Protein
View in Explore- UniProt accession
- Q58LL1 [UniProt]
- Protein name
- YadA domain-containing structural protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MANRLQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDADGNFAAGTITATVIGNASTAARLASTRQIQISGDLTATGNFDGSQNLNLASSLELIPTLPHYDGTASASGTYTKVTVDSKGRITNASFPSTLADYNLNGTVEGSSAQPYDLDLVAIAGLTTTGMISRTSGGNMATRTITGTPTRISIVNGNGVSGNPTIDLITTAVVPGNYNTESLTSVNAVGSSSEPFGTQTVNAVKFTVDDRGRLTSATNVPIATAVEGTTALDYNAATSYSRYAIIKNASKVYQAYQAISAGAGAPTHTSGDNGGWRYLAAESTEQKGLASFAQEDFDVASGHVSIAAAGVDNTQLQNNRVSFADGNSVEHFELDQELTATTGYRGFTGINYVNVKNTSGGLLFAANNTGDSGNGEVDINVKTLISDPDVVFDGATAQTIDKTGDGNLTIQTTQSSSSARSLSIAATNSGSGTSTVSITAEDVVDIQASDASTGKVHVENMRIQGDHLASTGTLKLDPGDDRAVTGLVQILGNLQVDGTTTTVNSTTTTVDDPVFTLGGDTAPTTDDNKDRGIEFRYYDSQARLGFFGYDDSYADLGGHTGGFAFLYNASQSSAEIFTGTDAGIRAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGVGIGDDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNIVFQGASKTLELKNGSGTTKTTLHTTTGNVDVGGILTVTGAIDANSSAAISGDVHLESTNDITTAKNGTTGAWEIQSSDYGALRLDGGFYVAGSGLIDGTLHVNGPIEVKDSATETESRLNWLRVRYRGRFGDTYQASPSYASHNFSTIKAHGGAGIMKSLYVGATGSGERFSVGKLNSGDTEKFSVIGASGNTDIQGTLNVEGNTTIQDSVTINASNENFKIQNGSAVDKFTVDTDNGNTVIEGTVNINGVTDVDADFAVRNGTTDKFFVASSTGNTNIEGTLTADGHTELNSTLNVDSNTTIGGTLEVTNNTEINGTLDVDANFAVRSGTTDKMTVASSTGNIATDGTLVVAGQTTINDSLIIQSDNEVVNVNNGSGVNKFSIDTDNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFGTSGVNTFTNNTEQTLTGTYAADGAVRLTGGAGIGKNLAVGGGLRVYGGTELSGALDLNSSANISGSTIVENQLIVKADNKFFKVQTAGAVDKFTIDTDNGNTVSQGDLTVAGDVNAQSNLIVTGNLTVNGTTSTVNSTTVTIDDPVFTLGGDTAPASNDGKDRGIEFRYFDGSAKLGFFGFDRSTQEFAFLTTATNSSEVFSGTDAALRIGSLNVTGAGTSVDIDNNLNVDGTATVDGQIISQLPQGTAPFVVASSTKVNNLNADFLDGLTTSATDTTGNSVVTRASGNFSAGQITAATGTGAAAGFLGNASTADAWKTARTLTIDGVVDGSVSINGASDPTLTVTFNDADITALAAQSGTGYMVRTAANTYAHRTFSVTASSGITLTNADGVSGNTTINVASASTNAANNLVLRDGSGNFASNVITATSFSGNLIKSSTSAKDIKPESNSTYDLGSSALQWANIHADAANIDTVTGNLTGNVTGNLVAATTQAKDIDPALNSTYDLGSSSLKWANIHADAASIGTTTGNVTGNLTGNLVAATTEAKDIDPALNSTYDLGSSSLKWANIHADAAAIATTTGNLTGNVTGNLVAATTESKNIVPDLNATYDLGSSTKQWSNIHADAGNIDAITGNLTGNVTGNLLAATTLAKDIKPDANSTYDLGSSTLKWQNIYADAAAIATTTGNVIGNLTGNLLASTTQAKDIKPALNSTYDLGSSSLKWQDIFADAASIGTVTGNVTGNLTGNLEASTTQAKDIDPALNSTYDLGSASLKWQRIFADAATISTTTGNLTGNVTGNLVANTTESANIIPDTNGIYSLGSSTKKYMNVFADAAAITTITGNLTGTATQAANINNHDTDALSEGLNNLYTTAARTRGHFTYGTGIEHDGAGGLAVTQSDINTDNITEGSTNVFFTDTRADARVAAATGANLDLSQKTTTNLAEGTNLYHTEARVQTKLDHAFEQLKAMLNNLATSTTLKLNLSGDPTPGSVVTLGSISSNGVGGYTAGTNVATTASALGTGLTVDTTVNADGAITAIALNQAGTDYVIGETITIPNSNLGGVDTLNLGTLSGGVGGFSAGTGVATTNSGSGDDALTVNTTVDGNGAITNVVINAAGTGYVAGDTITITNPNAGGAATVDTLVGGTGYANGTAIATTTVGSGSGLTLDLTTSNGVVTGVAINGAGSGYAVDDTITIVNANASGVKTLGSIATAGTGYATGTAIATTNDGSGSNFTVDISSVDASGAITAVAINNDGSGYTASDTITIVNANSGGVKTLGTIATGGTGYAAGSAIATTSSGSGTSLTVDLTVDNGVVTGVTINDDGSGYAASEVITIVNANASGIKTVGNFGATDSSRTPGTYTIGTSDYITQASGANATFTVVIGVGGTVDSITVTDDGSGFIVNETITIADAQLGGGGGAALTFDATAIHGNGCTIPVSAIHGNGCTIPVSEIHGNGATIDIATIFTNATVNVATVFTNATFSLSDITTMEIGATLTGTTSNSSGVITAMDSTSVTVDNVSGFFKKGETVGANDVTNLTISSFG
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2657 AA molecular weight: 268691,80570 Da isoelectric point: 4,29836 aromaticity: 0,05382 hydropathy: -0,09627
Domains
Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–242
STR
4–242
IPR041352
ATT
6–43
ATT
6–43
1
2657
Architecture
ATT 4-43 | STR 44-242 | STR 338-908 | STR 1106-1567 | STR 1688-1742 | RBD 1743-1910 | RBD 1997-2174 | RBD 2245-2325 | STR 2401-2656 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Prochlorococcus phage P-SSM4 [NCBI] |
268747 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Ronodorvirus > Ronodorvirus ssm4 |
| Host |
Prochlorococcus [NCBI] |
1218 | Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > |
| Host |
Prochlorococcus marinus str. NATL2A [NCBI] |
59920 | Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAX46888.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
AY940168
[NCBI]
CDS location
range 94008 -> 101981
strand +
strand +
CDS
ATGGCGAATAGATTACAATTAAGAAGAGGGGGTGCTCAGGAATGGGCAAACGCAAACCCAACACTTGCTCAAGGTGAATTAGGTATTGAGCTAGATACAGGTCGATTTAAAATCGGTGATGGTGTATCTGCATGGAACACATTGCGATATGAACGTCCAGTAGAATCAACATCAAACACTGCAAATACTCTCGTACAGAGAGATGCCGATGGTAATTTCGCTGCAGGTACAATAACTGCAACTGTAATTGGTAATGCTTCAACTGCTGCTAGACTTGCTTCAACTCGTCAAATACAAATATCTGGTGACTTAACTGCAACAGGAAACTTTGATGGTTCTCAAAACTTAAACCTTGCTTCATCCTTAGAACTTATACCTACACTACCTCATTATGATGGTACTGCGTCTGCCTCAGGAACTTATACAAAAGTCACAGTAGACTCAAAAGGTAGAATAACAAACGCTTCATTCCCTTCAACTCTTGCAGATTACAACTTAAATGGAACTGTTGAAGGATCTTCTGCTCAACCATATGATCTTGACTTGGTTGCAATAGCAGGACTTACTACTACTGGTATGATATCAAGAACCAGTGGTGGAAACATGGCGACCAGAACAATCACTGGTACTCCTACAAGAATTTCTATAGTTAATGGTAATGGTGTTTCTGGAAACCCAACAATAGATCTTATTACAACTGCTGTTGTACCAGGTAACTATAATACGGAATCCCTGACATCCGTAAATGCTGTTGGTTCTAGTTCAGAACCCTTTGGTACACAGACAGTTAACGCTGTTAAGTTCACTGTAGATGACCGTGGTAGATTGACAAGTGCAACAAATGTGCCTATCGCTACAGCAGTAGAAGGTACAACTGCACTAGATTATAATGCAGCGACTTCATACTCTAGGTATGCAATCATTAAGAATGCATCAAAAGTTTATCAAGCATATCAAGCTATTTCTGCAGGTGCAGGTGCTCCTACTCATACTAGCGGTGACAATGGCGGGTGGAGATACCTCGCTGCCGAGAGCACTGAACAGAAGGGTCTTGCATCCTTTGCCCAAGAAGACTTTGACGTAGCATCTGGACATGTTTCTATTGCTGCTGCAGGTGTAGATAATACACAATTACAAAATAATAGAGTATCTTTTGCTGATGGTAATTCTGTTGAGCATTTTGAATTAGATCAAGAACTCACAGCAACAACTGGATACAGAGGATTTACTGGTATAAATTATGTAAATGTAAAGAATACCTCAGGTGGTTTACTCTTTGCTGCTAATAACACAGGTGATAGTGGCAATGGTGAAGTTGATATTAATGTAAAAACATTAATAAGTGATCCAGATGTAGTATTTGATGGTGCAACTGCACAGACAATAGACAAAACTGGTGATGGTAATCTTACAATTCAAACGACTCAGAGTTCTAGTTCTGCAAGATCACTAAGTATTGCAGCAACCAACTCAGGTTCTGGAACCAGTACAGTTAGTATTACTGCTGAAGATGTTGTAGACATCCAAGCATCTGATGCATCAACTGGTAAAGTTCATGTAGAAAACATGAGGATACAAGGAGATCACCTTGCATCAACTGGTACACTTAAACTTGATCCTGGCGATGATAGAGCAGTCACAGGTCTTGTACAAATCTTAGGAAACTTACAAGTAGATGGAACAACTACAACAGTTAATAGTACAACTACGACAGTGGATGACCCAGTATTTACCTTGGGTGGCGACACTGCTCCTACTACTGACGATAATAAAGATAGGGGAATTGAGTTCAGATATTATGATTCTCAAGCAAGACTTGGATTCTTCGGTTACGACGATTCGTATGCAGATCTCGGAGGACATACAGGAGGATTTGCGTTCCTATACAATGCCTCACAAAGCTCCGCAGAGATTTTTACAGGAACTGACGCAGGAATCCGTGCGGGTAACTTAAAACTTACAACAAATACTAACTCAACATCTAATACTACTGGAGATTTGGTAGTTGCAGGTGGTGTTGGTATTGGAGATGATGTTAATATTGGTGGACTATTAGATGTAGATGGTACATTCCGTGCTAATTCTACAAGTAGATTTGATGATAATATTGTATTCCAAGGTGCTTCCAAGACCTTAGAACTTAAGAACGGATCAGGAACTACTAAAACTACACTTCATACTACTACAGGTAATGTTGATGTAGGTGGTATCCTTACAGTCACTGGTGCTATAGATGCTAACAGTTCTGCTGCTATCTCAGGTGATGTTCATTTAGAAAGTACAAACGATATTACAACTGCCAAGAACGGAACTACTGGTGCTTGGGAGATACAATCAAGTGATTATGGTGCATTAAGACTCGATGGTGGTTTCTATGTAGCAGGATCTGGTCTGATTGATGGTACGTTGCATGTTAATGGTCCTATTGAAGTTAAGGATAGTGCAACAGAAACTGAATCTAGATTGAACTGGTTGAGAGTTAGATACAGAGGTCGTTTTGGTGACACTTATCAGGCATCTCCTTCTTATGCTTCTCATAACTTCTCCACTATAAAAGCACATGGTGGTGCAGGTATTATGAAATCCTTGTACGTTGGTGCTACAGGGTCAGGAGAGAGGTTCTCAGTTGGTAAATTAAACAGTGGTGATACTGAGAAGTTTAGTGTTATTGGTGCAAGTGGTAATACAGATATTCAAGGTACTTTGAATGTTGAAGGTAATACAACTATTCAAGATTCGGTCACTATCAATGCATCAAATGAAAACTTTAAGATTCAAAATGGATCTGCAGTTGATAAGTTTACAGTAGATACAGATAATGGCAATACTGTAATTGAAGGTACAGTTAATATTAATGGTGTTACTGATGTTGACGCTGATTTCGCAGTTAGAAACGGAACGACTGATAAGTTCTTTGTCGCATCTTCCACAGGTAATACTAATATTGAAGGTACGCTGACTGCTGATGGTCATACTGAATTAAATTCAACACTTAATGTTGATAGTAATACTACTATTGGTGGTACACTAGAAGTCACAAATAATACAGAAATCAATGGTACCTTAGATGTCGATGCAAACTTTGCAGTCAGATCAGGTACAACTGATAAGATGACTGTTGCATCTTCAACAGGTAATATTGCAACTGATGGTACTCTAGTTGTTGCAGGTCAAACAACTATCAATGACTCTCTAATTATTCAGAGTGATAATGAGGTAGTTAATGTAAACAATGGATCTGGTGTCAATAAGTTCAGTATTGATACTGATAATGGTAATACCAATATAATCGGTACATTGACAGTTGGTGATGCGACTCAGATTAACGATACATTCGGAACATCTGGTGTTAATACATTTACAAACAATACAGAACAAACTCTTACAGGAACATATGCTGCTGATGGTGCTGTAAGACTTACTGGTGGTGCAGGTATTGGTAAAAACTTAGCAGTTGGTGGCGGGCTTAGGGTTTATGGTGGAACTGAATTATCAGGTGCTCTCGATCTTAATAGTAGTGCAAATATATCAGGTTCAACAATCGTTGAGAACCAATTAATTGTTAAGGCAGATAATAAGTTCTTCAAAGTACAAACAGCTGGTGCTGTTGATAAGTTTACGATAGATACCGACAATGGTAATACAGTATCACAAGGTGACTTAACTGTAGCTGGAGATGTTAATGCCCAGTCTAACTTAATTGTCACAGGTAATCTTACAGTTAATGGTACAACTTCTACAGTTAACTCAACAACGGTCACTATAGATGATCCTGTATTTACTCTAGGTGGTGATACTGCTCCTGCATCAAACGATGGTAAAGATAGGGGTATTGAATTTAGATATTTTGATGGATCTGCTAAACTTGGTTTCTTTGGATTTGATAGATCAACTCAAGAATTTGCTTTCTTAACTACCGCTACTAATAGTAGTGAAGTTTTCTCAGGAACTGATGCTGCATTAAGAATTGGTTCTTTAAATGTCACTGGTGCAGGTACATCTGTTGATATTGATAATAACTTAAATGTTGATGGTACAGCAACAGTTGATGGTCAGATCATCTCTCAACTTCCTCAGGGTACTGCTCCATTCGTAGTTGCATCTTCAACTAAAGTCAATAATCTTAACGCAGATTTCCTTGATGGATTAACTACAAGTGCTACAGATACAACTGGTAATAGTGTTGTAACTAGAGCATCTGGTAATTTCTCTGCAGGACAAATCACTGCTGCAACTGGAACTGGTGCTGCTGCAGGATTCTTAGGAAACGCATCAACTGCTGATGCATGGAAGACTGCTAGAACACTTACTATTGATGGTGTAGTAGATGGTTCAGTATCAATCAATGGTGCTTCTGATCCAACACTTACAGTTACATTTAATGATGCAGACATTACTGCACTTGCTGCACAATCTGGCACAGGATACATGGTCAGAACTGCTGCAAACACATATGCTCATCGTACGTTCTCAGTCACAGCATCTTCTGGTATTACACTAACAAATGCTGATGGTGTATCTGGTAATACTACAATCAACGTAGCATCTGCAAGCACAAACGCTGCAAACAACTTAGTCTTACGTGATGGATCTGGTAATTTTGCTTCTAATGTAATTACTGCTACTTCTTTCTCAGGTAATCTTATAAAATCTAGCACTTCAGCTAAGGATATTAAACCTGAGTCAAATTCAACTTACGATTTAGGTTCTAGTGCATTACAATGGGCAAACATTCATGCTGACGCAGCGAATATTGATACTGTCACAGGTAATTTAACTGGTAATGTAACAGGTAATCTTGTAGCAGCAACAACTCAAGCCAAAGATATAGATCCTGCTTTAAATTCAACATACGATTTAGGTTCTAGTTCCTTAAAATGGGCAAATATCCATGCTGATGCTGCCTCTATTGGTACTACTACAGGTAATGTCACAGGTAATCTTACTGGTAATCTTGTCGCAGCTACAACTGAAGCTAAGGATATAGATCCTGCTTTAAA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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
3003aadaa4ee929aba5e1dd7a5ce34c6522eb49e96bff69e844d568689665d70
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50