Protein

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Genbank accession
NP_861941.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,63
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,87
Protein sequence
MVDIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQNYDETRAYTKDFIVLYDNRFYQALSDIPAPAGPFSLAKWKATRTDAEWITVQGGDFQLSVGNSIAVDTSAGIDINFTLPQNPLDGDTVILSDIGGRVGYVKVQITAEAQSIVNFRGQQVRSVLMTHPKSKIVFIFSNRLWQMYVSDYERNAVTVTPAKPYQAQPNDFIIRRFTSAAPINITLPRNANNGDIINLVDLDKLNPLYHTIVKTYDDTTSIREAGVHVAEGRNTAEAFFVYDSANSLWRVWEGDQKSRLRIVRNDTDLRPNEEVLVFGTNNDTISTVNLTLPTDILSGDTVKISLNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSISLLQFPKRSEYPPDAQWVSVSELEFNGDTSYVPVLELAYIEDYSSETKYWVVQQNTVTVERVDASSNTTRARLGVIALASQAQANVDLENAPGKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTDFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEVATQAETNAGTDDTTIITPKKLDARQGSEVLSGIVKYTSTTGTTAATVRGNAGTNVYNKAVDNLTISPKALDQYKATHTQQGAVILAIESEVIAGESQAGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISSPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPSWTATTAIRGFVKTSSGSITFVGDDTQGNTQDLNLYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAADSNLLDGLDSLQFIRRDIDQTVNGSLSLTKQTNLSAPLVSTSTASFGSEASVTRRLTLNDSSGSEIVFTKGTQSLSNKENFVVRAWGNSATAGDRDTVFEAGDETGYHFYSQRAADNKVSFNINGTLYSTGIVSTNGLNVTGVSTFTGPISATGEIVSSSPIAFRAINGNYGVMLYNAGNSSYIALTNSGDQTGTFNNLRPITINNATGLVRLDNGVQITSGATITTGGLTVNNRIISNGVKTATVYTDKPTASTVGFWSIDINDSAVYSQFPGYWTRDNKGNRDQEIKYPGTLTQFGNSLDSLYQDWICYPTGANGGSIRYTRTWQKNKDAWTSFAMVFDSGNPPSPSDVGAIPSDNAVIGNLTVRDFLQLGNVRIVPDPVNKTVKFIWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1277 AA
molecular weight: 138562,17270 Da
isoelectric point:5,11786
aromaticity:0,07596
hydropathy:-0,33571

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–126
DC_1986 DC_1209
IPR048390
ATT
969–1089
IPR048390 IPR048391
NP_861941.1
1 1277
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-126 | STR 343-968 | ATT 969-1089 | STR 1090-1135 | ATT 1136-1225 | STR 1226-1260 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage RB69
[NCBI] 		12353 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Mosigvirus
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
NP_861941.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_004928 [NCBI]
CDS location
range 149353 -> 153186
strand +
CDS
ATGGTTGACATCAAACGTAAGTTCAGGGCCGAAGATGGTCTTGACGCAGGCGGTGATAAGATAGTTAACGTTGCGCTTGCTGACCGCACAGTTGGCACCGATGGCGTGAACGTTGACTTTTTGGTGCAAGAAAACACCGTACAGAATTATGACGAGACGCGCGCGTATACAAAAGATTTTATTGTTCTTTATGATAATCGTTTTTATCAAGCTTTAAGCGATATTCCAGCTCCGGCAGGCCCTTTCTCTTTGGCTAAATGGAAGGCAACTCGTACAGATGCAGAATGGATTACAGTTCAAGGCGGAGATTTCCAATTATCAGTAGGTAACTCTATTGCGGTTGATACTTCAGCTGGCATTGATATTAATTTCACTTTGCCTCAAAATCCTTTAGATGGCGATACAGTTATTTTGTCTGATATTGGCGGTAGAGTAGGCTATGTAAAAGTTCAAATTACTGCAGAGGCTCAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGACAACAGGTTCGTTCAGTTTTAATGACGCACCCAAAATCTAAAATAGTATTCATTTTTAGCAACCGCCTATGGCAAATGTATGTTTCTGATTATGAACGTAATGCAGTCACAGTAACTCCTGCTAAGCCATATCAGGCGCAACCTAACGATTTTATCATTCGACGTTTTACATCAGCCGCTCCTATTAATATTACATTGCCTCGCAATGCTAATAATGGCGATATTATTAATTTAGTTGATTTAGACAAATTAAACCCGTTATATCACACAATTGTCAAAACTTACGATGATACAACTTCTATACGAGAAGCCGGTGTTCATGTAGCAGAAGGACGTAATACTGCAGAAGCGTTCTTTGTTTATGATTCTGCTAATAGCTTATGGCGTGTTTGGGAAGGTGACCAGAAATCTCGTTTACGTATAGTTCGTAATGATACTGATTTACGCCCTAATGAAGAAGTTCTTGTTTTTGGAACTAATAATGATACAATCTCGACGGTAAATCTTACTTTGCCTACAGATATTTTGTCTGGTGATACTGTTAAAATATCGTTGAATTATATGCGTAAAGGGCAAACTGTAAAAATTAAAGCTGCTGAAGGCGATACAATTGCTAGCAGTATTTCTTTATTACAGTTCCCAAAACGTTCAGAGTATCCACCTGATGCACAATGGGTTTCTGTTAGTGAGCTGGAATTTAATGGCGATACTTCGTATGTCCCTGTACTTGAGTTGGCTTATATAGAAGATTATTCATCTGAAACAAAATATTGGGTAGTTCAACAAAACACTGTAACCGTCGAACGAGTCGATGCATCGAGCAATACAACTCGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTTCTCAAGCACAAGCAAATGTTGATTTAGAAAATGCTCCTGGTAAAGAACTGGCTATTACTCCGGAAACATTAGCAAATCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTATTGCTCGTATTGCAACAACTGCACAAGTTAACCAGAATACCGATTTTGCATTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTGAACGAACGTACAGCAACTGAAACCCGTAGAGGTGTTGCTGAAGTTGCAACTCAGGCTGAAACTAATGCTGGAACAGATGATACCACTATTATTACTCCTAAGAAATTGGATGCCCGTCAAGGTTCTGAAGTTTTATCTGGTATTGTAAAATACACATCTACGACTGGTACTACAGCTGCTACTGTTCGTGGTAATGCTGGGACTAACGTTTATAACAAAGCCGTAGATAATTTAACTATTTCTCCAAAGGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCATACTCAACAGGGCGCAGTAATTCTTGCTATTGAAAGTGAAGTTATCGCTGGCGAATCACAAGCCGGTTGGGCTAATGCTGTAGTGACCCCTGAAACTCTGCATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAACACTGGAACTGATTATACTAGAGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGACGATACTCGTATCTCGTCTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGCGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTGATTAAGGTTGCTACTCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCACCTAAGAATTTAAAATGGATTGTTCAATCAGAACCATCATGGACTGCTACTACGGCAATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCTGGTTCTATTACATTTGTCGGTGACGATACTCAAGGTAATACCCAGGATTTGAATCTTTATGAGAAAAATAGTTATGCTATTTCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTACTTACCGTTGAAAGCTAAAGCAGCTGATAGTAATTTGTTAGATGGTCTAGATTCTCTTCAGTTCATCCGTAGAGACATCGACCAGACGGTTAATGGTTCTTTAAGTCTTACTAAACAGACCAACCTGAGTGCTCCTTTAGTATCTACAAGCACCGCTTCTTTTGGTTCCGAAGCATCTGTTACTCGTAGATTAACTCTTAATGACTCTAGCGGTTCCGAAATAGTTTTCACTAAAGGAACCCAATCTCTTAGTAATAAAGAGAATTTCGTTGTTAGAGCATGGGGTAATAGCGCTACAGCTGGTGACCGTGATACAGTATTTGAAGCGGGTGACGAAACCGGATACCATTTCTATTCTCAGCGCGCTGCTGATAATAAAGTATCATTTAATATTAATGGAACACTTTATTCAACAGGTATTGTTTCTACAAATGGATTAAATGTTACAGGTGTTTCTACCTTTACCGGGCCTATTAGTGCTACAGGCGAAATTGTTTCTAGTTCTCCTATTGCATTCAGAGCTATTAACGGTAACTATGGTGTTATGCTTTATAACGCTGGTAACAGTTCTTATATTGCATTAACTAACTCAGGTGACCAGACCGGGACGTTTAATAACTTACGCCCGATCACGATTAACAATGCCACAGGATTAGTTCGTCTTGACAACGGTGTTCAAATCACAAGTGGTGCAACAATAACTACCGGTGGGTTAACTGTAAATAACAGGATTATTTCTAACGGCGTTAAAACTGCCACGGTTTATACCGATAAACCAACAGCTTCTACTGTAGGTTTTTGGTCTATTGACATTAACGATTCTGCTGTATATAGCCAATTCCCTGGATACTGGACGCGTGATAACAAAGGTAACCGTGACCAAGAAATTAAATATCCTGGTACTTTGACTCAATTCGGCAATAGCTTAGATTCGCTTTATCAGGATTGGATTTGTTATCCTACAGGTGCAAATGGTGGTAGTATTCGATATACTCGTACCTGGCAGAAAAATAAAGACGCTTGGACCTCATTTGCAATGGTATTTGATAGTGGCAACCCACCTTCACCTAGCGATGTCGGTGCTATCCCATCCGATAATGCTGTGATTGGAAACCTTACTGTTCGAGACTTCTTACAATTAGGAAATGTGAGAATTGTTCCAGACCCGGTTAACAAAACCGTTAAATTTATATGGGTTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7b4618a1ae6624d514992fc863fd205adffe70707cc83574a5c2803692b90f83
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5552
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Enterobacteria phage RB69 complete genome Petrov,V., Nolan,J., Chin,D., Letarov,A., Krisch,H.M. and Karam,J.D. 2002-08-01 — GenBank
RNA and protein determinants of autogenous translational control by the Ssb proteins of bacteriophages T4 and RB69 Borjac,J., Petrov,V.M. and Karam,J.D. 2004-09-17 — GenBank