Protein

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Genbank accession
AZB66608.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MIHVMNFKGEIVDFIAQSDSAVIQAVHKRDINERIETFDFTILSERTTYMQERNRIVIQDKNGQYREFIIDRISADIEGYTEVETVASYLEDITKARPYAPGKLEKMTTKQALSDVLKDTGWQVSDATEYDGLRTTSWTSYQTRYDVLLQLCTTYKMMADFYIEVGSNRVDKRLVVLRKRNPLFKGKEITYGKDLTGLKRTVDFSEIKTALLCVGPEPEEGKKRVELVVKDDESQAKYGLPGRYNWGIYEPETEDQNMTEKRLRTLGTTELNKRKSEVITYEVTAIDIEKEYKHEIVNLGDMVRIKNRDFTPPLYVEAEVISEEYDLISKDVTYGFGTYKEFKESDLRSSFDRKLDAIRQKVSDGLSNVNTIVRESLEGELQYFERKISKGDTPPDNPVNDLLWLDTSNPEVAVLRRYWNGEWIKSSAENADDVGAITREQALYSELNNTFVNLTIQHSRLIHEVSDVLESEYLVDTDIKEEVNSKLNETIGVFNTIKSNLDSMTSETATIGKLVDTQALFLEYREKLQALYNAVENAKIAIDQRFKLLQSQYTDEKFNEALNNVASKLGLTVNEDNQLVGEVDVSKQINESVREMTNEMLRDYVTSTEYQSDKNGIIERLNSADTERQQLSNEISDRVTLSEYNSGIDSTKQYADEQVNNLTLGNVNLIKSYHSPEYLKTATVEDDYSLLFSTSGKNINFFFYDSNGYTNTPLEANTDYILKLHEADENVEMGVFYNKGRNTIKTYTKDRVIRFNTADKVDFRILLIARDANVHAGKLSLYKGTKELDWTPNPEDVNAKIDQAKASAEKSSKAYTDDKVQQVNQTLSTHETRLTQNGKDIALRATQEELNASKKTLSHVIADLTVNTTTGLTMTYDENGAIQSHTIGPDGIKLKGDRVDITVNKDFNVLVNDVANKADETNIINKINLSREGLDINVNKIGIRGGNDFSYVDIRNDQIELSGEYTRTFRGDTQKDFVYTRIKDGLLRFRNNTRNRSLYYSDFGISTYVDGGPNESSGTLQFFDYTYSKNARGVTLNSVTGVVALRSDNNSIVIESSLTTNIESNNYSVYIRPFKQSRAGLNEFQFYVKDADSSSNTDGCILFGNLTDPNGVHGSGIRFSKSRTDNILYVTNPNGDIGTGDISVRAAEIRDYIRTIGMLEIRQWSDSKAFNQIKVGAVNTTNSVVMASHSGGNAYYGVGGGSNEMRVTNNNGYNGGNTSYKPVRASAFNNASLAEYKKDIKVWDYDALSVIANDLELYQYRYKGDSDDQMFHRGVVIGDGYLTPAEFVFGDGVNLYEMLTWSLRSIQQLNEKINKLEEQLNEQTAS
Physico‐chemical
properties
protein length:1326 AA
molecular weight: 150200,20630 Da
isoelectric point:4,99958
aromaticity:0,08974
hydropathy:-0,59804

Domains

Domains [InterPro]
DC_0109
STR
1–787
DC_0109 DC_0203
IPR007119
Unmapped
27–333
IPR007119 Coil DC_0899 Coil
AZB66608.1
1 1326
Architecture
STR
RBD
STR 1-1097 | RBD 1200-1326
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage phiSP38-1
[NCBI] 		2491320 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AZB66608.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK075002 [NCBI]
CDS location
range 35021 -> 39001
strand +
CDS
