Protein

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Genbank accession
UPW39723.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITIGDVLKTFKVNANGLRLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYSRLAVTNTFSGTQNILSDNEALIFKNITQGMPLYIRGQDADGTNRWYLGNDNRNTDNLVLKNVKSGAYVAILANLISVNKSIQITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLTADNTFSGYNTFNQLNVFKKDGEVIRLQNANAAQPLYIKAIDSTGANRWYIGNNNGGDNVALENYKTSGKITVGTSVDINKTLTVTGQVQPSDWTNIDSRYIPAGTLSNLAKLSDVNTFRSAQVINQNGSLLRLKNTTQDNELYIGGYNADNARRWYIGSGERDNPTRLIIHNDRTLTTIYMQDDFLLNKTVRITGQVQPSDWSNLDARYFTQTVANQRFMVAGSTGEATEQNADGVAWNAKTGLYNVTSTNADYTALVFQMYQGVNSSTACAQLKFQYKNGGMWYRTSVDSKGFEAKWSKIYTEAQKPTPSELGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVDPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGNHNHAISWIGQKTQHYSGGGGGWIGTGPGYTDSAGAHTHTISGTAASNGNHAHSVGIGAHTHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:784 AA
molecular weight: 85107,02200 Da
isoelectric point:8,45550
aromaticity:0,08929
hydropathy:-0,45778

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–268
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 DC_1993
G3DSA:6.20.80.10
STR
158–219
G3DSA:6.20.80.10 DC_1993 G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
ATT
159–248
IPR048388 IPR048388 IPR048388 IPR022246 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
UPW39723.1
1 784
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-359 | STR 360-381 | ATT 382-473 | STR 474-780 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_ESCO56
[NCBI] 		2918873 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UPW39723.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OM386665.1 [NCBI]
CDS location
range 62 -> 2416
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTTCTTCATGTCAGAGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTATTTGACCCAACAGGCTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAGTTAACGCAAATGGTCTTAGACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAACCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATTCAAGGTTGGCTGTAACAAACACATTCTCTGGGACTCAAAATATTCTCTCTGACAATGAAGCCCTTATTTTTAAGAATATCACACAAGGGATGCCACTCTATATTCGTGGTCAAGATGCAGATGGCACTAACAGATGGTATCTAGGTAATGATAATAGAAACACAGACAACCTTGTTTTAAAAAACGTTAAATCTGGTGCATACGTAGCGATTTTAGCTAACCTAATCTCTGTGAATAAATCAATTCAAATCACTGGCCAAGTTCAACCTTCGGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCGCAGTTAACTGCTGATAATACTTTTAGTGGCTATAACACTTTCAACCAACTAAATGTTTTCAAAAAAGATGGTGAAGTAATTAGGCTACAGAATGCCAATGCTGCACAACCATTGTACATTAAAGCGATTGATAGCACAGGTGCCAACAGATGGTACATTGGTAATAATAATGGAGGTGATAACGTAGCTCTAGAAAACTACAAAACTAGTGGCAAAATTACTGTAGGGACAAGTGTTGATATCAATAAAACACTAACTGTAACTGGTCAAGTACAACCTTCTGACTGGACTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGGGACTTTGAGTAATCTTGCTAAGCTAAGTGATGTAAACACTTTCAGGTCTGCGCAAGTTATCAACCAGAATGGCTCACTGTTACGGCTAAAGAACACCACACAAGACAATGAGCTATATATTGGTGGTTATAATGCTGATAATGCGAGAAGATGGTACATTGGTAGCGGGGAAAGAGACAACCCAACAAGGCTTATTATCCACAACGACAGAACTTTAACTACGATTTATATGCAAGATGATTTCTTGTTGAATAAAACTGTTAGAATTACTGGTCAAGTTCAACCATCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTCATGGTTGCAGGTTCTACAGGAGAAGCTACAGAGCAGAATGCAGATGGTGTGGCATGGAACGCTAAAACAGGCTTATATAATGTAACCTCAACAAATGCTGATTACACAGCACTTGTGTTTCAAATGTATCAGGGGGTTAACTCTTCTACTGCCTGTGCGCAATTAAAGTTCCAGTATAAGAACGGTGGGATGTGGTACAGAACATCTGTAGATAGTAAAGGCTTTGAAGCTAAGTGGTCTAAGATTTACACAGAAGCACAGAAACCAACACCTTCAGAGCTTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAAATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAACAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTGACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTATCTGAACAACGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACAGGTGGTTCAGATTCTGTTACGTTAGCAGTTGGAAACTTACCTTCACACACTCATAGTTTCTCTGCGACTACCTCATCGTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACACACTCTGTAAGTGGTTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAACCACGCTATCTCATGGATTGGTCAGAAAACCCAGCACTATTCCGGTGGTGGTGGTGGTTGGATTGGTACAGGACCGGGTTACACTGATTCTGCTGGTGCTCACACCCACACAATCTCTGGTACTGCTGCATCAAATGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACACCCATACAGTAAGCGGTAACACTGGCGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
821ef237a2238be25d44540a75be82c5e09471eafa2644eb1b9ca125e4e37462
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6885
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Avian Pathogenic Escherichia coli bacteriophages Nicolas,M., Trotereau,A. and Schouler,C. 2015-06 — GenBank