Protein

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Genbank accession
WPK19491.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MYSIKTDLDITGAGTVGKDLLVKGNAVFNNNLTVNGTVTFANATFTAIESSTANITSTLDVGGKATLSGGLGVEGNTTIGSAVVGSDTATINSNATFNGTVSVGSDFTQTAGTTTLQATKVKNLEVAETTAFKGNITADVGTTAAFDKITANTAEITNVSTTDISSTGTATFKDVTISGTLGGEFNLSDLNAVTLNVTGASNQQGAVTFGANVTGINSTATFKDIRIGSNSESQTFRLSFPYTAPGKRPTVILQNEIQSELMSPANLTVLTSASFGNASLSSYGITGNGLNKLDYLTVSGNNTQSPDTPLLEVQKGKTKVADFEVTGTATIPNIESTGTANFNNINISGVLGGTFQLDDINAASLNVTGATSLVGGVTLGSNITGYNSTASFKAISLGQSSQDSAVKLGFGYTAPSQRPTVILPNEVQSELVSPSTLNVLKTATFGNAALSTYGITGNGLNKLDYLTITGNATQDPSTPFLQVGGKAILNDVDFTGTVTGLTVDVSGQDLTPNSVVAATNIKGATLESTGNTTVGAKLTVTGDIAGTTATLSGALSAGSVSSGSITGTTSVSAPTISASTEVTAPTITASGTVSGQTINGTNISATTLTAPTISGNTNFTENVDITGNLTVTGTVTPGTIDLSTTDVSAKSITTTAGANIGGDLVVQGSFDLSAADINVKSLTSSGIVKSNDLVNANVLPVLNSTTITATTVNADDITVTGSANLGTIYSSSSVLVGSTLTVTGETTTASLVTPTISNASGVTISNNTNVTGDLTVTGAVIPGSIDLATTDVNAKSITTTAGATIGGNLTVNGTVDLTTADVTVKSLTSTGAIVSNESTISSVLPKLQSTDATIATLGSTTANITNLNVTGASTVADVTSSGKVKAVSVETPTISNVDGVSISNNTSITGDLTVSGTVTPGAIDLSTTDVSAKSITTTAGANIGGDLVVSGTVDLSGADVSVKSLTSTGIITVSSAEGINVLPKVQSTEVTVSALNATNAVVSGDVSAATASISGAITGGSATLSGIGTALNVTNNATVGGVLTVGSITSAAENVSITKNTAITGNLAVSGTLTAGVIDLSTTDVSVKTLTSLGDATVQGNLTVDGSIDLSSANIVGVTLESTGSTTVGTDLILTTGNITGSPSISGNLGVTGTTTLTGATTVSNTLSTGGKLTVNTGGIQVVDGGIQVDAGTITAPSANISGDSTLNSATVTTTLGVTGAASMNGGLTASTLDVTGDSTVQKLTVKGAFIPEGGLDLSGADLNVNSVTAATTLSVTGASTLTGGVSTSTVTASGKVTAQELSTGTLAVTTNGTVGGTLDVTGKATVGSLDSGAISATSGTFSTTLGVTGAATFGNNVNITGTLTPGALDLSSTDVDANSLSVATTLHSNGNATIGGTLGVTGAATAPSIALNGEGTALAVTNNATIGGTLGVTGKATVGSLDSGAISATSGTFSTTIDVTGAATFGNNVNITGTLTPGALDLASTDVVANSLSVATTLHSDGNATIGGTLGVTGAATAPSITLNGEGTALAVTNNATIGGTLGVTGAATLGSLTTSGAVKTGSNVIIGTKIGEQPETVQILHCWFLACRWWYQR
Physico‐chemical
properties
protein length:1595 AA
molecular weight: 155798,01800 Da
isoelectric point:4,18548
aromaticity:0,02696
hydropathy:0,24082

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage SD-6_S16
[NCBI] 		3096174 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Salmonella typhimurium
[NCBI] 		90371 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPK19491.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR699182.1 [NCBI]
CDS location
range 314586 -> 319373
strand +
CDS