TTGATCCACGTAATGAATTTTAAAGGTGAAATAGTTGATTTTATAGCGCAATCAGATAGTGCGGTAATTCAAGCGGTGCATAAACGCGACATTAACGAGCGTATAGAAACATTTGATTTTACGATATTGTCTGAACGCACAACTTACATGCAAGAACGTAATCGCATTGTCATTCAAGATAAAAACGGTCAGTATCGCGAATTTATTATCGATAGAATTTCAGCAGATATTGAGGGATATACCGAAGTCGAGACGGTCGCGTCGTACCTTGAAGATATAACAAAAGCGCGTCCCTACGCACCAGGCAAATTAGAAAAAATGACGACTAAACAAGCGTTGTCTGATGTGTTGAAAGACACAGGTTGGCAAGTATCTGACGCTACCGAATATGACGGCCTACGAACGACTTCATGGACATCTTATCAAACACGATATGATGTGTTATTACAACTGTGTACGACGTATAAAATGATGGCAGACTTTTATATAGAAGTTGGTTCGAATCGTGTGGATAAACGTCTTGTCGTTCTAAGAAAACGCAATCCTTTATTTAAAGGGAAAGAAATAACATACGGCAAAGACTTAACAGGTTTGAAGCGTACTGTTGACTTTTCAGAAATCAAGACAGCATTATTGTGTGTCGGTCCTGAGCCGGAAGAGGGTAAAAAACGTGTTGAGTTAGTCGTTAAAGATGACGAATCTCAAGCAAAATACGGGCTACCTGGTCGATATAATTGGGGTATTTACGAACCTGAAACAGAAGACCAGAACATGACTGAAAAACGTTTGCGAACTTTAGGTACAACAGAACTGAATAAACGTAAATCAGAGGTCATCACTTATGAAGTAACTGCAATCGATATCGAAAAAGAGTATAAACACGAAATCGTTAATCTCGGTGATATGGTACGTATTAAAAACCGAGATTTTACACCACCTCTATATGTAGAAGCTGAAGTTATTTCAGAAGAATATGACTTAATCAGTAAAGATGTAACTTATGGCTTTGGTACGTATAAAGAATTTAAAGAAAGTGACTTGAGAAGCTCATTTGACAGAAAATTAGACGCTATTCGACAAAAGGTAAGTGACGGTTTATCTAACGTCAATACAATCGTCAGGGAATCACTAGAGGGAGAACTGCAGTACTTTGAACGTAAAATTTCGAAAGGTGATACACCGCCAGATAATCCTGTTAACGATTTACTGTGGTTAGATACAAGCAATCCTGAAGTGGCTGTGTTACGTCGTTATTGGAATGGTGAGTGGATTAAGTCATCGGCTGAGAATGCAGATGATGTAGGCGCTATAACACGTGAACAAGCGTTGTATAGTGAGCTAAACAATACATTTGTTAATTTAACTATTCAGCATAGTAGATTGATACATGAAGTATCTGACGTTTTAGAATCTGAATATCTTGTCGATACTGATATAAAAGAAGAAGTAAACAGCAAATTAAATGAAACAATTGGCGTGTTTAACACGATTAAGTCTAATCTTGACAGTATGACTTCTGAAACAGCCACAATAGGAAAATTGGTTGATACACAAGCACTATTTCTTGAATATCGTGAGAAATTGCAAGCGCTATATAACGCTGTCGAAAACGCAAAAATCGCGATTGATCAGCGTTTTAAACTTTTGCAATCCCAGTATACTGATGAAAAGTTTAATGAAGCATTAAATAATGTAGCGTCTAAATTAGGGTTAACTGTTAATGAAGATAATCAACTTGTTGGAGAAGTTGACGTTTCCAAACAAATTAACGAATCCGTGCGTGAAATGACAAACGAAATGTTAAGAGACTACGTTACTTCTACCGAATATCAGAGTGATAAAAACGGTATTATAGAACGGTTAAATTCGGCCGACACAGAACGACAACAATTAAGTAACGAGATTAGCGATAGAGTTACATTAAGCGAATACAACAGTGGTATTGATAGTACAAAACAATATGCTGATGAACAAGTTAACAATTTAACTTTAGGTAATGTTAATCTTATTAAAAGTTATCATTCTCCGGAATATTTAAAAACAGCAACGGTTGAAGATGATTATAGCTTACTTTTTTCGACATCAGGAAAAAATATCAACTTCTTTTTCTATGACTCGAACGGCTATACAAATACACCGCTCGAAGCAAATACTGACTACATTTTAAAATTACATGAAGCTGATGAAAATGTTGAAATGGGTGTCTTTTACAATAAAGGACGTAACACTATTAAAACATATACAAAAGACAGGGTAATACGCTTTAACACAGCTGATAAAGTAGATTTTAGAATTTTATTAATTGCACGTGACGCAAATGTGCATGCTGGTAAATTAAGTTTATACAAAGGAACAAAAGAATTGGATTGGACACCTAATCCAGAAGATGTTAACGCTAAAATCGATCAGGCAAAAGCAAGCGCTGAAAAATCATCAAAAGCGTATACAGATGACAAAGTACAACAAGTGAACCAAACACTCTCAACTCACGAAACACGCTTAACTCAAAATGGTAAAGATATTGCGTTAAGAGCAACACAAGAAGAGCTCAATGCTAGTAAAAAAACATTATCGCATGTGATTGCTGATTTAACTGTAAACACAACGACTGGATTAACGATGACATATGACGAAAATGGTGCGATTCAATCTCACACTATCGGTCCGGACGGTATCAAGTTAAAAGGTGATAGAGTAGATATTACAGTTAACAAAGACTTTAATGTGTTAGTAAATGATGTTGCGAATAAAGCTGATGAAACAAACATTATTAATAAGATAAACCTGTCACGAGAGGGGCTAGACATCAACGTTAATAAAATCGGTATACGTGGTGGTAATGATTTTTCGTACGTCGATATTAGGAATGACCAAATTGAATTAAGCGGTGAATATACACGCACTTTTAGAGGAGATACACAAAAAGACTTTGTGTATACAAGAATAAAAGATGGTTTGCTTCGTTTTAGAAATAATACACGCAATCGCTCGCTTTATTATTCAGATTTTGGTATATCGACATATGTTGATGGTGGTCCTAATGAGTCTTCGGGGACATTACAATTTTTTGATTACACATACAGCAAAAATGCTAGAGGTGTTACCTTAAATAGTGTGACTGGTGTCGTTGCTTTACGGTCGGATAATAATAGTATTGTTATTGAATCATCACTAACAACTAATATTGAAAGCAATAATTATTCGGTTTATATAAGACCGTTTAAACAATCGCGTGCAGGTTTAAATGAATTTCAGTTTTATGTAAAAGATGCTGATTCTAGTAGTAATACTGACGGTTGTATTTTATTTGGAAACTTAACTGATCCAAACGGCGTACACGGTTCTGGCATTCGATTTAGTAAGTCGCGAACTGATAACATCTTATATGTTACTAACCCTAATGGGGATATTGGAACGGGTGATATTTCTGTAAGGGCTGCAGAAATAAGAGATTATATTAGAACAATCGGCATGTTAGAAATACGACAATGGAGCGACTCAAAAGCTTTTAATCAAATTAAAGTTGGAGCAGTTAACACAACAAATAGCGTTGTAATGGCTTCGCATAGTGGTGGTAATGCGTATTATGGTGTTGGTGGCGGAAGTAATGAGATGCGAGTTACTAATAACAACGGCTACAACGGAGGTAATACCTCGTACAAACCAGTTCGAGCATCAGCTTTTAATAACGCTTCGTTAGCCGAATATAAGAAAGATATTAAAGTGTGGGATTACGATGCTTTAAGTGTTATAGCTAATGATTTAGAACTATATCAATATCGCTATAAAGGTGATTCTGACGACCAAATGTTTCATAGAGGTGTTGTTATCGGAGATGGGTATTTGACGCCCGCCGAGTTTGTTTTCGGTGACGGTGTGAATTTGTATGAAATGCTGACGTGGTCGCTTAGATCCATACAGCAGTTAAACGAAAAAATAAACAAACTGGAGGAACAATTAAATGAACAAACTGCAAGCTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
cd9a58ea8a86f88d92ff9a798980f706a819418de770588e4b6e58140ce91c2c
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7607
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Prophage of Staphylococcus pseudintermedius Wipf,J.R.K., Deutsch,D.R. and Fischetti,V.A. 2014-10 — GenBank