Protein

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Genbank accession
XYM57670.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,54
Protein sequence
MSKILANQIANYLDNAPIEIKEGLNIPSGKPLQVNGAIGSSGQVLSTDGTGLVWANAPYFDGNYNNLTNQPTIPAAQVNSDWTASSGVAQILNKPSIPPLSSVVIGPASGGGSLIFNNVNGEFTFTPPDLSGYSTFSGSYADLTGKPDLSNYLTSYTESDPVFTASPVGSVTSGQVTNWDNAYGWGNHASAGYLTTEADTLDSVVARGGTTTGNIQVNDITVNGNFSVIGTSTTNNVATLNVTANQIIMNDGVTGAPTLNGTLKVERGTLPDSIFRWNETSDRWEFSNDGTNFYNLATGNADLANTAGYITTYTETDPLFTASAASGIGASDITNWNTAYGWGNHAGAGYLTAESDTLDSVLTRGSTTSLAATFGDLTCSNLTVTGTTTQINTVQLTVNDNTIVLNNDVSTTPTENAGIEVERGLSSNVRLRWNEATDRWTFTNDGSTYYVMPTTIGDLPNDVGYLTSFTETDPVFSASVASGITSTELANWNAAYNWGNHATAGYLTGLLSSSVGELSDVNVSGPATGELLRYNASSSKWENWSPNYLTAFTETDPVFSASAAAGITNTNIVNWNTAYTWGNHQAAGYLTNITSQPISNLSDVSSAAPSDGQALVWNASGSTWQPGTVSGGGGGSSNVPTQDDAPSSPTDGDLWWESDTAKLKVYYDDGNTAQWVDASPAGGGGASNVNGLSDVTVSSPQDGDVLIYNSGVPGWVNAANNVSTLNTAYFGVGDPGTGTPSIVQLEGLGPGGALELTNGGSPVAISFDYNTGTAGQVITATGNDGFGNATGATWSDVSVPTAPVAVGCINMNGSSPTWSGTSGYTVAHSGGGGSDEVYTLTFPTSYSARTDYIVHVTYDGYDWVGSNGAQVGVERGTASVVFVVRRWNEDPLALGDLMVSITNL
Physico‐chemical
properties
protein length:904 AA
molecular weight: 93709,28020 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,09071
hydropathy:-0,20520