ATGTACTCAATAAAAACTGACTTAGATATTACTGGTGCTGGTACGGTTGGTAAGGATCTTTTAGTCAAAGGAAATGCTGTTTTCAACAATAACCTAACTGTAAATGGTACTGTAACTTTTGCAAATGCAACTTTTACTGCCATTGAATCATCAACTGCCAATATTACATCTACTTTAGATGTAGGTGGCAAAGCAACACTTTCTGGTGGTCTTGGTGTTGAGGGTAATACTACAATCGGTAGTGCAGTGGTCGGGTCTGATACAGCAACAATTAATTCAAACGCTACCTTTAACGGTACTGTATCAGTTGGTTCTGATTTTACACAAACTGCTGGTACAACCACTCTACAAGCAACTAAAGTTAAAAACTTAGAAGTTGCTGAAACAACAGCATTTAAAGGTAATATTACTGCTGATGTTGGGACTACTGCTGCATTTGATAAAATTACTGCTAATACCGCAGAAATTACTAATGTAAGTACAACAGATATTAGTAGTACTGGTACTGCTACATTTAAAGATGTGACAATTAGTGGTACACTTGGTGGTGAGTTTAATCTATCTGACTTAAATGCAGTAACATTGAACGTTACTGGTGCATCTAACCAACAAGGTGCAGTAACTTTCGGTGCTAACGTAACTGGTATTAACAGTACTGCTACTTTTAAAGACATTCGTATTGGTTCTAACTCTGAATCACAAACCTTCAGATTAAGCTTCCCTTACACTGCTCCTGGTAAACGCCCAACTGTTATTCTACAAAACGAAATTCAGTCCGAGTTAATGTCACCTGCAAACTTAACAGTTTTGACATCTGCTTCTTTTGGTAATGCGTCATTATCTTCTTATGGTATTACTGGTAATGGTCTAAACAAATTAGATTATCTAACAGTTTCTGGTAACAATACACAATCACCAGACACCCCACTATTAGAAGTTCAAAAAGGAAAAACCAAAGTTGCCGATTTTGAAGTTACAGGAACCGCAACTATACCAAATATTGAAAGTACTGGAACTGCTAATTTTAATAATATTAATATTTCTGGTGTTCTTGGTGGAACATTCCAATTAGACGATATTAATGCAGCATCTTTGAACGTTACTGGTGCAACTTCATTAGTTGGTGGTGTTACTCTTGGTTCTAATATTACTGGTTATAATAGTACTGCATCATTTAAAGCTATCAGCTTAGGCCAAAGTAGTCAAGATTCTGCTGTAAAACTTGGATTTGGATATACTGCACCAAGTCAACGTCCAACCGTGATTTTACCTAACGAAGTTCAATCAGAATTAGTTTCTCCTTCAACACTGAACGTTCTAAAAACGGCAACTTTTGGTAATGCTGCACTTTCTACGTATGGTATTACTGGTAATGGCCTAAACAAATTAGATTACCTAACCATTACAGGTAACGCAACACAAGACCCTAGTACACCATTCCTACAAGTTGGTGGTAAAGCAATTCTTAATGATGTCGATTTTACTGGCACCGTAACTGGGTTAACTGTTGATGTAAGTGGTCAGGATCTAACACCAAACTCAGTTGTTGCTGCGACAAATATTAAAGGTGCAACCCTTGAAAGTACTGGTAACACTACCGTGGGTGCTAAACTAACTGTTACTGGTGATATTGCTGGTACAACTGCAACTCTTTCTGGTGCATTATCCGCTGGTTCAGTAAGTTCTGGTTCTATTACTGGTACAACTTCTGTATCTGCACCAACAATTAGTGCATCTACTGAAGTAACGGCTCCTACTATCACTGCGAGTGGAACTGTAAGTGGACAAACAATTAACGGTACTAATATTAGTGCAACAACTCTGACTGCACCAACTATTAGTGGTAATACTAACTTCACAGAAAATGTTGATATTACTGGAAATCTAACAGTTACTGGTACAGTAACCCCAGGTACAATTGATTTGAGTACTACTGATGTTAGTGCGAAATCAATCACTACTACCGCTGGTGCAAATATTGGTGGAGATCTTGTGGTTCAAGGTTCTTTTGATTTATCAGCAGCAGACATTAACGTTAAATCACTAACTTCTTCTGGTATTGTTAAAAGTAATGACCTTGTTAATGCTAACGTACTTCCTGTACTTAATAGTACTACCATAACGGCAACTACTGTTAATGCTGATGATATAACTGTTACCGGATCTGCTAATTTGGGTACAATTTACTCAAGCTCATCTGTTCTAGTTGGGTCAACTTTAACTGTAACTGGTGAAACTACAACTGCATCGTTGGTTACCCCAACCATTTCAAATGCAAGTGGTGTCACTATTTCCAATAATACAAATGTAACTGGTGACCTAACCGTTACTGGTGCAGTTATTCCAGGCTCTATCGATCTAGCAACAACTGATGTTAATGCTAAATCCATTACTACTACTGCTGGTGCAACTATTGGTGGTAACCTAACTGTTAATGGTACAGTAGATCTTACTACTGCTGATGTTACTGTCAAATCTTTAACTAGTACTGGTGCAATTGTTAGTAATGAATCTACAATTAGTAGTGTTCTACCTAAACTTCAAAGTACTGATGCAACTATTGCAACCCTTGGTTCAACAACTGCAAATATTACTAATTTGAATGTTACTGGTGCATCTACCGTAGCTGACGTAACTTCTTCAGGTAAAGTTAAAGCAGTTTCTGTAGAAACCCCAACAATTAGTAACGTTGATGGTGTATCTATTTCCAATAATACATCTATTACTGGTGACCTAACAGTTTCTGGTACAGTAACACCAGGTGCAATTGATTTGAGCACAACTGATGTAAGTGCAAAATCCATTACTACTACCGCTGGAGCAAATATTGGTGGAGATCTTGTTGTTTCTGGTACAGTTGATTTAAGTGGTGCTGATGTATCTGTTAAATCTCTAACAAGTACTGGTATTATTACAGTTAGTAGTGCAGAAGGTATCAACGTTCTACCTAAAGTTCAAAGTACTGAAGTTACAGTGTCTGCTCTAAATGCAACAAATGCAGTAGTTTCTGGTGATGTTTCAGCAGCAACAGCTTCAATCTCAGGTGCAATTACTGGTGGGTCAGCAACACTATCTGGTATTGGAACTGCTCTAAATGTAACTAATAACGCAACTGTTGGTGGTGTACTTACTGTTGGTTCTATTACTTCAGCGGCAGAAAATGTATCCATTACTAAAAATACCGCGATTACTGGTAATTTAGCAGTATCTGGAACACTAACTGCGGGTGTTATTGATCTTAGCACAACTGATGTGTCTGTGAAGACATTAACTTCTCTAGGTGATGCAACCGTTCAAGGTAACTTAACTGTTGATGGTTCTATTGACCTAAGTTCTGCAAACATCGTCGGTGTAACACTAGAAAGTACTGGCTCTACCACTGTAGGTACTGATTTGATTCTAACTACAGGTAACATTACAGGTAGTCCATCTATTTCTGGTAACTTGGGTGTTACTGGAACCACAACGTTAACTGGTGCAACTACAGTTTCAAACACATTGTCAACTGGTGGTAAACTAACAGTTAATACTGGTGGTATTCAAGTAGTTGATGGTGGTATTCAAGTTGATGCAGGAACTATTACCGCACCAAGTGCTAATATTTCTGGTGACTCTACCCTTAATAGTGCAACTGTAACTACTACCCTTGGTGTTACTGGTGCAGCTAGTATGAATGGTGGCCTTACAGCATCTACTCTAGATGTAACTGGTGACAGTACTGTACAAAAACTAACTGTTAAGGGTGCATTTATTCCTGAAGGTGGTTTGGACCTATCCGGTGCTGATCTTAACGTGAATAGCGTAACTGCTGCAACCACATTAAGTGTTACTGGTGCAAGTACTCTAACTGGTGGTGTTTCCACTTCAACTGTTACTGCATCCGGTAAGGTAACTGCACAAGAATTAAGTACTGGTACATTGGCAGTAACCACAAATGGAACAGTTGGTGGTACTTTAGATGTAACTGGAAAGGCAACAGTCGGTTCACTAGATTCAGGTGCAATATCTGCAACTTCTGGTACATTTAGTACTACACTAGGTGTAACAGGTGCAGCAACATTTGGTAACAATGTTAATATTACTGGCACGTTAACCCCAGGTGCATTGGATTTATCTAGTACTGATGTAGATGCTAACAGTCTTTCTGTTGCAACAACCCTACATTCAAACGGCAATGCAACAATCGGTGGTACACTAGGTGTAACTGGTGCAGCAACTGCTCCATCAATCGCTCTTAATGGTGAAGGAACTGCATTAGCAGTTACTAACAATGCAACAATTGGTGGTACACTAGGTGTAACTGGAAAGGCAACAGTCGGTTCACTAGATTCAGGTGCAATATCTGCAACTTCTGGTACATTTAGTACTACAATAGATGTAACTGGTGCAGCAACCTTTGGTAATAATGTTAACATTACTGGTACATTAACGCCAGGTGCATTGGATTTAGCTAGTACTGATGTAGTTGCAAACAGTCTTTCTGTTGCAACCACACTACATTCAGATGGTAATGCAACAATTGGTGGTACATTAGGTGTAACTGGTGCAGCAACTGCTCCATCAATCACTCTTAATGGTGAAGGAACTGCATTAGCAGTTACTAACAATGCAACAATTGGTGGTACATTAGGTGTAACTGGTGCAGCAACTTTAGGTTCACTAACAACTTCTGGTGCAGTGAAAACTGGTTCTAATGTTATTATTGGTACTAAGATCGGTGAACAACCAGAAACAGTTCAGATTTTACATTGCTGGTTCCTTGCGTGTAGATGGTGGTATCAACGCTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
190b90aca4742a88f4da21543d443a2d8edbe147207022766e2370f9b5f545f8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4951
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence a group of lytic Salmonella phages Dlamini,S.B., Montso,P.K., Ateba,C.N., Mnisi,M.C. and Mlambo,V. 2023-09 — GenBank