UniProt accession
Q58LL1 [UniProt]
Protein name
YadA domain-containing structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRLQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDADGNFAAGTITATVIGNASTAARLASTRQIQISGDLTATGNFDGSQNLNLASSLELIPTLPHYDGTASASGTYTKVTVDSKGRITNASFPSTLADYNLNGTVEGSSAQPYDLDLVAIAGLTTTGMISRTSGGNMATRTITGTPTRISIVNGNGVSGNPTIDLITTAVVPGNYNTESLTSVNAVGSSSEPFGTQTVNAVKFTVDDRGRLTSATNVPIATAVEGTTALDYNAATSYSRYAIIKNASKVYQAYQAISAGAGAPTHTSGDNGGWRYLAAESTEQKGLASFAQEDFDVASGHVSIAAAGVDNTQLQNNRVSFADGNSVEHFELDQELTATTGYRGFTGINYVNVKNTSGGLLFAANNTGDSGNGEVDINVKTLISDPDVVFDGATAQTIDKTGDGNLTIQTTQSSSSARSLSIAATNSGSGTSTVSITAEDVVDIQASDASTGKVHVENMRIQGDHLASTGTLKLDPGDDRAVTGLVQILGNLQVDGTTTTVNSTTTTVDDPVFTLGGDTAPTTDDNKDRGIEFRYYDSQARLGFFGYDDSYADLGGHTGGFAFLYNASQSSAEIFTGTDAGIRAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGVGIGDDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNIVFQGASKTLELKNGSGTTKTTLHTTTGNVDVGGILTVTGAIDANSSAAISGDVHLESTNDITTAKNGTTGAWEIQSSDYGALRLDGGFYVAGSGLIDGTLHVNGPIEVKDSATETESRLNWLRVRYRGRFGDTYQASPSYASHNFSTIKAHGGAGIMKSLYVGATGSGERFSVGKLNSGDTEKFSVIGASGNTDIQGTLNVEGNTTIQDSVTINASNENFKIQNGSAVDKFTVDTDNGNTVIEGTVNINGVTDVDADFAVRNGTTDKFFVASSTGNTNIEGTLTADGHTELNSTLNVDSNTTIGGTLEVTNNTEINGTLDVDANFAVRSGTTDKMTVASSTGNIATDGTLVVAGQTTINDSLIIQSDNEVVNVNNGSGVNKFSIDTDNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFGTSGVNTFTNNTEQTLTGTYAADGAVRLTGGAGIGKNLAVGGGLRVYGGTELSGALDLNSSANISGSTIVENQLIVKADNKFFKVQTAGAVDKFTIDTDNGNTVSQGDLTVAGDVNAQSNLIVTGNLTVNGTTSTVNSTTVTIDDPVFTLGGDTAPASNDGKDRGIEFRYFDGSAKLGFFGFDRSTQEFAFLTTATNSSEVFSGTDAALRIGSLNVTGAGTSVDIDNNLNVDGTATVDGQIISQLPQGTAPFVVASSTKVNNLNADFLDGLTTSATDTTGNSVVTRASGNFSAGQITAATGTGAAAGFLGNASTADAWKTARTLTIDGVVDGSVSINGASDPTLTVTFNDADITALAAQSGTGYMVRTAANTYAHRTFSVTASSGITLTNADGVSGNTTINVASASTNAANNLVLRDGSGNFASNVITATSFSGNLIKSSTSAKDIKPESNSTYDLGSSALQWANIHADAANIDTVTGNLTGNVTGNLVAATTQAKDIDPALNSTYDLGSSSLKWANIHADAASIGTTTGNVTGNLTGNLVAATTEAKDIDPALNSTYDLGSSSLKWANIHADAAAIATTTGNLTGNVTGNLVAATTESKNIVPDLNATYDLGSSTKQWSNIHADAGNIDAITGNLTGNVTGNLLAATTLAKDIKPDANSTYDLGSSTLKWQNIYADAAAIATTTGNVIGNLTGNLLASTTQAKDIKPALNSTYDLGSSSLKWQDIFADAASIGTVTGNVTGNLTGNLEASTTQAKDIDPALNSTYDLGSASLKWQRIFADAATISTTTGNLTGNVTGNLVANTTESANIIPDTNGIYSLGSSTKKYMNVFADAAAITTITGNLTGTATQAANINNHDTDALSEGLNNLYTTAARTRGHFTYGTGIEHDGAGGLAVTQSDINTDNITEGSTNVFFTDTRADARVAAATGANLDLSQKTTTNLAEGTNLYHTEARVQTKLDHAFEQLKAMLNNLATSTTLKLNLSGDPTPGSVVTLGSISSNGVGGYTAGTNVATTASALGTGLTVDTTVNADGAITAIALNQAGTDYVIGETITIPNSNLGGVDTLNLGTLSGGVGGFSAGTGVATTNSGSGDDALTVNTTVDGNGAITNVVINAAGTGYVAGDTITITNPNAGGAATVDTLVGGTGYANGTAIATTTVGSGSGLTLDLTTSNGVVTGVAINGAGSGYAVDDTITIVNANASGVKTLGSIATAGTGYATGTAIATTNDGSGSNFTVDISSVDASGAITAVAINNDGSGYTASDTITIVNANSGGVKTLGTIATGGTGYAAGSAIATTSSGSGTSLTVDLTVDNGVVTGVTINDDGSGYAASEVITIVNANASGIKTVGNFGATDSSRTPGTYTIGTSDYITQASGANATFTVVIGVGGTVDSITVTDDGSGFIVNETITIADAQLGGGGGAALTFDATAIHGNGCTIPVSAIHGNGCTIPVSEIHGNGATIDIATIFTNATVNVATVFTNATFSLSDITTMEIGATLTGTTSNSSGVITAMDSTSVTVDNVSGFFKKGETVGANDVTNLTISSFG
Physico‐chemical
properties
protein length:2657 AA
molecular weight: 268691,80570 Da
isoelectric point:4,29836
aromaticity:0,05382
hydropathy:-0,09627

Domains

Domains [InterPro]
Q58LL1
1 2657
Architecture
ATT
STR
STR
STR
STR
RBD
RBD
RBD
STR
ATT 4-43 | STR 44-242 | STR 338-908 | STR 1106-1567 | STR 1688-1742 | RBD 1743-1910 | RBD 1997-2174 | RBD 2245-2325 | STR 2401-2656 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-SSM4
[NCBI]
268747 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Ronodorvirus > Ronodorvirus ssm4
Host Prochlorococcus
[NCBI]
1218 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae >
Host Prochlorococcus marinus str. NATL2A
[NCBI]
59920 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAX46888.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AY940168 [NCBI]
CDS location
range 94008 -> 101981
strand +
CDS
ATGGCGAATAGATTACAATTAAGAAGAGGGGGTGCTCAGGAATGGGCAAACGCAAACCCAACACTTGCTCAAGGTGAATTAGGTATTGAGCTAGATACAGGTCGATTTAAAATCGGTGATGGTGTATCTGCATGGAACACATTGCGATATGAACGTCCAGTAGAATCAACATCAAACACTGCAAATACTCTCGTACAGAGAGATGCCGATGGTAATTTCGCTGCAGGTACAATAACTGCAACTGTAATTGGTAATGCTTCAACTGCTGCTAGACTTGCTTCAACTCGTCAAATACAAATATCTGGTGACTTAACTGCAACAGGAAACTTTGATGGTTCTCAAAACTTAAACCTTGCTTCATCCTTAGAACTTATACCTACACTACCTCATTATGATGGTACTGCGTCTGCCTCAGGAACTTATACAAAAGTCACAGTAGACTCAAAAGGTAGAATAACAAACGCTTCATTCCCTTCAACTCTTGCAGATTACAACTTAAATGGAACTGTTGAAGGATCTTCTGCTCAACCATATGATCTTGACTTGGTTGCAATAGCAGGACTTACTACTACTGGTATGATATCAAGAACCAGTGGTGGAAACATGGCGACCAGAACAATCACTGGTACTCCTACAAGAATTTCTATAGTTAATGGTAATGGTGTTTCTGGAAACCCAACAATAGATCTTATTACAACTGCTGTTGTACCAGGTAACTATAATACGGAATCCCTGACATCCGTAAATGCTGTTGGTTCTAGTTCAGAACCCTTTGGTACACAGACAGTTAACGCTGTTAAGTTCACTGTAGATGACCGTGGTAGATTGACAAGTGCAACAAATGTGCCTATCGCTACAGCAGTAGAAGGTACAACTGCACTAGATTATAATGCAGCGACTTCATACTCTAGGTATGCAATCATTAAGAATGCATCAAAAGTTTATCAAGCATATCAAGCTATTTCTGCAGGTGCAGGTGCTCCTACTCATACTAGCGGTGACAATGGCGGGTGGAGATACCTCGCTGCCGAGAGCACTGAACAGAAGGGTCTTGCATCCTTTGCCCAAGAAGACTTTGACGTAGCATCTGGACATGTTTCTATTGCTGCTGCAGGTGTAGATAATACACAATTACAAAATAATAGAGTATCTTTTGCTGATGGTAATTCTGTTGAGCATTTTGAATTAGATCAAGAACTCACAGCAACAACTGGATACAGAGGATTTACTGGTATAAATTATGTAAATGTAAAGAATACCTCAGGTGGTTTACTCTTTGCTGCTAATAACACAGGTGATAGTGGCAATGGTGAAGTTGATATTAATGTAAAAACATTAATAAGTGATCCAGATGTAGTATTTGATGGTGCAACTGCACAGACAATAGACAAAACTGGTGATGGTAATCTTACAATTCAAACGACTCAGAGTTCTAGTTCTGCAAGATCACTAAGTATTGCAGCAACCAACTCAGGTTCTGGAACCAGTACAGTTAGTATTACTGCTGAAGATGTTGTAGACATCCAAGCATCTGATGCATCAACTGGTAAAGTTCATGTAGAAAACATGAGGATACAAGGAGATCACCTTGCATCAACTGGTACACTTAAACTTGATCCTGGCGATGATAGAGCAGTCACAGGTCTTGTACAAATCTTAGGAAACTTACAAGTAGATGGAACAACTACAACAGTTAATAGTACAACTACGACAGTGGATGACCCAGTATTTACCTTGGGTGGCGACACTGCTCCTACTACTGACGATAATAAAGATAGGGGAATTGAGTTCAGATATTATGATTCTCAAGCAAGACTTGGATTCTTCGGTTACGACGATTCGTATGCAGATCTCGGAGGACATACAGGAGGATTTGCGTTCCTATACAATGCCTCACAAAGCTCCGCAGAGATTTTTACAGGAACTGACGCAGGAATCCGTGCGGGTAACTTAAAACTTACAACAAATACTAACTCAACATCTAATACTACTGGAGATTTGGTAGTTGCAGGTGGTGTTGGTATTGGAGATGATGTTAATATTGGTGGACTATTAGATGTAGATGGTACATTCCGTGCTAATTCTACAAGTAGATTTGATGATAATATTGTATTCCAAGGTGCTTCCAAGACCTTAGAACTTAAGAACGGATCAGGAACTACTAAAACTACACTTCATACTACTACAGGTAATGTTGATGTAGGTGGTATCCTTACAGTCACTGGTGCTATAGATGCTAACAGTTCTGCTGCTATCTCAGGTGATGTTCATTTAGAAAGTACAAACGATATTACAACTGCCAAGAACGGAACTACTGGTGCTTGGGAGATACAATCAAGTGATTATGGTGCATTAAGACTCGATGGTGGTTTCTATGTAGCAGGATCTGGTCTGATTGATGGTACGTTGCATGTTAATGGTCCTATTGAAGTTAAGGATAGTGCAACAGAAACTGAATCTAGATTGAACTGGTTGAGAGTTAGATACAGAGGTCGTTTTGGTGACACTTATCAGGCATCTCCTTCTTATGCTTCTCATAACTTCTCCACTATAAAAGCACATGGTGGTGCAGGTATTATGAAATCCTTGTACGTTGGTGCTACAGGGTCAGGAGAGAGGTTCTCAGTTGGTAAATTAAACAGTGGTGATACTGAGAAGTTTAGTGTTATTGGTGCAAGTGGTAATACAGATATTCAAGGTACTTTGAATGTTGAAGGTAATACAACTATTCAAGATTCGGTCACTATCAATGCATCAAATGAAAACTTTAAGATTCAAAATGGATCTGCAGTTGATAAGTTTACAGTAGATACAGATAATGGCAATACTGTAATTGAAGGTACAGTTAATATTAATGGTGTTACTGATGTTGACGCTGATTTCGCAGTTAGAAACGGAACGACTGATAAGTTCTTTGTCGCATCTTCCACAGGTAATACTAATATTGAAGGTACGCTGACTGCTGATGGTCATACTGAATTAAATTCAACACTTAATGTTGATAGTAATACTACTATTGGTGGTACACTAGAAGTCACAAATAATACAGAAATCAATGGTACCTTAGATGTCGATGCAAACTTTGCAGTCAGATCAGGTACAACTGATAAGATGACTGTTGCATCTTCAACAGGTAATATTGCAACTGATGGTACTCTAGTTGTTGCAGGTCAAACAACTATCAATGACTCTCTAATTATTCAGAGTGATAATGAGGTAGTTAATGTAAACAATGGATCTGGTGTCAATAAGTTCAGTATTGATACTGATAATGGTAATACCAATATAATCGGTACATTGACAGTTGGTGATGCGACTCAGATTAACGATACATTCGGAACATCTGGTGTTAATACATTTACAAACAATACAGAACAAACTCTTACAGGAACATATGCTGCTGATGGTGCTGTAAGACTTACTGGTGGTGCAGGTATTGGTAAAAACTTAGCAGTTGGTGGCGGGCTTAGGGTTTATGGTGGAACTGAATTATCAGGTGCTCTCGATCTTAATAGTAGTGCAAATATATCAGGTTCAACAATCGTTGAGAACCAATTAATTGTTAAGGCAGATAATAAGTTCTTCAAAGTACAAACAGCTGGTGCTGTTGATAAGTTTACGATAGATACCGACAATGGTAATACAGTATCACAAGGTGACTTAACTGTAGCTGGAGATGTTAATGCCCAGTCTAACTTAATTGTCACAGGTAATCTTACAGTTAATGGTACAACTTCTACAGTTAACTCAACAACGGTCACTATAGATGATCCTGTATTTACTCTAGGTGGTGATACTGCTCCTGCATCAAACGATGGTAAAGATAGGGGTATTGAATTTAGATATTTTGATGGATCTGCTAAACTTGGTTTCTTTGGATTTGATAGATCAACTCAAGAATTTGCTTTCTTAACTACCGCTACTAATAGTAGTGAAGTTTTCTCAGGAACTGATGCTGCATTAAGAATTGGTTCTTTAAATGTCACTGGTGCAGGTACATCTGTTGATATTGATAATAACTTAAATGTTGATGGTACAGCAACAGTTGATGGTCAGATCATCTCTCAACTTCCTCAGGGTACTGCTCCATTCGTAGTTGCATCTTCAACTAAAGTCAATAATCTTAACGCAGATTTCCTTGATGGATTAACTACAAGTGCTACAGATACAACTGGTAATAGTGTTGTAACTAGAGCATCTGGTAATTTCTCTGCAGGACAAATCACTGCTGCAACTGGAACTGGTGCTGCTGCAGGATTCTTAGGAAACGCATCAACTGCTGATGCATGGAAGACTGCTAGAACACTTACTATTGATGGTGTAGTAGATGGTTCAGTATCAATCAATGGTGCTTCTGATCCAACACTTACAGTTACATTTAATGATGCAGACATTACTGCACTTGCTGCACAATCTGGCACAGGATACATGGTCAGAACTGCTGCAAACACATATGCTCATCGTACGTTCTCAGTCACAGCATCTTCTGGTATTACACTAACAAATGCTGATGGTGTATCTGGTAATACTACAATCAACGTAGCATCTGCAAGCACAAACGCTGCAAACAACTTAGTCTTACGTGATGGATCTGGTAATTTTGCTTCTAATGTAATTACTGCTACTTCTTTCTCAGGTAATCTTATAAAATCTAGCACTTCAGCTAAGGATATTAAACCTGAGTCAAATTCAACTTACGATTTAGGTTCTAGTGCATTACAATGGGCAAACATTCATGCTGACGCAGCGAATATTGATACTGTCACAGGTAATTTAACTGGTAATGTAACAGGTAATCTTGTAGCAGCAACAACTCAAGCCAAAGATATAGATCCTGCTTTAAATTCAACATACGATTTAGGTTCTAGTTCCTTAAAATGGGCAAATATCCATGCTGATGCTGCCTCTATTGGTACTACTACAGGTAATGTCACAGGTAATCTTACTGGTAATCTTGTCGCAGCTACAACTGAAGCTAAGGATATAGATCCTGCTTTAAA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
3003aadaa4ee929aba5e1dd7a5ce34c6522eb49e96bff69e844d568689665d70
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4078
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50