Domains

Domains [InterPro]
DC_1617
STR
19–353
DC_1617 DC_1461 DC_0994
DC_1617
STR
321–600
DC_1617
XYM57670.1
1 904
Architecture
STR
RBD
STR 19-675 | RBD 771-904
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-CH1b
[NCBI] 		3413213 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM57670.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340850.1 [NCBI]
CDS location
range 169963 -> 172677
strand +
CDS
ATGTCAAAAATTCTTGCAAACCAGATTGCAAACTACCTTGATAACGCACCTATTGAAATCAAGGAAGGTTTGAATATCCCATCTGGAAAACCATTACAGGTTAATGGTGCTATTGGTTCTAGTGGACAGGTGTTAAGCACTGATGGAACTGGTCTGGTGTGGGCAAATGCTCCATACTTTGATGGTAACTATAATAATCTTACTAATCAACCAACAATTCCTGCAGCACAAGTTAATTCTGATTGGACTGCTTCTAGTGGTGTAGCACAGATTCTCAACAAACCATCAATTCCACCCCTGTCTAGTGTTGTTATTGGTCCTGCATCTGGTGGAGGTTCTTTAATCTTTAATAATGTAAATGGCGAATTCACATTTACACCACCTGATCTTTCTGGTTACTCTACATTCTCTGGATCATATGCTGATCTAACTGGTAAACCAGATCTTAGCAACTATCTTACATCTTATACCGAATCTGATCCTGTATTTACTGCGTCTCCCGTTGGTAGTGTAACCAGTGGACAAGTTACAAACTGGGATAATGCATATGGATGGGGCAATCACGCTTCTGCTGGATATCTAACTACAGAAGCAGACACACTTGATAGTGTAGTTGCTAGAGGTGGTACTACAACAGGAAATATTCAAGTAAATGACATTACAGTCAACGGAAACTTTAGTGTAATTGGAACTTCGACTACAAATAATGTAGCAACACTAAATGTTACTGCTAACCAAATCATTATGAATGATGGAGTCACTGGAGCTCCAACTCTCAATGGTACTTTGAAAGTAGAGAGAGGAACACTACCAGATTCTATCTTCCGTTGGAATGAAACTAGTGATCGCTGGGAGTTCTCTAACGATGGTACGAACTTCTATAATCTTGCTACAGGAAACGCTGATCTAGCAAATACTGCTGGATATATTACTACTTACACAGAAACTGATCCTCTCTTTACTGCATCTGCTGCTTCGGGTATCGGTGCATCTGACATCACCAACTGGAACACTGCATATGGATGGGGCAACCATGCTGGAGCAGGTTATTTAACTGCAGAATCTGATACATTAGATAGTGTATTGACTAGAGGTTCAACCACAAGTCTTGCTGCTACATTTGGTGATCTAACTTGTAGCAACCTCACAGTTACTGGAACTACAACACAAATTAATACTGTTCAACTTACAGTAAATGACAACACAATTGTCCTCAACAACGATGTATCTACAACACCAACAGAGAATGCTGGTATCGAAGTTGAGCGTGGACTATCTAGTAATGTAAGACTTCGCTGGAATGAAGCAACAGATAGGTGGACATTTACAAATGATGGGTCTACTTATTATGTAATGCCAACTACTATTGGCGACCTTCCAAATGATGTAGGATACCTAACCTCATTCACTGAAACAGATCCAGTATTCAGTGCTTCTGTTGCTTCTGGAATTACATCGACTGAACTTGCTAATTGGAATGCTGCATATAACTGGGGTAATCATGCTACTGCTGGTTACTTGACTGGTTTATTGTCTTCTTCGGTTGGTGAACTTTCTGATGTTAATGTATCTGGACCAGCAACTGGAGAACTTCTGAGATATAATGCCTCTTCTTCTAAGTGGGAGAATTGGTCTCCAAATTATCTGACAGCATTTACTGAAACGGATCCAGTATTCTCTGCATCTGCTGCAGCAGGTATTACTAATACAAATATTGTTAACTGGAACACTGCATATACTTGGGGCAACCATCAAGCAGCAGGATACCTAACAAATATTACATCACAACCCATCAGCAATCTATCTGATGTAAGTAGTGCTGCTCCTTCTGATGGACAAGCACTAGTTTGGAATGCATCTGGAAGCACTTGGCAACCAGGAACTGTATCTGGTGGAGGTGGTGGATCTTCTAATGTTCCTACACAAGATGATGCTCCATCTAGTCCTACTGATGGTGATCTCTGGTGGGAAAGTGACACTGCAAAACTAAAAGTATATTATGATGATGGCAATACAGCACAGTGGGTAGATGCTTCTCCTGCAGGAGGTGGCGGCGCTTCAAATGTTAATGGATTAAGTGATGTCACTGTTAGTAGTCCCCAGGATGGTGATGTTTTAATCTATAATTCTGGTGTTCCTGGATGGGTTAATGCTGCTAACAATGTTAGCACTCTTAATACTGCTTACTTTGGCGTTGGAGATCCTGGTACTGGTACTCCAAGTATCGTACAACTCGAAGGACTGGGACCAGGAGGAGCATTAGAATTAACTAATGGAGGATCTCCAGTTGCTATTTCTTTTGACTATAATACTGGAACAGCGGGACAAGTAATCACTGCAACAGGAAATGATGGGTTTGGAAATGCAACTGGTGCTACATGGAGTGATGTTAGTGTTCCTACTGCCCCTGTTGCTGTTGGTTGTATCAATATGAATGGCAGCTCACCAACATGGTCTGGAACTTCTGGATATACAGTTGCTCATTCTGGGGGTGGTGGTAGTGACGAAGTTTACACACTCACATTCCCAACATCATATAGTGCAAGGACTGATTACATTGTCCATGTTACCTATGATGGATATGATTGGGTTGGTTCTAACGGAGCACAAGTGGGTGTTGAGAGAGGAACTGCAAGTGTTGTATTTGTTGTTAGAAGATGGAATGAGGATCCACTAGCTCTTGGTGACCTTATGGTTTCAATCACTAATCTCTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
b1fa212e10a913e9a9256894a0352c518a2ec5895bbb3a61047339c89c77d47b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6793
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50