANNTEIVARIAKDSGVVSAVNITNVGDNYDEASLTIESPSLPGGNNATASAFVSEGKIYNSLLTLGGRGYTEPPSVVIRGTGIGNGGAVIDTEIEITEPAVRMGIAVDAVGSVPSVVATKFKFAYPVYLLNNTEYAVTIETDSQDYFLWASKLGEAEVATSTTVTTNPSLGSVYKSQNTNSWVEDLFEDIKFTLYRAEFDMSKTAHVQLKNTSLGYDAMKIDPLESYAFANANASSSLFKNNNNIIKVTHKNHGFEDGKSYVFFRNLKSTAGFTQGTLNGNLFKVDNAGIDTFTISGIGRAADSVFGGGSTGLIAANKKYERLLAQISYIQTPGTNIDTEVKTTNIIPIDSNTINYTSYSTSSFEKTFLNEEQYFINQKVIASGVNQLMNNLDNSLVYKLSLSTTKSYLSPVIDLSTSSIKISTNRIENGVGDEGRFGKRYQEITFYPVVKFSLANNTDPDSGNTIPITVGQVVEGIGNAANSIDPSASKGEVVRYEASGNTIYVKVKNSSIFRGNERLFFASQMAEGGDLGSYVTDGQGNQVWTPFNVEVTSSGAILENPAFTFGELITATNPSNVTETYDNLISGTVVLWDAPTQTLKLENDRQPINNNYVKESGASVYARAQQIADQPEDIFRVGDIVNAPSIDVGFESFYEIKSMAMTVGVDFVPEDSTLDSSAVAKYVTKEITLDKSATAIDVIITANVTNTKNLKMLYKTKTTSVQSKFDDLEWLLFNDTGYPNEMKNATPQNAISAQKEEQSAYQEFRYSVDTLDEFTSFGIKIAMQTDDPAFVPKIQDIRVVSSR
Physico‐chemical
properties
protein length:2758 AA
molecular weight: 301621,79920 Da
isoelectric point:4,76711
aromaticity:0,09826
hydropathy:-0,25062

Domains

Domains [InterPro]
IPR032096
STR
11–68
IPR032096 DC_0414 DC_0082
IPR032096
STR
202–342
IPR032096 Coil IPR032096 DC_0082
XYM57790.1
1 2758
Architecture
STR
STR
RBD
RBD
STR 11-68 | STR 88-1553 | RBD 1554-1944 | RBD 2002-2758
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-CH3
[NCBI] 		3413214 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM57790.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340851.1 [NCBI]
CDS location
range 81097 -> 89373
strand +
CDS
ATGCCCCAGAATACTAACTTAAACGCATCACCTTACTTTGAAGATTTCGATCCGAAGAAAAATTTCTACAAGGTTCTGTTTAGACCTGGGTACGCAGTACAGACCAGAGAGTTAATTCAACTCCAGTCTGTACTGCAGACTCAACTAGAAAACTTTGGTAGGAACATCTTCAAGCAAGGTGATCTTGTCGTGCCTGGTGAAGTCGGTCTTAATGTCCGACTTAACTATGTTAAACTGTCTTCTGTTTCCGAAGTTGCTGTTGCTGATGATGCAGGTAACGTAACTTATAAGAAATATGATATCAAGACCCTCGTCGGTCTTAAGGTACAGGGCGTATCCTCTGGGGTGGTTGCGACTGTAGTCGAAGTTGATTATGGTTCAGATACACAATCCGATACCCTCTATGTAAACTACCTTGATAGTGGTTCTTCAGGTGATGAAGAAACCTTCCGTCAGGGTGAGAACCTAGAGGTTATTGGTGGTGTTAATAGTCCACTATTAGTTGTTGGCACAGATGGGGTATCTCTGCCAACATCTATTGGTGTAACAAATCCAGATACAGGTGAATCTACTGTTATTGATAGTCCTGCACTGGGTTATGCTTCTGCTGTCAAGGTAGAAGAAGGTATTTACTTTGCCAATGGTTACTTTGTACGTAATGCAGAGCAACTTTTGGTTATTGACAAATTCTATGACAAACCATCGGCAAAAGTTGGTTTTACAATTGAAGAAACTCTAGTAACACCTGAGCAAGATTCCTCTCTGTATGATAATTCCAGAGGATCATCTAACTTCTCTGCTCCTGGTGCTCACAGACTTAAGATTACACTGACTCTGGTCAAGTACGATTACTTCCAGCTAACTGATAAGAATTTTATTCAGTTGCTACTTGTAAAAGAAGGTGTAATTCAAAAACAACTACAAGCAACTGATTATTCGCTCGTAGAAGCTGCTCTAGCAAGAAAAACATTTGATCAATCTGGAGACTATGTTGTCGATGAGTTCCCTATTCAAGTTAGGGAATATTATCAGCAGAATGACAACCTAGGATTCTATACTGCAGGCAATGATGGTCTAGTTAATGGTCTGACAGCAATCGATGCTGAGAAAAAATTAATTGCGACTGTTGGTTCTGGTAAAGCATATGTAAAAGGTTACGAAGTAAAGAATAAAGAAACTAAGTACCTTGAAATTGATAAAGCAAGAGACGAACTGAAGAGAGATAATGAGACTATTAAAACTAATGGTCTAAGTTCGTTTTATGTTACTAATGTATATGGCACTATTCCACTCAACGCAGAAGGTGCAGAACTAACCGCATATCCAACACTATATTTCCATAGTGTATTCAATGATGGTTCCATTGGTCTGAATAAGACTGAAGCAGCAGGAGATCCTAAGCGTACAGTCTCTAGAAGAGGTCAAGGTTTTACTGTTGCTGACGGTATCAAAACTGTCTACTGTACTATTTCAGATAGTACAAAGGACATGGATGATTTTGATGATGATGCTATCGGTGATATCCTAGACAAATTGTGGTTTATTAAAACTAGAAGTGATAGTGGATCTGTTAACACATATGGTTATGCAGAAGTAGTATCTTTCTCCAAGGTAAAGCGACCAGAACTTGGTAACAGCACATACCTAGAAATTACTGTTAAAGGTGTTCGTTCTGACCTAGATCTATACCTTACTAATAATGATGCAACAGATAGTATTGCACAAATTAGATACCTGTATCCTAGTGAAGCAAATGTTCAGGTTAAAGCAAATGAACTGCTTCGTATTCTAGACTATAATGAAACTGTAACTCCTGTTATTGGTGTTGCGAAACCCAAGAACATTGCTATTCAGCAAGTAAGTGATGGATTCAATGTAGATACAGATAAGGTTCTGTCTAAAGGTAAACTAGCAGGTGGTGTAGAAAAATACAACACCGTCTTTGACCTGTCATATTTTGCTCCTCAGTTCTTTACAAGACTAACTCTTACTGATTTTGTATCAAGTACATTTACTACTGGTAAGTATGTCACTGGCACCCTTAGTGGTGCAAAAGCAGTTATTGAAGGTGGAACAGATAATGTTTATTCTTCTACAAATAAACTATTTGTTTTAATGATTAGTGGTAAGTTCATCCCTGGTGAAACTATCATTAACGAAGATGGCGATACCATAAAAATCGCTAGAAACAACACTGTCTCTCACTTTATTGTTACTGATCGTGGCAGCGGTTATTCTGCAGGATCTTTGTTCAAATTAGATGGTGTCGTTTACGATCAGAATAAGATCGCATGGGTTCGTGGTGGCGGTGGCACAGTCCAGAGCATTAGAATTGTAGATAGAGATGCTGTATCTGTTGAATATGCAAAACCACCTACGATTGAAGTACAAACTAATGATGTTATCAATGCTGAAGATGTAGTAAAAGTAACACCAGTTCTGTTTAGAGATACAGTATATACATTTGATCCTTCTAATGTAAAGTCTGTAAGCACAGCGTTTGGTTCTGGTAATAAAAATGCATTTACTGCTGACGTTGAATTAGAAAAGACTGCTTTTGTTAATACCAAATCAATTACCGACTTTACATTTACAGGTAAAGAAGGTTACAAATATATTGAGTGTAATGGTTTTAGTGGCGATGCTACTGTTTCTCTAGTGATCGGCGATATTGTTCAGTTTGCTGATGACACTGGTGCAGTGTATCGTTATTGTGTGCAGTATGCGACCAGACCTGATGGTGTCAACAGATCCAGAATCTATCTGGATAGAGCACTACAAGCAAATGCAACTGGTGCTAGTGTAGTTGTACAGAAACCTGTTATTACCAATGCTAACGGCACTCTGGTGTTTGCTACAGGTGATAAGAAGATTTCTTCGCTGATTGACTCTAGCGAAGATTCTAAGATTGTTTATAATTTCAGAAGAGACTTTATTACAACAGCATCTTCTGGTTCTGGCAATCTGACGTTTGCTGCACAACTACCATTTGGTACACAAAGATTTGTTCCTTTCTCCGAAGAGAACTTCCTAATTACTGTTCTTGATCCAGGGATTACTATTCATGGTCTAGACACCAACGGCGATTTTGTTCCCAATGGTGGTTCCCTAGTTATGGGAGATGTTGTATACATTAATCCAGAATTTATTTCTATTACAGAATCTGATTCTGAGTTAACTGCAGGTAGTGTTACTGTTAATTTCCCAGAGAATCATTTCGGTGACATCGATGAGATTAGAACAAAAGCAGAAGCATATAACATTGCTAATCCAGGTTCTGCAGTTACACTTCCAGACAATAACTTCCCAACTCTTAAACTAACTGCTACTCTGCAAGTATCTAAAGCACGTCCTAGACTAAAGACTGTAGTTAGAAACAAGCGCATCATTGTACAAGCAGGTGGAACTACTGCTGTTCCATTTAGAGGTCAGGATTACGATGGCGAAAATATCCAAATCACCTCGTATTCTGACGCATTCAAATTAAGGTATGTATATGAAGGTTCAGTTTCTTCACCTCCAACAGTCGATTCCGTTGGCGGTCTCGTATCGGGTACAGATGTTACCTCCCGATATATTTTCGACGATGGTCAGCGCGACACGTATTATGATATCTCGCGCATAGTTCTGAAACCAGGGCAGACTGCACCTACAGGTCAGATGGTCATTGCATTCGATTACTTCGAGCATTCACAAGGAGACTTCTGTACTATTGACTCCTATCTGCATGAAGCAGGTGTACCTAGTACCGAAGTTCCATTTTTCAACTCTACTGTCAATGGTCTCATCTCTCTAAGAGATGCTATTGACTTTAGACCTAAGGCAGATGATTCTAATATCATCTCTGGTTACTTGGATAAAACTATCCTATCCAGTGATGGTTATATCTCCTTCTCAGGCACCTCTGGAATCCCCGCTAGCACCCCTGCGGATGATGCTAACCTAACATATACGGTCAAGTACAATAAGACCCAGTATCTGGACCGTATCGACGGAGTGTTCCTTGATACTAAAGGCAACTTTATTGTCAAGAAAGGCAATGCTTCTCTCAATCCATCCAGACCAGAATCTATCAGTGATGCTATTTCACTGTACTATCTGTATGTTCCTGCATACACTGACTCTAACAGAGATGTAAGAATCATCCCTGTGGAAAACAAGCGTTACACGATGAAAGACATCGGTAAACTTGATAGCAGAATTGAAAGACTAGAATACTACACTTCGCTGAGTGTTCTGGAACAGCAAGCACTTAACATGCAGATCAGCGATGAAGTTGGTCTTGATCGCTTTAAGTGCGGTTTCTTTGTAGATAATTTTGAGACTCATAAGGGTGATGTAAATTCCATCGACCACAAGGTTGCTGTTGATACTCAGCAATCTGTTCTAAGACCTCAGGTCAATGAAGAAAGTCTAGGTGTAAAAGAAATCAATACCAGAAATGACCAGCGCGAAGTTGATGGATATGTAATCAATAATGGTGTAATCTCTCTTCCATATACTGAGACTAAACTGGTTGGCAATAGTTTTGCTACTAAGACTATCAACCCCAATCCATTTGTTGTTATTCAGTATGTTGGTGATCTTGATATTTCTCCAAGAGTTGACTCTTGGTATGATAGAAGTATTGTTCCTCTAATTACTGACAATAACACTAATCTGTTTATTCCTTTCCTTGCCAAGGAAGATGTTGTTGATGCATTCTCTTGCATCTATAACTCTTTCATCATCACATGGACTGGTGCCGAAAGATCGTTCTTTAACATCAACCCACTTGCTACTACAAATAGTGAAATTTCTCAATCTAGAGTTGATAGTGCAACTGTTGCAAGTTCTTCTAACATTAGTCCTCAAAACAATGAGACACCTAAAGGTGTTGCTACTACCAACAGAAGAGGTAAGGAAATTGTTACCTCCCTCAAGTATTTCGCACGTAGCGTTCCTGTTAAGTTTACACTCCGTAGACTGAAACCAAAGACTGAAGTATTCGTATACCTGGA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
226349e67d32ecf715a8e7f8d994f3e28867a2cea89ef97369ddf6658cc9bd8a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7648
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50